More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0778 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0778  monooxygenase FAD-binding  100 
 
 		 393 aa  751    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0373747  decreased coverage  0.000456942 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1561  monooxygenase FAD-binding  50.75 
 
 		 392 aa  277  2e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0688558  normal  0.0725424 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0229  monooxygenase FAD-binding  42.36 
 
 		 409 aa  227  3e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.297351 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0392  monooxygenase FAD-binding protein  43.33 
 
 		 383 aa  219  8.999999999999998e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.890611  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2369  monooxygenase FAD-binding protein  42.97 
 
 		 371 aa  212  7.999999999999999e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5319  monooxygenase FAD-binding protein  39.95 
 
 		 390 aa  208  1e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2701  monooxygenase FAD-binding protein  43.29 
 
 		 377 aa  206  4e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2005  hypothetical protein  32.3 
 
 		 377 aa  206  5e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00436005  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5557  FAD-dependent oxidoreductase  40.26 
 
 		 367 aa  204  3e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.633311 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0307  FAD dependent oxidoreductase  43.47 
 
 		 378 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000823237 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1987  hypothetical protein  30.95 
 
 		 377 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000746962  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7785  FAD-dependent oxidoreductase  37.78 
 
 		 425 aa  196  4.0000000000000005e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.786204  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2257  hypothetical protein  34.09 
 
 		 378 aa  197  4.0000000000000005e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.472155 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1969  hypothetical protein  30.85 
 
 		 377 aa  193  4e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0438709  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1889  hypothetical protein  32.8 
 
 		 374 aa  192  1e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2230  hypothetical protein  29.63 
 
 		 377 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000757274  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2621  monooxygenase, FAD-binding  40.67 
 
 		 388 aa  189  7e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.684205  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1093  monooxygenase FAD-binding  36.72 
 
 		 408 aa  181  2e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0291534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2372  hypothetical protein  31.87 
 
 		 374 aa  181  2.9999999999999997e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2329  hypothetical protein  31.87 
 
 		 374 aa  181  2.9999999999999997e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0096  monooxygenase FAD-binding  37.87 
 
 		 388 aa  180  4e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0544698 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0019  monooxygenase FAD-binding protein  38.34 
 
 		 384 aa  173  3.9999999999999995e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3566  monooxygenase, FAD-binding  38.34 
 
 		 389 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.411114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4211  monooxygenase, FAD-binding  36.22 
 
 		 382 aa  171  3e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.815591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2527  monooxygenase FAD-binding protein  36.08 
 
 		 388 aa  170  3e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.172814 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3561  monooxygenase, FAD-binding protein  38.34 
 
 		 389 aa  167  4e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.014092  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3634  monooxygenase, FAD-binding  38.34 
 
 		 389 aa  167  4e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.231418  normal  0.598375 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3960  monooxygenase, FAD-binding  39.94 
 
 		 388 aa  164  3e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01380  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  37.91 
 
 		 378 aa  161  2e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19150  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  37.36 
 
 		 351 aa  160  4e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0319604  normal  0.370849 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2611  putative FAD-dependent monooxygenase  34.47 
 
 		 382 aa  146  6e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.172271  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3328  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  39.78 
 
 		 407 aa  145  9e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.150159  normal  0.347251 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2514  monooxygenase FAD-binding protein  36.27 
 
 		 391 aa  145  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21010  putative FAD-dependent monooxygenase  33.88 
 
 		 388 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.12929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2455  putative monooxygenase (putative secreted protein)  34.77 
 
 		 393 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30630  putative FAD-dependent monooxygenase  33.16 
 
 		 382 aa  140  6e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0241073 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0809  monooxygenase, FAD-binding  34.08 
 
 		 396 aa  138  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.815643  normal  0.21546 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3168  monooxygenase, FAD-binding  36.73 
 
 		 395 aa  138  1e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.138678 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4602  monooxygenase FAD-binding  36.48 
 
 		 382 aa  138  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.296431  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3393  monooxygenase FAD-binding  36.48 
 
 		 395 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.529657  normal  0.469317 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5335  FAD-dependent monooxygenase  34.68 
 
 		 378 aa  128  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103313  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3836  monooxygenase FAD-binding  34.9 
 
 		 351 aa  126  6e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2710  monooxygenase FAD-binding  29.67 
 
 		 392 aa  126  8.000000000000001e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2962  monooxygenase FAD-binding protein  31.2 
 
 		 397 aa  125  1e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4378  monooxygenase FAD-binding  33.24 
 
 		 420 aa  124  4e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.760367 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0338  monooxygenase FAD-binding  29.78 
 
 		 372 aa  122  8e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3466  monooxygenase, FAD-binding  32.77 
 
 		 392 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4900  monooxygenase, FAD-binding  32.77 
 
 		 392 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.99121 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5386  monooxygenase FAD-binding  32.82 
 
 		 392 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.336288 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2318  monooxygenase FAD-binding  31.09 
 
 		 385 aa  119  9e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.694664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4042  monooxygenase, FAD-binding  34.22 
 
 		 343 aa  118  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5278  monooxygenase, FAD-binding  31.77 
 
 		 395 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.630865 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0991  salicylate 1-monooxygenase  32.78 
 
 		 397 aa  114  3e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0622996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0813  monooxygenase, FAD-binding  30.87 
 
 		 377 aa  114  3e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0481  salicylate 1-monooxygenase  33.52 
 
 		 373 aa  110  5e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2858  monooxygenase FAD-binding  37.28 
 
 		 382 aa  110  5e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3294  monooxygenase FAD-binding protein  29.58 
 
 		 388 aa  109  8.000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0802651  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3565  monooxygenase FAD-binding  29.89 
 
 		 384 aa  109  9.000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2339  monooxygenase FAD-binding  30.21 
 
 		 388 aa  109  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000167175  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0213  salicylate 1-monooxygenase (NahW)  31.34 
 
 		 403 aa  108  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00584161  normal  0.918812 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4002  monooxygenase FAD-binding  30.17 
 
 		 376 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3957  monooxygenase FAD-binding  30.17 
 
 		 376 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_1611  zeaxanthin epoxidase (ABA1) (NPQ2)  31.3 
 
 		 429 aa  106  7e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.539309  normal  0.0529961 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1784  monooxygenase, FAD-binding  30.77 
 
 		 410 aa  105  2e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4129  monooxygenase FAD-binding protein  32.81 
 
 		 421 aa  105  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2657  monooxygenase, FAD-binding  33.43 
 
 		 377 aa  103  5e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.751067  normal  0.222603 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2182  monooxygenase, FAD-binding  31.37 
 
 		 412 aa  103  5e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4031  DNA mismatch endonuclease Vsr  32.29 
 
 		 404 aa  103  7e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2068  salicylate 1-monooxygenase  32.31 
 
 		 385 aa  102  9e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.341777 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0514  hypothetical protein  32.48 
 
 		 421 aa  101  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.472933  normal  0.467939 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1633  monooxygenase FAD-binding  33.42 
 
 		 410 aa  101  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.719976  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2552  monooxygenase FAD-binding protein  32.77 
 
 		 376 aa  100  3e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0125  monooxygenase FAD-binding  26.13 
 
 		 374 aa  98.6  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_56492  zeaxanthin epoxidase  27.96 
 
 		 557 aa  99  1e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.688102  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1853  monooxygenase FAD-binding  30.21 
 
 		 385 aa  99  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2304  monooxygenase FAD-binding  33.43 
 
 		 340 aa  98.6  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3586  salicylate 1-monooxygenase  31.03 
 
 		 427 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.942873 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1542  monooxygenase FAD-binding protein  28.23 
 
 		 374 aa  97.4  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0929471  normal  0.228138 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2515  salicylate 1-monooxygenase  30.7 
 
 		 386 aa  97.1  5e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.193433  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2128  salicylate hydroxylase  30.75 
 
 		 397 aa  96.7  6e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.453627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2526  salicylate 1-monooxygenase  30.7 
 
 		 396 aa  96.7  6e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.066083 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3927  salicylate 1-monooxygenase  30.5 
 
 		 385 aa  96.7  6e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.567277  normal  0.0279633 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0982  monooxygenase FAD-binding  32.06 
 
 		 369 aa  96.7  7e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.240273  decreased coverage  0.000117397 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2131  salicylate 1-monooxygenase  31.23 
 
 		 400 aa  95.5  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3547  hypothetical protein  30.86 
 
 		 374 aa  95.9  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4393  monooxygenase FAD-binding  30.86 
 
 		 377 aa  95.5  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1093  monooxygenase, FAD-binding  31.79 
 
 		 369 aa  94.7  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.363504 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_56488  precursor of protein zeaxanthin epoxidase-like protein  26.54 
 
 		 604 aa  94.7  3e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0982  monooxygenase FAD-binding  32.99 
 
 		 399 aa  94  4e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0183396 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1110  monooxygenase FAD-binding  29.72 
 
 		 389 aa  93.2  7e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.7504  normal  0.659993 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3612  monooxygenase FAD-binding  34.37 
 
 		 430 aa  93.2  8e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0302868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20710  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  31.66 
 
 		 414 aa  93.2  8e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.336211  normal  0.159251 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3149  salicylate 1-monooxygenase  31.79 
 
 		 398 aa  92.8  9e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.136472  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3284  monooxygenase FAD-binding protein  31.86 
 
 		 393 aa  92.8  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.289154 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3162  monooxygenase FAD-binding  30.95 
 
 		 387 aa  92  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5387  hypothetical protein  31.73 
 
 		 420 aa  92  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2242  hypothetical protein  32.24 
 
 		 379 aa  91.3  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3601  salicylate 1-monooxygenase  29.62 
 
 		 402 aa  90.5  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.733205  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0712  hypothetical protein  29.19 
 
 		 371 aa  90.5  4e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6537  monooxygenase, FAD-binding protein  29.43 
 
 		 392 aa  90.5  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0203356  normal  0.0154804 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>