More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3464 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3464  hypothetical protein  100 
 
 		 374 aa  771    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.803329  normal  0.0415669 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4959  hypothetical protein  38.71 
 
 		 374 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.128742 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0544  hypothetical protein  39.29 
 
 		 373 aa  244  1.9999999999999999e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01683  hypothetical protein  39.45 
 
 		 397 aa  240  2.9999999999999997e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5646  hypothetical protein  35.89 
 
 		 407 aa  233  3e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.419878  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4947  hypothetical protein  38.15 
 
 		 390 aa  233  5e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.648001 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0795  hypothetical protein  38.15 
 
 		 390 aa  233  5e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.921964 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1493  hypothetical protein  38.33 
 
 		 380 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6336  hypothetical protein  38.33 
 
 		 380 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4962  hypothetical protein  35.69 
 
 		 408 aa  229  6e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.42035  normal  0.249552 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1082  hypothetical protein  37.74 
 
 		 380 aa  228  2e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5501  hypothetical protein  37.25 
 
 		 355 aa  228  2e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.9082  normal  0.091793 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1082  hypothetical protein  37.74 
 
 		 380 aa  227  2e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2392  hypothetical protein  36.86 
 
 		 382 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5706  hypothetical protein  36.31 
 
 		 401 aa  226  6e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0755393 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7002  hypothetical protein  36.89 
 
 		 380 aa  222  9e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00600208 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3158  hypothetical protein  37.67 
 
 		 417 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2954  hypothetical protein  36 
 
 		 396 aa  206  7e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.235474  hitchhiker  0.00230621 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5851  hypothetical protein  35.95 
 
 		 405 aa  202  5e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.3306  hitchhiker  0.00183506 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3909  hypothetical protein  35.33 
 
 		 414 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0793599 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0592  hypothetical protein  34.96 
 
 		 394 aa  196  7e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4899  hypothetical protein  35.55 
 
 		 396 aa  194  1e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5187  monooxygenase FAD-binding  27.82 
 
 		 421 aa  135  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.983717 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0096  monooxygenase FAD-binding  25.25 
 
 		 388 aa  97.4  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0544698 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2005  hypothetical protein  24.42 
 
 		 377 aa  94.7  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00436005  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5812  monooxygenase, FAD-binding protein  26.67 
 
 		 408 aa  92  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0698086  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3565  monooxygenase FAD-binding  26.58 
 
 		 384 aa  91.3  3e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1231  salicylate 1-monooxygenase  27.52 
 
 		 404 aa  90.9  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.592071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4040  salicylate 1-monooxygenase  27.7 
 
 		 404 aa  91.3  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1889  hypothetical protein  24.21 
 
 		 374 aa  90.5  4e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2393  hypothetical protein  24.87 
 
 		 376 aa  90.1  5e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.142228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4138  monooxygenase, FAD-binding protein  26.94 
 
 		 408 aa  89.7  7e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.145497  normal  0.0296411 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0809  monooxygenase, FAD-binding  25.32 
 
 		 396 aa  89  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.815643  normal  0.21546 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0991  salicylate 1-monooxygenase  25.98 
 
 		 397 aa  88.6  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0622996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3927  salicylate 1-monooxygenase  26.16 
 
 		 385 aa  87.4  4e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.567277  normal  0.0279633 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02114  salicylate hydroxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G05260)  25.38 
 
 		 448 aa  87  5e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2339  monooxygenase FAD-binding  28.15 
 
 		 388 aa  87  5e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000167175  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4498  salicylate 1-monooxygenase  27.61 
 
 		 422 aa  86.3  8e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3968  monooxygenase FAD-binding  22.47 
 
 		 362 aa  86.3  9e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1486  monooxygenase FAD-binding protein  26.25 
 
 		 408 aa  85.5  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.528879  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4013  monooxygenase FAD-binding  22.19 
 
 		 362 aa  85.1  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0834664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2172  monooxygenase, FAD-binding  25.28 
 
 		 413 aa  84.7  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0853287 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5387  hypothetical protein  25.35 
 
 		 420 aa  84.3  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2257  hypothetical protein  23.9 
 
 		 378 aa  84.3  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.472155 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06742  salicylate hydroxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00590)  23.42 
 
 		 697 aa  83.2  0.000000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.00748094 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1969  hypothetical protein  23.65 
 
 		 377 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0438709  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4033  monooxygenase FAD-binding  26.42 
 
 		 404 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.115519 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1987  hypothetical protein  23.95 
 
 		 377 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000746962  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5278  monooxygenase, FAD-binding  26.48 
 
 		 395 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.630865 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3149  salicylate 1-monooxygenase  26.24 
 
 		 398 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.136472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2710  monooxygenase FAD-binding  25.56 
 
 		 392 aa  80.9  0.00000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5490  hypothetical protein  25.44 
 
 		 376 aa  79.7  0.00000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.263569  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2526  salicylate 1-monooxygenase  27.06 
 
 		 396 aa  79.7  0.00000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.066083 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4581  monooxygenase FAD-binding protein  26.86 
 
 		 399 aa  79.3  0.00000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.626069 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3162  monooxygenase FAD-binding  25.21 
 
 		 387 aa  79.3  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0514  hypothetical protein  27.2 
 
 		 421 aa  78.2  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.472933  normal  0.467939 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0213  salicylate 1-monooxygenase (NahW)  25.35 
 
 		 403 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00584161  normal  0.918812 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1853  monooxygenase FAD-binding  26.1 
 
 		 385 aa  77.8  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6537  monooxygenase, FAD-binding protein  24.41 
 
 		 392 aa  77.8  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0203356  normal  0.0154804 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3294  monooxygenase FAD-binding protein  27.27 
 
 		 388 aa  77.8  0.0000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0802651  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8535  monooxygenase FAD-binding  26.92 
 
 		 384 aa  77.8  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0157087  hitchhiker  0.0015439 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2372  hypothetical protein  25.79 
 
 		 374 aa  77.4  0.0000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2329  hypothetical protein  25.79 
 
 		 374 aa  77.4  0.0000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2584  monooxygenase, FAD-binding  23.77 
 
 		 400 aa  77  0.0000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.613825  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5557  FAD-dependent oxidoreductase  26.84 
 
 		 367 aa  76.6  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.633311 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4031  DNA mismatch endonuclease Vsr  25.07 
 
 		 404 aa  76.6  0.0000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1528  monooxygenase FAD-binding  23.53 
 
 		 362 aa  77  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.392805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1022  salicylate 1-monooxygenase  27.43 
 
 		 391 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0336  monooxygenase FAD-binding protein  26.5 
 
 		 412 aa  75.9  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.214027  normal  0.627257 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1110  monooxygenase FAD-binding  26.23 
 
 		 389 aa  75.1  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.7504  normal  0.659993 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3284  monooxygenase FAD-binding protein  25.13 
 
 		 393 aa  75.1  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.289154 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0813  monooxygenase, FAD-binding  23.89 
 
 		 377 aa  75.5  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1885  putative salicylate hydroxylase  27.62 
 
 		 389 aa  74.7  0.000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.122899  normal  0.226674 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7133  monooxygenase, FAD-binding  26.35 
 
 		 356 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2962  monooxygenase FAD-binding protein  27.32 
 
 		 397 aa  74.3  0.000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09400  hypothetical protein  24.39 
 
 		 402 aa  73.9  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2318  monooxygenase FAD-binding  28.32 
 
 		 385 aa  73.9  0.000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.694664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3466  monooxygenase, FAD-binding  25.28 
 
 		 392 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4900  monooxygenase, FAD-binding  25.28 
 
 		 392 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.99121 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5386  monooxygenase FAD-binding  25.28 
 
 		 392 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.336288 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0881  hypothetical protein  24.39 
 
 		 402 aa  73.2  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.200049  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7773  monooxygenase FAD-binding  22.77 
 
 		 374 aa  73.2  0.000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4211  monooxygenase, FAD-binding  26.15 
 
 		 382 aa  73.2  0.000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.815591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6277  monooxygenase FAD-binding  25.07 
 
 		 405 aa  73.2  0.000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.146167  normal  0.672282 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4386  hypothetical protein  26.27 
 
 		 441 aa  72  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05260  conserved hypothetical protein  25.54 
 
 		 446 aa  72.4  0.00000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2230  hypothetical protein  21.62 
 
 		 377 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000757274  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1214  hypothetical protein  24.67 
 
 		 414 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1542  monooxygenase FAD-binding protein  23.18 
 
 		 374 aa  71.6  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0929471  normal  0.228138 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2849  hypothetical protein  24.93 
 
 		 414 aa  72  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5319  monooxygenase FAD-binding protein  25.78 
 
 		 390 aa  70.9  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3637  hypothetical protein  24.79 
 
 		 416 aa  71.2  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.529402  normal  0.0728154 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0712  hypothetical protein  25.07 
 
 		 371 aa  71.2  0.00000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2552  monooxygenase FAD-binding protein  24.67 
 
 		 376 aa  70.9  0.00000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0391  hypothetical protein  24.67 
 
 		 440 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1770  hypothetical protein  24.67 
 
 		 440 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1585  hypothetical protein  24.67 
 
 		 440 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.825888  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0439  hypothetical protein  24.67 
 
 		 440 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3428  monooxygenase, FAD-binding  25.59 
 
 		 372 aa  70.1  0.00000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3586  salicylate 1-monooxygenase  24.51 
 
 		 427 aa  70.1  0.00000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.942873 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>