More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2326 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_2326  monooxygenase FAD-binding protein  100 
 
 
388 aa  808    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000156334  normal  0.582922 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5423  monooxygenase FAD-binding  57.85 
 
 
382 aa  469  1.0000000000000001e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.224517  normal  0.231326 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1277  monooxygenase FAD-binding  57.14 
 
 
381 aa  451  1e-125  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2826  monooxygenase, FAD-binding  51.82 
 
 
387 aa  416  9.999999999999999e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00129396  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1924  monooxygenase; 2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase  55.03 
 
 
387 aa  415  9.999999999999999e-116  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.630677  normal  0.306888 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4254  monooxygenase FAD-binding  47.57 
 
 
392 aa  376  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1438  monooxygenase, FAD-binding  42.74 
 
 
413 aa  278  8e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00120206  hitchhiker  0.00122057 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5691  monooxygenase FAD-binding  39.14 
 
 
376 aa  255  1.0000000000000001e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2823  monooxygenase, FAD-binding  35.85 
 
 
371 aa  239  8e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.091542  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3517  monooxygenase, FAD-binding  35.26 
 
 
385 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.623295  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4474  salicylate hydroxylase protein  38.78 
 
 
377 aa  229  6e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.102807 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2837  monooxygenase FAD-binding  35.19 
 
 
378 aa  227  3e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2878  monooxygenase FAD-binding  34.92 
 
 
378 aa  215  9.999999999999999e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4844  monooxygenase, FAD-binding protein  33.16 
 
 
390 aa  199  6e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3818  monooxygenase FAD-binding  33.94 
 
 
378 aa  195  9e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.357574  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3463  monooxygenase FAD-binding protein  31.94 
 
 
376 aa  192  1e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.039982  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1380  monooxygenase FAD-binding  34.92 
 
 
372 aa  187  2e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.709095 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0802  monooxygenase FAD-binding  32.6 
 
 
371 aa  182  8.000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.615046  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3699  monooxygenase FAD-binding  33.61 
 
 
371 aa  177  3e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.442596  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA01280  conserved expressed protein  35 
 
 
442 aa  175  9.999999999999999e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08716  salicylate hydroxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G01050)  31.18 
 
 
415 aa  171  2e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09224  conserved hypothetical protein  29.25 
 
 
443 aa  127  4.0000000000000003e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3854  monooxygenase FAD-binding protein  28.32 
 
 
424 aa  111  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4031  DNA mismatch endonuclease Vsr  25.47 
 
 
404 aa  106  8e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0398  putative monooxygenase  31.9 
 
 
257 aa  105  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3904  kynurenine 3-monooxygenase  27.25 
 
 
446 aa  99  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3529  kynurenine 3-monooxygenase  26.33 
 
 
445 aa  98.6  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.978115  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1231  salicylate 1-monooxygenase  25 
 
 
404 aa  95.1  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.592071  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4040  salicylate 1-monooxygenase  25.65 
 
 
404 aa  95.1  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4498  salicylate 1-monooxygenase  25.59 
 
 
422 aa  93.6  5e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4033  monooxygenase FAD-binding  24.68 
 
 
404 aa  91.3  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.115519 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2005  hypothetical protein  24.26 
 
 
377 aa  88.2  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00436005  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6537  monooxygenase, FAD-binding protein  26.35 
 
 
392 aa  88.6  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0203356  normal  0.0154804 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3524  monooxygenase FAD-binding protein  25.95 
 
 
401 aa  83.6  0.000000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.894226  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0213  salicylate 1-monooxygenase (NahW)  24.53 
 
 
403 aa  83.6  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00584161  normal  0.918812 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1022  salicylate 1-monooxygenase  25 
 
 
391 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5584  monooxygenase FAD-binding protein  24.94 
 
 
401 aa  82.4  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3209  monooxygenase, FAD-binding  27.2 
 
 
483 aa  82  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4207  salicylate 1-monooxygenase  27.01 
 
 
406 aa  81.3  0.00000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.880254  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2693  monooxygenase FAD-binding  24.03 
 
 
450 aa  80.9  0.00000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.433574  hitchhiker  0.000536484 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3927  salicylate 1-monooxygenase  26.22 
 
 
385 aa  80.5  0.00000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.567277  normal  0.0279633 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1853  monooxygenase FAD-binding  26.22 
 
 
385 aa  80.5  0.00000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2599  Kynurenine 3-monooxygenase  26.68 
 
 
455 aa  79  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0833412  normal  0.344661 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2311  monooxygenase FAD-binding  26.94 
 
 
383 aa  79  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1542  monooxygenase FAD-binding protein  23.76 
 
 
374 aa  78.6  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0929471  normal  0.228138 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2230  hypothetical protein  24.29 
 
 
377 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000757274  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6042  monooxygenase FAD-binding  27.53 
 
 
378 aa  77  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0233658  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_92063  predicted protein  24.22 
 
 
509 aa  76.6  0.0000000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0115456  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2068  salicylate 1-monooxygenase  23.88 
 
 
385 aa  76.3  0.0000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.341777 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1633  monooxygenase FAD-binding  24.33 
 
 
410 aa  76.3  0.0000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.719976  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0841  Kynurenine 3-monooxygenase  25.81 
 
 
427 aa  76.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4164  putative monoxygenase  24.03 
 
 
415 aa  75.5  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0321225  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0813  monooxygenase, FAD-binding  24.59 
 
 
377 aa  75.1  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6277  monooxygenase FAD-binding  24.04 
 
 
405 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.146167  normal  0.672282 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1565  monooxygenase FAD-binding  25.9 
 
 
384 aa  74.7  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.156985 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0812  Kynurenine 3-monooxygenase  25.54 
 
 
427 aa  74.3  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5727  monooxygenase, FAD-binding  26.06 
 
 
364 aa  73.9  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5348  monooxygenase, FAD-binding protein  26.06 
 
 
360 aa  73.6  0.000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.437085  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5437  monooxygenase, FAD-binding  26.06 
 
 
364 aa  73.2  0.000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.863729 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2393  hypothetical protein  22.37 
 
 
376 aa  73.2  0.000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.142228  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2786  monooxygenase FAD-binding protein  25.19 
 
 
408 aa  73.2  0.000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00390244  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08588  conserved hypothetical protein  26.05 
 
 
541 aa  72.4  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5650  monooxygenase FAD-binding  24.49 
 
 
416 aa  72.4  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.470651  normal  0.804587 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1576  putative monooxygenase  25.99 
 
 
388 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.472277  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3944  salicylate hydroxylase  25.66 
 
 
382 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0448295  normal  0.412797 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00340  kynurenine 3-monooxygenase, putative  24.5 
 
 
421 aa  72  0.00000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.303065  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1219  putative monooxygenase  25.64 
 
 
388 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00380078  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2421  putative monooxygenase  25.64 
 
 
388 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1144  putative monooxygenase  25.64 
 
 
388 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.670847  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0896  monooxygenase, FAD-binding  25.13 
 
 
389 aa  71.6  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2974  hypothetical protein  25.19 
 
 
414 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.556187  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2509  monooxygenase, FAD-binding  22.59 
 
 
450 aa  71.2  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.389183  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1585  hypothetical protein  24.63 
 
 
440 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.825888  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0770  putative monooxygenase  25.64 
 
 
388 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.522816  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0391  hypothetical protein  24.63 
 
 
440 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0696  putative monooxygenase  25.64 
 
 
388 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0540721  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1893  monooxygenase, FAD-binding  26.24 
 
 
382 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1734  putative monooxygenase  25.64 
 
 
388 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0439  hypothetical protein  24.63 
 
 
440 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1770  hypothetical protein  24.63 
 
 
440 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5490  hypothetical protein  26.77 
 
 
376 aa  71.2  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.263569  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1214  hypothetical protein  24.94 
 
 
414 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1561  hypothetical protein  25.19 
 
 
377 aa  70.5  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3224  monooxygenase FAD-binding  23.16 
 
 
399 aa  70.5  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.494892 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4547  monooxygenase FAD-binding  24.71 
 
 
385 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.326108  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0991  salicylate 1-monooxygenase  24.54 
 
 
397 aa  70.1  0.00000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0622996  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2849  hypothetical protein  24.69 
 
 
414 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3565  monooxygenase FAD-binding  22.77 
 
 
384 aa  69.7  0.00000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4581  monooxygenase FAD-binding protein  24.6 
 
 
399 aa  69.7  0.00000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.626069 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3579  monooxygenase FAD-binding  25.66 
 
 
382 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.817981 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5319  monooxygenase FAD-binding protein  23.62 
 
 
390 aa  68.9  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2140  monooxygenase FAD-binding  26.24 
 
 
382 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0383787 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4393  monooxygenase FAD-binding  25.63 
 
 
377 aa  68.6  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1784  monooxygenase, FAD-binding  24.85 
 
 
410 aa  68.6  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4263  monooxygenase FAD-binding  24.16 
 
 
398 aa  68.6  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00000952252  normal  0.156031 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0849  monooxygenase, FAD-binding  27.55 
 
 
484 aa  68.9  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.109359  normal 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47925  predicted protein  26.03 
 
 
562 aa  68.2  0.0000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.462072  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3936  monooxygenase FAD-binding protein  25.86 
 
 
455 aa  67.8  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.018551  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0712  hypothetical protein  26.02 
 
 
371 aa  67.8  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1285  monooxygenase, FAD-binding protein  24.66 
 
 
410 aa  67.8  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>