More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3463 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_3463  monooxygenase FAD-binding protein  100 
 
 
376 aa  738    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.039982  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2837  monooxygenase FAD-binding  59.14 
 
 
378 aa  416  9.999999999999999e-116  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2878  monooxygenase FAD-binding  57.49 
 
 
378 aa  402  1e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3517  monooxygenase, FAD-binding  52.14 
 
 
385 aa  348  7e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.623295  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3818  monooxygenase FAD-binding  50.28 
 
 
378 aa  306  5.0000000000000004e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.357574  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4844  monooxygenase, FAD-binding protein  44.78 
 
 
390 aa  246  4e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4474  salicylate hydroxylase protein  43.46 
 
 
377 aa  244  1.9999999999999999e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.102807 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0802  monooxygenase FAD-binding  43.42 
 
 
371 aa  237  3e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.615046  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1438  monooxygenase, FAD-binding  38.54 
 
 
413 aa  235  9e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00120206  hitchhiker  0.00122057 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3699  monooxygenase FAD-binding  44.56 
 
 
371 aa  218  2e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.442596  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5423  monooxygenase FAD-binding  36.65 
 
 
382 aa  213  5.999999999999999e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.224517  normal  0.231326 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4254  monooxygenase FAD-binding  33.94 
 
 
392 aa  211  1e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1924  monooxygenase; 2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase  37.22 
 
 
387 aa  198  2.0000000000000003e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.630677  normal  0.306888 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2326  monooxygenase FAD-binding protein  31.94 
 
 
388 aa  192  1e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000156334  normal  0.582922 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1277  monooxygenase FAD-binding  31.4 
 
 
381 aa  190  4e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1380  monooxygenase FAD-binding  41.44 
 
 
372 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.709095 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2826  monooxygenase, FAD-binding  30.81 
 
 
387 aa  179  4.999999999999999e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00129396  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08716  salicylate hydroxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G01050)  32.34 
 
 
415 aa  176  6e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA01280  conserved expressed protein  29.36 
 
 
442 aa  166  5.9999999999999996e-40  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5691  monooxygenase FAD-binding  29.86 
 
 
376 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09224  conserved hypothetical protein  28.15 
 
 
443 aa  140  4.999999999999999e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2823  monooxygenase, FAD-binding  27.78 
 
 
371 aa  132  1.0000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.091542  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0398  putative monooxygenase  37.5 
 
 
257 aa  117  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5278  monooxygenase, FAD-binding  30.93 
 
 
395 aa  95.5  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.630865 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3854  monooxygenase FAD-binding protein  29.7 
 
 
424 aa  94.7  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3565  monooxygenase FAD-binding  28.76 
 
 
384 aa  91.7  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4031  DNA mismatch endonuclease Vsr  30.79 
 
 
404 aa  87  5e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1885  putative salicylate hydroxylase  32.24 
 
 
389 aa  83.6  0.000000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.122899  normal  0.226674 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3295  monooxygenase FAD-binding protein  32.53 
 
 
379 aa  83.2  0.000000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.676341 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6537  monooxygenase, FAD-binding protein  29.41 
 
 
392 aa  80.1  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0203356  normal  0.0154804 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1039  putative oxidoreductase  29.89 
 
 
387 aa  79.3  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0582367  normal  0.0597058 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5335  FAD-dependent monooxygenase  30.03 
 
 
378 aa  78.6  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103313  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4063  monooxygenase FAD-binding protein  31.48 
 
 
402 aa  78.6  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.69418 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1285  monooxygenase, FAD-binding protein  30.4 
 
 
410 aa  75.9  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3294  monooxygenase FAD-binding protein  30.43 
 
 
388 aa  75.1  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0802651  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2036  monooxygenase FAD-binding  33.91 
 
 
388 aa  74.3  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06002  FAD-dependent monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00150)  26.56 
 
 
417 aa  73.9  0.000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.885397  normal  0.555833 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_92063  predicted protein  29.17 
 
 
509 aa  73.9  0.000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0115456  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1093  monooxygenase FAD-binding  30.16 
 
 
408 aa  72.4  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0291534  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_56492  zeaxanthin epoxidase  27.3 
 
 
557 aa  71.6  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.688102  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4602  monooxygenase FAD-binding  31.42 
 
 
382 aa  71.2  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.296431  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06750  conserved hypothetical protein  28.68 
 
 
447 aa  70.9  0.00000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.123632 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6278  monooxygenase FAD-binding  29.55 
 
 
393 aa  70.9  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.435986  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5650  monooxygenase FAD-binding  29.09 
 
 
416 aa  70.1  0.00000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.470651  normal  0.804587 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3524  monooxygenase FAD-binding protein  32.74 
 
 
401 aa  68.6  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.894226  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2526  salicylate 1-monooxygenase  28.84 
 
 
396 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.066083 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5584  monooxygenase FAD-binding protein  29.92 
 
 
401 aa  68.6  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4033  monooxygenase FAD-binding  28.53 
 
 
404 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.115519 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1719  monooxygenase FAD-binding protein  28.72 
 
 
402 aa  67.8  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.861582  normal  0.177423 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3284  monooxygenase FAD-binding protein  26.63 
 
 
393 aa  66.6  0.0000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.289154 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6042  monooxygenase FAD-binding  28.72 
 
 
378 aa  66.2  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0233658  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0896  monooxygenase, FAD-binding  30.38 
 
 
389 aa  66.2  0.0000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2393  hypothetical protein  27.76 
 
 
376 aa  65.5  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.142228  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1231  salicylate 1-monooxygenase  28.93 
 
 
404 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.592071  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5727  monooxygenase, FAD-binding  28.12 
 
 
364 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2318  monooxygenase FAD-binding  26.97 
 
 
385 aa  65.5  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.694664  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3936  monooxygenase FAD-binding protein  28.46 
 
 
455 aa  64.7  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.018551  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2962  monooxygenase FAD-binding protein  27.25 
 
 
397 aa  65.5  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5023  monooxygenase FAD-binding protein  28.97 
 
 
413 aa  65.1  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0712  hypothetical protein  27.32 
 
 
371 aa  65.1  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5851  hypothetical protein  29.82 
 
 
405 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.3306  hitchhiker  0.00183506 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0213  salicylate 1-monooxygenase (NahW)  28.15 
 
 
403 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00584161  normal  0.918812 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4164  putative monoxygenase  31.83 
 
 
415 aa  64.3  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0321225  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5437  monooxygenase, FAD-binding  28.12 
 
 
364 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.863729 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5812  monooxygenase, FAD-binding protein  29.97 
 
 
408 aa  64.3  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0698086  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5348  monooxygenase, FAD-binding protein  28.12 
 
 
360 aa  63.9  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.437085  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1893  monooxygenase, FAD-binding  27.63 
 
 
382 aa  63.9  0.000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4891  monooxygenase, FAD-binding  27.57 
 
 
402 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.292821 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2140  monooxygenase FAD-binding  27.24 
 
 
382 aa  63.9  0.000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0383787 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4040  salicylate 1-monooxygenase  28.77 
 
 
404 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2748  monooxygenase FAD-binding protein  30.1 
 
 
489 aa  63.9  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3944  salicylate hydroxylase  27.91 
 
 
382 aa  63.2  0.000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0448295  normal  0.412797 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2005  hypothetical protein  24.05 
 
 
377 aa  63.2  0.000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00436005  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4498  salicylate 1-monooxygenase  28.77 
 
 
422 aa  62.8  0.000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3579  monooxygenase FAD-binding  27.91 
 
 
382 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.817981 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1486  monooxygenase FAD-binding protein  29.45 
 
 
408 aa  62  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.528879  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4138  monooxygenase, FAD-binding protein  29.75 
 
 
408 aa  61.6  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.145497  normal  0.0296411 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27608  predicted protein  28.22 
 
 
971 aa  61.2  0.00000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000591044  normal  0.0770912 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2729  hypothetical protein  26.76 
 
 
415 aa  60.5  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0928  monooxygenase FAD-binding  30.32 
 
 
424 aa  60.8  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.607239  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4211  monooxygenase, FAD-binding  29.75 
 
 
382 aa  60.8  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.815591  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1542  monooxygenase FAD-binding protein  26.35 
 
 
374 aa  60.5  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0929471  normal  0.228138 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_88642  predicted protein  25.83 
 
 
1070 aa  60.1  0.00000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0132852 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0067  monooxygenase FAD-binding protein  29.68 
 
 
400 aa  60.1  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2116  monooxygenase FAD-binding protein  25 
 
 
384 aa  60.1  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.400145  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1253  monooxygenase, FAD-binding  28.15 
 
 
388 aa  60.1  0.00000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.420129  normal  0.229963 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2657  monooxygenase, FAD-binding  34.32 
 
 
377 aa  59.7  0.00000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.751067  normal  0.222603 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0982  monooxygenase FAD-binding  27.99 
 
 
369 aa  60.1  0.00000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.240273  decreased coverage  0.000117397 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0778  monooxygenase FAD-binding  29.12 
 
 
393 aa  59.7  0.00000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0373747  decreased coverage  0.000456942 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7773  monooxygenase FAD-binding  26.53 
 
 
374 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4581  monooxygenase FAD-binding protein  28.69 
 
 
399 aa  59.3  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.626069 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08588  conserved hypothetical protein  26.77 
 
 
541 aa  58.2  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28690  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  33.33 
 
 
387 aa  58.2  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2710  monooxygenase FAD-binding  25.33 
 
 
392 aa  58.2  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2424  monooxygenase FAD-binding protein  27.47 
 
 
393 aa  58.5  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.127723  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47310  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  31.25 
 
 
405 aa  58.2  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2189  Kynurenine 3-monooxygenase  26.06 
 
 
440 aa  57.8  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.953199  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1093  monooxygenase, FAD-binding  28.65 
 
 
369 aa  57.8  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.363504 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0096  monooxygenase FAD-binding  27.51 
 
 
388 aa  57.8  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0544698 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2656  putative salicylate hydroxylase (salicylate 1-monooxygenase)  28.45 
 
 
391 aa  57.4  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>