More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1438 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1438  monooxygenase, FAD-binding  100 
 
 		 413 aa  840    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00120206  hitchhiker  0.00122057 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5423  monooxygenase FAD-binding  41.94 
 
 		 382 aa  293  4e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.224517  normal  0.231326 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4844  monooxygenase, FAD-binding protein  41.9 
 
 		 390 aa  279  6e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2326  monooxygenase FAD-binding protein  42.74 
 
 		 388 aa  278  9e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000156334  normal  0.582922 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1277  monooxygenase FAD-binding  39.95 
 
 		 381 aa  273  3e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1924  monooxygenase; 2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase  41.21 
 
 		 387 aa  269  8e-71  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.630677  normal  0.306888 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3517  monooxygenase, FAD-binding  40.31 
 
 		 385 aa  263  3e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.623295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4474  salicylate hydroxylase protein  45.17 
 
 		 377 aa  262  6.999999999999999e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.102807 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4254  monooxygenase FAD-binding  39.69 
 
 		 392 aa  261  1e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2837  monooxygenase FAD-binding  39.08 
 
 		 378 aa  258  2e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3818  monooxygenase FAD-binding  40.45 
 
 		 378 aa  245  9.999999999999999e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.357574  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2878  monooxygenase FAD-binding  39.78 
 
 		 378 aa  242  7.999999999999999e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3463  monooxygenase FAD-binding protein  38.54 
 
 		 376 aa  235  1.0000000000000001e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.039982  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0802  monooxygenase FAD-binding  37.95 
 
 		 371 aa  230  4e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.615046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2826  monooxygenase, FAD-binding  34.29 
 
 		 387 aa  217  2.9999999999999998e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00129396  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3699  monooxygenase FAD-binding  40.48 
 
 		 371 aa  216  5e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.442596  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1380  monooxygenase FAD-binding  43.23 
 
 		 372 aa  204  2e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.709095 
 
 
-
 
NC_006670  CNA01280  conserved expressed protein  33.42 
 
 		 442 aa  201  9.999999999999999e-51  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5691  monooxygenase FAD-binding  34.57 
 
 		 376 aa  200  3.9999999999999996e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2823  monooxygenase, FAD-binding  33.62 
 
 		 371 aa  192  9e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.091542  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08716  salicylate hydroxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G01050)  33.68 
 
 		 415 aa  173  5.999999999999999e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09224  conserved hypothetical protein  31.37 
 
 		 443 aa  161  2e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0398  putative monooxygenase  39.02 
 
 		 257 aa  145  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5073  Salicylate 1-monooxygenase  30.94 
 
 		 386 aa  101  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.926874  normal  0.172716 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3854  monooxygenase FAD-binding protein  28.53 
 
 		 424 aa  100  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4031  DNA mismatch endonuclease Vsr  28.42 
 
 		 404 aa  95.1  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6042  monooxygenase FAD-binding  29.92 
 
 		 378 aa  95.1  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0233658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0813  monooxygenase, FAD-binding  28.12 
 
 		 377 aa  92.4  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1885  putative salicylate hydroxylase  27.02 
 
 		 389 aa  92  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.122899  normal  0.226674 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1285  monooxygenase, FAD-binding protein  29.56 
 
 		 410 aa  88.2  3e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2311  monooxygenase FAD-binding  27.13 
 
 		 383 aa  87  6e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_92063  predicted protein  28.94 
 
 		 509 aa  86.7  8e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0115456  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_56492  zeaxanthin epoxidase  27.39 
 
 		 557 aa  84.7  0.000000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.688102  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3524  monooxygenase FAD-binding protein  29.83 
 
 		 401 aa  84.3  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.894226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3601  salicylate 1-monooxygenase  29.33 
 
 		 402 aa  84  0.000000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.733205  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5278  monooxygenase, FAD-binding  27.81 
 
 		 395 aa  83.6  0.000000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.630865 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2393  hypothetical protein  28.31 
 
 		 376 aa  82.4  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.142228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2005  hypothetical protein  25.14 
 
 		 377 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00436005  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5812  monooxygenase, FAD-binding protein  29.13 
 
 		 408 aa  81.6  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0698086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0213  salicylate 1-monooxygenase (NahW)  29.13 
 
 		 403 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00584161  normal  0.918812 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3936  monooxygenase FAD-binding protein  27.85 
 
 		 455 aa  81.3  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.018551  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0712  hypothetical protein  28.93 
 
 		 371 aa  81.3  0.00000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2599  Kynurenine 3-monooxygenase  27.79 
 
 		 455 aa  81.3  0.00000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0833412  normal  0.344661 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1022  salicylate 1-monooxygenase  27.16 
 
 		 391 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10960  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  27.02 
 
 		 403 aa  81.6  0.00000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1633  monooxygenase FAD-binding  26.93 
 
 		 410 aa  80.5  0.00000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.719976  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1889  hypothetical protein  26.26 
 
 		 374 aa  80.1  0.00000000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4498  salicylate 1-monooxygenase  28.68 
 
 		 422 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1784  monooxygenase, FAD-binding  29.28 
 
 		 410 aa  79.7  0.00000000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2693  monooxygenase FAD-binding  27.18 
 
 		 450 aa  79  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.433574  hitchhiker  0.000536484 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2140  monooxygenase FAD-binding  26.82 
 
 		 382 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0383787 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4324  salicylate 1-monooxygenase  25.19 
 
 		 385 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.524787  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4042  salicylate 1-monooxygenase  25.19 
 
 		 385 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00369253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3483  monooxygenase FAD-binding  25.19 
 
 		 385 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147662 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2515  salicylate 1-monooxygenase  25.82 
 
 		 386 aa  77.4  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.193433  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3231  monooxygenase FAD-binding  31.54 
 
 		 400 aa  77.4  0.0000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4040  salicylate 1-monooxygenase  28.24 
 
 		 404 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00760  kynurenine 3-monooxygenase  27.83 
 
 		 445 aa  76.6  0.0000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.35221  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4033  monooxygenase FAD-binding  27.09 
 
 		 404 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.115519 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1969  hypothetical protein  24.93 
 
 		 377 aa  76.6  0.0000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0438709  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2526  salicylate 1-monooxygenase  26.4 
 
 		 396 aa  76.6  0.0000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.066083 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_88642  predicted protein  27.18 
 
 		 1070 aa  75.5  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0132852 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14452  predicted protein  30.71 
 
 		 296 aa  75.5  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0481  salicylate 1-monooxygenase  27.36 
 
 		 373 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1231  salicylate 1-monooxygenase  27.72 
 
 		 404 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.592071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2068  salicylate 1-monooxygenase  27.02 
 
 		 385 aa  75.1  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.341777 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4207  salicylate 1-monooxygenase  30.24 
 
 		 406 aa  75.5  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.880254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4547  monooxygenase FAD-binding  25.14 
 
 		 385 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.326108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5899  monooxygenase FAD-binding  27.36 
 
 		 398 aa  75.5  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00196665 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5490  hypothetical protein  27.39 
 
 		 376 aa  75.1  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.263569  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5387  hypothetical protein  28.05 
 
 		 420 aa  74.3  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0881  hypothetical protein  30.08 
 
 		 402 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.200049  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3162  monooxygenase FAD-binding  28.76 
 
 		 387 aa  74.3  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3565  monooxygenase FAD-binding  26.15 
 
 		 384 aa  74.3  0.000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09400  hypothetical protein  29.9 
 
 		 402 aa  74.3  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0549  monooxygenase FAD-binding  26.37 
 
 		 380 aa  73.9  0.000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.554692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3579  monooxygenase FAD-binding  26.98 
 
 		 382 aa  73.6  0.000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.817981 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3927  salicylate 1-monooxygenase  25.38 
 
 		 385 aa  73.6  0.000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.567277  normal  0.0279633 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3224  monooxygenase FAD-binding  27.9 
 
 		 399 aa  73.2  0.000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.494892 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2527  monooxygenase FAD-binding protein  29.04 
 
 		 388 aa  73.2  0.000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.172814 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2656  putative salicylate hydroxylase (salicylate 1-monooxygenase)  26.37 
 
 		 391 aa  73.2  0.000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1313  monooxygenase, FAD-binding  26.37 
 
 		 391 aa  73.2  0.000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3209  monooxygenase, FAD-binding  27.01 
 
 		 483 aa  72.4  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01821  FAD-binding monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G07040)  26.8 
 
 		 423 aa  72.4  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00520599  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1987  hypothetical protein  25.86 
 
 		 377 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000746962  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1853  monooxygenase FAD-binding  26.12 
 
 		 385 aa  72.8  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02114  salicylate hydroxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G05260)  24.27 
 
 		 448 aa  71.6  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1193  monooxygenase, FAD-binding  26.45 
 
 		 390 aa  71.6  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.155257  normal  0.524756 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1528  monooxygenase FAD-binding  27.4 
 
 		 362 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.392805  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1565  monooxygenase FAD-binding  27.72 
 
 		 384 aa  72  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.156985 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3328  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  31.9 
 
 		 407 aa  71.6  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.150159  normal  0.347251 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4211  monooxygenase, FAD-binding  28.83 
 
 		 382 aa  72  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.815591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4138  monooxygenase, FAD-binding protein  27.97 
 
 		 408 aa  70.9  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.145497  normal  0.0296411 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4249  monooxygenase FAD-binding  26.15 
 
 		 370 aa  70.9  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.850855  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3944  salicylate hydroxylase  26.7 
 
 		 382 aa  70.5  0.00000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0448295  normal  0.412797 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3441  monooxygenase FAD-binding  29.89 
 
 		 428 aa  70.5  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000658933  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1893  monooxygenase, FAD-binding  26.7 
 
 		 382 aa  70.5  0.00000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2329  hypothetical protein  25.93 
 
 		 374 aa  70.1  0.00000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2372  hypothetical protein  25.93 
 
 		 374 aa  70.1  0.00000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1762  monooxygenase FAD-binding  27.62 
 
 		 384 aa  70.1  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.638414  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>