More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3257 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_3257  monooxygenase family protein  100 
 
 
465 aa  956    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3209  monooxygenase, FAD-binding  73.38 
 
 
483 aa  684    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1886  monooxygenase FAD-binding  76.89 
 
 
480 aa  692    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0849  monooxygenase, FAD-binding  79.53 
 
 
484 aa  711    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.109359  normal 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45936  predicted protein  50.55 
 
 
598 aa  407  1.0000000000000001e-112  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_92063  predicted protein  38.73 
 
 
509 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0115456  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_88642  predicted protein  37.53 
 
 
1070 aa  210  5e-53  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0132852 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27608  predicted protein  31.01 
 
 
971 aa  157  4e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000591044  normal  0.0770912 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47925  predicted protein  29.62 
 
 
562 aa  144  3e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.462072  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5691  monooxygenase FAD-binding  27.91 
 
 
376 aa  104  4e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1277  monooxygenase FAD-binding  28.54 
 
 
381 aa  103  5e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08588  conserved hypothetical protein  27.8 
 
 
541 aa  98.6  2e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4031  DNA mismatch endonuclease Vsr  29 
 
 
404 aa  99  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4033  monooxygenase FAD-binding  27.34 
 
 
404 aa  95.9  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.115519 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1231  salicylate 1-monooxygenase  27.71 
 
 
404 aa  95.1  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.592071  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4040  salicylate 1-monooxygenase  28.1 
 
 
404 aa  94.7  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2823  monooxygenase, FAD-binding  28.12 
 
 
371 aa  94.4  4e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.091542  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4498  salicylate 1-monooxygenase  27.82 
 
 
422 aa  92.8  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1438  monooxygenase, FAD-binding  27.14 
 
 
413 aa  88.2  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00120206  hitchhiker  0.00122057 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2326  monooxygenase FAD-binding protein  26.95 
 
 
388 aa  88.2  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000156334  normal  0.582922 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4254  monooxygenase FAD-binding  28.61 
 
 
392 aa  88.2  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3294  monooxygenase FAD-binding protein  26.32 
 
 
388 aa  85.9  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0802651  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1770  hypothetical protein  27.32 
 
 
440 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0391  hypothetical protein  27.32 
 
 
440 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0439  hypothetical protein  27.32 
 
 
440 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1585  hypothetical protein  27.32 
 
 
440 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.825888  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2068  salicylate 1-monooxygenase  28.86 
 
 
385 aa  85.1  0.000000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.341777 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2005  hypothetical protein  27.11 
 
 
377 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00436005  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1214  hypothetical protein  27.32 
 
 
414 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4602  monooxygenase FAD-binding  26.95 
 
 
382 aa  84.3  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.296431  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2849  hypothetical protein  27.06 
 
 
414 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2974  hypothetical protein  27.32 
 
 
414 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.556187  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6277  monooxygenase FAD-binding  29.11 
 
 
405 aa  81.3  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.146167  normal  0.672282 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5423  monooxygenase FAD-binding  26.58 
 
 
382 aa  80.5  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.224517  normal  0.231326 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1633  monooxygenase FAD-binding  27.49 
 
 
410 aa  80.1  0.00000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.719976  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02114  salicylate hydroxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G05260)  24.44 
 
 
448 aa  79.3  0.0000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0336  monooxygenase FAD-binding protein  27.46 
 
 
412 aa  79.3  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.214027  normal  0.627257 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5387  hypothetical protein  25.69 
 
 
420 aa  78.2  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0514  hypothetical protein  24.62 
 
 
421 aa  78.2  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.472933  normal  0.467939 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0813  monooxygenase, FAD-binding  28.7 
 
 
377 aa  78.2  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3904  kynurenine 3-monooxygenase  27.02 
 
 
446 aa  78.2  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3960  monooxygenase, FAD-binding  28.82 
 
 
388 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3957  monooxygenase FAD-binding  26.96 
 
 
376 aa  77.4  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB00140  conserved hypothetical protein  26.91 
 
 
419 aa  77.4  0.0000000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.180406  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4002  monooxygenase FAD-binding  26.67 
 
 
376 aa  77.4  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3284  monooxygenase FAD-binding protein  27.12 
 
 
393 aa  77  0.0000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.289154 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0778  monooxygenase FAD-binding  27.17 
 
 
393 aa  76.3  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0373747  decreased coverage  0.000456942 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1987  hypothetical protein  28.28 
 
 
377 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000746962  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2515  salicylate 1-monooxygenase  27.7 
 
 
386 aa  75.9  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.193433  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3466  monooxygenase, FAD-binding  28.78 
 
 
392 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2705  monooxygenase, FAD-binding protein  29.65 
 
 
423 aa  76.3  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.891359  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4900  monooxygenase, FAD-binding  28.78 
 
 
392 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.99121 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3996  hypothetical protein  27.95 
 
 
417 aa  75.1  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5386  monooxygenase FAD-binding  28.78 
 
 
392 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.336288 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3517  monooxygenase, FAD-binding  26.42 
 
 
385 aa  75.1  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.623295  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2230  hypothetical protein  29.39 
 
 
377 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000757274  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4581  monooxygenase FAD-binding protein  27.61 
 
 
399 aa  75.1  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.626069 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3529  kynurenine 3-monooxygenase  27.3 
 
 
445 aa  74.7  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.978115  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1969  hypothetical protein  29.15 
 
 
377 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0438709  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3328  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  31.06 
 
 
407 aa  73.9  0.000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.150159  normal  0.347251 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2837  monooxygenase FAD-binding  25.72 
 
 
378 aa  73.6  0.000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0809  monooxygenase, FAD-binding  28.32 
 
 
396 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.815643  normal  0.21546 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0213  salicylate 1-monooxygenase (NahW)  23.64 
 
 
403 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00584161  normal  0.918812 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08716  salicylate hydroxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G01050)  25.3 
 
 
415 aa  72  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2257  hypothetical protein  26.3 
 
 
378 aa  72  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.472155 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0096  monooxygenase FAD-binding  26.11 
 
 
388 aa  72.4  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0544698 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2311  monooxygenase FAD-binding  27.05 
 
 
383 aa  72.4  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0881  hypothetical protein  28.85 
 
 
402 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.200049  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6172  hypothetical protein  27.14 
 
 
417 aa  72.4  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.272957 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6537  monooxygenase, FAD-binding protein  26.25 
 
 
392 aa  72  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0203356  normal  0.0154804 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4138  monooxygenase, FAD-binding protein  26.89 
 
 
408 aa  71.6  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.145497  normal  0.0296411 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06750  conserved hypothetical protein  24.41 
 
 
447 aa  70.9  0.00000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.123632 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01380  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  28.15 
 
 
378 aa  71.2  0.00000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0392  monooxygenase FAD-binding protein  33.33 
 
 
383 aa  71.2  0.00000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.890611  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3601  salicylate 1-monooxygenase  26.09 
 
 
402 aa  70.9  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.733205  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5319  monooxygenase FAD-binding protein  28.15 
 
 
390 aa  71.2  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3936  monooxygenase FAD-binding protein  26.02 
 
 
455 aa  70.9  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.018551  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4891  monooxygenase, FAD-binding  26.2 
 
 
402 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.292821 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2927  hypothetical protein  26.22 
 
 
424 aa  70.1  0.00000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.27992  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3637  hypothetical protein  25.41 
 
 
416 aa  69.7  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.529402  normal  0.0728154 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07897  FAD binding domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G00660)  23.63 
 
 
393 aa  69.7  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.467263 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1022  salicylate 1-monooxygenase  27.11 
 
 
391 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09400  hypothetical protein  28.49 
 
 
402 aa  69.7  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5727  monooxygenase, FAD-binding  25.52 
 
 
364 aa  69.7  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5437  monooxygenase, FAD-binding  25.52 
 
 
364 aa  69.7  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.863729 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4893  kynurenine 3-monooxygenase  25.07 
 
 
454 aa  68.9  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.221128  normal  0.0116181 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4207  salicylate 1-monooxygenase  26.25 
 
 
406 aa  68.9  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.880254  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4211  monooxygenase, FAD-binding  28.21 
 
 
382 aa  68.6  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.815591  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2172  monooxygenase, FAD-binding  25.92 
 
 
413 aa  68.9  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0853287 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3524  monooxygenase FAD-binding protein  27.33 
 
 
401 aa  68.6  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.894226  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2372  hypothetical protein  26.27 
 
 
374 aa  68.6  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0501  hypothetical protein  24.28 
 
 
421 aa  68.2  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.458939 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01033  hypothetical protein  28.96 
 
 
440 aa  68.2  0.0000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.10266 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3561  monooxygenase, FAD-binding protein  26.38 
 
 
389 aa  68.6  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.014092  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5348  monooxygenase, FAD-binding protein  25.53 
 
 
360 aa  68.2  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.437085  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2329  hypothetical protein  26.27 
 
 
374 aa  68.6  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3634  monooxygenase, FAD-binding  26.38 
 
 
389 aa  68.6  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.231418  normal  0.598375 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2786  monooxygenase FAD-binding protein  26.82 
 
 
408 aa  67.8  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00390244  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA01280  conserved expressed protein  26.7 
 
 
442 aa  67.8  0.0000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21010  putative FAD-dependent monooxygenase  27.3 
 
 
388 aa  67.8  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.12929  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>