More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_56492 on replicon NC_011672
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011672  PHATRDRAFT_56492  zeaxanthin epoxidase  100 
 
 
557 aa  1141    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.688102  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_56488  precursor of protein zeaxanthin epoxidase-like protein  43.31 
 
 
604 aa  355  1e-96  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_1611  zeaxanthin epoxidase (ABA1) (NPQ2)  39.41 
 
 
429 aa  255  1.0000000000000001e-66  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.539309  normal  0.0529961 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45845  zeaxanthin epoxidase  32.57 
 
 
565 aa  238  3e-61  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.915807  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0991  salicylate 1-monooxygenase  29.59 
 
 
397 aa  140  6e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0622996  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21010  putative FAD-dependent monooxygenase  32.8 
 
 
388 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.12929  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3957  monooxygenase FAD-binding  31.85 
 
 
376 aa  129  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4002  monooxygenase FAD-binding  31.85 
 
 
376 aa  129  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2005  hypothetical protein  29.63 
 
 
377 aa  128  3e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00436005  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4602  monooxygenase FAD-binding  31.09 
 
 
382 aa  126  9e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.296431  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2962  monooxygenase FAD-binding protein  30.11 
 
 
397 aa  124  4e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0229  monooxygenase FAD-binding  31.79 
 
 
409 aa  124  6e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.297351 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3561  monooxygenase, FAD-binding protein  29.48 
 
 
389 aa  123  8e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.014092  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3634  monooxygenase, FAD-binding  29.48 
 
 
389 aa  123  8e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.231418  normal  0.598375 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2710  monooxygenase FAD-binding  28.37 
 
 
392 aa  123  9.999999999999999e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3565  monooxygenase FAD-binding  28.53 
 
 
384 aa  119  1.9999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3566  monooxygenase, FAD-binding  28.9 
 
 
389 aa  118  3e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.411114  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3960  monooxygenase, FAD-binding  29.64 
 
 
388 aa  118  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1022  salicylate 1-monooxygenase  30.66 
 
 
391 aa  117  6e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1969  hypothetical protein  28.74 
 
 
377 aa  116  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0438709  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2621  monooxygenase, FAD-binding  28.33 
 
 
388 aa  116  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.684205  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5335  FAD-dependent monooxygenase  31.28 
 
 
378 aa  114  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103313  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2128  salicylate hydroxylase  32.38 
 
 
397 aa  114  4.0000000000000004e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.453627  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1987  hypothetical protein  28.23 
 
 
377 aa  113  8.000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000746962  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4129  monooxygenase FAD-binding protein  30.69 
 
 
421 aa  113  9e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4033  monooxygenase FAD-binding  29.16 
 
 
404 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.115519 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4031  DNA mismatch endonuclease Vsr  28.75 
 
 
404 aa  109  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1784  monooxygenase, FAD-binding  27.92 
 
 
410 aa  109  2e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3231  monooxygenase FAD-binding  28.7 
 
 
400 aa  108  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19150  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  31.03 
 
 
351 aa  107  7e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0319604  normal  0.370849 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0813  monooxygenase, FAD-binding  27.89 
 
 
377 aa  106  9e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4211  monooxygenase, FAD-binding  31.37 
 
 
382 aa  106  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.815591  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4498  salicylate 1-monooxygenase  27.78 
 
 
422 aa  105  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4040  salicylate 1-monooxygenase  27.78 
 
 
404 aa  105  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2318  monooxygenase FAD-binding  28.29 
 
 
385 aa  104  3e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.694664  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2230  hypothetical protein  28 
 
 
377 aa  104  5e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000757274  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0923  monooxygenase FAD-binding  27.32 
 
 
412 aa  103  6e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.264093 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5278  monooxygenase, FAD-binding  26.15 
 
 
395 aa  103  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.630865 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3328  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  28.65 
 
 
407 aa  102  2e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.150159  normal  0.347251 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1633  monooxygenase FAD-binding  28.12 
 
 
410 aa  100  5e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.719976  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0213  salicylate 1-monooxygenase (NahW)  25.15 
 
 
403 aa  100  7e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00584161  normal  0.918812 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1889  hypothetical protein  26.03 
 
 
374 aa  100  8e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0982  monooxygenase FAD-binding  30.03 
 
 
399 aa  100  9e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0183396 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1231  salicylate 1-monooxygenase  28.04 
 
 
404 aa  99.8  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.592071  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4207  salicylate 1-monooxygenase  28.25 
 
 
406 aa  99  2e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.880254  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2701  monooxygenase FAD-binding protein  31.17 
 
 
377 aa  99  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0778  monooxygenase FAD-binding  27.96 
 
 
393 aa  98.6  3e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0373747  decreased coverage  0.000456942 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2705  monooxygenase, FAD-binding protein  28.74 
 
 
423 aa  97.4  6e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.891359  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3579  monooxygenase FAD-binding  25.73 
 
 
382 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.817981 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5319  monooxygenase FAD-binding protein  27.4 
 
 
390 aa  95.9  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2140  monooxygenase FAD-binding  26.78 
 
 
382 aa  94.4  5e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0383787 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3601  salicylate 1-monooxygenase  27.73 
 
 
402 aa  94  6e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.733205  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1561  monooxygenase FAD-binding  35.09 
 
 
392 aa  94  7e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0688558  normal  0.0725424 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2339  monooxygenase FAD-binding  28.11 
 
 
388 aa  93.2  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000167175  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0096  monooxygenase FAD-binding  26.61 
 
 
388 aa  93.2  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0544698 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6042  monooxygenase FAD-binding  25 
 
 
378 aa  92.8  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0233658  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3944  salicylate hydroxylase  25.46 
 
 
382 aa  92.8  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0448295  normal  0.412797 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01380  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  26.78 
 
 
378 aa  92.8  1e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3294  monooxygenase FAD-binding protein  26.67 
 
 
388 aa  93.2  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0802651  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1893  monooxygenase, FAD-binding  25.46 
 
 
382 aa  92.8  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3662  monooxygenase, FAD-binding  27.83 
 
 
395 aa  92.4  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.555838  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5073  Salicylate 1-monooxygenase  27.71 
 
 
386 aa  92.8  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.926874  normal  0.172716 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2311  monooxygenase FAD-binding  23.69 
 
 
383 aa  91.7  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1117  monooxygenase, FAD-binding  25.33 
 
 
399 aa  91.3  4e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03569  salicylate hydroxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G10180)  26.78 
 
 
711 aa  90.5  7e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.417638  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6859  FAD dependent oxidoreductase  25.43 
 
 
420 aa  90.1  8e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.87929 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5419  salicylate 1-monooxygenase  26.6 
 
 
395 aa  90.5  8e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00608306  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09400  hypothetical protein  29.11 
 
 
402 aa  90.1  9e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4378  monooxygenase FAD-binding  28.77 
 
 
420 aa  90.1  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.760367 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5557  FAD-dependent oxidoreductase  24.78 
 
 
367 aa  89.4  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.633311 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0733  hypothetical protein  26.43 
 
 
369 aa  89  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2253  monooxygenase FAD-binding protein  29.11 
 
 
401 aa  89.4  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0740  salicylate hydroxylase  29.62 
 
 
401 aa  88.2  3e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6277  monooxygenase FAD-binding  26.34 
 
 
405 aa  88.2  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.146167  normal  0.672282 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0052  monooxygenase, FAD-binding  27.65 
 
 
413 aa  88.6  3e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1002  hypothetical protein  26.43 
 
 
369 aa  88.6  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.132346  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2526  salicylate 1-monooxygenase  26.56 
 
 
396 aa  87.8  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.066083 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2257  hypothetical protein  26.76 
 
 
378 aa  88.2  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.472155 
 
 
-
 
NC_004310  BR0746  salicylate hydroxylase  29.62 
 
 
401 aa  87.8  5e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0881  hypothetical protein  29.22 
 
 
402 aa  87.4  6e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.200049  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2131  salicylate 1-monooxygenase  26.67 
 
 
400 aa  87  8e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1313  monooxygenase, FAD-binding  26.98 
 
 
391 aa  86.3  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2656  putative salicylate hydroxylase (salicylate 1-monooxygenase)  26.98 
 
 
391 aa  86.3  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3311  monooxygenase, FAD-binding  28.22 
 
 
401 aa  86.7  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3162  monooxygenase FAD-binding  27.95 
 
 
387 aa  86.3  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1093  monooxygenase FAD-binding  23.82 
 
 
408 aa  85.9  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0291534  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1193  monooxygenase, FAD-binding  26.98 
 
 
390 aa  86.3  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.155257  normal  0.524756 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56402  Salicylate hydroxylase (Salicylate 1-monooxygenase)  27.27 
 
 
426 aa  85.5  0.000000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.476468  normal  0.198075 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0712  hypothetical protein  27.22 
 
 
371 aa  85.1  0.000000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5490  hypothetical protein  27.89 
 
 
376 aa  85.1  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.263569  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1438  monooxygenase, FAD-binding  27.39 
 
 
413 aa  84.7  0.000000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00120206  hitchhiker  0.00122057 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0392  monooxygenase FAD-binding protein  30.19 
 
 
383 aa  84.3  0.000000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.890611  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2611  putative FAD-dependent monooxygenase  28.14 
 
 
382 aa  84  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.172271  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2480  monooxygenase FAD-binding  25.28 
 
 
395 aa  83.6  0.000000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2584  monooxygenase, FAD-binding  27.82 
 
 
400 aa  83.6  0.000000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.613825  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3612  monooxygenase FAD-binding  26.48 
 
 
430 aa  82.8  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0302868  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3517  monooxygenase, FAD-binding  25.79 
 
 
385 aa  83.2  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.623295  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0338  monooxygenase FAD-binding  27.44 
 
 
372 aa  82.4  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2908  salicylate hydroxylase  25.98 
 
 
396 aa  82.4  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.511935 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2055  monooxygenase, FAD-binding  27.84 
 
 
416 aa  82.4  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.6459  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>