More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3699 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_3699  monooxygenase FAD-binding  100 
 
 
371 aa  724    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.442596  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0802  monooxygenase FAD-binding  74.65 
 
 
371 aa  501  1e-141  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.615046  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2878  monooxygenase FAD-binding  49.33 
 
 
378 aa  280  3e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2837  monooxygenase FAD-binding  44.97 
 
 
378 aa  271  1e-71  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3463  monooxygenase FAD-binding protein  44.56 
 
 
376 aa  263  3e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.039982  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1438  monooxygenase, FAD-binding  40.48 
 
 
413 aa  252  8.000000000000001e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00120206  hitchhiker  0.00122057 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5423  monooxygenase FAD-binding  37.43 
 
 
382 aa  248  1e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.224517  normal  0.231326 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4844  monooxygenase, FAD-binding protein  42.31 
 
 
390 aa  243  3.9999999999999997e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3517  monooxygenase, FAD-binding  43.7 
 
 
385 aa  239  5e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.623295  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4474  salicylate hydroxylase protein  45.17 
 
 
377 aa  232  8.000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.102807 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1277  monooxygenase FAD-binding  34.58 
 
 
381 aa  229  6e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3818  monooxygenase FAD-binding  47.22 
 
 
378 aa  228  1e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.357574  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4254  monooxygenase FAD-binding  36.39 
 
 
392 aa  224  2e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2326  monooxygenase FAD-binding protein  35.01 
 
 
388 aa  222  9e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000156334  normal  0.582922 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1924  monooxygenase; 2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase  36.55 
 
 
387 aa  211  2e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.630677  normal  0.306888 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2826  monooxygenase, FAD-binding  32.34 
 
 
387 aa  196  4.0000000000000005e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00129396  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1380  monooxygenase FAD-binding  44.63 
 
 
372 aa  191  2e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.709095 
 
 
-
 
NC_006670  CNA01280  conserved expressed protein  33.83 
 
 
442 aa  171  2e-41  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5691  monooxygenase FAD-binding  33.6 
 
 
376 aa  164  3e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08716  salicylate hydroxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G01050)  31.34 
 
 
415 aa  154  2e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2823  monooxygenase, FAD-binding  30.87 
 
 
371 aa  143  6e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.091542  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0398  putative monooxygenase  40.64 
 
 
257 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09224  conserved hypothetical protein  28.3 
 
 
443 aa  108  2e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3854  monooxygenase FAD-binding protein  32.02 
 
 
424 aa  90.5  4e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1285  monooxygenase, FAD-binding protein  32.75 
 
 
410 aa  82.4  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5584  monooxygenase FAD-binding protein  30.73 
 
 
401 aa  82  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2509  monooxygenase, FAD-binding  31.38 
 
 
450 aa  80.5  0.00000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.389183  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0778  monooxygenase FAD-binding  32.7 
 
 
393 aa  80.5  0.00000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0373747  decreased coverage  0.000456942 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0213  salicylate 1-monooxygenase (NahW)  26.93 
 
 
403 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00584161  normal  0.918812 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08588  conserved hypothetical protein  28.09 
 
 
541 aa  77.4  0.0000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0881  hypothetical protein  29.47 
 
 
402 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.200049  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0928  monooxygenase FAD-binding  30.17 
 
 
424 aa  75.1  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.607239  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1853  monooxygenase FAD-binding  27.92 
 
 
385 aa  75.1  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_56492  zeaxanthin epoxidase  26.09 
 
 
557 aa  74.3  0.000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.688102  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2693  monooxygenase FAD-binding  30.13 
 
 
450 aa  74.3  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.433574  hitchhiker  0.000536484 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3927  salicylate 1-monooxygenase  28.21 
 
 
385 aa  73.9  0.000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.567277  normal  0.0279633 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4031  DNA mismatch endonuclease Vsr  29.94 
 
 
404 aa  73.6  0.000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4164  putative monoxygenase  31.64 
 
 
415 aa  73.6  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0321225  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6537  monooxygenase, FAD-binding protein  28.17 
 
 
392 aa  72.8  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0203356  normal  0.0154804 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1093  monooxygenase FAD-binding  32.79 
 
 
408 aa  72.4  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0291534  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09400  hypothetical protein  29.92 
 
 
402 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0096  monooxygenase FAD-binding  29.97 
 
 
388 aa  71.6  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0544698 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5073  Salicylate 1-monooxygenase  29.34 
 
 
386 aa  70.9  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.926874  normal  0.172716 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3601  salicylate 1-monooxygenase  31.79 
 
 
402 aa  70.5  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.733205  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4211  monooxygenase, FAD-binding  29.17 
 
 
382 aa  70.9  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.815591  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6042  monooxygenase FAD-binding  27.02 
 
 
378 aa  70.1  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0233658  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2656  putative salicylate hydroxylase (salicylate 1-monooxygenase)  32.36 
 
 
391 aa  69.7  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1313  monooxygenase, FAD-binding  32.36 
 
 
391 aa  69.7  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5278  monooxygenase, FAD-binding  28.17 
 
 
395 aa  69.7  0.00000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.630865 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2005  hypothetical protein  23.34 
 
 
377 aa  69.7  0.00000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00436005  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02114  salicylate hydroxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G05260)  24.37 
 
 
448 aa  69.3  0.00000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1561  monooxygenase FAD-binding  32.87 
 
 
392 aa  68.9  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0688558  normal  0.0725424 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4190  FAD-binding domain protein  29.4 
 
 
452 aa  68.6  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.412488 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1633  monooxygenase FAD-binding  28.04 
 
 
410 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.719976  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2068  salicylate 1-monooxygenase  27.54 
 
 
385 aa  68.2  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.341777 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1039  putative oxidoreductase  28.81 
 
 
387 aa  68.6  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0582367  normal  0.0597058 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5812  monooxygenase, FAD-binding protein  29.47 
 
 
408 aa  67.4  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0698086  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5023  monooxygenase FAD-binding protein  31.62 
 
 
413 aa  67.4  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4602  monooxygenase FAD-binding  32.02 
 
 
382 aa  67.4  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.296431  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0771  monooxygenase FAD-binding  28.15 
 
 
380 aa  67  0.0000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000429101 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3284  monooxygenase FAD-binding protein  27.6 
 
 
393 aa  66.2  0.0000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.289154 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1193  monooxygenase, FAD-binding  31.67 
 
 
390 aa  66.2  0.0000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.155257  normal  0.524756 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3565  monooxygenase FAD-binding  28.93 
 
 
384 aa  65.9  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5319  monooxygenase FAD-binding protein  29.25 
 
 
390 aa  65.9  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2657  monooxygenase, FAD-binding  28.65 
 
 
377 aa  65.5  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.751067  normal  0.222603 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1253  monooxygenase, FAD-binding  30.11 
 
 
388 aa  65.9  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.420129  normal  0.229963 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0991  salicylate 1-monooxygenase  26.85 
 
 
397 aa  65.5  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0622996  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3917  putative oxidoreductase  29.34 
 
 
397 aa  65.5  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.280043  normal  0.0698195 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0481  salicylate 1-monooxygenase  31.64 
 
 
373 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8535  monooxygenase FAD-binding  28.62 
 
 
384 aa  64.3  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0157087  hitchhiker  0.0015439 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0336  monooxygenase FAD-binding protein  27.89 
 
 
412 aa  64.3  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.214027  normal  0.627257 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1784  monooxygenase, FAD-binding  30.82 
 
 
410 aa  64.3  0.000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0307  FAD dependent oxidoreductase  31.27 
 
 
378 aa  63.9  0.000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000823237 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21010  putative FAD-dependent monooxygenase  30.7 
 
 
388 aa  63.9  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.12929  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3295  monooxygenase FAD-binding protein  29.74 
 
 
379 aa  63.5  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.676341 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4138  monooxygenase, FAD-binding protein  30.5 
 
 
408 aa  63.2  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.145497  normal  0.0296411 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6278  monooxygenase FAD-binding  27.64 
 
 
393 aa  63.2  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.435986  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2701  monooxygenase FAD-binding protein  33.06 
 
 
377 aa  62.8  0.000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0724  monooxygenase FAD-binding  31.11 
 
 
408 aa  62.8  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.30015 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2022  putative oxidoreductase  28.91 
 
 
407 aa  62.4  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.461121  normal  0.126773 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4129  monooxygenase FAD-binding protein  29.67 
 
 
421 aa  61.2  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4498  salicylate 1-monooxygenase  27.49 
 
 
422 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0712  hypothetical protein  26.72 
 
 
371 aa  61.6  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5650  monooxygenase FAD-binding  29.55 
 
 
416 aa  61.2  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.470651  normal  0.804587 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0809  monooxygenase, FAD-binding  27.46 
 
 
396 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.815643  normal  0.21546 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5335  FAD-dependent monooxygenase  32.62 
 
 
378 aa  60.8  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103313  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4040  salicylate 1-monooxygenase  28.01 
 
 
404 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3936  monooxygenase FAD-binding protein  31.94 
 
 
455 aa  60.5  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.018551  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0896  monooxygenase, FAD-binding  29.6 
 
 
389 aa  60.5  0.00000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5386  monooxygenase FAD-binding  31.21 
 
 
392 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.336288 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2393  hypothetical protein  29.71 
 
 
376 aa  60.1  0.00000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.142228  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1885  putative salicylate hydroxylase  29.97 
 
 
389 aa  59.7  0.00000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.122899  normal  0.226674 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3294  monooxygenase FAD-binding protein  27.54 
 
 
388 aa  59.7  0.00000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0802651  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0135  monooxygenase FAD-binding  28.45 
 
 
400 aa  59.3  0.00000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19150  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  32.37 
 
 
351 aa  58.9  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0319604  normal  0.370849 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1142  monooxygenase FAD-binding  34.05 
 
 
388 aa  59.3  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000665044 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1231  salicylate 1-monooxygenase  26.65 
 
 
404 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.592071  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2424  monooxygenase FAD-binding protein  29.29 
 
 
393 aa  59.3  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.127723  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1576  putative monooxygenase  30 
 
 
388 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.472277  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2526  salicylate 1-monooxygenase  26.85 
 
 
396 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.066083 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>