More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2509 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2509  monooxygenase, FAD-binding  100 
 
 		 450 aa  909    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.389183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2693  monooxygenase FAD-binding  89.56 
 
 		 450 aa  815    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.433574  hitchhiker  0.000536484 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4190  FAD-binding domain protein  41.72 
 
 		 452 aa  323  4e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.412488 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1285  monooxygenase, FAD-binding protein  40.91 
 
 		 410 aa  229  1e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3854  monooxygenase FAD-binding protein  35.23 
 
 		 424 aa  227  4e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4164  putative monoxygenase  39.9 
 
 		 415 aa  218  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0321225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2587  putative monoxygenase  38.24 
 
 		 409 aa  205  2e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.137465 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3936  monooxygenase FAD-binding protein  34.88 
 
 		 455 aa  202  8e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.018551  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5584  monooxygenase FAD-binding protein  37.06 
 
 		 401 aa  191  2e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3295  monooxygenase FAD-binding protein  37.12 
 
 		 379 aa  181  2e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.676341 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5650  monooxygenase FAD-binding  33.59 
 
 		 416 aa  174  3.9999999999999995e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.470651  normal  0.804587 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2823  monooxygenase, FAD-binding  27.13 
 
 		 371 aa  96.3  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.091542  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2710  monooxygenase FAD-binding  24.09 
 
 		 392 aa  86.7  9e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1277  monooxygenase FAD-binding  25 
 
 		 381 aa  85.9  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02114  salicylate hydroxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G05260)  22.63 
 
 		 448 aa  84.3  0.000000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2626  monooxygenase FAD-binding  29.16 
 
 		 519 aa  84.3  0.000000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4031  DNA mismatch endonuclease Vsr  27.3 
 
 		 404 aa  84  0.000000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0991  salicylate 1-monooxygenase  25.73 
 
 		 397 aa  81.6  0.00000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0622996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1784  monooxygenase, FAD-binding  27.1 
 
 		 410 aa  81.3  0.00000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5691  monooxygenase FAD-binding  26.75 
 
 		 376 aa  80.5  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4211  monooxygenase, FAD-binding  28.3 
 
 		 382 aa  80.5  0.00000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.815591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2172  monooxygenase, FAD-binding  26.89 
 
 		 413 aa  80.1  0.00000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0853287 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6537  monooxygenase, FAD-binding protein  28.69 
 
 		 392 aa  79.3  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0203356  normal  0.0154804 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0481  salicylate 1-monooxygenase  31.35 
 
 		 373 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07897  FAD binding domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G00660)  30.02 
 
 		 393 aa  77.4  0.0000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.467263 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4891  monooxygenase, FAD-binding  26.22 
 
 		 402 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.292821 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3565  monooxygenase FAD-binding  36.07 
 
 		 384 aa  76.6  0.0000000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1022  salicylate 1-monooxygenase  25.48 
 
 		 391 aa  76.6  0.0000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3441  monooxygenase FAD-binding  28.57 
 
 		 428 aa  76.6  0.0000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000658933  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3517  monooxygenase, FAD-binding  28.9 
 
 		 385 aa  76.3  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.623295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2339  monooxygenase FAD-binding  27.37 
 
 		 388 aa  76.3  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000167175  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5437  monooxygenase, FAD-binding  27.32 
 
 		 364 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.863729 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4498  salicylate 1-monooxygenase  26.39 
 
 		 422 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4474  salicylate hydroxylase protein  29.3 
 
 		 377 aa  75.5  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.102807 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5387  hypothetical protein  26.55 
 
 		 420 aa  75.5  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4033  monooxygenase FAD-binding  25.93 
 
 		 404 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.115519 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5727  monooxygenase, FAD-binding  26.78 
 
 		 364 aa  74.7  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4040  salicylate 1-monooxygenase  26.6 
 
 		 404 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2005  hypothetical protein  29.35 
 
 		 377 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00436005  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5812  monooxygenase, FAD-binding protein  26.54 
 
 		 408 aa  74.3  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0698086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5348  monooxygenase, FAD-binding protein  27 
 
 		 360 aa  73.6  0.000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.437085  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7773  monooxygenase FAD-binding  27.42 
 
 		 374 aa  73.2  0.000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06742  salicylate hydroxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00590)  24.43 
 
 		 697 aa  72.8  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.00748094 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3284  monooxygenase FAD-binding protein  28.53 
 
 		 393 aa  72.8  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.289154 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02033  conserved hypothetical protein  25.06 
 
 		 435 aa  72  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.637061 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01033  hypothetical protein  23.99 
 
 		 440 aa  72.4  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.10266 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2837  monooxygenase FAD-binding  29.43 
 
 		 378 aa  72.4  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2962  monooxygenase FAD-binding protein  27.42 
 
 		 397 aa  72  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG00340  kynurenine 3-monooxygenase, putative  25.25 
 
 		 421 aa  71.2  0.00000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.303065  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2326  monooxygenase FAD-binding protein  22.59 
 
 		 388 aa  71.2  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000156334  normal  0.582922 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1231  salicylate 1-monooxygenase  24.66 
 
 		 404 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.592071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1486  monooxygenase FAD-binding protein  27.54 
 
 		 408 aa  71.2  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.528879  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1853  monooxygenase FAD-binding  27.35 
 
 		 385 aa  70.5  0.00000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01683  hypothetical protein  33.16 
 
 		 397 aa  70.5  0.00000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3601  salicylate 1-monooxygenase  27.99 
 
 		 402 aa  70.5  0.00000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.733205  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5278  monooxygenase, FAD-binding  25.34 
 
 		 395 aa  69.7  0.00000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.630865 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4263  monooxygenase FAD-binding  31.23 
 
 		 398 aa  70.1  0.00000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00000952252  normal  0.156031 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4971  monooxygenase FAD-binding  28.74 
 
 		 384 aa  69.3  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.415719  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2526  salicylate 1-monooxygenase  25.58 
 
 		 396 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.066083 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2705  monooxygenase, FAD-binding protein  29.35 
 
 		 423 aa  69.3  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.891359  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0982  monooxygenase FAD-binding  29.01 
 
 		 399 aa  68.6  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0183396 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3927  salicylate 1-monooxygenase  26.98 
 
 		 385 aa  68.6  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.567277  normal  0.0279633 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1438  monooxygenase, FAD-binding  27.81 
 
 		 413 aa  68.9  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00120206  hitchhiker  0.00122057 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5073  Salicylate 1-monooxygenase  27.53 
 
 		 386 aa  67.8  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.926874  normal  0.172716 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4129  monooxygenase FAD-binding protein  28.89 
 
 		 421 aa  67.8  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3818  monooxygenase FAD-binding  29.41 
 
 		 378 aa  67.4  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.357574  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03227  conserved hypothetical protein  25.85 
 
 		 504 aa  67  0.0000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5423  monooxygenase FAD-binding  25 
 
 		 382 aa  67  0.0000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.224517  normal  0.231326 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2318  monooxygenase FAD-binding  32.97 
 
 		 385 aa  67  0.0000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.694664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_92063  predicted protein  30.37 
 
 		 509 aa  67  0.0000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0115456  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6277  monooxygenase FAD-binding  28.04 
 
 		 405 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.146167  normal  0.672282 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3328  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  30.75 
 
 		 407 aa  66.6  0.0000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.150159  normal  0.347251 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2905  monooxygenase FAD-binding  27.51 
 
 		 381 aa  65.9  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00589473 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4581  monooxygenase FAD-binding protein  35.47 
 
 		 399 aa  66.2  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.626069 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0802  monooxygenase FAD-binding  29.55 
 
 		 371 aa  65.5  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.615046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1214  hypothetical protein  26.96 
 
 		 414 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01311  conserved hypothetical protein  29.28 
 
 		 402 aa  65.1  0.000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2974  hypothetical protein  27.32 
 
 		 414 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.556187  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0439  hypothetical protein  26.72 
 
 		 440 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0391  hypothetical protein  26.72 
 
 		 440 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1585  hypothetical protein  26.72 
 
 		 440 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.825888  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1770  hypothetical protein  26.72 
 
 		 440 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2849  hypothetical protein  26.72 
 
 		 414 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4138  monooxygenase, FAD-binding protein  33.52 
 
 		 408 aa  64.3  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.145497  normal  0.0296411 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4602  monooxygenase FAD-binding  25.7 
 
 		 382 aa  63.9  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.296431  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2552  monooxygenase FAD-binding protein  24.93 
 
 		 376 aa  63.5  0.000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1886  monooxygenase FAD-binding  27.54 
 
 		 480 aa  63.2  0.000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3162  monooxygenase FAD-binding  25.58 
 
 		 387 aa  63.2  0.000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1082  hypothetical protein  32.98 
 
 		 380 aa  63.2  0.000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3294  monooxygenase FAD-binding protein  31.09 
 
 		 388 aa  63.2  0.000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0802651  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08588  conserved hypothetical protein  25.91 
 
 		 541 aa  62.4  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2238  hypothetical protein  27.04 
 
 		 430 aa  62.8  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3311  monooxygenase, FAD-binding  28.68 
 
 		 401 aa  62.8  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0213  salicylate 1-monooxygenase (NahW)  25.47 
 
 		 403 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00584161  normal  0.918812 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_56492  zeaxanthin epoxidase  22.83 
 
 		 557 aa  62  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.688102  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2230  hypothetical protein  29.34 
 
 		 377 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000757274  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2068  salicylate 1-monooxygenase  25.13 
 
 		 385 aa  62  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.341777 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0813  monooxygenase, FAD-binding  24.4 
 
 		 377 aa  62  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1082  hypothetical protein  32.62 
 
 		 380 aa  62  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6336  hypothetical protein  31.4 
 
 		 380 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>