189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5650 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_5650  monooxygenase FAD-binding  100 
 
 		 416 aa  840    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.470651  normal  0.804587 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2587  putative monoxygenase  54.59 
 
 		 409 aa  385  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.137465 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3854  monooxygenase FAD-binding protein  33.93 
 
 		 424 aa  199  6e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2693  monooxygenase FAD-binding  35 
 
 		 450 aa  198  2.0000000000000003e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.433574  hitchhiker  0.000536484 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2509  monooxygenase, FAD-binding  34.9 
 
 		 450 aa  191  1e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.389183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4190  FAD-binding domain protein  35.19 
 
 		 452 aa  190  5e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.412488 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3936  monooxygenase FAD-binding protein  35.29 
 
 		 455 aa  177  3e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.018551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1285  monooxygenase, FAD-binding protein  34.21 
 
 		 410 aa  160  5e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5584  monooxygenase FAD-binding protein  33.33 
 
 		 401 aa  158  2e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4164  putative monoxygenase  33.07 
 
 		 415 aa  157  4e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0321225  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3295  monooxygenase FAD-binding protein  34.09 
 
 		 379 aa  157  4e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.676341 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2326  monooxygenase FAD-binding protein  26.02 
 
 		 388 aa  97.1  6e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000156334  normal  0.582922 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4254  monooxygenase FAD-binding  28.16 
 
 		 392 aa  92.8  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3441  monooxygenase FAD-binding  27.43 
 
 		 428 aa  87.4  5e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000658933  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3463  monooxygenase FAD-binding protein  30.17 
 
 		 376 aa  84.3  0.000000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.039982  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2626  monooxygenase FAD-binding  26.38 
 
 		 519 aa  81.3  0.00000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5423  monooxygenase FAD-binding  26.15 
 
 		 382 aa  78.6  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.224517  normal  0.231326 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1277  monooxygenase FAD-binding  26.12 
 
 		 381 aa  75.5  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6537  monooxygenase, FAD-binding protein  33.33 
 
 		 392 aa  73.9  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0203356  normal  0.0154804 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07897  FAD binding domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G00660)  28.42 
 
 		 393 aa  72.4  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.467263 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08588  conserved hypothetical protein  25.18 
 
 		 541 aa  72  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5691  monooxygenase FAD-binding  24.56 
 
 		 376 aa  72  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2823  monooxygenase, FAD-binding  24.16 
 
 		 371 aa  70.9  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.091542  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4031  DNA mismatch endonuclease Vsr  26.79 
 
 		 404 aa  70.5  0.00000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06750  conserved hypothetical protein  25.74 
 
 		 447 aa  69.7  0.00000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.123632 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3517  monooxygenase, FAD-binding  27.76 
 
 		 385 aa  69.7  0.00000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.623295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2837  monooxygenase FAD-binding  28.97 
 
 		 378 aa  68.2  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1438  monooxygenase, FAD-binding  25.99 
 
 		 413 aa  67.4  0.0000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00120206  hitchhiker  0.00122057 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_92063  predicted protein  25.42 
 
 		 509 aa  66.6  0.0000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0115456  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1082  hypothetical protein  34.66 
 
 		 380 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_56492  zeaxanthin epoxidase  23.88 
 
 		 557 aa  62.4  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.688102  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7002  hypothetical protein  33.33 
 
 		 380 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00600208 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1493  hypothetical protein  33.33 
 
 		 380 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6336  hypothetical protein  33.33 
 
 		 380 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4844  monooxygenase, FAD-binding protein  25.55 
 
 		 390 aa  62.4  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1082  hypothetical protein  34.43 
 
 		 380 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2878  monooxygenase FAD-binding  31.84 
 
 		 378 aa  61.2  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08716  salicylate hydroxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G01050)  31.25 
 
 		 415 aa  60.8  0.00000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4947  hypothetical protein  32.14 
 
 		 390 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.648001 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3586  salicylate 1-monooxygenase  25.49 
 
 		 427 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.942873 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2005  hypothetical protein  28.49 
 
 		 377 aa  58.2  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00436005  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06002  FAD-dependent monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00150)  25.66 
 
 		 417 aa  57.8  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.885397  normal  0.555833 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0795  hypothetical protein  32.31 
 
 		 390 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.921964 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1924  monooxygenase; 2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase  24.94 
 
 		 387 aa  57.8  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.630677  normal  0.306888 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0771  monooxygenase FAD-binding  26.05 
 
 		 380 aa  57.8  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000429101 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3294  monooxygenase FAD-binding protein  24.48 
 
 		 388 aa  57  0.0000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0802651  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0809  monooxygenase, FAD-binding  24.4 
 
 		 396 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.815643  normal  0.21546 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3565  monooxygenase FAD-binding  32.99 
 
 		 384 aa  56.2  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2526  salicylate 1-monooxygenase  24.53 
 
 		 396 aa  55.5  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.066083 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3466  monooxygenase, FAD-binding  24.59 
 
 		 392 aa  55.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4900  monooxygenase, FAD-binding  24.59 
 
 		 392 aa  55.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.99121 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2318  monooxygenase FAD-binding  26.55 
 
 		 385 aa  55.1  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.694664  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7773  monooxygenase FAD-binding  29.22 
 
 		 374 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5278  monooxygenase, FAD-binding  25.19 
 
 		 395 aa  55.1  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.630865 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2710  monooxygenase FAD-binding  30 
 
 		 392 aa  55.1  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4474  salicylate hydroxylase protein  26.49 
 
 		 377 aa  54.3  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.102807 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02033  conserved hypothetical protein  26.13 
 
 		 435 aa  54.3  0.000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.637061 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1022  salicylate 1-monooxygenase  25.81 
 
 		 391 aa  54.3  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3209  monooxygenase, FAD-binding  24.06 
 
 		 483 aa  54.3  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09400  hypothetical protein  27.05 
 
 		 402 aa  53.9  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3818  monooxygenase FAD-binding  27.72 
 
 		 378 aa  53.5  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.357574  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1542  monooxygenase FAD-binding protein  25.75 
 
 		 374 aa  53.5  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0929471  normal  0.228138 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2954  hypothetical protein  32.72 
 
 		 396 aa  53.1  0.000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.235474  hitchhiker  0.00230621 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5386  monooxygenase FAD-binding  24.59 
 
 		 392 aa  53.1  0.000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.336288 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01821  FAD-binding monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G07040)  25.12 
 
 		 423 aa  52.8  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00520599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0213  salicylate 1-monooxygenase (NahW)  26.86 
 
 		 403 aa  53.1  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00584161  normal  0.918812 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_1611  zeaxanthin epoxidase (ABA1) (NPQ2)  22.79 
 
 		 429 aa  52.8  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.539309  normal  0.0529961 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5073  Salicylate 1-monooxygenase  26.88 
 
 		 386 aa  51.6  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.926874  normal  0.172716 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4498  salicylate 1-monooxygenase  24.06 
 
 		 422 aa  52  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01683  hypothetical protein  51.85 
 
 		 397 aa  51.6  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5706  hypothetical protein  29.38 
 
 		 401 aa  51.2  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0755393 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4040  salicylate 1-monooxygenase  24.8 
 
 		 404 aa  50.8  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45936  predicted protein  24.52 
 
 		 598 aa  50.8  0.00005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2051  2-octaprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase  29.44 
 
 		 409 aa  50.8  0.00005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0991465  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4581  monooxygenase FAD-binding protein  24.59 
 
 		 399 aa  50.4  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.626069 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4129  monooxygenase FAD-binding protein  26.94 
 
 		 421 aa  50.4  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0712  hypothetical protein  30.06 
 
 		 371 aa  50.1  0.00007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5812  monooxygenase, FAD-binding protein  29.76 
 
 		 408 aa  50.1  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0698086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1494  monooxygenase, FAD-binding  24.48 
 
 		 386 aa  50.1  0.00008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.379752  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02114  salicylate hydroxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G05260)  23.8 
 
 		 448 aa  49.7  0.00009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1946  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  31.07 
 
 		 395 aa  49.7  0.00009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0857423  hitchhiker  0.00135918 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2068  salicylate 1-monooxygenase  24.27 
 
 		 385 aa  49.7  0.00009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.341777 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0802  monooxygenase FAD-binding  27.04 
 
 		 371 aa  49.7  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.615046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1486  monooxygenase FAD-binding protein  31.14 
 
 		 408 aa  49.7  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.528879  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21010  putative FAD-dependent monooxygenase  25.16 
 
 		 388 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.12929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0991  salicylate 1-monooxygenase  23.84 
 
 		 397 aa  49.3  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0622996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0881  hypothetical protein  26.3 
 
 		 402 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.200049  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1528  monooxygenase FAD-binding  27.84 
 
 		 362 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.392805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2729  hypothetical protein  30.34 
 
 		 415 aa  48.9  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5646  hypothetical protein  30.36 
 
 		 407 aa  48.9  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.419878  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4063  monooxygenase FAD-binding protein  24.62 
 
 		 402 aa  48.5  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.69418 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0681  monooxygenase, FAD-binding  24.87 
 
 		 453 aa  48.9  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2748  monooxygenase FAD-binding protein  27.72 
 
 		 489 aa  48.5  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3328  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  26.64 
 
 		 407 aa  48.5  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.150159  normal  0.347251 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0779  monooxygenase, FAD-binding  28.49 
 
 		 500 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.813515  normal  0.655211 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08231  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  29.71 
 
 		 445 aa  48.5  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.891697  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4033  monooxygenase FAD-binding  23.59 
 
 		 404 aa  48.9  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.115519 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4133  pentachlorophenol monooxygenase  28.81 
 
 		 479 aa  48.5  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.636421 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5009  monooxygenase, FAD-binding  27.94 
 
 		 506 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0680  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  24.86 
 
 		 391 aa  48.1  0.0003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000873378  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>