230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4899 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_4899  hypothetical protein  100 
 
 
396 aa  802    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5706  hypothetical protein  40.32 
 
 
401 aa  236  6e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0755393 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0592  hypothetical protein  39.95 
 
 
394 aa  226  5.0000000000000005e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1082  hypothetical protein  36.97 
 
 
380 aa  219  6e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1082  hypothetical protein  37.23 
 
 
380 aa  218  1e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5501  hypothetical protein  37.99 
 
 
355 aa  216  5e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.9082  normal  0.091793 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2392  hypothetical protein  38.52 
 
 
382 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4959  hypothetical protein  34.17 
 
 
374 aa  211  2e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.128742 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0795  hypothetical protein  37.06 
 
 
390 aa  209  5e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.921964 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1493  hypothetical protein  37.06 
 
 
380 aa  207  3e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6336  hypothetical protein  37.06 
 
 
380 aa  207  3e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4947  hypothetical protein  35.39 
 
 
390 aa  207  4e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.648001 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7002  hypothetical protein  36.47 
 
 
380 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00600208 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5646  hypothetical protein  34.69 
 
 
407 aa  202  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.419878  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01683  hypothetical protein  38.77 
 
 
397 aa  198  2.0000000000000003e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3909  hypothetical protein  36.44 
 
 
414 aa  190  4e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0793599 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3464  hypothetical protein  32.96 
 
 
374 aa  189  5e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.803329  normal  0.0415669 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0544  hypothetical protein  36.39 
 
 
373 aa  183  5.0000000000000004e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3158  hypothetical protein  35.03 
 
 
417 aa  178  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2954  hypothetical protein  35.36 
 
 
396 aa  177  4e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.235474  hitchhiker  0.00230621 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4962  hypothetical protein  30.89 
 
 
408 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.42035  normal  0.249552 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5851  hypothetical protein  36.1 
 
 
405 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.3306  hitchhiker  0.00183506 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5187  monooxygenase FAD-binding  35.51 
 
 
421 aa  95.1  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.983717 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4040  salicylate 1-monooxygenase  28.9 
 
 
404 aa  93.6  5e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4498  salicylate 1-monooxygenase  27.92 
 
 
422 aa  89.4  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1231  salicylate 1-monooxygenase  29.43 
 
 
404 aa  86.7  6e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.592071  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4033  monooxygenase FAD-binding  28.21 
 
 
404 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.115519 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1784  monooxygenase, FAD-binding  26.91 
 
 
410 aa  80.1  0.00000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4031  DNA mismatch endonuclease Vsr  26.55 
 
 
404 aa  79.7  0.00000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2005  hypothetical protein  20.76 
 
 
377 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00436005  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7773  monooxygenase FAD-binding  27.98 
 
 
374 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6277  monooxygenase FAD-binding  25.87 
 
 
405 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.146167  normal  0.672282 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0336  monooxygenase FAD-binding protein  25.82 
 
 
412 aa  71.2  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.214027  normal  0.627257 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2526  salicylate 1-monooxygenase  25.2 
 
 
396 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.066083 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3996  hypothetical protein  26.82 
 
 
417 aa  69.7  0.00000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1206  hypothetical protein  29.63 
 
 
417 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4211  monooxygenase, FAD-binding  25.43 
 
 
382 aa  67.4  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.815591  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2257  hypothetical protein  23.76 
 
 
378 aa  67.8  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.472155 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5387  hypothetical protein  26.06 
 
 
420 aa  65.9  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1154  monooxygenase, FAD-binding  27.86 
 
 
412 aa  65.5  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3637  hypothetical protein  28.65 
 
 
416 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.529402  normal  0.0728154 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1542  monooxygenase FAD-binding protein  25.38 
 
 
374 aa  63.9  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0929471  normal  0.228138 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5319  monooxygenase FAD-binding protein  31.58 
 
 
390 aa  64.3  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8153  monooxygenase FAD-binding protein  23.77 
 
 
424 aa  63.5  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.976532 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5899  monooxygenase FAD-binding  27.01 
 
 
398 aa  63.5  0.000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00196665 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2318  monooxygenase FAD-binding  24.81 
 
 
385 aa  62.8  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.694664  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3292  salicylate 1-monooxygenase  27.22 
 
 
404 aa  62.4  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0110847 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4581  monooxygenase FAD-binding protein  23.7 
 
 
399 aa  62.8  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.626069 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2131  salicylate 1-monooxygenase  25.92 
 
 
400 aa  61.6  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1110  monooxygenase FAD-binding  26.79 
 
 
389 aa  61.2  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.7504  normal  0.659993 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_31126  Salicylate hydroxylase (Salicylate 1-monooxygenase)  25.89 
 
 
411 aa  61.2  0.00000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0923  monooxygenase FAD-binding  25.97 
 
 
412 aa  61.2  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.264093 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0310  monooxygenase FAD-binding protein  28.14 
 
 
309 aa  60.1  0.00000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0496808  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2680  monooxygenase, FAD-binding  23.95 
 
 
384 aa  60.1  0.00000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.156834  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1987  hypothetical protein  20.29 
 
 
377 aa  59.7  0.00000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000746962  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3565  monooxygenase FAD-binding  25.5 
 
 
384 aa  59.7  0.00000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2199  hypothetical protein  24.59 
 
 
413 aa  59.7  0.00000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0226443  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3927  salicylate 1-monooxygenase  22.86 
 
 
385 aa  59.7  0.00000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.567277  normal  0.0279633 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1969  hypothetical protein  19.88 
 
 
377 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0438709  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0229  monooxygenase FAD-binding  25.35 
 
 
409 aa  58.9  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.297351 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5278  monooxygenase, FAD-binding  22.93 
 
 
395 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.630865 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1214  hypothetical protein  26.74 
 
 
414 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3149  salicylate 1-monooxygenase  25.82 
 
 
398 aa  58.9  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.136472  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6042  monooxygenase FAD-binding  24.64 
 
 
378 aa  58.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0233658  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2849  hypothetical protein  27.01 
 
 
414 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1853  monooxygenase FAD-binding  23.12 
 
 
385 aa  57.8  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0991  salicylate 1-monooxygenase  24.53 
 
 
397 aa  58.2  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0622996  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0391  hypothetical protein  25.97 
 
 
440 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1585  hypothetical protein  25.97 
 
 
440 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.825888  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1770  hypothetical protein  25.97 
 
 
440 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2974  hypothetical protein  26.2 
 
 
414 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.556187  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0439  hypothetical protein  25.97 
 
 
440 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2927  hypothetical protein  27.76 
 
 
424 aa  57  0.0000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.27992  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3960  monooxygenase, FAD-binding  28.02 
 
 
388 aa  57.4  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4094  FAD dependent oxidoreductase  26.95 
 
 
413 aa  57  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.232539  normal  0.561641 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0321  hypothetical protein  25.74 
 
 
414 aa  57.4  0.0000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.372833  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2393  hypothetical protein  24.87 
 
 
376 aa  56.6  0.0000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.142228  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4891  monooxygenase, FAD-binding  28.19 
 
 
402 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.292821 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56402  Salicylate hydroxylase (Salicylate 1-monooxygenase)  24.45 
 
 
426 aa  56.6  0.0000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.476468  normal  0.198075 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3311  monooxygenase, FAD-binding  23.18 
 
 
401 aa  56.2  0.0000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2116  monooxygenase FAD-binding protein  23.68 
 
 
384 aa  55.8  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.400145  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4207  salicylate 1-monooxygenase  26.79 
 
 
406 aa  55.8  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.880254  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2311  monooxygenase FAD-binding  22.8 
 
 
383 aa  55.5  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0712  hypothetical protein  25.41 
 
 
371 aa  55.1  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0213  salicylate 1-monooxygenase (NahW)  26.03 
 
 
403 aa  55.5  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00584161  normal  0.918812 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2160  monooxygenase FAD-binding  27.35 
 
 
395 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4129  monooxygenase FAD-binding protein  25.58 
 
 
421 aa  55.5  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4063  monooxygenase FAD-binding protein  25.56 
 
 
402 aa  55.5  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.69418 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0546  monooxygenase, FAD-binding  24.46 
 
 
373 aa  55.1  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01821  FAD-binding monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G07040)  24.35 
 
 
423 aa  54.7  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00520599  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5490  hypothetical protein  24.26 
 
 
376 aa  54.7  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.263569  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2159  monooxygenase FAD-binding  24.22 
 
 
402 aa  54.7  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.429326  normal  0.511267 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3586  salicylate 1-monooxygenase  22.7 
 
 
427 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.942873 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2584  monooxygenase, FAD-binding  27.6 
 
 
400 aa  53.5  0.000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.613825  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4386  hypothetical protein  26.56 
 
 
441 aa  53.5  0.000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3990  monooxygenase FAD-binding  23.86 
 
 
415 aa  53.1  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.842303  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1633  monooxygenase FAD-binding  25.24 
 
 
410 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.719976  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1561  hypothetical protein  30.32 
 
 
377 aa  52.8  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3428  monooxygenase, FAD-binding  27.91 
 
 
372 aa  52.8  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5073  Salicylate 1-monooxygenase  22.94 
 
 
386 aa  52  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.926874  normal  0.172716 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>