More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3158 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_3158  hypothetical protein  100 
 
 		 417 aa  810    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3909  hypothetical protein  80.45 
 
 		 414 aa  612  9.999999999999999e-175  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0793599 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4962  hypothetical protein  55.53 
 
 		 408 aa  412  1e-114  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.42035  normal  0.249552 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5646  hypothetical protein  52.75 
 
 		 407 aa  390  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.419878  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5851  hypothetical protein  58.99 
 
 		 405 aa  369  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.3306  hitchhiker  0.00183506 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2954  hypothetical protein  47.97 
 
 		 396 aa  298  1e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.235474  hitchhiker  0.00230621 
 
 
-
 
NC_003296  RS01683  hypothetical protein  46.42 
 
 		 397 aa  283  5.000000000000001e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0795  hypothetical protein  44.09 
 
 		 390 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.921964 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4947  hypothetical protein  43.47 
 
 		 390 aa  266  4e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.648001 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1082  hypothetical protein  44.35 
 
 		 380 aa  254  3e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1082  hypothetical protein  44.63 
 
 		 380 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5706  hypothetical protein  42.93 
 
 		 401 aa  250  3e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0755393 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5501  hypothetical protein  42.51 
 
 		 355 aa  247  3e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.9082  normal  0.091793 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2392  hypothetical protein  41.67 
 
 		 382 aa  247  4e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1493  hypothetical protein  45.13 
 
 		 380 aa  241  1e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6336  hypothetical protein  45.13 
 
 		 380 aa  241  1e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0544  hypothetical protein  41.67 
 
 		 373 aa  239  5e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7002  hypothetical protein  44.25 
 
 		 380 aa  236  8e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00600208 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4959  hypothetical protein  37.67 
 
 		 374 aa  221  3e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.128742 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3464  hypothetical protein  36.87 
 
 		 374 aa  219  8.999999999999998e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.803329  normal  0.0415669 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0592  hypothetical protein  40.11 
 
 		 394 aa  206  6e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4899  hypothetical protein  35.8 
 
 		 396 aa  193  6e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5187  monooxygenase FAD-binding  31.36 
 
 		 421 aa  136  6.0000000000000005e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.983717 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7773  monooxygenase FAD-binding  30.81 
 
 		 374 aa  102  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2257  hypothetical protein  27.15 
 
 		 378 aa  102  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.472155 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1528  monooxygenase FAD-binding  28.91 
 
 		 362 aa  100  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.392805  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1206  hypothetical protein  31.81 
 
 		 417 aa  97.4  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4581  monooxygenase FAD-binding protein  29 
 
 		 399 aa  95.9  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.626069 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3637  hypothetical protein  31.81 
 
 		 416 aa  94.4  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.529402  normal  0.0728154 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4013  monooxygenase FAD-binding  26.82 
 
 		 362 aa  93.6  6e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0834664  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3968  monooxygenase FAD-binding  26.82 
 
 		 362 aa  92  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7133  monooxygenase, FAD-binding  32.23 
 
 		 356 aa  88.2  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0213  salicylate 1-monooxygenase (NahW)  29.2 
 
 		 403 aa  87.8  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00584161  normal  0.918812 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3294  monooxygenase FAD-binding protein  28.64 
 
 		 388 aa  88.2  3e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0802651  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2005  hypothetical protein  23.65 
 
 		 377 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00436005  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3284  monooxygenase FAD-binding protein  28.5 
 
 		 393 aa  84.3  0.000000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.289154 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5278  monooxygenase, FAD-binding  26.97 
 
 		 395 aa  84.3  0.000000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.630865 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1987  hypothetical protein  24.41 
 
 		 377 aa  83.6  0.000000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000746962  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2372  hypothetical protein  23.22 
 
 		 374 aa  83.2  0.000000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2329  hypothetical protein  23.22 
 
 		 374 aa  83.2  0.000000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5727  monooxygenase, FAD-binding  26.39 
 
 		 364 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4002  monooxygenase FAD-binding  25.34 
 
 		 376 aa  82.4  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3957  monooxygenase FAD-binding  25.34 
 
 		 376 aa  81.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5437  monooxygenase, FAD-binding  26.39 
 
 		 364 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.863729 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2710  monooxygenase FAD-binding  23.71 
 
 		 392 aa  80.9  0.00000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4129  monooxygenase FAD-binding protein  30 
 
 		 421 aa  80.9  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5490  hypothetical protein  25.5 
 
 		 376 aa  80.9  0.00000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.263569  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4777  monooxygenase FAD-binding protein  26.92 
 
 		 496 aa  80.5  0.00000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.712751  hitchhiker  0.00463722 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4207  salicylate 1-monooxygenase  29.39 
 
 		 406 aa  78.2  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.880254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5348  monooxygenase, FAD-binding protein  26.06 
 
 		 360 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.437085  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3565  monooxygenase FAD-binding  28.93 
 
 		 384 aa  77.4  0.0000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1969  hypothetical protein  23.36 
 
 		 377 aa  77  0.0000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0438709  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1889  hypothetical protein  28.33 
 
 		 374 aa  76.6  0.0000000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4094  FAD dependent oxidoreductase  30.71 
 
 		 413 aa  76.3  0.0000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.232539  normal  0.561641 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0336  monooxygenase FAD-binding protein  26.8 
 
 		 412 aa  75.1  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.214027  normal  0.627257 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5812  monooxygenase, FAD-binding protein  28.07 
 
 		 408 aa  74.7  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0698086  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2962  monooxygenase FAD-binding protein  25.95 
 
 		 397 aa  74.3  0.000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0712  hypothetical protein  24.6 
 
 		 371 aa  73.6  0.000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2311  monooxygenase FAD-binding  27.97 
 
 		 383 aa  73.6  0.000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2339  monooxygenase FAD-binding  28.71 
 
 		 388 aa  73.2  0.000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000167175  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6537  monooxygenase, FAD-binding protein  25.39 
 
 		 392 aa  72.4  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0203356  normal  0.0154804 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0514  hypothetical protein  27.49 
 
 		 421 aa  72.8  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.472933  normal  0.467939 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4138  monooxygenase, FAD-binding protein  28.34 
 
 		 408 aa  72.4  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.145497  normal  0.0296411 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2068  salicylate 1-monooxygenase  27.85 
 
 		 385 aa  72.8  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.341777 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4211  monooxygenase, FAD-binding  29.86 
 
 		 382 aa  72  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.815591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5319  monooxygenase FAD-binding protein  38.1 
 
 		 390 aa  71.6  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1633  monooxygenase FAD-binding  26.76 
 
 		 410 aa  70.9  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.719976  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2230  hypothetical protein  23.06 
 
 		 377 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000757274  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2242  hypothetical protein  25.88 
 
 		 379 aa  70.9  0.00000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0859  hypothetical protein  24.4 
 
 		 376 aa  70.9  0.00000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4031  DNA mismatch endonuclease Vsr  26.56 
 
 		 404 aa  70.1  0.00000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1486  monooxygenase FAD-binding protein  28.92 
 
 		 408 aa  70.1  0.00000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.528879  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4040  salicylate 1-monooxygenase  28.53 
 
 		 404 aa  69.7  0.00000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2621  monooxygenase, FAD-binding  31.67 
 
 		 388 aa  69.7  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.684205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4891  monooxygenase, FAD-binding  33.52 
 
 		 402 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.292821 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1762  monooxygenase FAD-binding  26.74 
 
 		 384 aa  69.3  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.638414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2927  hypothetical protein  25.23 
 
 		 424 aa  69.3  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.27992  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3311  monooxygenase, FAD-binding  34.47 
 
 		 401 aa  68.9  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2318  monooxygenase FAD-binding  26.49 
 
 		 385 aa  68.6  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.694664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3996  hypothetical protein  27.69 
 
 		 417 aa  68.6  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3328  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  30.65 
 
 		 407 aa  68.6  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.150159  normal  0.347251 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1542  monooxygenase FAD-binding protein  23.21 
 
 		 374 aa  68.2  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0929471  normal  0.228138 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8535  monooxygenase FAD-binding  31.44 
 
 		 384 aa  67.4  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0157087  hitchhiker  0.0015439 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2199  hypothetical protein  26.81 
 
 		 413 aa  67.8  0.0000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0226443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3591  salicylate 1-monooxygenase  32.83 
 
 		 398 aa  67.8  0.0000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.331421 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5387  hypothetical protein  28.42 
 
 		 420 aa  67  0.0000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1784  monooxygenase, FAD-binding  28.25 
 
 		 410 aa  67  0.0000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0778  monooxygenase FAD-binding  27.85 
 
 		 393 aa  67  0.0000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0373747  decreased coverage  0.000456942 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0991  salicylate 1-monooxygenase  26.04 
 
 		 397 aa  67  0.0000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0622996  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5557  FAD-dependent oxidoreductase  27.01 
 
 		 367 aa  67  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.633311 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3140  hypothetical protein  23.75 
 
 		 376 aa  66.6  0.0000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09400  hypothetical protein  26.99 
 
 		 402 aa  67  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4033  monooxygenase FAD-binding  27.81 
 
 		 404 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.115519 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3428  monooxygenase, FAD-binding  27.06 
 
 		 372 aa  65.9  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0881  hypothetical protein  26.74 
 
 		 402 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.200049  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3927  salicylate 1-monooxygenase  26.14 
 
 		 385 aa  66.2  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.567277  normal  0.0279633 
 
 
-
 
NC_006684  CNB00140  conserved hypothetical protein  27.62 
 
 		 419 aa  65.5  0.000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.180406  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2526  salicylate 1-monooxygenase  26.09 
 
 		 396 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.066083 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1022  salicylate 1-monooxygenase  26.82 
 
 		 391 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3144  salicylate hydroxylase  25.72 
 
 		 400 aa  65.1  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.403778  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>