228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5501 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5501  hypothetical protein  100 
 
 		 355 aa  713    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.9082  normal  0.091793 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2392  hypothetical protein  80.91 
 
 		 382 aa  553  1e-156  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5706  hypothetical protein  72.7 
 
 		 401 aa  513  1e-144  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0755393 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0795  hypothetical protein  58.81 
 
 		 390 aa  385  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.921964 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4947  hypothetical protein  59.15 
 
 		 390 aa  384  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.648001 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1082  hypothetical protein  54.65 
 
 		 380 aa  375  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1082  hypothetical protein  54.89 
 
 		 380 aa  374  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1493  hypothetical protein  53.74 
 
 		 380 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6336  hypothetical protein  53.74 
 
 		 380 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7002  hypothetical protein  53.16 
 
 		 380 aa  352  4e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00600208 
 
 
-
 
NC_003296  RS01683  hypothetical protein  46.03 
 
 		 397 aa  262  6e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4962  hypothetical protein  42.47 
 
 		 408 aa  250  2e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.42035  normal  0.249552 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5646  hypothetical protein  39.46 
 
 		 407 aa  238  1e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.419878  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3909  hypothetical protein  42.22 
 
 		 414 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0793599 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3158  hypothetical protein  41.61 
 
 		 417 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2954  hypothetical protein  40.37 
 
 		 396 aa  213  2.9999999999999995e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.235474  hitchhiker  0.00230621 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3464  hypothetical protein  36.5 
 
 		 374 aa  210  2e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.803329  normal  0.0415669 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0544  hypothetical protein  39.88 
 
 		 373 aa  209  5e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4959  hypothetical protein  37.91 
 
 		 374 aa  206  4e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.128742 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5851  hypothetical protein  38.69 
 
 		 405 aa  204  2e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.3306  hitchhiker  0.00183506 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4899  hypothetical protein  37.99 
 
 		 396 aa  203  4e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0592  hypothetical protein  33.33 
 
 		 394 aa  157  2e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5187  monooxygenase FAD-binding  28.01 
 
 		 421 aa  94.7  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.983717 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4013  monooxygenase FAD-binding  24.27 
 
 		 362 aa  88.2  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0834664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2257  hypothetical protein  30.27 
 
 		 378 aa  86.7  6e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.472155 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3968  monooxygenase FAD-binding  24 
 
 		 362 aa  86.7  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_1611  zeaxanthin epoxidase (ABA1) (NPQ2)  27.34 
 
 		 429 aa  83.6  0.000000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.539309  normal  0.0529961 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2526  salicylate 1-monooxygenase  27.22 
 
 		 396 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.066083 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0991  salicylate 1-monooxygenase  27.07 
 
 		 397 aa  78.6  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0622996  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1528  monooxygenase FAD-binding  24.5 
 
 		 362 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.392805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4211  monooxygenase, FAD-binding  27.59 
 
 		 382 aa  77.8  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.815591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5319  monooxygenase FAD-binding protein  32.43 
 
 		 390 aa  77  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1853  monooxygenase FAD-binding  25.57 
 
 		 385 aa  75.9  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7773  monooxygenase FAD-binding  25.51 
 
 		 374 aa  73.6  0.000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3927  salicylate 1-monooxygenase  25.07 
 
 		 385 aa  73.6  0.000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.567277  normal  0.0279633 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4581  monooxygenase FAD-binding protein  27.48 
 
 		 399 aa  72.4  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.626069 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0813  monooxygenase, FAD-binding  29.65 
 
 		 377 aa  72.4  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5557  FAD-dependent oxidoreductase  32.37 
 
 		 367 aa  71.2  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.633311 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3957  monooxygenase FAD-binding  32.12 
 
 		 376 aa  71.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0213  salicylate 1-monooxygenase (NahW)  29.32 
 
 		 403 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00584161  normal  0.918812 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4002  monooxygenase FAD-binding  32.12 
 
 		 376 aa  70.9  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0310  monooxygenase FAD-binding protein  31.25 
 
 		 309 aa  70.5  0.00000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0496808  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4031  DNA mismatch endonuclease Vsr  29.69 
 
 		 404 aa  70.1  0.00000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1893  monooxygenase, FAD-binding  26.44 
 
 		 382 aa  70.5  0.00000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2140  monooxygenase FAD-binding  26.14 
 
 		 382 aa  70.1  0.00000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0383787 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3292  salicylate 1-monooxygenase  33.82 
 
 		 404 aa  69.7  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0110847 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7133  monooxygenase, FAD-binding  27.52 
 
 		 356 aa  69.3  0.00000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2584  monooxygenase, FAD-binding  28.95 
 
 		 400 aa  69.3  0.00000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.613825  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3579  monooxygenase FAD-binding  26.44 
 
 		 382 aa  69.3  0.00000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.817981 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3944  salicylate hydroxylase  26.14 
 
 		 382 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0448295  normal  0.412797 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2159  monooxygenase FAD-binding  30.56 
 
 		 402 aa  68.9  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.429326  normal  0.511267 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3149  salicylate 1-monooxygenase  30.67 
 
 		 398 aa  68.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.136472  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6042  monooxygenase FAD-binding  25 
 
 		 378 aa  68.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0233658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2005  hypothetical protein  23.82 
 
 		 377 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00436005  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1206  hypothetical protein  28.4 
 
 		 417 aa  67.8  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2311  monooxygenase FAD-binding  25.68 
 
 		 383 aa  66.2  0.0000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3662  monooxygenase, FAD-binding  25.21 
 
 		 395 aa  66.2  0.0000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.555838  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0771  monooxygenase FAD-binding  29.9 
 
 		 380 aa  65.5  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000429101 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0391  hypothetical protein  26.37 
 
 		 440 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4602  monooxygenase FAD-binding  28.65 
 
 		 382 aa  64.7  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.296431  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1585  hypothetical protein  26.37 
 
 		 440 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.825888  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1770  hypothetical protein  26.37 
 
 		 440 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0439  hypothetical protein  26.37 
 
 		 440 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4355  hypothetical protein  26.09 
 
 		 421 aa  63.9  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0233973  normal  0.534906 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2849  hypothetical protein  26.26 
 
 		 414 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3565  monooxygenase FAD-binding  25.82 
 
 		 384 aa  63.5  0.000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1214  hypothetical protein  26.26 
 
 		 414 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2199  hypothetical protein  23.53 
 
 		 413 aa  63.5  0.000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0226443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1784  monooxygenase, FAD-binding  28.65 
 
 		 410 aa  63.2  0.000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2974  hypothetical protein  26.54 
 
 		 414 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.556187  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1889  hypothetical protein  24.46 
 
 		 374 aa  62.4  0.00000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4138  monooxygenase, FAD-binding protein  32.1 
 
 		 408 aa  62.4  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.145497  normal  0.0296411 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4498  salicylate 1-monooxygenase  27.75 
 
 		 422 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6172  hypothetical protein  26.05 
 
 		 417 aa  62  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.272957 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5727  monooxygenase, FAD-binding  28.92 
 
 		 364 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3140  hypothetical protein  27.17 
 
 		 376 aa  61.2  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1542  monooxygenase FAD-binding protein  26.82 
 
 		 374 aa  61.2  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0929471  normal  0.228138 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0982  monooxygenase FAD-binding  31.18 
 
 		 399 aa  61.2  0.00000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0183396 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2515  salicylate 1-monooxygenase  26.72 
 
 		 386 aa  60.5  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.193433  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2068  salicylate 1-monooxygenase  25.78 
 
 		 385 aa  60.8  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.341777 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5437  monooxygenase, FAD-binding  28.92 
 
 		 364 aa  60.8  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.863729 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4033  monooxygenase FAD-binding  24.86 
 
 		 404 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.115519 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2621  monooxygenase, FAD-binding  30.56 
 
 		 388 aa  60.8  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.684205  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3960  monooxygenase, FAD-binding  31.11 
 
 		 388 aa  60.1  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4891  monooxygenase, FAD-binding  28.3 
 
 		 402 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.292821 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5812  monooxygenase, FAD-binding protein  30.86 
 
 		 408 aa  59.7  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0698086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1022  salicylate 1-monooxygenase  26.16 
 
 		 391 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3637  hypothetical protein  27.11 
 
 		 416 aa  59.7  0.00000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.529402  normal  0.0728154 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5348  monooxygenase, FAD-binding protein  28.57 
 
 		 360 aa  59.3  0.00000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.437085  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4040  salicylate 1-monooxygenase  24.59 
 
 		 404 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2372  hypothetical protein  25.58 
 
 		 374 aa  58.2  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0096  monooxygenase FAD-binding  31.35 
 
 		 388 aa  58.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0544698 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3591  salicylate 1-monooxygenase  29.82 
 
 		 398 aa  58.2  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.331421 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3466  monooxygenase, FAD-binding  27.41 
 
 		 392 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5386  monooxygenase FAD-binding  27.41 
 
 		 392 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.336288 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4900  monooxygenase, FAD-binding  27.41 
 
 		 392 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.99121 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1154  monooxygenase, FAD-binding  26.74 
 
 		 412 aa  58.5  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3284  monooxygenase FAD-binding protein  26.45 
 
 		 393 aa  58.5  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.289154 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2329  hypothetical protein  25.58 
 
 		 374 aa  58.2  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1486  monooxygenase FAD-binding protein  31.48 
 
 		 408 aa  57.4  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.528879  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>