More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3909 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_3909  hypothetical protein  100 
 
 		 414 aa  801    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0793599 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3158  hypothetical protein  80.45 
 
 		 417 aa  593  1e-168  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4962  hypothetical protein  55.31 
 
 		 408 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.42035  normal  0.249552 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5646  hypothetical protein  53.63 
 
 		 407 aa  380  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.419878  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5851  hypothetical protein  55.7 
 
 		 405 aa  346  6e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.3306  hitchhiker  0.00183506 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2954  hypothetical protein  47.43 
 
 		 396 aa  290  2e-77  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.235474  hitchhiker  0.00230621 
 
 
-
 
NC_003296  RS01683  hypothetical protein  47.2 
 
 		 397 aa  288  1e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4947  hypothetical protein  45.25 
 
 		 390 aa  258  1e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.648001 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0795  hypothetical protein  45.57 
 
 		 390 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.921964 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5501  hypothetical protein  42.22 
 
 		 355 aa  248  1e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.9082  normal  0.091793 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1082  hypothetical protein  42.05 
 
 		 380 aa  244  3e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1082  hypothetical protein  42.33 
 
 		 380 aa  242  1e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2392  hypothetical protein  42.41 
 
 		 382 aa  238  1e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1493  hypothetical protein  44.21 
 
 		 380 aa  238  2e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6336  hypothetical protein  44.21 
 
 		 380 aa  238  2e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5706  hypothetical protein  39.8 
 
 		 401 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0755393 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0544  hypothetical protein  42.82 
 
 		 373 aa  232  9e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7002  hypothetical protein  43.32 
 
 		 380 aa  232  1e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00600208 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4959  hypothetical protein  36.68 
 
 		 374 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.128742 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3464  hypothetical protein  34.73 
 
 		 374 aa  197  3e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.803329  normal  0.0415669 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4899  hypothetical protein  36.44 
 
 		 396 aa  188  2e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0592  hypothetical protein  37.33 
 
 		 394 aa  180  4e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5187  monooxygenase FAD-binding  34.91 
 
 		 421 aa  134  3.9999999999999996e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.983717 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1889  hypothetical protein  23.16 
 
 		 374 aa  98.6  2e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2257  hypothetical protein  27.46 
 
 		 378 aa  96.7  7e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.472155 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4581  monooxygenase FAD-binding protein  30.16 
 
 		 399 aa  92.8  9e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.626069 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2005  hypothetical protein  30.27 
 
 		 377 aa  91.3  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00436005  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7773  monooxygenase FAD-binding  30.29 
 
 		 374 aa  90.1  6e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1969  hypothetical protein  24.54 
 
 		 377 aa  89.7  8e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0438709  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3294  monooxygenase FAD-binding protein  28.35 
 
 		 388 aa  89.7  8e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0802651  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2339  monooxygenase FAD-binding  28.86 
 
 		 388 aa  88.2  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000167175  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5278  monooxygenase, FAD-binding  27.13 
 
 		 395 aa  89  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.630865 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2710  monooxygenase FAD-binding  25.06 
 
 		 392 aa  86.7  7e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1528  monooxygenase FAD-binding  28.31 
 
 		 362 aa  86.3  9e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.392805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4013  monooxygenase FAD-binding  26.1 
 
 		 362 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0834664  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3968  monooxygenase FAD-binding  26.77 
 
 		 362 aa  84  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1987  hypothetical protein  30.11 
 
 		 377 aa  83.6  0.000000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000746962  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3284  monooxygenase FAD-binding protein  27.91 
 
 		 393 aa  82.4  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.289154 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5319  monooxygenase FAD-binding protein  27.95 
 
 		 390 aa  82  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1853  monooxygenase FAD-binding  27.64 
 
 		 385 aa  80.5  0.00000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2230  hypothetical protein  30.06 
 
 		 377 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000757274  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4211  monooxygenase, FAD-binding  29.43 
 
 		 382 aa  80.1  0.00000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.815591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7133  monooxygenase, FAD-binding  31.64 
 
 		 356 aa  79.7  0.00000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1206  hypothetical protein  30.84 
 
 		 417 aa  79.7  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0712  hypothetical protein  25.93 
 
 		 371 aa  79.3  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4040  salicylate 1-monooxygenase  29.92 
 
 		 404 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0213  salicylate 1-monooxygenase (NahW)  28.49 
 
 		 403 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00584161  normal  0.918812 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3996  hypothetical protein  29.14 
 
 		 417 aa  77  0.0000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1762  monooxygenase FAD-binding  27.7 
 
 		 384 aa  77.4  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.638414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3637  hypothetical protein  30.55 
 
 		 416 aa  77  0.0000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.529402  normal  0.0728154 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5557  FAD-dependent oxidoreductase  27.13 
 
 		 367 aa  75.9  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.633311 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4777  monooxygenase FAD-binding protein  27.52 
 
 		 496 aa  75.9  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.712751  hitchhiker  0.00463722 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3565  monooxygenase FAD-binding  26.01 
 
 		 384 aa  76.3  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2962  monooxygenase FAD-binding protein  26.94 
 
 		 397 aa  75.9  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5490  hypothetical protein  25.06 
 
 		 376 aa  75.9  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.263569  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4033  monooxygenase FAD-binding  29.44 
 
 		 404 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.115519 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4207  salicylate 1-monooxygenase  28.77 
 
 		 406 aa  75.1  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.880254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2242  hypothetical protein  27.08 
 
 		 379 aa  75.5  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1542  monooxygenase FAD-binding protein  24.02 
 
 		 374 aa  75.1  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0929471  normal  0.228138 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3927  salicylate 1-monooxygenase  27.22 
 
 		 385 aa  75.5  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.567277  normal  0.0279633 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4031  DNA mismatch endonuclease Vsr  28 
 
 		 404 aa  74.3  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1486  monooxygenase FAD-binding protein  28.61 
 
 		 408 aa  74.7  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.528879  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2068  salicylate 1-monooxygenase  27.65 
 
 		 385 aa  73.6  0.000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.341777 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1231  salicylate 1-monooxygenase  28.8 
 
 		 404 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.592071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6537  monooxygenase, FAD-binding protein  26.49 
 
 		 392 aa  72.8  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0203356  normal  0.0154804 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4891  monooxygenase, FAD-binding  33.7 
 
 		 402 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.292821 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1022  salicylate 1-monooxygenase  27.25 
 
 		 391 aa  72  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4002  monooxygenase FAD-binding  30.91 
 
 		 376 aa  71.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3957  monooxygenase FAD-binding  30.91 
 
 		 376 aa  71.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2927  hypothetical protein  27.07 
 
 		 424 aa  71.2  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.27992  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3428  monooxygenase, FAD-binding  27.58 
 
 		 372 aa  71.2  0.00000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4498  salicylate 1-monooxygenase  28.95 
 
 		 422 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4138  monooxygenase, FAD-binding protein  28.46 
 
 		 408 aa  70.9  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.145497  normal  0.0296411 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2318  monooxygenase FAD-binding  27.94 
 
 		 385 aa  70.5  0.00000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.694664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5812  monooxygenase, FAD-binding protein  27.44 
 
 		 408 aa  70.5  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0698086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4378  monooxygenase FAD-binding  31.4 
 
 		 420 aa  70.1  0.00000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.760367 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8535  monooxygenase FAD-binding  31.49 
 
 		 384 aa  70.1  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0157087  hitchhiker  0.0015439 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0991  salicylate 1-monooxygenase  27.66 
 
 		 397 aa  69.7  0.00000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0622996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0809  monooxygenase, FAD-binding  27.25 
 
 		 396 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.815643  normal  0.21546 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4094  FAD dependent oxidoreductase  28.28 
 
 		 413 aa  68.9  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.232539  normal  0.561641 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09400  hypothetical protein  27.48 
 
 		 402 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2552  monooxygenase FAD-binding protein  26.65 
 
 		 376 aa  68.6  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3140  hypothetical protein  23.9 
 
 		 376 aa  68.6  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6042  monooxygenase FAD-binding  25.46 
 
 		 378 aa  68.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0233658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0336  monooxygenase FAD-binding protein  23.8 
 
 		 412 aa  67.8  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.214027  normal  0.627257 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02033  conserved hypothetical protein  24.44 
 
 		 435 aa  67.8  0.0000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.637061 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3224  monooxygenase FAD-binding  34.52 
 
 		 399 aa  67  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.494892 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1462  monooxygenase FAD-binding  28.15 
 
 		 390 aa  66.6  0.0000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000001589  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02114  salicylate hydroxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G05260)  24.2 
 
 		 448 aa  66.2  0.0000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0881  hypothetical protein  27.48 
 
 		 402 aa  66.2  0.0000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.200049  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4971  monooxygenase FAD-binding  31.55 
 
 		 384 aa  66.2  0.0000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.415719  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2372  hypothetical protein  26.9 
 
 		 374 aa  66.2  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3669  salicylate hydroxylase  26.09 
 
 		 400 aa  66.2  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2329  hypothetical protein  26.9 
 
 		 374 aa  66.2  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2311  monooxygenase FAD-binding  27.06 
 
 		 383 aa  65.9  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2199  hypothetical protein  26.03 
 
 		 413 aa  66.2  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0226443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2729  hypothetical protein  25.97 
 
 		 415 aa  65.5  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1633  monooxygenase FAD-binding  27.64 
 
 		 410 aa  66.2  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.719976  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2253  monooxygenase FAD-binding protein  25.35 
 
 		 401 aa  65.1  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6277  monooxygenase FAD-binding  29.74 
 
 		 405 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.146167  normal  0.672282 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>