More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3960 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_3960  monooxygenase, FAD-binding  100 
 
 
388 aa  755    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2621  monooxygenase, FAD-binding  73.06 
 
 
388 aa  557  1e-157  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.684205  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3561  monooxygenase, FAD-binding protein  68.73 
 
 
389 aa  496  1e-139  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.014092  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3634  monooxygenase, FAD-binding  68.73 
 
 
389 aa  496  1e-139  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.231418  normal  0.598375 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3566  monooxygenase, FAD-binding  67.96 
 
 
389 aa  491  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.411114  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0096  monooxygenase FAD-binding  36.6 
 
 
388 aa  185  1.0000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0544698 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0778  monooxygenase FAD-binding  39.78 
 
 
393 aa  175  9.999999999999999e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0373747  decreased coverage  0.000456942 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2527  monooxygenase FAD-binding protein  40.06 
 
 
388 aa  173  3.9999999999999995e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.172814 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4211  monooxygenase, FAD-binding  35.76 
 
 
382 aa  172  9e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.815591  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5319  monooxygenase FAD-binding protein  35.22 
 
 
390 aa  172  1e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2005  hypothetical protein  28.49 
 
 
377 aa  169  6e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00436005  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5557  FAD-dependent oxidoreductase  37.04 
 
 
367 aa  167  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.633311 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0229  monooxygenase FAD-binding  38.66 
 
 
409 aa  167  2.9999999999999998e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.297351 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01380  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  38.46 
 
 
378 aa  165  2.0000000000000002e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1987  hypothetical protein  28.89 
 
 
377 aa  164  3e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000746962  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2257  hypothetical protein  31.49 
 
 
378 aa  163  5.0000000000000005e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.472155 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1889  hypothetical protein  29.97 
 
 
374 aa  162  7e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2701  monooxygenase FAD-binding protein  39.94 
 
 
377 aa  161  2e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19150  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  37.65 
 
 
351 aa  158  1e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0319604  normal  0.370849 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4002  monooxygenase FAD-binding  30.98 
 
 
376 aa  157  2e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1969  hypothetical protein  28.06 
 
 
377 aa  158  2e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0438709  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3957  monooxygenase FAD-binding  30.98 
 
 
376 aa  157  4e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1561  monooxygenase FAD-binding  38.14 
 
 
392 aa  154  2e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0688558  normal  0.0725424 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0019  monooxygenase FAD-binding protein  37.97 
 
 
384 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4602  monooxygenase FAD-binding  36.31 
 
 
382 aa  149  6e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.296431  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2230  hypothetical protein  26.69 
 
 
377 aa  149  7e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000757274  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7785  FAD-dependent oxidoreductase  33.67 
 
 
425 aa  149  7e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.786204  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5278  monooxygenase, FAD-binding  30.86 
 
 
395 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.630865 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2339  monooxygenase FAD-binding  30.93 
 
 
388 aa  145  1e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000167175  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5727  monooxygenase, FAD-binding  30.08 
 
 
364 aa  140  4.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5348  monooxygenase, FAD-binding protein  29.94 
 
 
360 aa  139  6e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.437085  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5437  monooxygenase, FAD-binding  30.08 
 
 
364 aa  139  7e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.863729 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2369  monooxygenase FAD-binding protein  38.49 
 
 
371 aa  139  7.999999999999999e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21010  putative FAD-dependent monooxygenase  31.91 
 
 
388 aa  139  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.12929  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1784  monooxygenase, FAD-binding  33.44 
 
 
410 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1022  salicylate 1-monooxygenase  31.32 
 
 
391 aa  137  4e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0307  FAD dependent oxidoreductase  38.81 
 
 
378 aa  137  4e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000823237 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0813  monooxygenase, FAD-binding  32.8 
 
 
377 aa  135  9.999999999999999e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2526  salicylate 1-monooxygenase  33.62 
 
 
396 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.066083 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3466  monooxygenase, FAD-binding  35.05 
 
 
392 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4900  monooxygenase, FAD-binding  35.05 
 
 
392 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.99121 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2318  monooxygenase FAD-binding  31.86 
 
 
385 aa  134  3e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.694664  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2962  monooxygenase FAD-binding protein  31.27 
 
 
397 aa  133  6e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3294  monooxygenase FAD-binding protein  31.85 
 
 
388 aa  133  6e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0802651  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5386  monooxygenase FAD-binding  35.14 
 
 
392 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.336288 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0392  monooxygenase FAD-binding protein  36.42 
 
 
383 aa  132  1.0000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.890611  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30630  putative FAD-dependent monooxygenase  32.46 
 
 
382 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0241073 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3565  monooxygenase FAD-binding  30.36 
 
 
384 aa  130  3e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0809  monooxygenase, FAD-binding  31.1 
 
 
396 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.815643  normal  0.21546 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2372  hypothetical protein  25.98 
 
 
374 aa  128  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2329  hypothetical protein  25.98 
 
 
374 aa  128  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2710  monooxygenase FAD-binding  28.61 
 
 
392 aa  126  6e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_56492  zeaxanthin epoxidase  29.04 
 
 
557 aa  124  2e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.688102  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5335  FAD-dependent monooxygenase  32.11 
 
 
378 aa  125  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103313  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2657  monooxygenase, FAD-binding  34.38 
 
 
377 aa  122  9.999999999999999e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.751067  normal  0.222603 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1093  monooxygenase FAD-binding  34.37 
 
 
408 aa  122  1.9999999999999998e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0291534  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3168  monooxygenase, FAD-binding  35.82 
 
 
395 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.138678 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7773  monooxygenase FAD-binding  32.57 
 
 
374 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2611  putative FAD-dependent monooxygenase  30.16 
 
 
382 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.172271  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3328  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  33.8 
 
 
407 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.150159  normal  0.347251 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2068  salicylate 1-monooxygenase  31.78 
 
 
385 aa  120  3e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.341777 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0712  hypothetical protein  33.82 
 
 
371 aa  120  3e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2514  monooxygenase FAD-binding protein  32.6 
 
 
391 aa  120  4.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2304  monooxygenase FAD-binding  34.02 
 
 
340 aa  120  4.9999999999999996e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1542  monooxygenase FAD-binding protein  28.82 
 
 
374 aa  119  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0929471  normal  0.228138 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4378  monooxygenase FAD-binding  32.26 
 
 
420 aa  119  9.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.760367 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_1611  zeaxanthin epoxidase (ABA1) (NPQ2)  30.36 
 
 
429 aa  117  3e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.539309  normal  0.0529961 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3393  monooxygenase FAD-binding  34.2 
 
 
395 aa  117  3e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.529657  normal  0.469317 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3601  salicylate 1-monooxygenase  33.94 
 
 
402 aa  115  8.999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.733205  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3927  salicylate 1-monooxygenase  30.94 
 
 
385 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.567277  normal  0.0279633 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1853  monooxygenase FAD-binding  30.17 
 
 
385 aa  115  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2455  putative monooxygenase (putative secreted protein)  35.1 
 
 
393 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4547  monooxygenase FAD-binding  30.18 
 
 
385 aa  113  5e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.326108  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0588  monooxygenase FAD-binding  34.47 
 
 
397 aa  113  5e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.395887  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0052  monooxygenase, FAD-binding  31.14 
 
 
413 aa  113  5e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1936  hypothetical protein  30.53 
 
 
376 aa  113  6e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4129  monooxygenase FAD-binding protein  32.88 
 
 
421 aa  113  6e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3162  monooxygenase FAD-binding  32.12 
 
 
387 aa  112  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5490  hypothetical protein  29.57 
 
 
376 aa  111  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.263569  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5073  Salicylate 1-monooxygenase  29.73 
 
 
386 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.926874  normal  0.172716 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1633  monooxygenase FAD-binding  30.59 
 
 
410 aa  111  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.719976  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4324  salicylate 1-monooxygenase  30.84 
 
 
385 aa  111  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.524787  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4042  salicylate 1-monooxygenase  30.84 
 
 
385 aa  111  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00369253  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2393  hypothetical protein  29.15 
 
 
376 aa  110  5e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.142228  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0859  hypothetical protein  29.33 
 
 
376 aa  110  5e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6042  monooxygenase FAD-binding  28.65 
 
 
378 aa  109  9.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0233658  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2515  salicylate 1-monooxygenase  28.66 
 
 
386 aa  108  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.193433  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0213  salicylate 1-monooxygenase (NahW)  28.53 
 
 
403 aa  109  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00584161  normal  0.918812 
 
 
-
 
NC_004310  BR0960  monooxygenase, FAD-binding  28.05 
 
 
368 aa  107  2e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.234631  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0950  monooxygenase, FAD-binding  28.05 
 
 
368 aa  108  2e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1561  hypothetical protein  31.94 
 
 
377 aa  107  3e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3483  monooxygenase FAD-binding  30.22 
 
 
385 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00147662 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3579  monooxygenase FAD-binding  28.97 
 
 
382 aa  107  4e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.817981 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0991  salicylate 1-monooxygenase  28.45 
 
 
397 aa  106  5e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0622996  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4031  DNA mismatch endonuclease Vsr  27.81 
 
 
404 aa  106  8e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0896  monooxygenase, FAD-binding  31.87 
 
 
389 aa  105  1e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3662  monooxygenase, FAD-binding  28.61 
 
 
395 aa  105  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.555838  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45845  zeaxanthin epoxidase  27.86 
 
 
565 aa  104  2e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.915807  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2140  monooxygenase FAD-binding  29.81 
 
 
382 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0383787 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0982  monooxygenase FAD-binding  32.2 
 
 
399 aa  103  4e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0183396 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>