258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2392 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B2392  hypothetical protein  100 
 
 		 382 aa  766    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5501  hypothetical protein  80.91 
 
 		 355 aa  581  1.0000000000000001e-165  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.9082  normal  0.091793 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5706  hypothetical protein  70.6 
 
 		 401 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0755393 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4947  hypothetical protein  59.89 
 
 		 390 aa  410  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.648001 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0795  hypothetical protein  59.1 
 
 		 390 aa  409  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.921964 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1082  hypothetical protein  55.03 
 
 		 380 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1082  hypothetical protein  55.03 
 
 		 380 aa  397  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7002  hypothetical protein  52.94 
 
 		 380 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00600208 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1493  hypothetical protein  53.48 
 
 		 380 aa  368  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6336  hypothetical protein  53.48 
 
 		 380 aa  368  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01683  hypothetical protein  45.07 
 
 		 397 aa  272  7e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5646  hypothetical protein  37.74 
 
 		 407 aa  252  8.000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.419878  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4962  hypothetical protein  41.02 
 
 		 408 aa  247  2e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.42035  normal  0.249552 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3909  hypothetical protein  40.54 
 
 		 414 aa  238  2e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0793599 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3158  hypothetical protein  42.86 
 
 		 417 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3464  hypothetical protein  36.03 
 
 		 374 aa  223  4e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.803329  normal  0.0415669 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2954  hypothetical protein  40.67 
 
 		 396 aa  216  5.9999999999999996e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.235474  hitchhiker  0.00230621 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4899  hypothetical protein  38.52 
 
 		 396 aa  214  2.9999999999999995e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0544  hypothetical protein  38.61 
 
 		 373 aa  213  3.9999999999999995e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5851  hypothetical protein  39.02 
 
 		 405 aa  209  9e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.3306  hitchhiker  0.00183506 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4959  hypothetical protein  35.77 
 
 		 374 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.128742 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0592  hypothetical protein  34.34 
 
 		 394 aa  162  1e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5187  monooxygenase FAD-binding  28.88 
 
 		 421 aa  108  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.983717 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2257  hypothetical protein  31.02 
 
 		 378 aa  94  4e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.472155 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5319  monooxygenase FAD-binding protein  27.75 
 
 		 390 aa  91.7  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4211  monooxygenase, FAD-binding  26.54 
 
 		 382 aa  90.9  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.815591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4013  monooxygenase FAD-binding  25.2 
 
 		 362 aa  90.1  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0834664  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3968  monooxygenase FAD-binding  25.72 
 
 		 362 aa  90.1  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3927  salicylate 1-monooxygenase  27.84 
 
 		 385 aa  87  5e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.567277  normal  0.0279633 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3944  salicylate hydroxylase  27.05 
 
 		 382 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0448295  normal  0.412797 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3579  monooxygenase FAD-binding  26.75 
 
 		 382 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.817981 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2140  monooxygenase FAD-binding  26.97 
 
 		 382 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0383787 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1853  monooxygenase FAD-binding  27.25 
 
 		 385 aa  81.3  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1893  monooxygenase, FAD-binding  26.75 
 
 		 382 aa  80.5  0.00000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2526  salicylate 1-monooxygenase  26.74 
 
 		 396 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.066083 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2849  hypothetical protein  27.48 
 
 		 414 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_1611  zeaxanthin epoxidase (ABA1) (NPQ2)  26.45 
 
 		 429 aa  78.2  0.0000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.539309  normal  0.0529961 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0391  hypothetical protein  28.24 
 
 		 440 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1214  hypothetical protein  27.23 
 
 		 414 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1585  hypothetical protein  28.24 
 
 		 440 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.825888  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1770  hypothetical protein  28.24 
 
 		 440 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0439  hypothetical protein  28.24 
 
 		 440 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2974  hypothetical protein  28.24 
 
 		 414 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.556187  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6042  monooxygenase FAD-binding  26.36 
 
 		 378 aa  76.3  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0233658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0991  salicylate 1-monooxygenase  26.06 
 
 		 397 aa  75.5  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0622996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2311  monooxygenase FAD-binding  25.5 
 
 		 383 aa  75.9  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4602  monooxygenase FAD-binding  32.97 
 
 		 382 aa  75.5  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.296431  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7133  monooxygenase, FAD-binding  26.91 
 
 		 356 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1528  monooxygenase FAD-binding  23.39 
 
 		 362 aa  73.2  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.392805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2005  hypothetical protein  23.68 
 
 		 377 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00436005  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0213  salicylate 1-monooxygenase (NahW)  27.17 
 
 		 403 aa  72  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00584161  normal  0.918812 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2159  monooxygenase FAD-binding  28.49 
 
 		 402 aa  69.7  0.00000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.429326  normal  0.511267 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2199  hypothetical protein  24.18 
 
 		 413 aa  70.1  0.00000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0226443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3996  hypothetical protein  28.99 
 
 		 417 aa  69.3  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0336  monooxygenase FAD-binding protein  27.05 
 
 		 412 aa  69.3  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.214027  normal  0.627257 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5073  Salicylate 1-monooxygenase  26.19 
 
 		 386 aa  68.2  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.926874  normal  0.172716 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7773  monooxygenase FAD-binding  29.1 
 
 		 374 aa  68.9  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4581  monooxygenase FAD-binding protein  28.42 
 
 		 399 aa  68.6  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.626069 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3292  salicylate 1-monooxygenase  31.43 
 
 		 404 aa  68.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0110847 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5387  hypothetical protein  25.97 
 
 		 420 aa  68.6  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3483  monooxygenase FAD-binding  25.99 
 
 		 385 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147662 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4355  hypothetical protein  24.38 
 
 		 421 aa  67.8  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0233973  normal  0.534906 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0310  monooxygenase FAD-binding protein  31.82 
 
 		 309 aa  67.8  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0496808  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2621  monooxygenase, FAD-binding  27.13 
 
 		 388 aa  67.4  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.684205  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4324  salicylate 1-monooxygenase  25.92 
 
 		 385 aa  67  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.524787  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4042  salicylate 1-monooxygenase  25.92 
 
 		 385 aa  67  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00369253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0514  hypothetical protein  26.33 
 
 		 421 aa  66.2  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.472933  normal  0.467939 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3140  hypothetical protein  28.88 
 
 		 376 aa  66.2  0.0000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0813  monooxygenase, FAD-binding  27.09 
 
 		 377 aa  66.2  0.0000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1936  hypothetical protein  26.49 
 
 		 376 aa  65.5  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3960  monooxygenase, FAD-binding  31.11 
 
 		 388 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3601  salicylate 1-monooxygenase  25.52 
 
 		 402 aa  65.1  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.733205  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3662  monooxygenase, FAD-binding  25.47 
 
 		 395 aa  64.3  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.555838  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2339  monooxygenase FAD-binding  24.39 
 
 		 388 aa  64.3  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000167175  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1022  salicylate 1-monooxygenase  27.91 
 
 		 391 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6172  hypothetical protein  28.84 
 
 		 417 aa  64.3  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.272957 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4138  monooxygenase, FAD-binding protein  32.72 
 
 		 408 aa  63.5  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.145497  normal  0.0296411 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2515  salicylate 1-monooxygenase  24.57 
 
 		 386 aa  63.2  0.000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.193433  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4031  DNA mismatch endonuclease Vsr  27.89 
 
 		 404 aa  63.2  0.000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3149  salicylate 1-monooxygenase  29 
 
 		 398 aa  62.4  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.136472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4547  monooxygenase FAD-binding  24.79 
 
 		 385 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.326108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1154  monooxygenase, FAD-binding  28.4 
 
 		 412 aa  62.4  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3328  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  31.4 
 
 		 407 aa  62  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.150159  normal  0.347251 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4002  monooxygenase FAD-binding  27.27 
 
 		 376 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5557  FAD-dependent oxidoreductase  32.75 
 
 		 367 aa  62  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.633311 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5490  hypothetical protein  24.61 
 
 		 376 aa  61.6  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.263569  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3565  monooxygenase FAD-binding  23.67 
 
 		 384 aa  61.2  0.00000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2329  hypothetical protein  21.65 
 
 		 374 aa  61.2  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2372  hypothetical protein  21.65 
 
 		 374 aa  61.2  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3957  monooxygenase FAD-binding  27.27 
 
 		 376 aa  61.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0809  monooxygenase, FAD-binding  24.54 
 
 		 396 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.815643  normal  0.21546 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1889  hypothetical protein  21.28 
 
 		 374 aa  60.5  0.00000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2927  hypothetical protein  29.8 
 
 		 424 aa  60.1  0.00000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.27992  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0501  hypothetical protein  29.96 
 
 		 421 aa  60.1  0.00000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.458939 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2584  monooxygenase, FAD-binding  27.16 
 
 		 400 aa  60.1  0.00000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.613825  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2068  salicylate 1-monooxygenase  25.33 
 
 		 385 aa  58.9  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.341777 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5727  monooxygenase, FAD-binding  28.34 
 
 		 364 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2684  hypothetical protein  28.18 
 
 		 415 aa  58.2  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.552249  normal  0.307817 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3162  monooxygenase FAD-binding  23.21 
 
 		 387 aa  58.5  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5437  monooxygenase, FAD-binding  28.34 
 
 		 364 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.863729 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>