164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0398 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B0398  putative monooxygenase  100 
 
 		 257 aa  529  1e-149  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1438  monooxygenase, FAD-binding  39.02 
 
 		 413 aa  145  9e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00120206  hitchhiker  0.00122057 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1380  monooxygenase FAD-binding  42.99 
 
 		 372 aa  144  1e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.709095 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4844  monooxygenase, FAD-binding protein  38.86 
 
 		 390 aa  137  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3818  monooxygenase FAD-binding  40.86 
 
 		 378 aa  132  6e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.357574  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4474  salicylate hydroxylase protein  38.89 
 
 		 377 aa  120  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.102807 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3463  monooxygenase FAD-binding protein  37.5 
 
 		 376 aa  117  9.999999999999999e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.039982  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0802  monooxygenase FAD-binding  38.83 
 
 		 371 aa  114  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.615046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3699  monooxygenase FAD-binding  40.57 
 
 		 371 aa  112  5e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.442596  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2837  monooxygenase FAD-binding  36.42 
 
 		 378 aa  107  1e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1924  monooxygenase; 2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase  33.82 
 
 		 387 aa  107  1e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.630677  normal  0.306888 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2326  monooxygenase FAD-binding protein  31.9 
 
 		 388 aa  105  7e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000156334  normal  0.582922 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5423  monooxygenase FAD-binding  31.19 
 
 		 382 aa  104  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.224517  normal  0.231326 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3517  monooxygenase, FAD-binding  32.71 
 
 		 385 aa  100  2e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.623295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4254  monooxygenase FAD-binding  30.58 
 
 		 392 aa  97.8  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1277  monooxygenase FAD-binding  31.22 
 
 		 381 aa  95.1  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2878  monooxygenase FAD-binding  37.57 
 
 		 378 aa  93.2  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2826  monooxygenase, FAD-binding  28.22 
 
 		 387 aa  91.7  9e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00129396  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA01280  conserved expressed protein  36.84 
 
 		 442 aa  84.7  0.000000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08716  salicylate hydroxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G01050)  28.88 
 
 		 415 aa  82.4  0.000000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09224  conserved hypothetical protein  28.03 
 
 		 443 aa  75.5  0.0000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5691  monooxygenase FAD-binding  30.32 
 
 		 376 aa  68.9  0.00000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2823  monooxygenase, FAD-binding  28.02 
 
 		 371 aa  60.5  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.091542  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45936  predicted protein  35.38 
 
 		 598 aa  58.9  0.00000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3209  monooxygenase, FAD-binding  46.15 
 
 		 483 aa  59.3  0.00000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3972  monooxygenase FAD-binding  47.37 
 
 		 416 aa  57.4  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0762736  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1886  monooxygenase FAD-binding  50 
 
 		 480 aa  53.1  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02114  salicylate hydroxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G05260)  25.15 
 
 		 448 aa  51.6  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2705  monooxygenase, FAD-binding protein  37.18 
 
 		 423 aa  51.2  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.891359  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_88642  predicted protein  29.69 
 
 		 1070 aa  50.8  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0132852 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3035  hypothetical protein  33.9 
 
 		 399 aa  51.2  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0437  hypothetical protein  65.79 
 
 		 423 aa  50.4  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2242  hypothetical protein  32.61 
 
 		 379 aa  50.1  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0991  salicylate 1-monooxygenase  32.12 
 
 		 397 aa  50.1  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0622996  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08521  salicylate hydroxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G06050)  39.02 
 
 		 469 aa  50.1  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.883838  normal  0.0891916 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5584  monooxygenase FAD-binding protein  50 
 
 		 401 aa  49.7  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6010  monooxygenase FAD-binding  63.16 
 
 		 410 aa  49.7  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_92063  predicted protein  63.64 
 
 		 509 aa  49.7  0.00005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0115456  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3168  monooxygenase, FAD-binding  37.5 
 
 		 395 aa  49.7  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.138678 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3393  monooxygenase FAD-binding  32.06 
 
 		 395 aa  49.7  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.529657  normal  0.469317 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00330  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  63.16 
 
 		 405 aa  49.3  0.00007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3882  monooxygenase FAD-binding protein  60.53 
 
 		 410 aa  48.9  0.00008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0304  hypothetical protein  60.98 
 
 		 415 aa  48.9  0.00008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.605002  normal  0.180027 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3510  ubiquinone biosynthesis hydroxylase family protein  45.28 
 
 		 387 aa  48.5  0.00009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0224516 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09000  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  41.46 
 
 		 416 aa  48.5  0.00009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2693  monooxygenase FAD-binding  46.38 
 
 		 450 aa  48.5  0.00009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.433574  hitchhiker  0.000536484 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3257  monooxygenase family protein  46.34 
 
 		 465 aa  48.1  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2548  salicylate hydroxylase  35.05 
 
 		 221 aa  48.5  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1117  monooxygenase, FAD-binding  48 
 
 		 399 aa  48.1  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0442  hypothetical protein  63.16 
 
 		 425 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1366  hypothetical protein  31.06 
 
 		 418 aa  48.5  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.496364 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1754  monooxygenase, FAD-binding  39.02 
 
 		 405 aa  47.8  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47310  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  46.55 
 
 		 405 aa  47.4  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2680  monooxygenase, FAD-binding  33.96 
 
 		 384 aa  47.4  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.156834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2174  hypothetical protein  60.53 
 
 		 405 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.825478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2172  monooxygenase, FAD-binding  28.78 
 
 		 413 aa  47.8  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0853287 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1762  monooxygenase FAD-binding  33.64 
 
 		 384 aa  47.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.638414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2509  monooxygenase, FAD-binding  46.38 
 
 		 450 aa  47.4  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.389183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0725  monooxygenase FAD-binding protein  36.78 
 
 		 509 aa  47.8  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.812372  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4893  kynurenine 3-monooxygenase  33.7 
 
 		 454 aa  47.4  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.221128  normal  0.0116181 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4381  monooxygenase FAD-binding  35.14 
 
 		 417 aa  47  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB00140  conserved hypothetical protein  33.94 
 
 		 419 aa  47  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.180406  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2049  hypothetical protein  57.89 
 
 		 409 aa  47  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.961619  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4033  monooxygenase FAD-binding  35.29 
 
 		 404 aa  47  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.115519 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4164  putative monoxygenase  43.55 
 
 		 415 aa  46.6  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0321225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2578  UbiH/UbiF/VisC/COQ6 family ubiquinone biosynthesis hydroxylase  26.36 
 
 		 381 aa  46.6  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0456  hypothetical protein  60.53 
 
 		 400 aa  46.6  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.558276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1561  monooxygenase FAD-binding  38.78 
 
 		 392 aa  46.6  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0688558  normal  0.0725424 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0503  monooxygenase FAD-binding  32.08 
 
 		 376 aa  46.2  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5898  monooxygenase FAD-binding protein  35 
 
 		 408 aa  46.2  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.106816 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4419  kynurenine 3-monooxygenase  32.61 
 
 		 453 aa  46.2  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.366347 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1110  monooxygenase FAD-binding  41.67 
 
 		 389 aa  46.2  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.7504  normal  0.659993 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5431  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  36.36 
 
 		 407 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.509963  normal  0.0291121 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19150  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  34.15 
 
 		 351 aa  46.2  0.0006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0319604  normal  0.370849 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0881  hypothetical protein  48 
 
 		 402 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.200049  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0568  monooxygenase FAD-binding  32.08 
 
 		 376 aa  45.8  0.0007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09400  hypothetical protein  48 
 
 		 402 aa  45.8  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0321  hypothetical protein  40.91 
 
 		 414 aa  45.8  0.0007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.372833  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4031  DNA mismatch endonuclease Vsr  31.06 
 
 		 404 aa  45.4  0.0008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8778  putative monooxygenase  36.36 
 
 		 492 aa  45.4  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4378  monooxygenase FAD-binding  35.19 
 
 		 420 aa  45.4  0.0009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.760367 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10916  conserved hypothetical protein  34.52 
 
 		 234 aa  44.7  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0860074  normal  0.521992 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2230  hypothetical protein  27.78 
 
 		 377 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000757274  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3289  monooxygenase FAD-binding protein  60.53 
 
 		 405 aa  45.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2327  hypothetical protein  62.16 
 
 		 414 aa  44.7  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0143705  normal  0.574012 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4498  salicylate 1-monooxygenase  30.07 
 
 		 422 aa  44.7  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1565  monooxygenase FAD-binding  33.66 
 
 		 384 aa  45.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.156985 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2196  monooxygenase, FAD-binding  35.64 
 
 		 378 aa  45.4  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.07146  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0849  monooxygenase, FAD-binding  41.49 
 
 		 484 aa  45.1  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.109359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14452  predicted protein  34.04 
 
 		 296 aa  45.4  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27608  predicted protein  40 
 
 		 971 aa  44.7  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000591044  normal  0.0770912 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1232  monooxygenase FAD-binding protein  60.53 
 
 		 417 aa  45.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0108745 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1983  hypothetical protein  59.46 
 
 		 431 aa  45.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.564684 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5197  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  56.76 
 
 		 407 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3582  monooxygenase family protein  30.68 
 
 		 463 aa  43.9  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.802949  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1655  hypothetical protein  62.5 
 
 		 419 aa  44.3  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.151005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4040  salicylate 1-monooxygenase  34.29 
 
 		 404 aa  43.9  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21010  putative FAD-dependent monooxygenase  33.08 
 
 		 388 aa  43.9  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.12929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01733  oxidoreductase  44.07 
 
 		 267 aa  44.3  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5104  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  56.76 
 
 		 407 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.447652  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>