More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A4959 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A4959  hypothetical protein  100 
 
 
374 aa  759    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.128742 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3464  hypothetical protein  38.71 
 
 
374 aa  253  3e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.803329  normal  0.0415669 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1493  hypothetical protein  41.25 
 
 
380 aa  230  3e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6336  hypothetical protein  41.25 
 
 
380 aa  230  3e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7002  hypothetical protein  40.95 
 
 
380 aa  226  4e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00600208 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1082  hypothetical protein  36.14 
 
 
380 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1082  hypothetical protein  36.14 
 
 
380 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5706  hypothetical protein  37.53 
 
 
401 aa  218  1e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0755393 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0795  hypothetical protein  37.25 
 
 
390 aa  210  3e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.921964 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4947  hypothetical protein  36.96 
 
 
390 aa  206  4e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.648001 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5501  hypothetical protein  37.91 
 
 
355 aa  206  4e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.9082  normal  0.091793 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4962  hypothetical protein  34.58 
 
 
408 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.42035  normal  0.249552 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2954  hypothetical protein  36.31 
 
 
396 aa  201  1.9999999999999998e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.235474  hitchhiker  0.00230621 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3909  hypothetical protein  36.68 
 
 
414 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0793599 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4899  hypothetical protein  34.58 
 
 
396 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0544  hypothetical protein  35.77 
 
 
373 aa  196  4.0000000000000005e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5646  hypothetical protein  35.14 
 
 
407 aa  196  6e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.419878  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3158  hypothetical protein  37.67 
 
 
417 aa  194  2e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2392  hypothetical protein  36.56 
 
 
382 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5851  hypothetical protein  35.15 
 
 
405 aa  183  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.3306  hitchhiker  0.00183506 
 
 
-
 
NC_003296  RS01683  hypothetical protein  36.89 
 
 
397 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0592  hypothetical protein  34.32 
 
 
394 aa  157  3e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5187  monooxygenase FAD-binding  29.87 
 
 
421 aa  110  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.983717 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1528  monooxygenase FAD-binding  24.43 
 
 
362 aa  79.7  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.392805  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0336  monooxygenase FAD-binding protein  25.93 
 
 
412 aa  79  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.214027  normal  0.627257 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0809  monooxygenase, FAD-binding  27.13 
 
 
396 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.815643  normal  0.21546 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7773  monooxygenase FAD-binding  28.41 
 
 
374 aa  77.8  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2257  hypothetical protein  29.02 
 
 
378 aa  72  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.472155 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5335  FAD-dependent monooxygenase  26.99 
 
 
378 aa  72.4  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103313  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3968  monooxygenase FAD-binding  22.31 
 
 
362 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0813  monooxygenase, FAD-binding  25.06 
 
 
377 aa  71.2  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3637  hypothetical protein  28.78 
 
 
416 aa  70.5  0.00000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.529402  normal  0.0728154 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5319  monooxygenase FAD-binding protein  25.85 
 
 
390 aa  70.1  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09400  hypothetical protein  26.82 
 
 
402 aa  70.1  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1889  hypothetical protein  22.17 
 
 
374 aa  69.3  0.0000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2199  hypothetical protein  26 
 
 
413 aa  69.3  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0226443  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4013  monooxygenase FAD-binding  22.05 
 
 
362 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0834664  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2927  hypothetical protein  27.37 
 
 
424 aa  69.3  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.27992  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5386  monooxygenase FAD-binding  27.11 
 
 
392 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.336288 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3466  monooxygenase, FAD-binding  26.22 
 
 
392 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4900  monooxygenase, FAD-binding  26.22 
 
 
392 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.99121 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0096  monooxygenase FAD-binding  26.28 
 
 
388 aa  67.8  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0544698 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2684  hypothetical protein  27.7 
 
 
415 aa  67  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.552249  normal  0.307817 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5727  monooxygenase, FAD-binding  29.79 
 
 
364 aa  66.6  0.0000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2005  hypothetical protein  23.6 
 
 
377 aa  66.6  0.0000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00436005  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7133  monooxygenase, FAD-binding  28.96 
 
 
356 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0229  monooxygenase FAD-binding  27.56 
 
 
409 aa  66.2  0.0000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.297351 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4211  monooxygenase, FAD-binding  25.45 
 
 
382 aa  66.2  0.0000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.815591  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3199  hypothetical protein  29.44 
 
 
374 aa  66.2  0.0000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.3549  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0991  salicylate 1-monooxygenase  24.58 
 
 
397 aa  66.2  0.0000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0622996  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3996  hypothetical protein  27.04 
 
 
417 aa  66.2  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5278  monooxygenase, FAD-binding  25.38 
 
 
395 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.630865 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5437  monooxygenase, FAD-binding  29.79 
 
 
364 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.863729 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2318  monooxygenase FAD-binding  27.51 
 
 
385 aa  65.5  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.694664  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6042  monooxygenase FAD-binding  21.56 
 
 
378 aa  64.7  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0233658  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1542  monooxygenase FAD-binding protein  25.99 
 
 
374 aa  64.7  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0929471  normal  0.228138 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5490  hypothetical protein  25.88 
 
 
376 aa  64.7  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.263569  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5348  monooxygenase, FAD-binding protein  29.79 
 
 
360 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.437085  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0514  hypothetical protein  26.45 
 
 
421 aa  64.7  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.472933  normal  0.467939 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0881  hypothetical protein  26.53 
 
 
402 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.200049  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3586  salicylate 1-monooxygenase  28.41 
 
 
427 aa  63.5  0.000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.942873 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0771  monooxygenase FAD-binding  23.25 
 
 
380 aa  63.5  0.000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000429101 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4031  DNA mismatch endonuclease Vsr  26.93 
 
 
404 aa  63.5  0.000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1987  hypothetical protein  23.55 
 
 
377 aa  63.5  0.000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000746962  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4602  monooxygenase FAD-binding  31.02 
 
 
382 aa  63.2  0.000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.296431  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3284  monooxygenase FAD-binding protein  27.18 
 
 
393 aa  63.2  0.000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.289154 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02114  salicylate hydroxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G05260)  25 
 
 
448 aa  62.4  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3328  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  28.35 
 
 
407 aa  62.4  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.150159  normal  0.347251 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1969  hypothetical protein  24.26 
 
 
377 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0438709  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3662  monooxygenase, FAD-binding  26.3 
 
 
395 aa  61.6  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.555838  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1206  hypothetical protein  26.48 
 
 
417 aa  61.2  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3311  monooxygenase, FAD-binding  28.85 
 
 
401 aa  61.2  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3565  monooxygenase FAD-binding  24.81 
 
 
384 aa  60.8  0.00000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4386  hypothetical protein  26.94 
 
 
441 aa  61.2  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2311  monooxygenase FAD-binding  23.01 
 
 
383 aa  60.8  0.00000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01380  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  27.34 
 
 
378 aa  60.5  0.00000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0859  hypothetical protein  22.7 
 
 
376 aa  60.5  0.00000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3294  monooxygenase FAD-binding protein  24.51 
 
 
388 aa  60.1  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0802651  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2159  monooxygenase FAD-binding  25.5 
 
 
402 aa  59.7  0.00000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.429326  normal  0.511267 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3149  salicylate 1-monooxygenase  27.71 
 
 
398 aa  59.7  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.136472  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2962  monooxygenase FAD-binding protein  25 
 
 
397 aa  58.9  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2360  monooxygenase, FAD-binding protein  26.93 
 
 
400 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.175962  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2407  monooxygenase, FAD-binding  26.93 
 
 
400 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.254272 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4129  monooxygenase FAD-binding protein  25.52 
 
 
421 aa  58.2  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1154  monooxygenase, FAD-binding  27.32 
 
 
412 aa  58.5  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2242  hypothetical protein  24.57 
 
 
379 aa  58.5  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2527  monooxygenase FAD-binding protein  28.49 
 
 
388 aa  57.8  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.172814 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2957  monooxygenase FAD-binding  22.07 
 
 
372 aa  57.8  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575675  hitchhiker  0.00000079656 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3441  hypothetical protein  25.71 
 
 
417 aa  57.8  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0819399  normal  0.800354 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0321  hypothetical protein  25.95 
 
 
414 aa  57.4  0.0000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.372833  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1486  monooxygenase FAD-binding protein  26.55 
 
 
408 aa  57.4  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.528879  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1561  hypothetical protein  26.4 
 
 
377 aa  57.4  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2584  monooxygenase, FAD-binding  25.41 
 
 
400 aa  57.4  0.0000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.613825  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3698  hypothetical protein  24.71 
 
 
417 aa  57  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0252348  normal  0.169871 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6172  hypothetical protein  26.59 
 
 
417 aa  57.4  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.272957 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0481  salicylate 1-monooxygenase  25.76 
 
 
373 aa  57  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5073  Salicylate 1-monooxygenase  22.47 
 
 
386 aa  57  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.926874  normal  0.172716 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4615  monooxygenase FAD-binding  28.08 
 
 
392 aa  57  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.992897  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2128  salicylate hydroxylase  24.44 
 
 
397 aa  56.6  0.0000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.453627  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0439  hypothetical protein  24.75 
 
 
440 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>