More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3818 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_3818  monooxygenase FAD-binding  100 
 
 
378 aa  728    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.357574  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2837  monooxygenase FAD-binding  52.86 
 
 
378 aa  373  1e-102  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2878  monooxygenase FAD-binding  52.42 
 
 
378 aa  342  7e-93  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3463  monooxygenase FAD-binding protein  51.21 
 
 
376 aa  330  2e-89  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.039982  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3517  monooxygenase, FAD-binding  49.73 
 
 
385 aa  311  1e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.623295  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1438  monooxygenase, FAD-binding  40.75 
 
 
413 aa  263  4e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00120206  hitchhiker  0.00122057 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4844  monooxygenase, FAD-binding protein  43.6 
 
 
390 aa  246  6e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5423  monooxygenase FAD-binding  35.45 
 
 
382 aa  239  5.999999999999999e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.224517  normal  0.231326 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4474  salicylate hydroxylase protein  44.29 
 
 
377 aa  238  9e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.102807 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0802  monooxygenase FAD-binding  43.61 
 
 
371 aa  230  4e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.615046  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2326  monooxygenase FAD-binding protein  33.94 
 
 
388 aa  218  8.999999999999998e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000156334  normal  0.582922 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3699  monooxygenase FAD-binding  48.01 
 
 
371 aa  209  6e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.442596  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1380  monooxygenase FAD-binding  43.77 
 
 
372 aa  209  9e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.709095 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1924  monooxygenase; 2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase  37.75 
 
 
387 aa  208  1e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.630677  normal  0.306888 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4254  monooxygenase FAD-binding  34.99 
 
 
392 aa  194  3e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2826  monooxygenase, FAD-binding  31.25 
 
 
387 aa  189  5e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00129396  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA01280  conserved expressed protein  35.03 
 
 
442 aa  187  2e-46  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1277  monooxygenase FAD-binding  31.18 
 
 
381 aa  179  9e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08716  salicylate hydroxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G01050)  30.88 
 
 
415 aa  164  2.0000000000000002e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5691  monooxygenase FAD-binding  32.51 
 
 
376 aa  152  8.999999999999999e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09224  conserved hypothetical protein  28.44 
 
 
443 aa  140  3.9999999999999997e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2823  monooxygenase, FAD-binding  29.11 
 
 
371 aa  139  7.999999999999999e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.091542  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0398  putative monooxygenase  40.61 
 
 
257 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4498  salicylate 1-monooxygenase  30.89 
 
 
422 aa  101  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4031  DNA mismatch endonuclease Vsr  30.21 
 
 
404 aa  99  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4040  salicylate 1-monooxygenase  31.35 
 
 
404 aa  98.6  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0991  salicylate 1-monooxygenase  29.44 
 
 
397 aa  97.4  3e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0622996  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4033  monooxygenase FAD-binding  31.44 
 
 
404 aa  96.3  7e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.115519 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6537  monooxygenase, FAD-binding protein  30.99 
 
 
392 aa  94  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0203356  normal  0.0154804 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1285  monooxygenase, FAD-binding protein  32.7 
 
 
410 aa  92  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4129  monooxygenase FAD-binding protein  30.67 
 
 
421 aa  90.9  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1231  salicylate 1-monooxygenase  30.41 
 
 
404 aa  90.1  5e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.592071  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5278  monooxygenase, FAD-binding  27.46 
 
 
395 aa  89  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.630865 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0096  monooxygenase FAD-binding  34.1 
 
 
388 aa  87.4  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0544698 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0213  salicylate 1-monooxygenase (NahW)  33.33 
 
 
403 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00584161  normal  0.918812 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1193  monooxygenase, FAD-binding  31.62 
 
 
390 aa  84.3  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.155257  normal  0.524756 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0982  monooxygenase FAD-binding  32.35 
 
 
369 aa  83.6  0.000000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.240273  decreased coverage  0.000117397 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5812  monooxygenase, FAD-binding protein  29.84 
 
 
408 aa  83.6  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0698086  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2656  putative salicylate hydroxylase (salicylate 1-monooxygenase)  31.34 
 
 
391 aa  82  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2509  monooxygenase, FAD-binding  30.33 
 
 
450 aa  82.4  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.389183  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1313  monooxygenase, FAD-binding  31.34 
 
 
391 aa  82  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2693  monooxygenase FAD-binding  30.15 
 
 
450 aa  81.3  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.433574  hitchhiker  0.000536484 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2705  monooxygenase, FAD-binding protein  31.65 
 
 
423 aa  81.3  0.00000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.891359  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3854  monooxygenase FAD-binding protein  29.38 
 
 
424 aa  80.5  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_1611  zeaxanthin epoxidase (ABA1) (NPQ2)  26.19 
 
 
429 aa  80.5  0.00000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.539309  normal  0.0529961 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3936  monooxygenase FAD-binding protein  28.79 
 
 
455 aa  80.1  0.00000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.018551  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0928  monooxygenase FAD-binding  33.71 
 
 
424 aa  79.7  0.00000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.607239  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3565  monooxygenase FAD-binding  29.49 
 
 
384 aa  79.7  0.00000000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1486  monooxygenase FAD-binding protein  29.81 
 
 
408 aa  79  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.528879  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0712  hypothetical protein  28.21 
 
 
371 aa  78.2  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0067  monooxygenase FAD-binding protein  32.1 
 
 
400 aa  78.6  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_56492  zeaxanthin epoxidase  28.5 
 
 
557 aa  78.6  0.0000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.688102  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10960  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  30.19 
 
 
403 aa  77  0.0000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1885  putative salicylate hydroxylase  30.97 
 
 
389 aa  77  0.0000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.122899  normal  0.226674 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2526  salicylate 1-monooxygenase  26.77 
 
 
396 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.066083 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4249  monooxygenase FAD-binding  27.82 
 
 
370 aa  76.6  0.0000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.850855  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0896  monooxygenase, FAD-binding  33.33 
 
 
389 aa  75.9  0.000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1110  monooxygenase FAD-binding  25.88 
 
 
389 aa  75.5  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.7504  normal  0.659993 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1093  monooxygenase, FAD-binding  31.69 
 
 
369 aa  75.9  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.363504 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1253  monooxygenase, FAD-binding  29.72 
 
 
388 aa  75.5  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.420129  normal  0.229963 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2729  hypothetical protein  28.06 
 
 
415 aa  75.1  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5584  monooxygenase FAD-binding protein  33.33 
 
 
401 aa  75.1  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0495  kynurenine 3-monooxygenase  24.87 
 
 
446 aa  74.7  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.167172  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4602  monooxygenase FAD-binding  31.64 
 
 
382 aa  73.9  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.296431  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1117  monooxygenase, FAD-binding  29.34 
 
 
399 aa  73.9  0.000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3295  monooxygenase FAD-binding protein  30.85 
 
 
379 aa  73.9  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.676341 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6277  monooxygenase FAD-binding  28.72 
 
 
405 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.146167  normal  0.672282 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2393  hypothetical protein  27.93 
 
 
376 aa  73.6  0.000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.142228  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2599  Kynurenine 3-monooxygenase  29.68 
 
 
455 aa  73.2  0.000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0833412  normal  0.344661 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3582  monooxygenase family protein  25.83 
 
 
463 aa  72.8  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.802949  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2786  monooxygenase FAD-binding protein  31 
 
 
408 aa  72.4  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00390244  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4063  monooxygenase FAD-binding protein  30.68 
 
 
402 aa  72.8  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.69418 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0229  monooxygenase FAD-binding  33.06 
 
 
409 aa  71.6  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.297351 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2343  monooxygenase FAD-binding protein  32.55 
 
 
392 aa  72  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2626  monooxygenase FAD-binding  30.95 
 
 
519 aa  71.6  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06002  FAD-dependent monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00150)  26.73 
 
 
417 aa  71.2  0.00000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.885397  normal  0.555833 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0813  monooxygenase, FAD-binding  28.3 
 
 
377 aa  70.9  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4138  monooxygenase, FAD-binding protein  28.85 
 
 
408 aa  70.5  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.145497  normal  0.0296411 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1219  putative monooxygenase  29.88 
 
 
388 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00380078  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01380  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  31 
 
 
378 aa  70.1  0.00000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0391  hypothetical protein  29.3 
 
 
440 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1585  hypothetical protein  29.3 
 
 
440 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.825888  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1770  hypothetical protein  29.3 
 
 
440 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0439  hypothetical protein  29.3 
 
 
440 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0696  putative monooxygenase  29.88 
 
 
388 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0540721  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4581  monooxygenase FAD-binding protein  30 
 
 
399 aa  69.7  0.00000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.626069 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1734  putative monooxygenase  29.88 
 
 
388 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3662  monooxygenase, FAD-binding  26.09 
 
 
395 aa  69.7  0.00000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.555838  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0770  putative monooxygenase  29.88 
 
 
388 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.522816  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_31126  Salicylate hydroxylase (Salicylate 1-monooxygenase)  25.63 
 
 
411 aa  69.3  0.00000000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2514  monooxygenase FAD-binding protein  30.79 
 
 
391 aa  68.9  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09400  hypothetical protein  31.58 
 
 
402 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1542  monooxygenase FAD-binding protein  27.25 
 
 
374 aa  68.9  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0929471  normal  0.228138 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2421  putative monooxygenase  29.59 
 
 
388 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1404  kynurenine 3-monooxygenase  25.91 
 
 
456 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21010  putative FAD-dependent monooxygenase  31.91 
 
 
388 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.12929  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1093  monooxygenase FAD-binding  31.3 
 
 
408 aa  68.2  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0291534  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1144  putative monooxygenase  29.59 
 
 
388 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.670847  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06750  conserved hypothetical protein  23.97 
 
 
447 aa  67.8  0.0000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.123632 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7487  putative oxidoreductase  28.23 
 
 
399 aa  67.8  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.455453  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>