More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1380 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_1380  monooxygenase FAD-binding  100 
 
 		 372 aa  741    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.709095 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5423  monooxygenase FAD-binding  40.06 
 
 		 382 aa  251  2e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.224517  normal  0.231326 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1438  monooxygenase, FAD-binding  40.37 
 
 		 413 aa  242  7.999999999999999e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00120206  hitchhiker  0.00122057 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4844  monooxygenase, FAD-binding protein  42.23 
 
 		 390 aa  238  2e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2837  monooxygenase FAD-binding  42.11 
 
 		 378 aa  229  5e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2326  monooxygenase FAD-binding protein  35.98 
 
 		 388 aa  224  1e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000156334  normal  0.582922 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1924  monooxygenase; 2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase  41.13 
 
 		 387 aa  223  3e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.630677  normal  0.306888 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4474  salicylate hydroxylase protein  44.84 
 
 		 377 aa  223  6e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.102807 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3463  monooxygenase FAD-binding protein  41.44 
 
 		 376 aa  222  9.999999999999999e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.039982  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1277  monooxygenase FAD-binding  37.03 
 
 		 381 aa  221  9.999999999999999e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3818  monooxygenase FAD-binding  44.03 
 
 		 378 aa  218  1e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.357574  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2878  monooxygenase FAD-binding  43.27 
 
 		 378 aa  215  8e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3517  monooxygenase, FAD-binding  39.63 
 
 		 385 aa  215  9e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.623295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4254  monooxygenase FAD-binding  37.06 
 
 		 392 aa  206  7e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0802  monooxygenase FAD-binding  43.81 
 
 		 371 aa  200  3e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.615046  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA01280  conserved expressed protein  32.65 
 
 		 442 aa  191  1e-47  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3699  monooxygenase FAD-binding  44.89 
 
 		 371 aa  189  5e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.442596  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2826  monooxygenase, FAD-binding  31.45 
 
 		 387 aa  186  7e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00129396  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09224  conserved hypothetical protein  33.56 
 
 		 443 aa  180  2.9999999999999997e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08716  salicylate hydroxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G01050)  34.97 
 
 		 415 aa  170  4e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2823  monooxygenase, FAD-binding  31.07 
 
 		 371 aa  161  2e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.091542  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0398  putative monooxygenase  42.99 
 
 		 257 aa  161  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5691  monooxygenase FAD-binding  30.77 
 
 		 376 aa  146  5e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_92063  predicted protein  32.47 
 
 		 509 aa  82.8  0.000000000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0115456  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1542  monooxygenase FAD-binding protein  27.38 
 
 		 374 aa  81.6  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0929471  normal  0.228138 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_56492  zeaxanthin epoxidase  26.8 
 
 		 557 aa  75.9  0.000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.688102  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1462  monooxygenase FAD-binding  28.1 
 
 		 390 aa  75.9  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000001589  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1762  monooxygenase FAD-binding  25.51 
 
 		 384 aa  75.5  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.638414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3854  monooxygenase FAD-binding protein  27.14 
 
 		 424 aa  75.9  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3917  putative oxidoreductase  30.31 
 
 		 397 aa  75.1  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.280043  normal  0.0698195 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6537  monooxygenase, FAD-binding protein  28.41 
 
 		 392 aa  74.7  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0203356  normal  0.0154804 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0813  monooxygenase, FAD-binding  27.73 
 
 		 377 aa  74.3  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2526  salicylate 1-monooxygenase  28.8 
 
 		 396 aa  73.2  0.000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.066083 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3380  kynurenine 3-monooxygenase  25.57 
 
 		 449 aa  72  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0739949 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1494  monooxygenase, FAD-binding  30.14 
 
 		 386 aa  70.9  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.379752  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6042  monooxygenase FAD-binding  28.75 
 
 		 378 aa  70.1  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0233658  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0392  monooxygenase FAD-binding protein  31.35 
 
 		 383 aa  68.9  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.890611  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0896  monooxygenase, FAD-binding  31.44 
 
 		 389 aa  69.3  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0546  monooxygenase, FAD-binding  28.12 
 
 		 373 aa  68.2  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01821  FAD-binding monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G07040)  29.18 
 
 		 423 aa  67.8  0.0000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00520599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2599  Kynurenine 3-monooxygenase  28.15 
 
 		 455 aa  67.8  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0833412  normal  0.344661 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3601  salicylate 1-monooxygenase  27.6 
 
 		 402 aa  68.2  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.733205  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_1611  zeaxanthin epoxidase (ABA1) (NPQ2)  25.43 
 
 		 429 aa  67.8  0.0000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.539309  normal  0.0529961 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4498  salicylate 1-monooxygenase  27.81 
 
 		 422 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4040  salicylate 1-monooxygenase  27.81 
 
 		 404 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5335  FAD-dependent monooxygenase  28.23 
 
 		 378 aa  67  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1231  salicylate 1-monooxygenase  27.2 
 
 		 404 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.592071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0725  monooxygenase FAD-binding protein  30.45 
 
 		 509 aa  66.6  0.0000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.812372  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2068  salicylate 1-monooxygenase  25.94 
 
 		 385 aa  66.6  0.0000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.341777 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04120  conserved hypothetical protein  26.85 
 
 		 506 aa  66.2  0.0000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1561  hypothetical protein  27.12 
 
 		 377 aa  65.9  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4031  DNA mismatch endonuclease Vsr  27.37 
 
 		 404 aa  65.5  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2657  monooxygenase, FAD-binding  27.84 
 
 		 377 aa  65.5  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.751067  normal  0.222603 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1093  monooxygenase FAD-binding  28.62 
 
 		 408 aa  65.9  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0291534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2242  hypothetical protein  26.04 
 
 		 379 aa  65.9  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4971  monooxygenase FAD-binding  29.24 
 
 		 384 aa  64.7  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.415719  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0387  monooxygenase FAD-binding  26.91 
 
 		 402 aa  64.3  0.000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.491614 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4033  monooxygenase FAD-binding  26.01 
 
 		 404 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.115519 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21010  putative FAD-dependent monooxygenase  27.84 
 
 		 388 aa  64.3  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.12929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0928  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  29.15 
 
 		 509 aa  63.5  0.000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4164  putative monoxygenase  30.03 
 
 		 415 aa  63.5  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0321225  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2786  monooxygenase FAD-binding protein  27.38 
 
 		 408 aa  63.5  0.000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00390244  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1565  monooxygenase FAD-binding  24.34 
 
 		 384 aa  63.2  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.156985 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3529  kynurenine 3-monooxygenase  27 
 
 		 445 aa  62.8  0.000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.978115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28907  Salicylate hydroxylase (Salicylate 1-monooxygenase)  24.16 
 
 		 446 aa  62.4  0.00000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.283926  normal  0.292215 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2587  putative monoxygenase  28.37 
 
 		 409 aa  62.8  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.137465 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27608  predicted protein  28.21 
 
 		 971 aa  61.6  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000591044  normal  0.0770912 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3483  monooxygenase FAD-binding  27.64 
 
 		 385 aa  62  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147662 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2515  salicylate 1-monooxygenase  26.11 
 
 		 386 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.193433  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0514  hypothetical protein  27.32 
 
 		 421 aa  61.6  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.472933  normal  0.467939 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4207  salicylate 1-monooxygenase  28.95 
 
 		 406 aa  61.6  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.880254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0812  Kynurenine 3-monooxygenase  24.3 
 
 		 427 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10960  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  28.29 
 
 		 403 aa  61.6  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0442  hypothetical protein  28.35 
 
 		 425 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3904  kynurenine 3-monooxygenase  27 
 
 		 446 aa  62  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2506  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  26.34 
 
 		 392 aa  61.6  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0696  putative monooxygenase  26.49 
 
 		 388 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0540721  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1734  putative monooxygenase  26.49 
 
 		 388 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3957  monooxygenase FAD-binding  26.63 
 
 		 376 aa  61.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09400  hypothetical protein  27.36 
 
 		 402 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0841  Kynurenine 3-monooxygenase  24.3 
 
 		 427 aa  61.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0982  monooxygenase FAD-binding  28.24 
 
 		 369 aa  60.8  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.240273  decreased coverage  0.000117397 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0770  putative monooxygenase  26.49 
 
 		 388 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.522816  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5584  monooxygenase FAD-binding protein  28.38 
 
 		 401 aa  60.8  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3920  monooxygenase FAD-binding  26.1 
 
 		 397 aa  60.8  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3284  monooxygenase FAD-binding protein  26.32 
 
 		 393 aa  60.8  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.289154 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2189  Kynurenine 3-monooxygenase  25.6 
 
 		 440 aa  60.5  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.953199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1219  putative monooxygenase  26.63 
 
 		 388 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00380078  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8535  monooxygenase FAD-binding  31.25 
 
 		 384 aa  60.5  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0157087  hitchhiker  0.0015439 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4324  salicylate 1-monooxygenase  27.24 
 
 		 385 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.524787  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4042  salicylate 1-monooxygenase  27.24 
 
 		 385 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00369253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0881  hypothetical protein  27.36 
 
 		 402 aa  60.5  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.200049  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02114  salicylate hydroxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G05260)  24.93 
 
 		 448 aa  60.1  0.00000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1144  putative monooxygenase  26.63 
 
 		 388 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.670847  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2421  putative monooxygenase  26.63 
 
 		 388 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1285  monooxygenase, FAD-binding protein  30.84 
 
 		 410 aa  60.1  0.00000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2705  monooxygenase, FAD-binding protein  26.63 
 
 		 423 aa  60.1  0.00000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.891359  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3438  monooxygenase, FAD-binding  27.61 
 
 		 399 aa  60.1  0.00000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2584  monooxygenase, FAD-binding  25.37 
 
 		 400 aa  60.1  0.00000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.613825  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1117  monooxygenase, FAD-binding  25.43 
 
 		 399 aa  60.1  0.00000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>