More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_56488 on replicon NC_011669
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011669  PHATRDRAFT_56488  precursor of protein zeaxanthin epoxidase-like protein  100 
 
 
604 aa  1254    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_56492  zeaxanthin epoxidase  43.31 
 
 
557 aa  367  1e-100  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.688102  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45845  zeaxanthin epoxidase  37.42 
 
 
565 aa  266  1e-69  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.915807  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_1611  zeaxanthin epoxidase (ABA1) (NPQ2)  34.52 
 
 
429 aa  225  2e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.539309  normal  0.0529961 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0991  salicylate 1-monooxygenase  29.78 
 
 
397 aa  143  9e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0622996  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0923  monooxygenase FAD-binding  25.56 
 
 
412 aa  123  9.999999999999999e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.264093 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2962  monooxygenase FAD-binding protein  27.1 
 
 
397 aa  120  9.999999999999999e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21010  putative FAD-dependent monooxygenase  28.78 
 
 
388 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.12929  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0229  monooxygenase FAD-binding  27.87 
 
 
409 aa  114  7.000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.297351 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4207  salicylate 1-monooxygenase  28.5 
 
 
406 aa  113  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.880254  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4211  monooxygenase, FAD-binding  28.35 
 
 
382 aa  111  3e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.815591  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2526  salicylate 1-monooxygenase  27.41 
 
 
396 aa  111  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.066083 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2131  salicylate 1-monooxygenase  27.83 
 
 
400 aa  111  5e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0213  salicylate 1-monooxygenase (NahW)  26.32 
 
 
403 aa  110  7.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00584161  normal  0.918812 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3634  monooxygenase, FAD-binding  29.02 
 
 
389 aa  110  1e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.231418  normal  0.598375 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3561  monooxygenase, FAD-binding protein  29.02 
 
 
389 aa  110  1e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.014092  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2701  monooxygenase FAD-binding protein  29.01 
 
 
377 aa  108  3e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1022  salicylate 1-monooxygenase  28.32 
 
 
391 aa  108  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4129  monooxygenase FAD-binding protein  28.47 
 
 
421 aa  107  5e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4031  DNA mismatch endonuclease Vsr  28.16 
 
 
404 aa  107  5e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3960  monooxygenase, FAD-binding  28.57 
 
 
388 aa  107  6e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5073  Salicylate 1-monooxygenase  28.98 
 
 
386 aa  107  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.926874  normal  0.172716 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3566  monooxygenase, FAD-binding  28.24 
 
 
389 aa  106  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.411114  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3328  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  28.95 
 
 
407 aa  105  2e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.150159  normal  0.347251 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4033  monooxygenase FAD-binding  27.21 
 
 
404 aa  105  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.115519 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1633  monooxygenase FAD-binding  27.94 
 
 
410 aa  105  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.719976  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0778  monooxygenase FAD-binding  26.35 
 
 
393 aa  105  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0373747  decreased coverage  0.000456942 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2318  monooxygenase FAD-binding  26.49 
 
 
385 aa  104  4e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.694664  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56402  Salicylate hydroxylase (Salicylate 1-monooxygenase)  28.87 
 
 
426 aa  103  7e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.476468  normal  0.198075 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2005  hypothetical protein  25.94 
 
 
377 aa  103  7e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00436005  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5278  monooxygenase, FAD-binding  25.9 
 
 
395 aa  102  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.630865 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0982  monooxygenase FAD-binding  26.73 
 
 
399 aa  102  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0183396 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3149  salicylate 1-monooxygenase  27.21 
 
 
398 aa  102  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.136472  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1231  salicylate 1-monooxygenase  26.14 
 
 
404 aa  101  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.592071  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3565  monooxygenase FAD-binding  24.7 
 
 
384 aa  101  5e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2584  monooxygenase, FAD-binding  25.86 
 
 
400 aa  100  8e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.613825  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG00340  kynurenine 3-monooxygenase, putative  26.78 
 
 
421 aa  100  1e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.303065  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2068  salicylate 1-monooxygenase  26.42 
 
 
385 aa  99.8  1e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.341777 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4602  monooxygenase FAD-binding  27.32 
 
 
382 aa  99  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.296431  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3662  monooxygenase, FAD-binding  25.54 
 
 
395 aa  98.6  3e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.555838  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2480  monooxygenase FAD-binding  27.53 
 
 
395 aa  98.2  4e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5490  hypothetical protein  26.38 
 
 
376 aa  97.8  5e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.263569  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2257  hypothetical protein  26.32 
 
 
378 aa  97.8  5e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.472155 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4498  salicylate 1-monooxygenase  26.68 
 
 
422 aa  97.8  5e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4040  salicylate 1-monooxygenase  26.44 
 
 
404 aa  97.8  6e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1987  hypothetical protein  26.48 
 
 
377 aa  96.7  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000746962  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3927  salicylate 1-monooxygenase  25.83 
 
 
385 aa  96.3  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.567277  normal  0.0279633 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2710  monooxygenase FAD-binding  22.95 
 
 
392 aa  95.5  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1969  hypothetical protein  25.83 
 
 
377 aa  95.5  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0438709  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5319  monooxygenase FAD-binding protein  23.41 
 
 
390 aa  95.5  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2140  monooxygenase FAD-binding  26.83 
 
 
382 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0383787 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2339  monooxygenase FAD-binding  27.99 
 
 
388 aa  95.5  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000167175  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2621  monooxygenase, FAD-binding  27.22 
 
 
388 aa  96.3  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.684205  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_31126  Salicylate hydroxylase (Salicylate 1-monooxygenase)  27.58 
 
 
411 aa  95.5  3e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0813  monooxygenase, FAD-binding  27.23 
 
 
377 aa  95.1  3e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1784  monooxygenase, FAD-binding  26.01 
 
 
410 aa  94.4  5e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2128  salicylate hydroxylase  26.78 
 
 
397 aa  94  7e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.453627  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5557  FAD-dependent oxidoreductase  25.55 
 
 
367 aa  94  7e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.633311 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2160  monooxygenase FAD-binding  27.61 
 
 
395 aa  94  8e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3579  monooxygenase FAD-binding  26.15 
 
 
382 aa  93.6  9e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.817981 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0096  monooxygenase FAD-binding  25.51 
 
 
388 aa  93.2  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0544698 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3944  salicylate hydroxylase  26.24 
 
 
382 aa  93.2  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0448295  normal  0.412797 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5727  monooxygenase, FAD-binding  26.41 
 
 
364 aa  93.6  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5437  monooxygenase, FAD-binding  26.15 
 
 
364 aa  93.2  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.863729 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5348  monooxygenase, FAD-binding protein  26.15 
 
 
360 aa  93.2  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.437085  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2172  monooxygenase, FAD-binding  26.67 
 
 
413 aa  92  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0853287 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1893  monooxygenase, FAD-binding  26.15 
 
 
382 aa  91.7  4e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3292  salicylate 1-monooxygenase  26.2 
 
 
404 aa  90.9  6e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0110847 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2203  monooxygenase FAD-binding  27.53 
 
 
395 aa  90.9  7e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3294  monooxygenase FAD-binding protein  26.19 
 
 
388 aa  90.1  9e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0802651  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1561  monooxygenase FAD-binding  25.81 
 
 
392 aa  89.7  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0688558  normal  0.0725424 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1853  monooxygenase FAD-binding  25.06 
 
 
385 aa  89  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2527  monooxygenase FAD-binding protein  25.42 
 
 
388 aa  89.4  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.172814 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2230  hypothetical protein  26.67 
 
 
377 aa  89.7  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000757274  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1093  monooxygenase FAD-binding  22.7 
 
 
408 aa  89.4  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0291534  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3162  monooxygenase FAD-binding  26.3 
 
 
387 aa  89.4  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0307  FAD dependent oxidoreductase  27.56 
 
 
378 aa  89.4  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000823237 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2182  monooxygenase, FAD-binding  26.12 
 
 
412 aa  89  3e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2369  monooxygenase FAD-binding protein  26.45 
 
 
371 aa  88.2  4e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0712  hypothetical protein  26.02 
 
 
371 aa  88.2  4e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1110  monooxygenase FAD-binding  25.25 
 
 
389 aa  88.2  4e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.7504  normal  0.659993 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1762  monooxygenase FAD-binding  24.69 
 
 
384 aa  87.4  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.638414  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2514  monooxygenase FAD-binding protein  26.62 
 
 
391 aa  87  9e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6859  FAD dependent oxidoreductase  26.1 
 
 
420 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.87929 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2253  monooxygenase FAD-binding protein  25.91 
 
 
401 aa  86.7  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3957  monooxygenase FAD-binding  25.83 
 
 
376 aa  85.5  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6042  monooxygenase FAD-binding  23.74 
 
 
378 aa  85.9  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0233658  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3586  salicylate 1-monooxygenase  24.2 
 
 
427 aa  86.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.942873 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01380  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  25.62 
 
 
378 aa  85.1  0.000000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5237  putative salicylate 1-monooxygenase  29.03 
 
 
399 aa  85.1  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.192496 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5812  monooxygenase, FAD-binding protein  26.78 
 
 
408 aa  84.3  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0698086  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4002  monooxygenase FAD-binding  25.56 
 
 
376 aa  84.3  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2311  monooxygenase FAD-binding  25.25 
 
 
383 aa  84.3  0.000000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3601  salicylate 1-monooxygenase  27.39 
 
 
402 aa  84.3  0.000000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.733205  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4581  monooxygenase FAD-binding protein  26.88 
 
 
399 aa  84.3  0.000000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.626069 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4378  monooxygenase FAD-binding  23.18 
 
 
420 aa  84.3  0.000000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.760367 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4900  monooxygenase, FAD-binding  23.61 
 
 
392 aa  84  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.99121 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3466  monooxygenase, FAD-binding  23.61 
 
 
392 aa  84  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3612  monooxygenase FAD-binding  25.29 
 
 
430 aa  83.2  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0302868  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19150  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  32.59 
 
 
351 aa  83.2  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0319604  normal  0.370849 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>