266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_1082 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_1082  hypothetical protein  97.63 
 
 		 380 aa  747    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1082  hypothetical protein  100 
 
 		 380 aa  761    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7002  hypothetical protein  75.81 
 
 		 380 aa  558  1e-158  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00600208 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1493  hypothetical protein  76.34 
 
 		 380 aa  560  1e-158  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6336  hypothetical protein  76.34 
 
 		 380 aa  560  1e-158  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5706  hypothetical protein  55.56 
 
 		 401 aa  395  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0755393 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4947  hypothetical protein  54.4 
 
 		 390 aa  381  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.648001 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2392  hypothetical protein  55.03 
 
 		 382 aa  382  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5501  hypothetical protein  54.65 
 
 		 355 aa  375  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.9082  normal  0.091793 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0795  hypothetical protein  54.13 
 
 		 390 aa  375  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.921964 
 
 
-
 
NC_003296  RS01683  hypothetical protein  47.33 
 
 		 397 aa  276  6e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4962  hypothetical protein  41.57 
 
 		 408 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.42035  normal  0.249552 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5646  hypothetical protein  40.47 
 
 		 407 aa  243  3.9999999999999997e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.419878  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3909  hypothetical protein  42.33 
 
 		 414 aa  227  3e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0793599 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3158  hypothetical protein  44.63 
 
 		 417 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4959  hypothetical protein  36.14 
 
 		 374 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.128742 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3464  hypothetical protein  36.94 
 
 		 374 aa  212  1e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.803329  normal  0.0415669 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0544  hypothetical protein  38.24 
 
 		 373 aa  206  6e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4899  hypothetical protein  37.92 
 
 		 396 aa  199  7e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2954  hypothetical protein  39.14 
 
 		 396 aa  197  2.0000000000000003e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.235474  hitchhiker  0.00230621 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5851  hypothetical protein  39.19 
 
 		 405 aa  187  3e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.3306  hitchhiker  0.00183506 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0592  hypothetical protein  35.8 
 
 		 394 aa  153  5e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5187  monooxygenase FAD-binding  31.35 
 
 		 421 aa  95.9  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.983717 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7133  monooxygenase, FAD-binding  32.73 
 
 		 356 aa  94.7  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1893  monooxygenase, FAD-binding  26.23 
 
 		 382 aa  84  0.000000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2311  monooxygenase FAD-binding  25.38 
 
 		 383 aa  83.6  0.000000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3579  monooxygenase FAD-binding  26.54 
 
 		 382 aa  83.2  0.000000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.817981 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3944  salicylate hydroxylase  26.23 
 
 		 382 aa  82.8  0.000000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0448295  normal  0.412797 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2199  hypothetical protein  27.78 
 
 		 413 aa  82.8  0.000000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0226443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2257  hypothetical protein  25.27 
 
 		 378 aa  82.4  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.472155 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3149  salicylate 1-monooxygenase  28.31 
 
 		 398 aa  82.8  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.136472  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1889  hypothetical protein  21.97 
 
 		 374 aa  81.3  0.00000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2140  monooxygenase FAD-binding  25.93 
 
 		 382 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0383787 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4013  monooxygenase FAD-binding  23.36 
 
 		 362 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0834664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0991  salicylate 1-monooxygenase  26.11 
 
 		 397 aa  77.4  0.0000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0622996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4211  monooxygenase, FAD-binding  24.93 
 
 		 382 aa  77  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.815591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3968  monooxygenase FAD-binding  22.25 
 
 		 362 aa  76.6  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2005  hypothetical protein  23.58 
 
 		 377 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00436005  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0813  monooxygenase, FAD-binding  26.22 
 
 		 377 aa  75.9  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09400  hypothetical protein  28.72 
 
 		 402 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3996  hypothetical protein  30.03 
 
 		 417 aa  74.7  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2526  salicylate 1-monooxygenase  26.98 
 
 		 396 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.066083 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3957  monooxygenase FAD-binding  50 
 
 		 376 aa  74.3  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4002  monooxygenase FAD-binding  50 
 
 		 376 aa  74.3  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3927  salicylate 1-monooxygenase  26.06 
 
 		 385 aa  74.7  0.000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.567277  normal  0.0279633 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1853  monooxygenase FAD-binding  25.61 
 
 		 385 aa  73.9  0.000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0881  hypothetical protein  30.65 
 
 		 402 aa  73.2  0.000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.200049  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0336  monooxygenase FAD-binding protein  28.88 
 
 		 412 aa  72.4  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.214027  normal  0.627257 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2159  monooxygenase FAD-binding  26.82 
 
 		 402 aa  72.4  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.429326  normal  0.511267 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1528  monooxygenase FAD-binding  24.33 
 
 		 362 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.392805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2131  salicylate 1-monooxygenase  31.53 
 
 		 400 aa  71.6  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5319  monooxygenase FAD-binding protein  33.16 
 
 		 390 aa  70.9  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0712  hypothetical protein  31.89 
 
 		 371 aa  70.5  0.00000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6042  monooxygenase FAD-binding  25.07 
 
 		 378 aa  70.9  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0233658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3662  monooxygenase, FAD-binding  25.07 
 
 		 395 aa  69.7  0.00000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.555838  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7773  monooxygenase FAD-binding  33.33 
 
 		 374 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2329  hypothetical protein  28.09 
 
 		 374 aa  68.2  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4031  DNA mismatch endonuclease Vsr  26.65 
 
 		 404 aa  68.2  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6172  hypothetical protein  26.92 
 
 		 417 aa  68.9  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.272957 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2372  hypothetical protein  28.09 
 
 		 374 aa  68.2  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2621  monooxygenase, FAD-binding  27.55 
 
 		 388 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.684205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2584  monooxygenase, FAD-binding  29 
 
 		 400 aa  67.8  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.613825  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2242  hypothetical protein  26.67 
 
 		 379 aa  67.8  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2552  monooxygenase FAD-binding protein  26.17 
 
 		 376 aa  67.8  0.0000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4581  monooxygenase FAD-binding protein  27.84 
 
 		 399 aa  67.4  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.626069 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1206  hypothetical protein  26.96 
 
 		 417 aa  67.4  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_1611  zeaxanthin epoxidase (ABA1) (NPQ2)  25.94 
 
 		 429 aa  67.4  0.0000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.539309  normal  0.0529961 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0481  salicylate 1-monooxygenase  28.45 
 
 		 373 aa  67  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4129  monooxygenase FAD-binding protein  26.7 
 
 		 421 aa  67  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5073  Salicylate 1-monooxygenase  23.58 
 
 		 386 aa  66.6  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.926874  normal  0.172716 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1022  salicylate 1-monooxygenase  25.13 
 
 		 391 aa  66.2  0.0000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3698  hypothetical protein  25 
 
 		 417 aa  66.6  0.0000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0252348  normal  0.169871 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3586  salicylate 1-monooxygenase  25.79 
 
 		 427 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.942873 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4324  salicylate 1-monooxygenase  25.35 
 
 		 385 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.524787  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4042  salicylate 1-monooxygenase  25.35 
 
 		 385 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00369253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3483  monooxygenase FAD-binding  24.36 
 
 		 385 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147662 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5490  hypothetical protein  26.78 
 
 		 376 aa  64.7  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.263569  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1542  monooxygenase FAD-binding protein  23.66 
 
 		 374 aa  64.3  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0929471  normal  0.228138 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2693  monooxygenase FAD-binding  34.92 
 
 		 450 aa  64.7  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.433574  hitchhiker  0.000536484 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5387  hypothetical protein  26.77 
 
 		 420 aa  64.3  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0514  hypothetical protein  27.59 
 
 		 421 aa  63.5  0.000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.472933  normal  0.467939 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2509  monooxygenase, FAD-binding  32.98 
 
 		 450 aa  63.2  0.000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.389183  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3284  monooxygenase FAD-binding protein  25.71 
 
 		 393 aa  63.2  0.000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.289154 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4355  hypothetical protein  31.56 
 
 		 421 aa  63.2  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0233973  normal  0.534906 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0982  monooxygenase FAD-binding  33.33 
 
 		 399 aa  62.8  0.000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0183396 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0771  monooxygenase FAD-binding  31.76 
 
 		 380 aa  62.8  0.000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000429101 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50409  Salicylate hydroxylase (Salicylate 1-monooxygenase)  24.5 
 
 		 447 aa  62.4  0.00000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0406434 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5341  monooxygenase FAD-binding protein  28.93 
 
 		 418 aa  62  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3292  salicylate 1-monooxygenase  26.42 
 
 		 404 aa  62.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0110847 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3669  salicylate hydroxylase  26.22 
 
 		 400 aa  61.6  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1936  hypothetical protein  25.45 
 
 		 376 aa  62  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4602  monooxygenase FAD-binding  32.77 
 
 		 382 aa  61.6  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.296431  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2393  hypothetical protein  25.82 
 
 		 376 aa  62  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.142228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1117  monooxygenase, FAD-binding  27.61 
 
 		 399 aa  61.2  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0809  monooxygenase, FAD-binding  24.81 
 
 		 396 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.815643  normal  0.21546 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0310  monooxygenase FAD-binding protein  28.4 
 
 		 309 aa  60.8  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0496808  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56402  Salicylate hydroxylase (Salicylate 1-monooxygenase)  24.1 
 
 		 426 aa  60.8  0.00000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.476468  normal  0.198075 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3565  monooxygenase FAD-binding  27.15 
 
 		 384 aa  60.1  0.00000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4547  monooxygenase FAD-binding  25.07 
 
 		 385 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.326108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1154  monooxygenase, FAD-binding  28.24 
 
 		 412 aa  60.1  0.00000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>