276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5706 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_5706  hypothetical protein  100 
 
 		 401 aa  801    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0755393 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5501  hypothetical protein  72.7 
 
 		 355 aa  513  1e-144  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.9082  normal  0.091793 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2392  hypothetical protein  70.6 
 
 		 382 aa  511  1e-144  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0795  hypothetical protein  56.53 
 
 		 390 aa  404  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.921964 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4947  hypothetical protein  57.07 
 
 		 390 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.648001 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1082  hypothetical protein  55.56 
 
 		 380 aa  395  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1082  hypothetical protein  55.29 
 
 		 380 aa  397  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1493  hypothetical protein  55.24 
 
 		 380 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6336  hypothetical protein  55.24 
 
 		 380 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7002  hypothetical protein  54.71 
 
 		 380 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00600208 
 
 
-
 
NC_003296  RS01683  hypothetical protein  46.37 
 
 		 397 aa  293  5e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5646  hypothetical protein  39.25 
 
 		 407 aa  253  4.0000000000000004e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.419878  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4962  hypothetical protein  42.17 
 
 		 408 aa  249  5e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.42035  normal  0.249552 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3158  hypothetical protein  42.93 
 
 		 417 aa  221  3e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3909  hypothetical protein  39.8 
 
 		 414 aa  219  6e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0793599 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4899  hypothetical protein  40.32 
 
 		 396 aa  218  1e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4959  hypothetical protein  37.53 
 
 		 374 aa  218  1e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.128742 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0544  hypothetical protein  39.35 
 
 		 373 aa  218  2e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2954  hypothetical protein  40.98 
 
 		 396 aa  216  5e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.235474  hitchhiker  0.00230621 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3464  hypothetical protein  35.47 
 
 		 374 aa  209  6e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.803329  normal  0.0415669 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5851  hypothetical protein  41.49 
 
 		 405 aa  207  2e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.3306  hitchhiker  0.00183506 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0592  hypothetical protein  34.73 
 
 		 394 aa  149  7e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5187  monooxygenase FAD-binding  32.46 
 
 		 421 aa  109  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.983717 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5319  monooxygenase FAD-binding protein  34.57 
 
 		 390 aa  89  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2257  hypothetical protein  32.04 
 
 		 378 aa  89  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.472155 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3968  monooxygenase FAD-binding  25.77 
 
 		 362 aa  88.2  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4013  monooxygenase FAD-binding  25.77 
 
 		 362 aa  87.8  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0834664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7133  monooxygenase, FAD-binding  28.87 
 
 		 356 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1528  monooxygenase FAD-binding  25.14 
 
 		 362 aa  84  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.392805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4211  monooxygenase, FAD-binding  30 
 
 		 382 aa  80.5  0.00000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.815591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5557  FAD-dependent oxidoreductase  28.34 
 
 		 367 aa  79  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.633311 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3927  salicylate 1-monooxygenase  27.09 
 
 		 385 aa  79.3  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.567277  normal  0.0279633 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2005  hypothetical protein  22.92 
 
 		 377 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00436005  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1853  monooxygenase FAD-binding  26.22 
 
 		 385 aa  75.9  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2140  monooxygenase FAD-binding  26.82 
 
 		 382 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0383787 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1893  monooxygenase, FAD-binding  26.58 
 
 		 382 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7773  monooxygenase FAD-binding  29.44 
 
 		 374 aa  73.6  0.000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_1611  zeaxanthin epoxidase (ABA1) (NPQ2)  26.54 
 
 		 429 aa  73.9  0.000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.539309  normal  0.0529961 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6042  monooxygenase FAD-binding  24.58 
 
 		 378 aa  73.9  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0233658  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0310  monooxygenase FAD-binding protein  30.36 
 
 		 309 aa  73.6  0.000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0496808  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1154  monooxygenase, FAD-binding  32.66 
 
 		 412 aa  73.6  0.000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2621  monooxygenase, FAD-binding  27.85 
 
 		 388 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.684205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2159  monooxygenase FAD-binding  31.98 
 
 		 402 aa  71.6  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.429326  normal  0.511267 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3944  salicylate hydroxylase  26.3 
 
 		 382 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0448295  normal  0.412797 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1889  hypothetical protein  22.61 
 
 		 374 aa  72  0.00000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5727  monooxygenase, FAD-binding  29.47 
 
 		 364 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5437  monooxygenase, FAD-binding  29.47 
 
 		 364 aa  71.6  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.863729 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4002  monooxygenase FAD-binding  31.4 
 
 		 376 aa  70.9  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3957  monooxygenase FAD-binding  31.4 
 
 		 376 aa  70.9  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3311  monooxygenase, FAD-binding  33.72 
 
 		 401 aa  70.9  0.00000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3579  monooxygenase FAD-binding  26.37 
 
 		 382 aa  70.9  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.817981 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2526  salicylate 1-monooxygenase  25.26 
 
 		 396 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.066083 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2311  monooxygenase FAD-binding  24.85 
 
 		 383 aa  70.5  0.00000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0991  salicylate 1-monooxygenase  25.13 
 
 		 397 aa  70.5  0.00000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0622996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4891  monooxygenase, FAD-binding  29.91 
 
 		 402 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.292821 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4581  monooxygenase FAD-binding protein  26.17 
 
 		 399 aa  69.3  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.626069 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0982  monooxygenase FAD-binding  34.02 
 
 		 399 aa  68.2  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0183396 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5387  hypothetical protein  31.55 
 
 		 420 aa  68.9  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3591  salicylate 1-monooxygenase  28.45 
 
 		 398 aa  68.6  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.331421 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4138  monooxygenase, FAD-binding protein  33.95 
 
 		 408 aa  68.6  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.145497  normal  0.0296411 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2584  monooxygenase, FAD-binding  29.82 
 
 		 400 aa  68.2  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.613825  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5490  hypothetical protein  24.81 
 
 		 376 aa  68.2  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.263569  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5812  monooxygenase, FAD-binding protein  33.95 
 
 		 408 aa  68.2  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0698086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1022  salicylate 1-monooxygenase  27.17 
 
 		 391 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4031  DNA mismatch endonuclease Vsr  25.77 
 
 		 404 aa  67  0.0000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1969  hypothetical protein  23.06 
 
 		 377 aa  67.4  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0438709  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3483  monooxygenase FAD-binding  27.32 
 
 		 385 aa  67  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147662 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2131  salicylate 1-monooxygenase  32.52 
 
 		 400 aa  66.6  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2199  hypothetical protein  24.73 
 
 		 413 aa  66.6  0.0000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0226443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5348  monooxygenase, FAD-binding protein  29.06 
 
 		 360 aa  66.6  0.0000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.437085  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1067  monooxygenase FAD-binding  27.63 
 
 		 414 aa  66.2  0.0000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.265786  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0213  salicylate 1-monooxygenase (NahW)  38.46 
 
 		 403 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00584161  normal  0.918812 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4324  salicylate 1-monooxygenase  26.99 
 
 		 385 aa  66.2  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.524787  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4042  salicylate 1-monooxygenase  26.99 
 
 		 385 aa  66.2  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00369253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1885  putative salicylate hydroxylase  31.74 
 
 		 389 aa  65.9  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.122899  normal  0.226674 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4828  hypothetical protein  25.45 
 
 		 376 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.454319 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3292  salicylate 1-monooxygenase  32.84 
 
 		 404 aa  66.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0110847 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0813  monooxygenase, FAD-binding  29.02 
 
 		 377 aa  65.9  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1146  monooxygenase, FAD-binding  27.63 
 
 		 414 aa  65.9  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.263204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4547  monooxygenase FAD-binding  26.51 
 
 		 385 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.326108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6172  hypothetical protein  28.53 
 
 		 417 aa  64.7  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.272957 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1987  hypothetical protein  22.77 
 
 		 377 aa  64.7  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000746962  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0809  monooxygenase, FAD-binding  25.76 
 
 		 396 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.815643  normal  0.21546 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2242  hypothetical protein  25.79 
 
 		 379 aa  64.7  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3637  hypothetical protein  26.71 
 
 		 416 aa  63.9  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.529402  normal  0.0728154 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3140  hypothetical protein  27.66 
 
 		 376 aa  64.3  0.000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1206  hypothetical protein  26.69 
 
 		 417 aa  63.9  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3565  monooxygenase FAD-binding  31.09 
 
 		 384 aa  64.3  0.000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0923  monooxygenase FAD-binding  30.32 
 
 		 412 aa  64.3  0.000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.264093 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0229  monooxygenase FAD-binding  30.85 
 
 		 409 aa  63.9  0.000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.297351 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3149  salicylate 1-monooxygenase  31.19 
 
 		 398 aa  63.9  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.136472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0546  monooxygenase, FAD-binding  27.75 
 
 		 373 aa  63.9  0.000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1784  monooxygenase, FAD-binding  30 
 
 		 410 aa  63.2  0.000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3960  monooxygenase, FAD-binding  29.07 
 
 		 388 aa  63.5  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3614  monooxygenase FAD-binding  25.95 
 
 		 378 aa  63.2  0.000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0392094  normal  0.0720055 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2927  hypothetical protein  26.47 
 
 		 424 aa  63.2  0.000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.27992  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4033  monooxygenase FAD-binding  25.94 
 
 		 404 aa  63.2  0.000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.115519 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1542  monooxygenase FAD-binding protein  26.63 
 
 		 374 aa  62.4  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0929471  normal  0.228138 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2329  hypothetical protein  21.37 
 
 		 374 aa  62.8  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2372  hypothetical protein  21.37 
 
 		 374 aa  62.8  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>