More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5423 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_5423  monooxygenase FAD-binding  100 
 
 
382 aa  797    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.224517  normal  0.231326 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2326  monooxygenase FAD-binding protein  57.85 
 
 
388 aa  469  1.0000000000000001e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000156334  normal  0.582922 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1924  monooxygenase; 2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase  62.3 
 
 
387 aa  466  9.999999999999999e-131  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.630677  normal  0.306888 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4254  monooxygenase FAD-binding  52.71 
 
 
392 aa  417  9.999999999999999e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1277  monooxygenase FAD-binding  50.67 
 
 
381 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2826  monooxygenase, FAD-binding  52.24 
 
 
387 aa  396  1e-109  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00129396  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1438  monooxygenase, FAD-binding  41.94 
 
 
413 aa  293  4e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00120206  hitchhiker  0.00122057 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5691  monooxygenase FAD-binding  36.39 
 
 
376 aa  241  1e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2837  monooxygenase FAD-binding  37.32 
 
 
378 aa  239  6.999999999999999e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4844  monooxygenase, FAD-binding protein  35.57 
 
 
390 aa  232  8.000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4474  salicylate hydroxylase protein  39.31 
 
 
377 aa  232  1e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.102807 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0802  monooxygenase FAD-binding  37.11 
 
 
371 aa  216  5.9999999999999996e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.615046  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1380  monooxygenase FAD-binding  39.5 
 
 
372 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.709095 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3818  monooxygenase FAD-binding  35.95 
 
 
378 aa  215  9.999999999999999e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.357574  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3517  monooxygenase, FAD-binding  35.31 
 
 
385 aa  214  2.9999999999999995e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.623295  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3463  monooxygenase FAD-binding protein  36.65 
 
 
376 aa  213  5.999999999999999e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.039982  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2878  monooxygenase FAD-binding  35.77 
 
 
378 aa  211  1e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2823  monooxygenase, FAD-binding  35.99 
 
 
371 aa  208  1e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.091542  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3699  monooxygenase FAD-binding  37.08 
 
 
371 aa  205  1e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.442596  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA01280  conserved expressed protein  35.42 
 
 
442 aa  196  8.000000000000001e-49  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08716  salicylate hydroxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G01050)  33.24 
 
 
415 aa  163  4.0000000000000004e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09224  conserved hypothetical protein  30.95 
 
 
443 aa  140  3.9999999999999997e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0398  putative monooxygenase  31.19 
 
 
257 aa  104  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3854  monooxygenase FAD-binding protein  29.21 
 
 
424 aa  100  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6537  monooxygenase, FAD-binding protein  27.64 
 
 
392 aa  94.4  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0203356  normal  0.0154804 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4031  DNA mismatch endonuclease Vsr  26.53 
 
 
404 aa  89.4  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1022  salicylate 1-monooxygenase  26.1 
 
 
391 aa  88.6  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_92063  predicted protein  26.33 
 
 
509 aa  87  4e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0115456  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3944  salicylate hydroxylase  27.91 
 
 
382 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0448295  normal  0.412797 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5278  monooxygenase, FAD-binding  27.17 
 
 
395 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.630865 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1893  monooxygenase, FAD-binding  28.29 
 
 
382 aa  84  0.000000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2140  monooxygenase FAD-binding  27.52 
 
 
382 aa  83.2  0.000000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0383787 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3579  monooxygenase FAD-binding  27.91 
 
 
382 aa  83.2  0.000000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.817981 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2515  salicylate 1-monooxygenase  28.09 
 
 
386 aa  81.3  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.193433  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1633  monooxygenase FAD-binding  27.41 
 
 
410 aa  80.9  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.719976  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1231  salicylate 1-monooxygenase  24.94 
 
 
404 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.592071  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4498  salicylate 1-monooxygenase  25.78 
 
 
422 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4040  salicylate 1-monooxygenase  24.87 
 
 
404 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2680  monooxygenase, FAD-binding  27.27 
 
 
384 aa  79.7  0.00000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.156834  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3294  monooxygenase FAD-binding protein  27.68 
 
 
388 aa  79  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0802651  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6042  monooxygenase FAD-binding  25.28 
 
 
378 aa  79  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0233658  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4263  monooxygenase FAD-binding  28.21 
 
 
398 aa  78.2  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00000952252  normal  0.156031 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4033  monooxygenase FAD-binding  24.17 
 
 
404 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.115519 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2005  hypothetical protein  25.07 
 
 
377 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00436005  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2311  monooxygenase FAD-binding  27.8 
 
 
383 aa  77.8  0.0000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_88642  predicted protein  24.31 
 
 
1070 aa  77  0.0000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0132852 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1853  monooxygenase FAD-binding  28.42 
 
 
385 aa  76.6  0.0000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0991  salicylate 1-monooxygenase  25.27 
 
 
397 aa  76.3  0.0000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0622996  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3295  monooxygenase FAD-binding protein  26.03 
 
 
379 aa  76.3  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.676341 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2705  monooxygenase, FAD-binding protein  27.25 
 
 
423 aa  75.9  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.891359  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5584  monooxygenase FAD-binding protein  26.5 
 
 
401 aa  75.1  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5073  Salicylate 1-monooxygenase  29.31 
 
 
386 aa  75.1  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.926874  normal  0.172716 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3927  salicylate 1-monooxygenase  27.08 
 
 
385 aa  74.3  0.000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.567277  normal  0.0279633 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0813  monooxygenase, FAD-binding  26.42 
 
 
377 aa  74.3  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2786  monooxygenase FAD-binding protein  26.45 
 
 
408 aa  74.3  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00390244  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0881  hypothetical protein  27.5 
 
 
402 aa  73.9  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.200049  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3209  monooxygenase, FAD-binding  26.36 
 
 
483 aa  74.3  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0546  monooxygenase, FAD-binding  25.14 
 
 
373 aa  74.3  0.000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4207  salicylate 1-monooxygenase  24.81 
 
 
406 aa  73.6  0.000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.880254  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3996  hypothetical protein  26.89 
 
 
417 aa  73.9  0.000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1193  monooxygenase, FAD-binding  24.87 
 
 
390 aa  73.6  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.155257  normal  0.524756 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4164  putative monoxygenase  26.42 
 
 
415 aa  73.6  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0321225  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1542  monooxygenase FAD-binding protein  24.58 
 
 
374 aa  73.2  0.000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0929471  normal  0.228138 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1285  monooxygenase, FAD-binding protein  24.87 
 
 
410 aa  73.2  0.000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1110  monooxygenase FAD-binding  26.21 
 
 
389 aa  72.4  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.7504  normal  0.659993 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3601  salicylate 1-monooxygenase  27.33 
 
 
402 aa  71.2  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.733205  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2693  monooxygenase FAD-binding  24.81 
 
 
450 aa  70.9  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.433574  hitchhiker  0.000536484 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2962  monooxygenase FAD-binding protein  23.68 
 
 
397 aa  70.9  0.00000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0812  Kynurenine 3-monooxygenase  26.54 
 
 
427 aa  70.5  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3284  monooxygenase FAD-binding protein  26.92 
 
 
393 aa  70.5  0.00000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.289154 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2230  hypothetical protein  23.68 
 
 
377 aa  70.1  0.00000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000757274  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09400  hypothetical protein  27 
 
 
402 aa  70.1  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5851  hypothetical protein  24.79 
 
 
405 aa  69.7  0.00000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.3306  hitchhiker  0.00183506 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2526  salicylate 1-monooxygenase  24.46 
 
 
396 aa  69.7  0.00000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.066083 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0841  Kynurenine 3-monooxygenase  26.92 
 
 
427 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4547  monooxygenase FAD-binding  25.38 
 
 
385 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.326108  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6277  monooxygenase FAD-binding  23.68 
 
 
405 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.146167  normal  0.672282 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5727  monooxygenase, FAD-binding  24.21 
 
 
364 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1313  monooxygenase, FAD-binding  23.8 
 
 
391 aa  68.2  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2656  putative salicylate hydroxylase (salicylate 1-monooxygenase)  23.8 
 
 
391 aa  68.2  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21010  putative FAD-dependent monooxygenase  27.72 
 
 
388 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.12929  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2748  monooxygenase FAD-binding protein  25.93 
 
 
489 aa  68.6  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2974  hypothetical protein  27.3 
 
 
414 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.556187  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3565  monooxygenase FAD-binding  24.49 
 
 
384 aa  67.8  0.0000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2710  monooxygenase FAD-binding  23.42 
 
 
392 aa  68.2  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3524  monooxygenase FAD-binding protein  26.69 
 
 
401 aa  67.8  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.894226  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4355  hypothetical protein  25.24 
 
 
421 aa  67.8  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0233973  normal  0.534906 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5348  monooxygenase, FAD-binding protein  24.21 
 
 
360 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.437085  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5437  monooxygenase, FAD-binding  24.21 
 
 
364 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.863729 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1889  hypothetical protein  24.19 
 
 
374 aa  67.4  0.0000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1214  hypothetical protein  27.03 
 
 
414 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2509  monooxygenase, FAD-binding  25 
 
 
450 aa  67  0.0000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.389183  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4962  hypothetical protein  25.98 
 
 
408 aa  67  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.42035  normal  0.249552 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4138  monooxygenase, FAD-binding protein  27.22 
 
 
408 aa  67  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.145497  normal  0.0296411 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68955  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  28.64 
 
 
405 aa  66.6  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2849  hypothetical protein  26.77 
 
 
414 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG00340  kynurenine 3-monooxygenase, putative  23.82 
 
 
421 aa  66.2  0.0000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.303065  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2599  Kynurenine 3-monooxygenase  26.34 
 
 
455 aa  66.2  0.0000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0833412  normal  0.344661 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5812  monooxygenase, FAD-binding protein  25.55 
 
 
408 aa  66.2  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0698086  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0712  hypothetical protein  26.6 
 
 
371 aa  66.2  0.0000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>