284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3441 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_3441  monooxygenase FAD-binding  100 
 
 
428 aa  817    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000658933  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2626  monooxygenase FAD-binding  53.08 
 
 
519 aa  350  2e-95  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3936  monooxygenase FAD-binding protein  29.46 
 
 
455 aa  120  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.018551  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4164  putative monoxygenase  29.8 
 
 
415 aa  106  8e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0321225  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3854  monooxygenase FAD-binding protein  29.72 
 
 
424 aa  104  4e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4031  DNA mismatch endonuclease Vsr  29.52 
 
 
404 aa  100  6e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2693  monooxygenase FAD-binding  28.61 
 
 
450 aa  95.5  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.433574  hitchhiker  0.000536484 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5650  monooxygenase FAD-binding  27.9 
 
 
416 aa  94.7  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.470651  normal  0.804587 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1231  salicylate 1-monooxygenase  29.9 
 
 
404 aa  93.6  5e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.592071  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2587  putative monoxygenase  28.97 
 
 
409 aa  93.2  7e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.137465 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2509  monooxygenase, FAD-binding  27.85 
 
 
450 aa  91.7  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.389183  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4040  salicylate 1-monooxygenase  30.55 
 
 
404 aa  91.7  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4498  salicylate 1-monooxygenase  30.55 
 
 
422 aa  91.3  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0778  monooxygenase FAD-binding  34.41 
 
 
393 aa  90.9  4e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0373747  decreased coverage  0.000456942 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5584  monooxygenase FAD-binding protein  33.91 
 
 
401 aa  87.8  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4033  monooxygenase FAD-binding  29.55 
 
 
404 aa  87.4  5e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.115519 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4190  FAD-binding domain protein  28.18 
 
 
452 aa  82.4  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.412488 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4581  monooxygenase FAD-binding protein  27.03 
 
 
399 aa  82  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.626069 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2962  monooxygenase FAD-binding protein  29.08 
 
 
397 aa  80.1  0.00000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1784  monooxygenase, FAD-binding  28.89 
 
 
410 aa  77.8  0.0000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3295  monooxygenase FAD-binding protein  28.8 
 
 
379 aa  77.4  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.676341 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5278  monooxygenase, FAD-binding  25.71 
 
 
395 aa  77.4  0.0000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.630865 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08588  conserved hypothetical protein  27.25 
 
 
541 aa  76.6  0.0000000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1022  salicylate 1-monooxygenase  29.97 
 
 
391 aa  76.3  0.0000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3466  monooxygenase, FAD-binding  26.92 
 
 
392 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1438  monooxygenase, FAD-binding  27.34 
 
 
413 aa  76.3  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00120206  hitchhiker  0.00122057 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4900  monooxygenase, FAD-binding  26.92 
 
 
392 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.99121 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3294  monooxygenase FAD-binding protein  27.5 
 
 
388 aa  75.5  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0802651  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5386  monooxygenase FAD-binding  27.2 
 
 
392 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.336288 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6277  monooxygenase FAD-binding  32.14 
 
 
405 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.146167  normal  0.672282 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0813  monooxygenase, FAD-binding  26.33 
 
 
377 aa  75.1  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3524  monooxygenase FAD-binding protein  32.73 
 
 
401 aa  73.9  0.000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.894226  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2471  monooxygenase FAD-binding  29.09 
 
 
373 aa  73.6  0.000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4971  monooxygenase FAD-binding  29.63 
 
 
384 aa  73.2  0.000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.415719  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2526  salicylate 1-monooxygenase  27.29 
 
 
396 aa  73.2  0.000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.066083 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2005  hypothetical protein  21.63 
 
 
377 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00436005  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01821  FAD-binding monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G07040)  24.8 
 
 
423 aa  71.2  0.00000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00520599  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4393  monooxygenase FAD-binding  27.66 
 
 
377 aa  71.6  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2621  monooxygenase, FAD-binding  28.47 
 
 
388 aa  71.6  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.684205  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0503  monooxygenase FAD-binding  30.92 
 
 
376 aa  70.9  0.00000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1889  hypothetical protein  25.14 
 
 
374 aa  70.5  0.00000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4063  monooxygenase FAD-binding protein  26.6 
 
 
402 aa  70.5  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.69418 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1462  monooxygenase FAD-binding  25.4 
 
 
390 aa  70.1  0.00000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000001589  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2360  monooxygenase, FAD-binding protein  28.94 
 
 
400 aa  69.7  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.175962  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2407  monooxygenase, FAD-binding  28.94 
 
 
400 aa  69.7  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.254272 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4891  monooxygenase, FAD-binding  28.73 
 
 
402 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.292821 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2326  monooxygenase FAD-binding protein  24.35 
 
 
388 aa  67.8  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000156334  normal  0.582922 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1277  monooxygenase FAD-binding  24.34 
 
 
381 aa  67.8  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2401  monooxygenase, FAD-binding  28.53 
 
 
400 aa  67  0.0000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.236058 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1987  hypothetical protein  20.57 
 
 
377 aa  65.9  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000746962  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_1611  zeaxanthin epoxidase (ABA1) (NPQ2)  25.27 
 
 
429 aa  66.2  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.539309  normal  0.0529961 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2318  monooxygenase FAD-binding  27.52 
 
 
385 aa  66.2  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.694664  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0338  monooxygenase FAD-binding  24.66 
 
 
372 aa  65.1  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1561  hypothetical protein  28.04 
 
 
377 aa  65.1  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0568  monooxygenase FAD-binding  30.97 
 
 
376 aa  65.5  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1542  monooxygenase FAD-binding protein  25.86 
 
 
374 aa  65.9  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0929471  normal  0.228138 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2527  monooxygenase FAD-binding protein  31.34 
 
 
388 aa  65.1  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.172814 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2729  hypothetical protein  23.56 
 
 
415 aa  64.3  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0950  monooxygenase, FAD-binding  25.21 
 
 
368 aa  63.9  0.000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02114  salicylate hydroxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G05260)  24.34 
 
 
448 aa  63.9  0.000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1969  hypothetical protein  21.58 
 
 
377 aa  63.9  0.000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0438709  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6537  monooxygenase, FAD-binding protein  27.09 
 
 
392 aa  63.5  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0203356  normal  0.0154804 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06742  salicylate hydroxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00590)  24.94 
 
 
697 aa  63.2  0.000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.00748094 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0982  monooxygenase FAD-binding  29.38 
 
 
369 aa  63.2  0.000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.240273  decreased coverage  0.000117397 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4844  monooxygenase, FAD-binding protein  40.32 
 
 
390 aa  63.2  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2823  monooxygenase, FAD-binding  22.36 
 
 
371 aa  62.4  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.091542  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0125  monooxygenase FAD-binding  22.82 
 
 
374 aa  62.8  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2339  monooxygenase FAD-binding  28.81 
 
 
388 aa  62.4  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000167175  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_56488  precursor of protein zeaxanthin epoxidase-like protein  26.12 
 
 
604 aa  62.4  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0495  kynurenine 3-monooxygenase  23.65 
 
 
446 aa  62.8  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.167172  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0960  monooxygenase, FAD-binding  25.61 
 
 
368 aa  62.4  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.234631  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5423  monooxygenase FAD-binding  25.19 
 
 
382 aa  62.4  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.224517  normal  0.231326 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4378  monooxygenase FAD-binding  26.83 
 
 
420 aa  62.4  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.760367 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0514  hypothetical protein  30.05 
 
 
421 aa  62  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.472933  normal  0.467939 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3960  monooxygenase, FAD-binding  34.64 
 
 
388 aa  62.4  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1093  monooxygenase, FAD-binding  27.53 
 
 
369 aa  61.6  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.363504 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5490  hypothetical protein  28 
 
 
376 aa  61.6  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.263569  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2257  hypothetical protein  25.55 
 
 
378 aa  61.6  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.472155 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1093  monooxygenase FAD-binding  30.59 
 
 
408 aa  60.8  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0291534  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5335  FAD-dependent monooxygenase  29.46 
 
 
378 aa  61.2  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103313  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4602  monooxygenase FAD-binding  29.68 
 
 
382 aa  60.8  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.296431  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21010  putative FAD-dependent monooxygenase  29.66 
 
 
388 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.12929  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2372  hypothetical protein  23.34 
 
 
374 aa  60.8  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2329  hypothetical protein  23.34 
 
 
374 aa  60.8  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2036  monooxygenase FAD-binding  29.29 
 
 
388 aa  60.5  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1762  monooxygenase FAD-binding  26.89 
 
 
384 aa  60.5  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.638414  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2705  monooxygenase, FAD-binding protein  26.25 
 
 
423 aa  60.5  0.00000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.891359  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4211  monooxygenase, FAD-binding  26.62 
 
 
382 aa  60.1  0.00000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.815591  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08521  salicylate hydroxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G06050)  26.33 
 
 
469 aa  60.1  0.00000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.883838  normal  0.0891916 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2343  monooxygenase FAD-binding protein  30.19 
 
 
392 aa  60.1  0.00000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7249  monooxygenase FAD-binding  26.06 
 
 
377 aa  59.7  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08349  conserved hypothetical protein  28.63 
 
 
349 aa  59.3  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3463  monooxygenase FAD-binding protein  28.89 
 
 
376 aa  59.7  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.039982  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0096  monooxygenase FAD-binding  27.09 
 
 
388 aa  59.7  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0544698 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0809  monooxygenase, FAD-binding  26.38 
 
 
396 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.815643  normal  0.21546 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4013  monooxygenase FAD-binding  25 
 
 
362 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0834664  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1285  monooxygenase, FAD-binding protein  31.37 
 
 
410 aa  59.7  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3565  monooxygenase FAD-binding  25.33 
 
 
384 aa  59.3  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3328  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  30.21 
 
 
407 aa  58.9  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.150159  normal  0.347251 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3561  monooxygenase, FAD-binding protein  29.21 
 
 
389 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.014092  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>