More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4254 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4254  monooxygenase FAD-binding  100 
 
 		 392 aa  809    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5423  monooxygenase FAD-binding  52.71 
 
 		 382 aa  417  9.999999999999999e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.224517  normal  0.231326 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2326  monooxygenase FAD-binding protein  47.57 
 
 		 388 aa  376  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000156334  normal  0.582922 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1924  monooxygenase; 2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase  52.33 
 
 		 387 aa  375  1e-102  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.630677  normal  0.306888 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1277  monooxygenase FAD-binding  46.15 
 
 		 381 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2826  monooxygenase, FAD-binding  44.76 
 
 		 387 aa  318  7e-86  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00129396  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1438  monooxygenase, FAD-binding  39.69 
 
 		 413 aa  261  1e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00120206  hitchhiker  0.00122057 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2823  monooxygenase, FAD-binding  35.73 
 
 		 371 aa  217  2.9999999999999998e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.091542  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5691  monooxygenase FAD-binding  35.18 
 
 		 376 aa  213  2.9999999999999995e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3463  monooxygenase FAD-binding protein  33.94 
 
 		 376 aa  211  1e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.039982  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4474  salicylate hydroxylase protein  37.33 
 
 		 377 aa  208  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.102807 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2837  monooxygenase FAD-binding  34.46 
 
 		 378 aa  207  3e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3517  monooxygenase, FAD-binding  33.76 
 
 		 385 aa  206  8e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.623295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2878  monooxygenase FAD-binding  34.29 
 
 		 378 aa  195  1e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4844  monooxygenase, FAD-binding protein  33 
 
 		 390 aa  190  4e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0802  monooxygenase FAD-binding  32.61 
 
 		 371 aa  188  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.615046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3818  monooxygenase FAD-binding  34.51 
 
 		 378 aa  177  3e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.357574  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3699  monooxygenase FAD-binding  36.39 
 
 		 371 aa  175  9.999999999999999e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.442596  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA01280  conserved expressed protein  33.72 
 
 		 442 aa  172  1e-41  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1380  monooxygenase FAD-binding  36.29 
 
 		 372 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.709095 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08716  salicylate hydroxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G01050)  29.66 
 
 		 415 aa  135  9.999999999999999e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09224  conserved hypothetical protein  27.4 
 
 		 443 aa  122  9e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0398  putative monooxygenase  30.58 
 
 		 257 aa  97.8  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1231  salicylate 1-monooxygenase  25.42 
 
 		 404 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.592071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3579  monooxygenase FAD-binding  26.52 
 
 		 382 aa  80.1  0.00000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.817981 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1633  monooxygenase FAD-binding  26.49 
 
 		 410 aa  79.7  0.00000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.719976  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3944  salicylate hydroxylase  26.78 
 
 		 382 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0448295  normal  0.412797 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1893  monooxygenase, FAD-binding  26.78 
 
 		 382 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3904  kynurenine 3-monooxygenase  27.4 
 
 		 446 aa  79  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2140  monooxygenase FAD-binding  27.08 
 
 		 382 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0383787 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4031  DNA mismatch endonuclease Vsr  26.18 
 
 		 404 aa  77.4  0.0000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_92063  predicted protein  25.74 
 
 		 509 aa  76.6  0.0000000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0115456  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4164  putative monoxygenase  27.41 
 
 		 415 aa  76.3  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0321225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3209  monooxygenase, FAD-binding  27.59 
 
 		 483 aa  75.5  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1285  monooxygenase, FAD-binding protein  27.86 
 
 		 410 aa  74.7  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0896  monooxygenase, FAD-binding  27.97 
 
 		 389 aa  74.3  0.000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3529  kynurenine 3-monooxygenase  26.75 
 
 		 445 aa  73.6  0.000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.978115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4033  monooxygenase FAD-binding  24.88 
 
 		 404 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.115519 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5278  monooxygenase, FAD-binding  27.15 
 
 		 395 aa  72.8  0.000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.630865 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1214  hypothetical protein  27.6 
 
 		 414 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_88642  predicted protein  26.04 
 
 		 1070 aa  72.8  0.00000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0132852 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3854  monooxygenase FAD-binding protein  27.6 
 
 		 424 aa  72.8  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6042  monooxygenase FAD-binding  27.03 
 
 		 378 aa  72  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0233658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4547  monooxygenase FAD-binding  27 
 
 		 385 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.326108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2849  hypothetical protein  27.32 
 
 		 414 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3565  monooxygenase FAD-binding  25.9 
 
 		 384 aa  70.9  0.00000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2974  hypothetical protein  28.07 
 
 		 414 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.556187  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1142  monooxygenase FAD-binding  26.07 
 
 		 388 aa  70.5  0.00000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000665044 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1253  monooxygenase, FAD-binding  25.79 
 
 		 388 aa  69.7  0.00000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.420129  normal  0.229963 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0391  hypothetical protein  27.52 
 
 		 440 aa  69.7  0.00000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0439  hypothetical protein  27.52 
 
 		 440 aa  69.7  0.00000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1585  hypothetical protein  27.52 
 
 		 440 aa  69.7  0.00000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.825888  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1770  hypothetical protein  27.52 
 
 		 440 aa  69.7  0.00000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6537  monooxygenase, FAD-binding protein  26.9 
 
 		 392 aa  68.9  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0203356  normal  0.0154804 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2515  salicylate 1-monooxygenase  26.22 
 
 		 386 aa  68.9  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.193433  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5851  hypothetical protein  26.65 
 
 		 405 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.3306  hitchhiker  0.00183506 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2526  salicylate 1-monooxygenase  24.33 
 
 		 396 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.066083 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4040  salicylate 1-monooxygenase  24.36 
 
 		 404 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5650  monooxygenase FAD-binding  25.96 
 
 		 416 aa  69.3  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.470651  normal  0.804587 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2599  Kynurenine 3-monooxygenase  24.17 
 
 		 455 aa  69.3  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0833412  normal  0.344661 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14452  predicted protein  29.46 
 
 		 296 aa  68.9  0.0000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4498  salicylate 1-monooxygenase  24.75 
 
 		 422 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0813  monooxygenase, FAD-binding  25.38 
 
 		 377 aa  67.4  0.0000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2393  hypothetical protein  25.13 
 
 		 376 aa  67  0.0000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.142228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3483  monooxygenase FAD-binding  27.27 
 
 		 385 aa  67  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147662 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5584  monooxygenase FAD-binding protein  26.75 
 
 		 401 aa  66.2  0.0000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2311  monooxygenase FAD-binding  24.71 
 
 		 383 aa  65.9  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4324  salicylate 1-monooxygenase  26.33 
 
 		 385 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.524787  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1528  monooxygenase FAD-binding  24.87 
 
 		 362 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.392805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4042  salicylate 1-monooxygenase  26.33 
 
 		 385 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00369253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0928  monooxygenase FAD-binding  26.85 
 
 		 424 aa  64.7  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.607239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4063  monooxygenase FAD-binding protein  26.79 
 
 		 402 aa  64.3  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.69418 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3936  monooxygenase FAD-binding protein  25.81 
 
 		 455 aa  63.9  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.018551  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3547  hypothetical protein  25.97 
 
 		 374 aa  63.9  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3294  monooxygenase FAD-binding protein  30.14 
 
 		 388 aa  63.9  0.000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0802651  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4207  salicylate 1-monooxygenase  26.35 
 
 		 406 aa  63.9  0.000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.880254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0881  hypothetical protein  26.68 
 
 		 402 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.200049  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4602  monooxygenase FAD-binding  27.39 
 
 		 382 aa  62.8  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.296431  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4006  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  25.59 
 
 		 395 aa  62.8  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187739  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0213  salicylate 1-monooxygenase (NahW)  25.13 
 
 		 403 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00584161  normal  0.918812 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4018  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  27.5 
 
 		 398 aa  62.4  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0812  Kynurenine 3-monooxygenase  26.02 
 
 		 427 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2705  monooxygenase, FAD-binding protein  27.15 
 
 		 423 aa  62.8  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.891359  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1542  monooxygenase FAD-binding protein  23.62 
 
 		 374 aa  62.4  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0929471  normal  0.228138 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0841  Kynurenine 3-monooxygenase  26.02 
 
 		 427 aa  62.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6220  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  26.15 
 
 		 390 aa  62  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.315018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1193  monooxygenase, FAD-binding  28.34 
 
 		 390 aa  62  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.155257  normal  0.524756 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6277  monooxygenase FAD-binding  24.8 
 
 		 405 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.146167  normal  0.672282 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05260  conserved hypothetical protein  24.86 
 
 		 446 aa  60.8  0.00000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3586  salicylate 1-monooxygenase  22.69 
 
 		 427 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.942873 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09400  hypothetical protein  26.42 
 
 		 402 aa  60.5  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2962  monooxygenase FAD-binding protein  26.16 
 
 		 397 aa  60.1  0.00000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2656  putative salicylate hydroxylase (salicylate 1-monooxygenase)  28.34 
 
 		 391 aa  60.1  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5490  hypothetical protein  26.56 
 
 		 376 aa  60.1  0.00000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.263569  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1313  monooxygenase, FAD-binding  28.34 
 
 		 391 aa  60.1  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5727  monooxygenase, FAD-binding  23.14 
 
 		 364 aa  60.1  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2693  monooxygenase FAD-binding  25.49 
 
 		 450 aa  59.3  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.433574  hitchhiker  0.000536484 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0546  monooxygenase, FAD-binding  26.43 
 
 		 373 aa  59.3  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1886  monooxygenase FAD-binding  25.66 
 
 		 480 aa  59.3  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5348  monooxygenase, FAD-binding protein  23.14 
 
 		 360 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.437085  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>