More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_01733 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_01733  oxidoreductase  100 
 
 
267 aa  532  1e-150  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2964  monooxygenase FAD-binding  73.75 
 
 
422 aa  361  6e-99  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000808449 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1535  monooxygenase, FAD-binding  41.91 
 
 
422 aa  156  3e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.859227 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3613  monooxygenase, FAD-binding  41.94 
 
 
390 aa  145  6e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.210857  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3466  monooxygenase, FAD-binding  39.51 
 
 
417 aa  121  9.999999999999999e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.185468  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0545  oxidoreductase protein  37.67 
 
 
398 aa  104  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.309598  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0440  monooxygenase FAD-binding  40.1 
 
 
386 aa  105  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0943043  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0427  monooxygenase FAD-binding  38.73 
 
 
402 aa  102  6e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.12804  hitchhiker  0.0000412039 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3289  monooxygenase FAD-binding protein  35.65 
 
 
405 aa  63.5  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158471  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4014  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  29.67 
 
 
390 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0442  hypothetical protein  33.61 
 
 
425 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3199  hypothetical protein  52.73 
 
 
374 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.3549  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1093  monooxygenase, FAD-binding  47.89 
 
 
369 aa  60.8  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.363504 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4013  monooxygenase FAD-binding  30.89 
 
 
362 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0834664  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2372  hypothetical protein  36.36 
 
 
374 aa  60.5  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1542  monooxygenase FAD-binding protein  42.11 
 
 
374 aa  60.1  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0929471  normal  0.228138 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2329  hypothetical protein  36.36 
 
 
374 aa  60.5  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3968  monooxygenase FAD-binding  30.89 
 
 
362 aa  60.1  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0733  hypothetical protein  28.05 
 
 
369 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0982  monooxygenase FAD-binding  50 
 
 
369 aa  59.3  0.00000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.240273  decreased coverage  0.000117397 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1002  hypothetical protein  28.05 
 
 
369 aa  59.3  0.00000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.132346  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0892  Ubiquinone biosynthesis hydroxylase, UbiH/UbiF/VisC/COQ6 family  40.66 
 
 
400 aa  58.9  0.00000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09000  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  32.48 
 
 
416 aa  58.5  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11769  hypothetical protein  30.22 
 
 
460 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.196079  hitchhiker  0.00000209473 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0321  hypothetical protein  44.59 
 
 
414 aa  58.5  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.372833  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1528  monooxygenase FAD-binding  35.64 
 
 
362 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.392805  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1889  hypothetical protein  32.56 
 
 
374 aa  57.8  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2174  hypothetical protein  35.09 
 
 
405 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.825478  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2242  hypothetical protein  47.27 
 
 
379 aa  57.8  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2552  monooxygenase FAD-binding protein  37.5 
 
 
376 aa  57.8  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0778  monooxygenase FAD-binding  43.68 
 
 
393 aa  57  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0373747  decreased coverage  0.000456942 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1557  UbiH/UbiF/VisC/COQ6 family ubiquinone biosynthesis hydroxylase  41.94 
 
 
415 aa  57  0.0000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000280445  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6078  hypothetical protein  36.45 
 
 
421 aa  56.6  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.25348  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0712  hypothetical protein  31.82 
 
 
371 aa  56.6  0.0000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3882  monooxygenase FAD-binding protein  25.93 
 
 
410 aa  56.6  0.0000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1819  Ubiquinone biosynthesis hydroxylase, UbiH/UbiF/VisC/COQ6 family  29.89 
 
 
398 aa  56.2  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00519293  hitchhiker  0.000000000058103 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1561  monooxygenase FAD-binding  39.69 
 
 
392 aa  56.2  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0688558  normal  0.0725424 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0437  hypothetical protein  32.26 
 
 
423 aa  56.2  0.0000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3239  2-octaprenyl-6-methoxyphenyl hydroxylase  37.17 
 
 
415 aa  56.2  0.0000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1898  monooxygenase FAD-binding protein  31.75 
 
 
391 aa  56.2  0.0000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.305388 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6461  monooxygenase FAD-binding  31.86 
 
 
537 aa  56.2  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0929587  normal  0.112964 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0481  salicylate 1-monooxygenase  36.57 
 
 
373 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2786  monooxygenase FAD-binding protein  36.08 
 
 
408 aa  55.5  0.0000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00390244  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1232  monooxygenase FAD-binding protein  38.67 
 
 
417 aa  55.5  0.0000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0108745 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2049  hypothetical protein  31.18 
 
 
409 aa  55.5  0.0000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.961619  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2040  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  30.77 
 
 
394 aa  55.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.256118 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0957  2-octaprenyl-6-methoxyphenyl hydroxylase  34.86 
 
 
414 aa  55.1  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0307  FAD dependent oxidoreductase  58.82 
 
 
378 aa  54.7  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000823237 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4320  monooxygenase FAD-binding protein  37.66 
 
 
400 aa  54.7  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2682  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  34.16 
 
 
402 aa  54.7  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0923834 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4928  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase and related FAD-dependent oxidoreductase-like protein  42.86 
 
 
123 aa  54.3  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.182085  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3680  monooxygenase, FAD-binding  25.76 
 
 
489 aa  53.9  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.841637  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1885  putative salicylate hydroxylase  44.78 
 
 
389 aa  54.7  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.122899  normal  0.226674 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_56488  precursor of protein zeaxanthin epoxidase-like protein  39.51 
 
 
604 aa  54.3  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0456  hypothetical protein  30.25 
 
 
400 aa  53.5  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.558276  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0439  hypothetical protein  44.26 
 
 
440 aa  53.5  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0391  hypothetical protein  44.26 
 
 
440 aa  53.5  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5024  2-octaprenyl-6-methoxyphenyl hydroxylase  39.77 
 
 
399 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3162  monooxygenase FAD-binding  37.27 
 
 
387 aa  53.5  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1585  hypothetical protein  44.26 
 
 
440 aa  53.5  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.825888  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1770  hypothetical protein  44.26 
 
 
440 aa  53.5  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3227  hypothetical protein  27.43 
 
 
400 aa  53.1  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.470901  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3328  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  29.53 
 
 
407 aa  53.5  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.150159  normal  0.347251 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0079  2-octaprenyl-6-methoxyphenyl hydroxylase  35.78 
 
 
406 aa  53.5  0.000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0535408 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1214  hypothetical protein  44.26 
 
 
414 aa  53.5  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3394  hypothetical protein  27.43 
 
 
400 aa  53.1  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.626262  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3289  hypothetical protein  27.43 
 
 
400 aa  53.1  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.672486  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0376  UbiH/UbiF/VisC/COQ6 family ubiquinone biosynthesis hydroxylase  34.23 
 
 
396 aa  53.5  0.000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.730245  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2974  hypothetical protein  44.26 
 
 
414 aa  53.5  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.556187  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2230  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  30.57 
 
 
392 aa  53.5  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.633224  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0088  2-octaprenyl-6-methoxyphenyl hydroxylase  35.78 
 
 
406 aa  53.1  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.231112  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3292  hypothetical protein  27.43 
 
 
400 aa  53.1  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.61616  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3293  monooxygenase FAD-binding  41.58 
 
 
486 aa  53.1  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247977  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2386  monooxygenase FAD-binding protein  35 
 
 
412 aa  53.1  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.611075  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3214  hypothetical protein  27.43 
 
 
400 aa  53.1  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00565491  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2817  monooxygenase FAD-binding protein  41.79 
 
 
712 aa  53.1  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.606317  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2849  hypothetical protein  44.26 
 
 
414 aa  53.5  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5727  monooxygenase, FAD-binding  46.43 
 
 
364 aa  52.8  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6537  monooxygenase, FAD-binding protein  38.82 
 
 
392 aa  53.1  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0203356  normal  0.0154804 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3068  monooxygenase FAD-binding  41.58 
 
 
493 aa  53.1  0.000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.159708  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1633  monooxygenase FAD-binding  42.11 
 
 
410 aa  53.1  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.719976  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5437  monooxygenase, FAD-binding  46.43 
 
 
364 aa  52.8  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.863729 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0092  2-octaprenyl-6-methoxyphenyl hydroxylase  30.16 
 
 
415 aa  53.1  0.000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2211  2-octaprenyl-6-methoxyphenyl hydroxylase  37.61 
 
 
430 aa  52.8  0.000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0667415  normal  0.307335 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5348  monooxygenase, FAD-binding protein  46.43 
 
 
360 aa  52.8  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.437085  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43425  predicted protein  35.92 
 
 
408 aa  52.8  0.000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1827  2-octaprenyl-6-methoxyphenyl hydroxylase  33.94 
 
 
414 aa  52.8  0.000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0943693  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2611  putative FAD-dependent monooxygenase  38.39 
 
 
382 aa  52.4  0.000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.172271  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1899  2-octaprenyl-6-methoxyphenyl hydroxylase  33.94 
 
 
414 aa  52.8  0.000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2515  salicylate 1-monooxygenase  38 
 
 
386 aa  52.4  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.193433  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28690  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  49.37 
 
 
387 aa  52.4  0.000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2680  monooxygenase, FAD-binding  42.65 
 
 
384 aa  52.4  0.000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.156834  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2599  Kynurenine 3-monooxygenase  45.9 
 
 
455 aa  52.4  0.000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0833412  normal  0.344661 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5898  monooxygenase FAD-binding protein  28.48 
 
 
408 aa  52.4  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.106816 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3972  monooxygenase FAD-binding  32 
 
 
416 aa  52.4  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0762736  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1486  monooxygenase FAD-binding protein  48.39 
 
 
408 aa  52  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.528879  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2848  monooxygenase FAD-binding  43.66 
 
 
404 aa  52  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2621  monooxygenase, FAD-binding  27.95 
 
 
388 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.684205  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2318  monooxygenase FAD-binding  27.97 
 
 
385 aa  51.6  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.694664  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3393  monooxygenase FAD-binding  41.18 
 
 
395 aa  52  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.529657  normal  0.469317 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>