More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5851 on replicon NC_010510
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010510  Mrad2831_5851  hypothetical protein  100 
 
 
405 aa  773    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.3306  hitchhiker  0.00183506 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3158  hypothetical protein  58.99 
 
 
417 aa  375  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3909  hypothetical protein  55.7 
 
 
414 aa  358  7e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0793599 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4962  hypothetical protein  47.99 
 
 
408 aa  333  3e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.42035  normal  0.249552 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5646  hypothetical protein  48.26 
 
 
407 aa  323  3e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.419878  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2954  hypothetical protein  45.07 
 
 
396 aa  250  3e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.235474  hitchhiker  0.00230621 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4947  hypothetical protein  40.11 
 
 
390 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.648001 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5706  hypothetical protein  39.84 
 
 
401 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0755393 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0795  hypothetical protein  40.66 
 
 
390 aa  220  3e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.921964 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5501  hypothetical protein  38.24 
 
 
355 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.9082  normal  0.091793 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2392  hypothetical protein  39.34 
 
 
382 aa  211  3e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0544  hypothetical protein  39.89 
 
 
373 aa  208  2e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01683  hypothetical protein  39.52 
 
 
397 aa  205  1e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1082  hypothetical protein  38.96 
 
 
380 aa  204  3e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3464  hypothetical protein  35.2 
 
 
374 aa  202  9e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.803329  normal  0.0415669 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1082  hypothetical protein  38.48 
 
 
380 aa  202  9e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1493  hypothetical protein  41.67 
 
 
380 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6336  hypothetical protein  41.67 
 
 
380 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7002  hypothetical protein  40.8 
 
 
380 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00600208 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4959  hypothetical protein  35.15 
 
 
374 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.128742 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4899  hypothetical protein  36 
 
 
396 aa  179  1e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0592  hypothetical protein  39.16 
 
 
394 aa  179  1e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5187  monooxygenase FAD-binding  34.25 
 
 
421 aa  124  4e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.983717 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2257  hypothetical protein  28.36 
 
 
378 aa  110  5e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.472155 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2005  hypothetical protein  26.1 
 
 
377 aa  101  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00436005  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0213  salicylate 1-monooxygenase (NahW)  29.46 
 
 
403 aa  100  6e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00584161  normal  0.918812 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01380  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  33.07 
 
 
378 aa  97.1  5e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3586  salicylate 1-monooxygenase  30.53 
 
 
427 aa  96.7  6e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.942873 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1987  hypothetical protein  26.07 
 
 
377 aa  95.5  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000746962  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0813  monooxygenase, FAD-binding  26.95 
 
 
377 aa  92  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3483  monooxygenase FAD-binding  29 
 
 
385 aa  89.7  8e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00147662 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2621  monooxygenase, FAD-binding  31.68 
 
 
388 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.684205  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1889  hypothetical protein  24.27 
 
 
374 aa  88.2  2e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1969  hypothetical protein  24.26 
 
 
377 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0438709  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4324  salicylate 1-monooxygenase  29 
 
 
385 aa  87.4  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.524787  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4042  salicylate 1-monooxygenase  29 
 
 
385 aa  87.4  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00369253  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3968  monooxygenase FAD-binding  27.62 
 
 
362 aa  86.7  8e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4013  monooxygenase FAD-binding  27.62 
 
 
362 aa  86.3  9e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0834664  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1784  monooxygenase, FAD-binding  31.04 
 
 
410 aa  85.9  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0809  monooxygenase, FAD-binding  27.5 
 
 
396 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.815643  normal  0.21546 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2230  hypothetical protein  24.93 
 
 
377 aa  83.6  0.000000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000757274  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1528  monooxygenase FAD-binding  29.41 
 
 
362 aa  83.6  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.392805  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4547  monooxygenase FAD-binding  28.02 
 
 
385 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.326108  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2480  monooxygenase FAD-binding  31.01 
 
 
395 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1893  monooxygenase, FAD-binding  27.61 
 
 
382 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7133  monooxygenase, FAD-binding  30.54 
 
 
356 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0712  hypothetical protein  27.84 
 
 
371 aa  81.6  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2837  monooxygenase FAD-binding  29.23 
 
 
378 aa  82  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5490  hypothetical protein  29.17 
 
 
376 aa  81.3  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.263569  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7773  monooxygenase FAD-binding  29.25 
 
 
374 aa  81.3  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3466  monooxygenase, FAD-binding  28.72 
 
 
392 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4900  monooxygenase, FAD-binding  28.72 
 
 
392 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.99121 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0896  monooxygenase, FAD-binding  31.81 
 
 
389 aa  79.7  0.00000000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6042  monooxygenase FAD-binding  25.82 
 
 
378 aa  79  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0233658  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2318  monooxygenase FAD-binding  28.26 
 
 
385 aa  79  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.694664  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0991  salicylate 1-monooxygenase  28.23 
 
 
397 aa  77.8  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0622996  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5386  monooxygenase FAD-binding  28.46 
 
 
392 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.336288 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1117  monooxygenase, FAD-binding  31.13 
 
 
399 aa  77.8  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2160  monooxygenase FAD-binding  29.95 
 
 
395 aa  77.4  0.0000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3944  salicylate hydroxylase  26.8 
 
 
382 aa  77  0.0000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0448295  normal  0.412797 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5278  monooxygenase, FAD-binding  27.03 
 
 
395 aa  77  0.0000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.630865 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2515  salicylate 1-monooxygenase  25.95 
 
 
386 aa  75.9  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.193433  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1853  monooxygenase FAD-binding  25.68 
 
 
385 aa  76.3  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2526  salicylate 1-monooxygenase  25.81 
 
 
396 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.066083 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3960  monooxygenase, FAD-binding  32.34 
 
 
388 aa  76.3  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3927  salicylate 1-monooxygenase  25.41 
 
 
385 aa  75.9  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.567277  normal  0.0279633 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2393  hypothetical protein  29.13 
 
 
376 aa  75.5  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.142228  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2311  monooxygenase FAD-binding  25.26 
 
 
383 aa  75.1  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3579  monooxygenase FAD-binding  26.81 
 
 
382 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.817981 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2203  monooxygenase FAD-binding  31.75 
 
 
395 aa  75.5  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0546  monooxygenase, FAD-binding  29.16 
 
 
373 aa  75.5  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3428  monooxygenase, FAD-binding  27.75 
 
 
372 aa  74.3  0.000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02114  salicylate hydroxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G05260)  23.68 
 
 
448 aa  74.3  0.000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4828  hypothetical protein  30.1 
 
 
376 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.454319 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4581  monooxygenase FAD-binding protein  30.29 
 
 
399 aa  74.7  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.626069 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2140  monooxygenase FAD-binding  26.4 
 
 
382 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0383787 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2729  hypothetical protein  28.91 
 
 
415 aa  74.3  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4254  monooxygenase FAD-binding  26.62 
 
 
392 aa  74.7  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4129  monooxygenase FAD-binding protein  28.21 
 
 
421 aa  73.9  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1885  putative salicylate hydroxylase  29.95 
 
 
389 aa  74.3  0.000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.122899  normal  0.226674 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1762  monooxygenase FAD-binding  28.12 
 
 
384 aa  73.9  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.638414  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1231  salicylate 1-monooxygenase  27.56 
 
 
404 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.592071  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4031  DNA mismatch endonuclease Vsr  27.47 
 
 
404 aa  72.8  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3565  monooxygenase FAD-binding  30.1 
 
 
384 aa  72.4  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_1611  zeaxanthin epoxidase (ABA1) (NPQ2)  26.53 
 
 
429 aa  72.4  0.00000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.539309  normal  0.0529961 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5557  FAD-dependent oxidoreductase  29.95 
 
 
367 aa  72.8  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.633311 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3463  monooxygenase FAD-binding protein  29.82 
 
 
376 aa  72.4  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.039982  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4040  salicylate 1-monooxygenase  27.73 
 
 
404 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0336  monooxygenase FAD-binding protein  25.67 
 
 
412 aa  71.6  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.214027  normal  0.627257 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2962  monooxygenase FAD-binding protein  26.11 
 
 
397 aa  71.6  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2710  monooxygenase FAD-binding  24.94 
 
 
392 aa  71.2  0.00000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0771  monooxygenase FAD-binding  26.94 
 
 
380 aa  70.9  0.00000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000429101 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2068  salicylate 1-monooxygenase  27.76 
 
 
385 aa  70.9  0.00000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.341777 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0514  hypothetical protein  28.18 
 
 
421 aa  70.9  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.472933  normal  0.467939 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1093  monooxygenase FAD-binding  30.29 
 
 
408 aa  70.9  0.00000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0291534  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0096  monooxygenase FAD-binding  29.41 
 
 
388 aa  70.9  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0544698 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1565  monooxygenase FAD-binding  28.46 
 
 
384 aa  70.5  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.156985 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5423  monooxygenase FAD-binding  24.79 
 
 
382 aa  70.1  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.224517  normal  0.231326 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09400  hypothetical protein  26.44 
 
 
402 aa  69.7  0.00000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4498  salicylate 1-monooxygenase  27.06 
 
 
422 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>