More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5646 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B5646  hypothetical protein  100 
 
 		 407 aa  829    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.419878  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4962  hypothetical protein  67.4 
 
 		 408 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.42035  normal  0.249552 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3909  hypothetical protein  53.63 
 
 		 414 aa  361  2e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0793599 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3158  hypothetical protein  52.75 
 
 		 417 aa  357  2.9999999999999997e-97  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5851  hypothetical protein  48.01 
 
 		 405 aa  300  3e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.3306  hitchhiker  0.00183506 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2954  hypothetical protein  44.3 
 
 		 396 aa  290  3e-77  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.235474  hitchhiker  0.00230621 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0544  hypothetical protein  43.67 
 
 		 373 aa  259  5.0000000000000005e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5706  hypothetical protein  39.25 
 
 		 401 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0755393 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1082  hypothetical protein  40.47 
 
 		 380 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1082  hypothetical protein  40.47 
 
 		 380 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5501  hypothetical protein  39.46 
 
 		 355 aa  238  2e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.9082  normal  0.091793 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2392  hypothetical protein  37.74 
 
 		 382 aa  237  3e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4947  hypothetical protein  40.25 
 
 		 390 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.648001 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0795  hypothetical protein  39.3 
 
 		 390 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.921964 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1493  hypothetical protein  40.66 
 
 		 380 aa  228  1e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6336  hypothetical protein  40.66 
 
 		 380 aa  228  1e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3464  hypothetical protein  35.92 
 
 		 374 aa  221  9.999999999999999e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.803329  normal  0.0415669 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7002  hypothetical protein  39.46 
 
 		 380 aa  220  3e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00600208 
 
 
-
 
NC_003296  RS01683  hypothetical protein  38.52 
 
 		 397 aa  218  2e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4959  hypothetical protein  35.14 
 
 		 374 aa  196  7e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.128742 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4899  hypothetical protein  36.75 
 
 		 396 aa  189  5.999999999999999e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0592  hypothetical protein  35.56 
 
 		 394 aa  182  1e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5187  monooxygenase FAD-binding  33.51 
 
 		 421 aa  139  8.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.983717 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2257  hypothetical protein  27.25 
 
 		 378 aa  123  7e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.472155 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1528  monooxygenase FAD-binding  25.75 
 
 		 362 aa  95.1  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.392805  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3565  monooxygenase FAD-binding  29.77 
 
 		 384 aa  91.3  3e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2005  hypothetical protein  23.13 
 
 		 377 aa  90.9  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00436005  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5490  hypothetical protein  25.93 
 
 		 376 aa  83.6  0.000000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.263569  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4031  DNA mismatch endonuclease Vsr  27.47 
 
 		 404 aa  82.8  0.000000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3968  monooxygenase FAD-binding  24.32 
 
 		 362 aa  82.4  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4013  monooxygenase FAD-binding  24.12 
 
 		 362 aa  82.8  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0834664  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0923  monooxygenase FAD-binding  27.03 
 
 		 412 aa  82  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.264093 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2621  monooxygenase, FAD-binding  27.37 
 
 		 388 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.684205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2160  monooxygenase FAD-binding  30.35 
 
 		 395 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1987  hypothetical protein  23.1 
 
 		 377 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000746962  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4129  monooxygenase FAD-binding protein  28.72 
 
 		 421 aa  79.7  0.00000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3294  monooxygenase FAD-binding protein  28.99 
 
 		 388 aa  79.7  0.00000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0802651  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1889  hypothetical protein  24.15 
 
 		 374 aa  79.3  0.0000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0514  hypothetical protein  26.29 
 
 		 421 aa  79.3  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.472933  normal  0.467939 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4211  monooxygenase, FAD-binding  25.92 
 
 		 382 aa  78.2  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.815591  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1969  hypothetical protein  23.14 
 
 		 377 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0438709  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_1611  zeaxanthin epoxidase (ABA1) (NPQ2)  25.71 
 
 		 429 aa  78.2  0.0000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.539309  normal  0.0529961 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0896  monooxygenase, FAD-binding  29.49 
 
 		 389 aa  77.4  0.0000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20710  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  26.72 
 
 		 414 aa  77.4  0.0000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.336211  normal  0.159251 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7133  monooxygenase, FAD-binding  29.44 
 
 		 356 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01380  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  29.87 
 
 		 378 aa  76.6  0.0000000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0213  salicylate 1-monooxygenase (NahW)  26.75 
 
 		 403 aa  76.3  0.0000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00584161  normal  0.918812 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5557  FAD-dependent oxidoreductase  27.32 
 
 		 367 aa  74.7  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.633311 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5727  monooxygenase, FAD-binding  24.44 
 
 		 364 aa  73.9  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5319  monooxygenase FAD-binding protein  27.42 
 
 		 390 aa  73.6  0.000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6042  monooxygenase FAD-binding  25.58 
 
 		 378 aa  73.6  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0233658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5437  monooxygenase, FAD-binding  24.26 
 
 		 364 aa  73.6  0.000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.863729 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2393  hypothetical protein  26.44 
 
 		 376 aa  73.2  0.000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.142228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2964  monooxygenase FAD-binding  27.66 
 
 		 422 aa  73.2  0.000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000808449 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02114  salicylate hydroxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G05260)  25.74 
 
 		 448 aa  72.4  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2199  hypothetical protein  26.54 
 
 		 413 aa  72.8  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0226443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0096  monooxygenase FAD-binding  27.23 
 
 		 388 aa  72  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0544698 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02033  conserved hypothetical protein  23.1 
 
 		 435 aa  71.6  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.637061 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3996  hypothetical protein  26.02 
 
 		 417 aa  71.6  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4581  monooxygenase FAD-binding protein  27.64 
 
 		 399 aa  71.6  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.626069 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0778  monooxygenase FAD-binding  28.28 
 
 		 393 aa  71.2  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0373747  decreased coverage  0.000456942 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1067  monooxygenase FAD-binding  26.03 
 
 		 414 aa  70.9  0.00000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.265786  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0982  monooxygenase FAD-binding  29.24 
 
 		 399 aa  70.9  0.00000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0183396 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2369  monooxygenase FAD-binding protein  29.41 
 
 		 371 aa  70.5  0.00000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2480  monooxygenase FAD-binding  27.94 
 
 		 395 aa  70.5  0.00000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0321  hypothetical protein  25.72 
 
 		 414 aa  70.1  0.00000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.372833  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1146  monooxygenase, FAD-binding  26.03 
 
 		 414 aa  70.1  0.00000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.263204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4498  salicylate 1-monooxygenase  24.24 
 
 		 422 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2526  salicylate 1-monooxygenase  25.47 
 
 		 396 aa  70.1  0.00000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.066083 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5348  monooxygenase, FAD-binding protein  23.76 
 
 		 360 aa  69.7  0.00000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.437085  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2311  monooxygenase FAD-binding  25.1 
 
 		 383 aa  69.7  0.00000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2552  monooxygenase FAD-binding protein  25.78 
 
 		 376 aa  68.9  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2242  hypothetical protein  25.48 
 
 		 379 aa  69.7  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19150  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  26.72 
 
 		 351 aa  68.6  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0319604  normal  0.370849 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3944  salicylate hydroxylase  25.29 
 
 		 382 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0448295  normal  0.412797 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2701  monooxygenase FAD-binding protein  28.95 
 
 		 377 aa  68.9  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3579  monooxygenase FAD-binding  25.29 
 
 		 382 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.817981 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3140  hypothetical protein  26.24 
 
 		 376 aa  68.2  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3428  monooxygenase, FAD-binding  25.82 
 
 		 372 aa  67.8  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1231  salicylate 1-monooxygenase  24.81 
 
 		 404 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.592071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1893  monooxygenase, FAD-binding  25.29 
 
 		 382 aa  67  0.0000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0501  hypothetical protein  26.52 
 
 		 421 aa  66.2  0.0000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.458939 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4063  monooxygenase FAD-binding protein  25.34 
 
 		 402 aa  66.2  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.69418 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0481  salicylate 1-monooxygenase  28.35 
 
 		 373 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3566  monooxygenase, FAD-binding  27.4 
 
 		 389 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.411114  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1093  monooxygenase FAD-binding  28.21 
 
 		 408 aa  65.9  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0291534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0813  monooxygenase, FAD-binding  26.9 
 
 		 377 aa  65.9  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1206  hypothetical protein  29.79 
 
 		 417 aa  66.2  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5237  putative salicylate 1-monooxygenase  26.75 
 
 		 399 aa  65.5  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.192496 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3927  salicylate 1-monooxygenase  26.15 
 
 		 385 aa  65.9  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.567277  normal  0.0279633 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2140  monooxygenase FAD-binding  24.01 
 
 		 382 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0383787 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3393  monooxygenase FAD-binding  27.47 
 
 		 395 aa  65.5  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.529657  normal  0.469317 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4094  FAD dependent oxidoreductase  28.17 
 
 		 413 aa  65.1  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.232539  normal  0.561641 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0859  hypothetical protein  22.95 
 
 		 376 aa  64.7  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7785  FAD-dependent oxidoreductase  28.25 
 
 		 425 aa  64.7  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.786204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2339  monooxygenase FAD-binding  27.27 
 
 		 388 aa  64.7  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000167175  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3328  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  29.78 
 
 		 407 aa  64.3  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.150159  normal  0.347251 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3586  salicylate 1-monooxygenase  25.33 
 
 		 427 aa  64.3  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.942873 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2159  monooxygenase FAD-binding  27.6 
 
 		 402 aa  63.9  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.429326  normal  0.511267 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0229  monooxygenase FAD-binding  27.62 
 
 		 409 aa  63.9  0.000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.297351 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>