275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0544 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_0544  hypothetical protein  100 
 
 
373 aa  743    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4962  hypothetical protein  44.26 
 
 
408 aa  280  3e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.42035  normal  0.249552 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5646  hypothetical protein  43.67 
 
 
407 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.419878  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3464  hypothetical protein  39.19 
 
 
374 aa  245  9e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.803329  normal  0.0415669 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5706  hypothetical protein  41.35 
 
 
401 aa  228  1e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0755393 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3909  hypothetical protein  42.82 
 
 
414 aa  228  2e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0793599 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0795  hypothetical protein  42.72 
 
 
390 aa  227  2e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.921964 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3158  hypothetical protein  41.67 
 
 
417 aa  226  4e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4947  hypothetical protein  43.26 
 
 
390 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.648001 
 
 
-
 
NC_003296  RS01683  hypothetical protein  42.9 
 
 
397 aa  225  8e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2954  hypothetical protein  39.73 
 
 
396 aa  224  2e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.235474  hitchhiker  0.00230621 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5501  hypothetical protein  39.88 
 
 
355 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.9082  normal  0.091793 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1493  hypothetical protein  40.92 
 
 
380 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6336  hypothetical protein  40.92 
 
 
380 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5851  hypothetical protein  39.89 
 
 
405 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.3306  hitchhiker  0.00183506 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1082  hypothetical protein  38.24 
 
 
380 aa  216  4e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1082  hypothetical protein  38.11 
 
 
380 aa  215  9e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7002  hypothetical protein  39.48 
 
 
380 aa  211  1e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00600208 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2392  hypothetical protein  39.69 
 
 
382 aa  210  3e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4959  hypothetical protein  35.77 
 
 
374 aa  208  1e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.128742 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4899  hypothetical protein  36.39 
 
 
396 aa  185  1.0000000000000001e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0592  hypothetical protein  35.79 
 
 
394 aa  179  1e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5187  monooxygenase FAD-binding  32.8 
 
 
421 aa  133  5e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.983717 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5073  Salicylate 1-monooxygenase  29.97 
 
 
386 aa  87  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.926874  normal  0.172716 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02114  salicylate hydroxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G05260)  24.76 
 
 
448 aa  84.7  0.000000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3162  monooxygenase FAD-binding  28.84 
 
 
387 aa  84.7  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3968  monooxygenase FAD-binding  24.73 
 
 
362 aa  84.3  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4013  monooxygenase FAD-binding  25.2 
 
 
362 aa  83.6  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0834664  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4031  DNA mismatch endonuclease Vsr  27.27 
 
 
404 aa  82.8  0.000000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0213  salicylate 1-monooxygenase (NahW)  25.61 
 
 
403 aa  79.7  0.00000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00584161  normal  0.918812 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2005  hypothetical protein  23.4 
 
 
377 aa  79.3  0.00000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00436005  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4547  monooxygenase FAD-binding  28.31 
 
 
385 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.326108  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3601  salicylate 1-monooxygenase  26.92 
 
 
402 aa  72.8  0.000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.733205  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6042  monooxygenase FAD-binding  24.93 
 
 
378 aa  72.4  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0233658  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1969  hypothetical protein  22.7 
 
 
377 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0438709  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5557  FAD-dependent oxidoreductase  27.52 
 
 
367 aa  71.2  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.633311 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3637  hypothetical protein  26.9 
 
 
416 aa  70.5  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.529402  normal  0.0728154 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3483  monooxygenase FAD-binding  27.11 
 
 
385 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00147662 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0991  salicylate 1-monooxygenase  27.01 
 
 
397 aa  70.5  0.00000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0622996  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0712  hypothetical protein  26.87 
 
 
371 aa  70.1  0.00000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4324  salicylate 1-monooxygenase  26.98 
 
 
385 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.524787  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4042  salicylate 1-monooxygenase  26.98 
 
 
385 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00369253  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1987  hypothetical protein  22.7 
 
 
377 aa  70.1  0.00000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000746962  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0813  monooxygenase, FAD-binding  25 
 
 
377 aa  69.7  0.00000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03392  salicylate hydroxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G17670)  26.74 
 
 
710 aa  68.9  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.39217 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2515  salicylate 1-monooxygenase  26.86 
 
 
386 aa  68.9  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.193433  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2257  hypothetical protein  23.22 
 
 
378 aa  68.2  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.472155 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2584  monooxygenase, FAD-binding  28.14 
 
 
400 aa  68.6  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.613825  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3294  monooxygenase FAD-binding protein  26.65 
 
 
388 aa  68.9  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0802651  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5490  hypothetical protein  24.11 
 
 
376 aa  67.4  0.0000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.263569  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3927  salicylate 1-monooxygenase  24.86 
 
 
385 aa  67  0.0000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.567277  normal  0.0279633 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1022  salicylate 1-monooxygenase  26.81 
 
 
391 aa  67  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3284  monooxygenase FAD-binding protein  26.43 
 
 
393 aa  66.6  0.0000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.289154 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1528  monooxygenase FAD-binding  23.51 
 
 
362 aa  66.6  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.392805  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2140  monooxygenase FAD-binding  24.14 
 
 
382 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0383787 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1853  monooxygenase FAD-binding  24.43 
 
 
385 aa  65.9  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2962  monooxygenase FAD-binding protein  25.94 
 
 
397 aa  65.5  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1214  hypothetical protein  29.14 
 
 
414 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4040  salicylate 1-monooxygenase  26.74 
 
 
404 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2393  hypothetical protein  26.5 
 
 
376 aa  65.9  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.142228  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2160  monooxygenase FAD-binding  28.16 
 
 
395 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5899  monooxygenase FAD-binding  25.27 
 
 
398 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00196665 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1889  hypothetical protein  27.57 
 
 
374 aa  64.7  0.000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0391  hypothetical protein  28.88 
 
 
440 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2372  hypothetical protein  23.14 
 
 
374 aa  64.7  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1770  hypothetical protein  28.88 
 
 
440 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2526  salicylate 1-monooxygenase  29.73 
 
 
396 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.066083 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2329  hypothetical protein  23.14 
 
 
374 aa  64.7  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0439  hypothetical protein  28.88 
 
 
440 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2849  hypothetical protein  28.88 
 
 
414 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1585  hypothetical protein  28.88 
 
 
440 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.825888  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_31126  Salicylate hydroxylase (Salicylate 1-monooxygenase)  25.41 
 
 
411 aa  64.7  0.000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0310  monooxygenase FAD-binding protein  25.16 
 
 
309 aa  64.7  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0496808  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0724  monooxygenase FAD-binding  25.74 
 
 
408 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.30015 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4207  salicylate 1-monooxygenase  28.87 
 
 
406 aa  64.3  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.880254  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3311  monooxygenase, FAD-binding  25.59 
 
 
401 aa  64.3  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2172  monooxygenase, FAD-binding  25.14 
 
 
413 aa  64.3  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0853287 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5376  hypothetical protein  27.79 
 
 
438 aa  63.9  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.819759 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2974  hypothetical protein  28.87 
 
 
414 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.556187  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1110  monooxygenase FAD-binding  26.01 
 
 
389 aa  63.9  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.7504  normal  0.659993 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1542  monooxygenase FAD-binding protein  23.62 
 
 
374 aa  63.9  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0929471  normal  0.228138 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2230  hypothetical protein  23.16 
 
 
377 aa  63.5  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000757274  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4033  monooxygenase FAD-binding  25.74 
 
 
404 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.115519 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1633  monooxygenase FAD-binding  27.5 
 
 
410 aa  63.2  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.719976  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0052  monooxygenase, FAD-binding  25.41 
 
 
413 aa  63.5  0.000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4498  salicylate 1-monooxygenase  26.4 
 
 
422 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1885  putative salicylate hydroxylase  25.82 
 
 
389 aa  63.2  0.000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.122899  normal  0.226674 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3960  monooxygenase, FAD-binding  25.49 
 
 
388 aa  63.2  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3565  monooxygenase FAD-binding  25.28 
 
 
384 aa  63.2  0.000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1206  hypothetical protein  26.79 
 
 
417 aa  62.8  0.000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0321  hypothetical protein  27.55 
 
 
414 aa  62  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.372833  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00530  conserved hypothetical protein  24.65 
 
 
435 aa  62.4  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.192511  normal  0.728795 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5727  monooxygenase, FAD-binding  25.41 
 
 
364 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3662  monooxygenase, FAD-binding  23.96 
 
 
395 aa  62.4  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.555838  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08349  conserved hypothetical protein  28.74 
 
 
349 aa  62  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2311  monooxygenase FAD-binding  24.86 
 
 
383 aa  62  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1784  monooxygenase, FAD-binding  27.72 
 
 
410 aa  62  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5348  monooxygenase, FAD-binding protein  25.41 
 
 
360 aa  62  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.437085  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0546  monooxygenase, FAD-binding  28.41 
 
 
373 aa  62  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5437  monooxygenase, FAD-binding  25.41 
 
 
364 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.863729 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>