270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2878 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_2878  monooxygenase FAD-binding  100 
 
 
378 aa  741    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2837  monooxygenase FAD-binding  60.92 
 
 
378 aa  438  9.999999999999999e-123  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3463  monooxygenase FAD-binding protein  57.49 
 
 
376 aa  404  1.0000000000000001e-112  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.039982  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3517  monooxygenase, FAD-binding  55.14 
 
 
385 aa  379  1e-104  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.623295  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3818  monooxygenase FAD-binding  51.97 
 
 
378 aa  322  7e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.357574  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4844  monooxygenase, FAD-binding protein  42.08 
 
 
390 aa  254  3e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4474  salicylate hydroxylase protein  45.27 
 
 
377 aa  253  5.000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.102807 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1438  monooxygenase, FAD-binding  39.78 
 
 
413 aa  248  1e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00120206  hitchhiker  0.00122057 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3699  monooxygenase FAD-binding  51.01 
 
 
371 aa  242  9e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.442596  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0802  monooxygenase FAD-binding  44.26 
 
 
371 aa  241  1e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.615046  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2326  monooxygenase FAD-binding protein  34.92 
 
 
388 aa  219  7.999999999999999e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000156334  normal  0.582922 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5423  monooxygenase FAD-binding  35.77 
 
 
382 aa  218  2e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.224517  normal  0.231326 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4254  monooxygenase FAD-binding  34.46 
 
 
392 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2826  monooxygenase, FAD-binding  31.38 
 
 
387 aa  187  2e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00129396  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1380  monooxygenase FAD-binding  45.05 
 
 
372 aa  187  2e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.709095 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1924  monooxygenase; 2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase  35.33 
 
 
387 aa  181  1e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.630677  normal  0.306888 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1277  monooxygenase FAD-binding  32.39 
 
 
381 aa  176  4e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA01280  conserved expressed protein  29.24 
 
 
442 aa  173  5e-42  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08716  salicylate hydroxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G01050)  32.66 
 
 
415 aa  166  5e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2823  monooxygenase, FAD-binding  30.66 
 
 
371 aa  150  3e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.091542  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09224  conserved hypothetical protein  29.3 
 
 
443 aa  127  3e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5691  monooxygenase FAD-binding  28.02 
 
 
376 aa  126  6e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0398  putative monooxygenase  37.57 
 
 
257 aa  94.7  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3294  monooxygenase FAD-binding protein  30.13 
 
 
388 aa  84.3  0.000000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0802651  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6537  monooxygenase, FAD-binding protein  31.11 
 
 
392 aa  84  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0203356  normal  0.0154804 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4031  DNA mismatch endonuclease Vsr  27.06 
 
 
404 aa  78.6  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3224  monooxygenase FAD-binding  33.05 
 
 
399 aa  75.9  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.494892 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3295  monooxygenase FAD-binding protein  33.71 
 
 
379 aa  74.3  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.676341 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0712  hypothetical protein  29.43 
 
 
371 aa  74.7  0.000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_56492  zeaxanthin epoxidase  24.94 
 
 
557 aa  73.2  0.000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.688102  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5278  monooxygenase, FAD-binding  28.46 
 
 
395 aa  73.2  0.000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.630865 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4465  putative oxygenase  55.17 
 
 
578 aa  73.2  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.164502  normal  0.0132982 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2693  monooxygenase FAD-binding  29.04 
 
 
450 aa  71.2  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.433574  hitchhiker  0.000536484 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1885  putative salicylate hydroxylase  29.57 
 
 
389 aa  69.7  0.00000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.122899  normal  0.226674 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4063  monooxygenase FAD-binding protein  29.92 
 
 
402 aa  69.7  0.00000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.69418 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1117  monooxygenase, FAD-binding  28.11 
 
 
399 aa  69.7  0.00000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3936  monooxygenase FAD-binding protein  29.29 
 
 
455 aa  67.4  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.018551  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2424  monooxygenase FAD-binding protein  28.22 
 
 
393 aa  67.8  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.127723  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3927  salicylate 1-monooxygenase  27.5 
 
 
385 aa  67.4  0.0000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.567277  normal  0.0279633 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2657  monooxygenase, FAD-binding  29.71 
 
 
377 aa  67  0.0000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.751067  normal  0.222603 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4033  monooxygenase FAD-binding  28.73 
 
 
404 aa  67  0.0000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.115519 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2962  monooxygenase FAD-binding protein  27.49 
 
 
397 aa  67  0.0000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5812  monooxygenase, FAD-binding protein  31.61 
 
 
408 aa  66.2  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0698086  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3854  monooxygenase FAD-binding protein  29.64 
 
 
424 aa  66.2  0.0000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4138  monooxygenase, FAD-binding protein  29.63 
 
 
408 aa  65.9  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.145497  normal  0.0296411 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0881  hypothetical protein  30.54 
 
 
402 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.200049  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1853  monooxygenase FAD-binding  27.14 
 
 
385 aa  64.3  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3524  monooxygenase FAD-binding protein  30.08 
 
 
401 aa  64.3  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.894226  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1285  monooxygenase, FAD-binding protein  28.27 
 
 
410 aa  64.7  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4040  salicylate 1-monooxygenase  27.47 
 
 
404 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_92063  predicted protein  29.43 
 
 
509 aa  64.7  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0115456  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0991  salicylate 1-monooxygenase  27.25 
 
 
397 aa  63.9  0.000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0622996  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02114  salicylate hydroxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G05260)  23.04 
 
 
448 aa  63.5  0.000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4498  salicylate 1-monooxygenase  27.61 
 
 
422 aa  62.8  0.000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1231  salicylate 1-monooxygenase  26.76 
 
 
404 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.592071  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0213  salicylate 1-monooxygenase (NahW)  27.73 
 
 
403 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00584161  normal  0.918812 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09400  hypothetical protein  30.27 
 
 
402 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4602  monooxygenase FAD-binding  32.69 
 
 
382 aa  62.4  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.296431  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06002  FAD-dependent monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00150)  27.3 
 
 
417 aa  61.6  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.885397  normal  0.555833 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2128  salicylate hydroxylase  26.1 
 
 
397 aa  62  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.453627  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2526  salicylate 1-monooxygenase  25.63 
 
 
396 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.066083 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3483  monooxygenase FAD-binding  28.93 
 
 
385 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00147662 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3960  monooxygenase, FAD-binding  31.82 
 
 
388 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1486  monooxygenase FAD-binding protein  30.11 
 
 
408 aa  62  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.528879  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6034  monooxygenase FAD-binding protein  28.61 
 
 
489 aa  61.2  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.829011  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1893  monooxygenase, FAD-binding  29.21 
 
 
382 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4547  monooxygenase FAD-binding  29.2 
 
 
385 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.326108  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4971  monooxygenase FAD-binding  32.23 
 
 
384 aa  61.2  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.415719  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4324  salicylate 1-monooxygenase  28.93 
 
 
385 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.524787  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4042  salicylate 1-monooxygenase  28.93 
 
 
385 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00369253  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2140  monooxygenase FAD-binding  28.46 
 
 
382 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0383787 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2189  Kynurenine 3-monooxygenase  26.22 
 
 
440 aa  60.8  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.953199  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7773  monooxygenase FAD-binding  27.86 
 
 
374 aa  60.5  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3579  monooxygenase FAD-binding  28 
 
 
382 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.817981 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6042  monooxygenase FAD-binding  27.21 
 
 
378 aa  60.8  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0233658  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2509  monooxygenase, FAD-binding  28.14 
 
 
450 aa  60.5  0.00000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.389183  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3944  salicylate hydroxylase  28 
 
 
382 aa  60.1  0.00000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0448295  normal  0.412797 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4355  hypothetical protein  27.03 
 
 
421 aa  60.1  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0233973  normal  0.534906 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2710  monooxygenase FAD-binding  25.52 
 
 
392 aa  59.7  0.00000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3311  monooxygenase, FAD-binding  28.85 
 
 
401 aa  59.7  0.00000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0096  monooxygenase FAD-binding  30.09 
 
 
388 aa  59.3  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0544698 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5851  hypothetical protein  28.69 
 
 
405 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.3306  hitchhiker  0.00183506 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3565  monooxygenase FAD-binding  25.87 
 
 
384 aa  59.3  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2005  hypothetical protein  22.19 
 
 
377 aa  58.9  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00436005  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06750  conserved hypothetical protein  24.69 
 
 
447 aa  58.5  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.123632 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4129  monooxygenase FAD-binding protein  29.44 
 
 
421 aa  58.2  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4891  monooxygenase, FAD-binding  27.53 
 
 
402 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.292821 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4419  kynurenine 3-monooxygenase  28.49 
 
 
453 aa  58.2  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.366347 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2786  monooxygenase FAD-binding protein  28.08 
 
 
408 aa  58.5  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00390244  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2311  monooxygenase FAD-binding  26.45 
 
 
383 aa  57.4  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0928  monooxygenase FAD-binding  28.53 
 
 
424 aa  57.4  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.607239  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2748  monooxygenase FAD-binding protein  29.46 
 
 
489 aa  57.8  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0960  monooxygenase, FAD-binding  25.91 
 
 
368 aa  57.4  0.0000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.234631  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0982  monooxygenase FAD-binding  29.07 
 
 
369 aa  57  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.240273  decreased coverage  0.000117397 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2515  salicylate 1-monooxygenase  26.32 
 
 
386 aa  57  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.193433  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8535  monooxygenase FAD-binding  28.2 
 
 
384 aa  56.6  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0157087  hitchhiker  0.0015439 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1542  monooxygenase FAD-binding protein  29.85 
 
 
374 aa  56.6  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0929471  normal  0.228138 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0950  monooxygenase, FAD-binding  25.91 
 
 
368 aa  56.6  0.0000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0896  monooxygenase, FAD-binding  32.88 
 
 
389 aa  56.2  0.0000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1719  monooxygenase FAD-binding protein  26.43 
 
 
402 aa  56.2  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.861582  normal  0.177423 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>