252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0592 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_0592  hypothetical protein  100 
 
 
394 aa  796    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4899  hypothetical protein  39.95 
 
 
396 aa  229  5e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4962  hypothetical protein  36.73 
 
 
408 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.42035  normal  0.249552 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3464  hypothetical protein  34.38 
 
 
374 aa  200  3.9999999999999996e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.803329  normal  0.0415669 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5646  hypothetical protein  35.56 
 
 
407 aa  199  5e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.419878  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3158  hypothetical protein  40.11 
 
 
417 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0544  hypothetical protein  35.79 
 
 
373 aa  187  3e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3909  hypothetical protein  37.33 
 
 
414 aa  186  5e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0793599 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5851  hypothetical protein  38.64 
 
 
405 aa  180  4e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.3306  hitchhiker  0.00183506 
 
 
-
 
NC_003296  RS01683  hypothetical protein  38.46 
 
 
397 aa  178  1e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4959  hypothetical protein  34.32 
 
 
374 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.128742 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5501  hypothetical protein  33.91 
 
 
355 aa  172  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.9082  normal  0.091793 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1082  hypothetical protein  36.09 
 
 
380 aa  169  7e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1082  hypothetical protein  35.81 
 
 
380 aa  168  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5706  hypothetical protein  34.73 
 
 
401 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0755393 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2392  hypothetical protein  34.34 
 
 
382 aa  162  7e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4947  hypothetical protein  34.25 
 
 
390 aa  161  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.648001 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7002  hypothetical protein  35.04 
 
 
380 aa  159  6e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00600208 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2954  hypothetical protein  34.76 
 
 
396 aa  159  7e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.235474  hitchhiker  0.00230621 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0795  hypothetical protein  33.89 
 
 
390 aa  157  4e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.921964 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1493  hypothetical protein  34.76 
 
 
380 aa  155  8e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6336  hypothetical protein  34.76 
 
 
380 aa  155  8e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5187  monooxygenase FAD-binding  31.15 
 
 
421 aa  97.8  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.983717 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0336  monooxygenase FAD-binding protein  29.81 
 
 
412 aa  94  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.214027  normal  0.627257 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4040  salicylate 1-monooxygenase  27.27 
 
 
404 aa  93.2  8e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4498  salicylate 1-monooxygenase  27.01 
 
 
422 aa  91.3  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3968  monooxygenase FAD-binding  26.61 
 
 
362 aa  86.7  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1231  salicylate 1-monooxygenase  26.23 
 
 
404 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.592071  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4013  monooxygenase FAD-binding  27.01 
 
 
362 aa  84  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0834664  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4033  monooxygenase FAD-binding  26.3 
 
 
404 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.115519 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2257  hypothetical protein  26.63 
 
 
378 aa  82  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.472155 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2849  hypothetical protein  30.08 
 
 
414 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1214  hypothetical protein  29.82 
 
 
414 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2974  hypothetical protein  30.08 
 
 
414 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.556187  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0439  hypothetical protein  29.37 
 
 
440 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0391  hypothetical protein  29.37 
 
 
440 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1585  hypothetical protein  29.37 
 
 
440 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.825888  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1770  hypothetical protein  29.37 
 
 
440 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1110  monooxygenase FAD-binding  28.46 
 
 
389 aa  80.1  0.00000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.7504  normal  0.659993 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2068  salicylate 1-monooxygenase  27.76 
 
 
385 aa  79  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.341777 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1784  monooxygenase, FAD-binding  27.27 
 
 
410 aa  78.2  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1528  monooxygenase FAD-binding  25.72 
 
 
362 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.392805  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6277  monooxygenase FAD-binding  25.84 
 
 
405 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.146167  normal  0.672282 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4031  DNA mismatch endonuclease Vsr  25.93 
 
 
404 aa  76.6  0.0000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5278  monooxygenase, FAD-binding  27.25 
 
 
395 aa  76.6  0.0000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.630865 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5727  monooxygenase, FAD-binding  27.58 
 
 
364 aa  76.6  0.0000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3996  hypothetical protein  28.25 
 
 
417 aa  76.3  0.0000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0514  hypothetical protein  28.05 
 
 
421 aa  75.9  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.472933  normal  0.467939 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5437  monooxygenase, FAD-binding  27.97 
 
 
364 aa  76.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.863729 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4581  monooxygenase FAD-binding protein  28.96 
 
 
399 aa  75.9  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.626069 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4129  monooxygenase FAD-binding protein  27.25 
 
 
421 aa  74.3  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2318  monooxygenase FAD-binding  26.8 
 
 
385 aa  74.3  0.000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.694664  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06742  salicylate hydroxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00590)  25.27 
 
 
697 aa  73.6  0.000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.00748094 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5348  monooxygenase, FAD-binding protein  27.81 
 
 
360 aa  73.2  0.000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.437085  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2199  hypothetical protein  28.3 
 
 
413 aa  73.2  0.000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0226443  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2515  salicylate 1-monooxygenase  28.69 
 
 
386 aa  72.4  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.193433  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2005  hypothetical protein  25.13 
 
 
377 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00436005  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3565  monooxygenase FAD-binding  26.8 
 
 
384 aa  71.6  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0213  salicylate 1-monooxygenase (NahW)  26.87 
 
 
403 aa  72  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00584161  normal  0.918812 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3294  monooxygenase FAD-binding protein  26.49 
 
 
388 aa  72  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0802651  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3586  salicylate 1-monooxygenase  24.87 
 
 
427 aa  70.5  0.00000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.942873 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02114  salicylate hydroxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G05260)  24.44 
 
 
448 aa  70.1  0.00000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2410  salicylate hydroxylase  26.04 
 
 
397 aa  69.7  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.228446  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2365  salicylate hydroxylase  26.04 
 
 
397 aa  69.7  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.602992  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2321  salicylate hydroxylase  26.04 
 
 
397 aa  69.7  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3483  monooxygenase FAD-binding  27.69 
 
 
385 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00147662 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5319  monooxygenase FAD-binding protein  32.49 
 
 
390 aa  69.3  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3698  hypothetical protein  26.97 
 
 
417 aa  68.9  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0252348  normal  0.169871 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2414  salicylate hydroxylase  26.04 
 
 
397 aa  68.6  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.285012  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2522  salicylate hydroxylase  25.66 
 
 
397 aa  68.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4324  salicylate 1-monooxygenase  27.69 
 
 
385 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.524787  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09400  hypothetical protein  27.42 
 
 
402 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4042  salicylate 1-monooxygenase  27.69 
 
 
385 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00369253  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4547  monooxygenase FAD-binding  27.08 
 
 
385 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.326108  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2140  monooxygenase FAD-binding  27.3 
 
 
382 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0383787 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1987  hypothetical protein  27.27 
 
 
377 aa  67.8  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000746962  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0881  hypothetical protein  28.2 
 
 
402 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.200049  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0321  hypothetical protein  28.23 
 
 
414 aa  67.4  0.0000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.372833  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2710  monooxygenase FAD-binding  24.63 
 
 
392 aa  67  0.0000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2311  monooxygenase FAD-binding  27.17 
 
 
383 aa  66.6  0.0000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3267  salicylate hydroxylase  24.53 
 
 
397 aa  66.6  0.0000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.128222 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2172  monooxygenase, FAD-binding  23.4 
 
 
413 aa  66.2  0.0000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0853287 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1889  hypothetical protein  24.25 
 
 
374 aa  65.9  0.000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1969  hypothetical protein  26.2 
 
 
377 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0438709  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0991  salicylate 1-monooxygenase  27.17 
 
 
397 aa  65.5  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0622996  normal 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_1611  zeaxanthin epoxidase (ABA1) (NPQ2)  25.25 
 
 
429 aa  65.1  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.539309  normal  0.0529961 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2230  hypothetical protein  26.23 
 
 
377 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000757274  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0501  hypothetical protein  27.96 
 
 
421 aa  65.1  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.458939 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0813  monooxygenase, FAD-binding  27.4 
 
 
377 aa  64.3  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1117  monooxygenase, FAD-binding  32.74 
 
 
399 aa  64.3  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4207  salicylate 1-monooxygenase  27.66 
 
 
406 aa  63.9  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.880254  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6172  hypothetical protein  27.35 
 
 
417 aa  64.3  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.272957 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3927  salicylate 1-monooxygenase  27.84 
 
 
385 aa  63.9  0.000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.567277  normal  0.0279633 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2527  monooxygenase FAD-binding protein  25.21 
 
 
388 aa  63.9  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.172814 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3637  hypothetical protein  26.57 
 
 
416 aa  63.9  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.529402  normal  0.0728154 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5490  hypothetical protein  25.13 
 
 
376 aa  63.5  0.000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.263569  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0982  monooxygenase FAD-binding  27.01 
 
 
399 aa  63.2  0.000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0183396 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1022  salicylate 1-monooxygenase  25.75 
 
 
391 aa  63.2  0.000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5812  monooxygenase, FAD-binding protein  26.45 
 
 
408 aa  62.4  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0698086  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1853  monooxygenase FAD-binding  27.75 
 
 
385 aa  62.4  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>