More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_0440 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_0440  monooxygenase FAD-binding  100 
 
 		 386 aa  777    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0943043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0427  monooxygenase FAD-binding  95.25 
 
 		 402 aa  675    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.12804  hitchhiker  0.0000412039 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0545  oxidoreductase protein  81.46 
 
 		 398 aa  575  1.0000000000000001e-163  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.309598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2964  monooxygenase FAD-binding  38.34 
 
 		 422 aa  194  2e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000808449 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3613  monooxygenase, FAD-binding  35.73 
 
 		 390 aa  162  8.000000000000001e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.210857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1535  monooxygenase, FAD-binding  33.51 
 
 		 422 aa  153  5e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.859227 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3466  monooxygenase, FAD-binding  32.56 
 
 		 417 aa  124  2e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.185468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01733  oxidoreductase  40.1 
 
 		 267 aa  115  1.0000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5557  FAD-dependent oxidoreductase  33.23 
 
 		 367 aa  101  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.633311 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1784  monooxygenase, FAD-binding  29.57 
 
 		 410 aa  94  5e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2369  monooxygenase FAD-binding protein  33.55 
 
 		 371 aa  90.1  5e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4971  monooxygenase FAD-binding  31.04 
 
 		 384 aa  85.9  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.415719  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2257  hypothetical protein  27.62 
 
 		 378 aa  84  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.472155 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5727  monooxygenase, FAD-binding  30.24 
 
 		 364 aa  84.3  0.000000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1313  monooxygenase, FAD-binding  30.11 
 
 		 391 aa  84  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1193  monooxygenase, FAD-binding  30.36 
 
 		 390 aa  84  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.155257  normal  0.524756 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2656  putative salicylate hydroxylase (salicylate 1-monooxygenase)  30.11 
 
 		 391 aa  84  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3284  monooxygenase FAD-binding protein  27.99 
 
 		 393 aa  83.6  0.000000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.289154 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1655  hypothetical protein  27.62 
 
 		 419 aa  83.2  0.000000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.151005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5437  monooxygenase, FAD-binding  29.94 
 
 		 364 aa  83.2  0.000000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.863729 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5348  monooxygenase, FAD-binding protein  29.94 
 
 		 360 aa  82.8  0.000000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.437085  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01380  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  28.81 
 
 		 378 aa  82.4  0.00000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0809  monooxygenase, FAD-binding  26.15 
 
 		 396 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.815643  normal  0.21546 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0712  hypothetical protein  26.04 
 
 		 371 aa  82.4  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1889  hypothetical protein  23.95 
 
 		 374 aa  79  0.0000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0546  monooxygenase, FAD-binding  28.4 
 
 		 373 aa  77.4  0.0000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2393  hypothetical protein  27.38 
 
 		 376 aa  77.4  0.0000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.142228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3579  monooxygenase FAD-binding  24.78 
 
 		 382 aa  77  0.0000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.817981 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1898  monooxygenase FAD-binding protein  26.92 
 
 		 391 aa  76.6  0.0000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.305388 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1893  monooxygenase, FAD-binding  24.78 
 
 		 382 aa  76.3  0.0000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3170  hypothetical protein  26.85 
 
 		 406 aa  75.9  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.161745 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2174  hypothetical protein  27 
 
 		 405 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.825478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0813  monooxygenase, FAD-binding  26.27 
 
 		 377 aa  75.1  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2848  monooxygenase FAD-binding  28 
 
 		 404 aa  75.5  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00330  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  27.32 
 
 		 405 aa  74.7  0.000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11769  hypothetical protein  27.47 
 
 		 460 aa  74.7  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.196079  hitchhiker  0.00000209473 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3944  salicylate hydroxylase  24.5 
 
 		 382 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0448295  normal  0.412797 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6537  monooxygenase, FAD-binding protein  25.98 
 
 		 392 aa  73.9  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0203356  normal  0.0154804 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2514  monooxygenase FAD-binding protein  28.19 
 
 		 391 aa  73.6  0.000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1987  hypothetical protein  22.49 
 
 		 377 aa  73.2  0.000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000746962  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3565  monooxygenase FAD-binding  26.12 
 
 		 384 aa  73.2  0.000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2005  hypothetical protein  21.64 
 
 		 377 aa  72.8  0.000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00436005  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3466  monooxygenase, FAD-binding  26.63 
 
 		 392 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0506  hypothetical protein  27.11 
 
 		 420 aa  72  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4900  monooxygenase, FAD-binding  26.63 
 
 		 392 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.99121 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0304  hypothetical protein  29.54 
 
 		 415 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.605002  normal  0.180027 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1561  hypothetical protein  25.8 
 
 		 377 aa  72.8  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2527  monooxygenase FAD-binding protein  30.42 
 
 		 388 aa  72.4  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.172814 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2140  monooxygenase FAD-binding  24.5 
 
 		 382 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0383787 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5386  monooxygenase FAD-binding  26.63 
 
 		 392 aa  72  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.336288 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4393  monooxygenase FAD-binding  28.1 
 
 		 377 aa  71.6  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5278  monooxygenase, FAD-binding  25.27 
 
 		 395 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.630865 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1969  hypothetical protein  23.1 
 
 		 377 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0438709  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0338  monooxygenase FAD-binding  26.74 
 
 		 372 aa  70.5  0.00000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2242  hypothetical protein  25.3 
 
 		 379 aa  70.5  0.00000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2526  salicylate 1-monooxygenase  25.71 
 
 		 396 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.066083 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5319  monooxygenase FAD-binding protein  29.01 
 
 		 390 aa  70.1  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4581  monooxygenase FAD-binding protein  28.75 
 
 		 399 aa  70.1  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.626069 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21010  putative FAD-dependent monooxygenase  26.35 
 
 		 388 aa  70.1  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.12929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0442  hypothetical protein  26.98 
 
 		 425 aa  70.1  0.00000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4129  monooxygenase FAD-binding protein  28.72 
 
 		 421 aa  69.7  0.00000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5812  monooxygenase, FAD-binding protein  26.27 
 
 		 408 aa  68.9  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0698086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5646  hypothetical protein  27.85 
 
 		 407 aa  68.9  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.419878  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3882  monooxygenase FAD-binding protein  24.38 
 
 		 410 aa  69.3  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2318  monooxygenase FAD-binding  25.33 
 
 		 385 aa  69.3  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.694664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0437  hypothetical protein  23.54 
 
 		 423 aa  68.9  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0229  monooxygenase FAD-binding  28.35 
 
 		 409 aa  69.3  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.297351 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4891  monooxygenase, FAD-binding  26.89 
 
 		 402 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.292821 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0096  monooxygenase FAD-binding  28 
 
 		 388 aa  68.2  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0544698 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1486  monooxygenase FAD-binding protein  26.27 
 
 		 408 aa  68.2  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.528879  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2710  monooxygenase FAD-binding  26.01 
 
 		 392 aa  67.8  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0859  hypothetical protein  23.89 
 
 		 376 aa  67.4  0.0000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0456  hypothetical protein  28.24 
 
 		 400 aa  67  0.0000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.558276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6010  monooxygenase FAD-binding  28.92 
 
 		 410 aa  66.2  0.0000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3960  monooxygenase, FAD-binding  28.75 
 
 		 388 aa  66.2  0.0000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0213  salicylate 1-monooxygenase (NahW)  24.93 
 
 		 403 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00584161  normal  0.918812 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3289  monooxygenase FAD-binding protein  27.08 
 
 		 405 aa  65.9  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5490  hypothetical protein  25.36 
 
 		 376 aa  65.1  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.263569  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5851  hypothetical protein  27.58 
 
 		 405 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.3306  hitchhiker  0.00183506 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2320  hypothetical protein  25.32 
 
 		 421 aa  64.7  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2230  hypothetical protein  21.15 
 
 		 377 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000757274  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1542  monooxygenase FAD-binding protein  24.27 
 
 		 374 aa  64.7  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0929471  normal  0.228138 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3968  monooxygenase FAD-binding  26.84 
 
 		 362 aa  64.3  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0307  FAD dependent oxidoreductase  30.89 
 
 		 378 aa  64.7  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000823237 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2386  monooxygenase FAD-binding protein  26.94 
 
 		 412 aa  64.3  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.611075  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1366  hypothetical protein  26.77 
 
 		 418 aa  63.2  0.000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.496364 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5335  FAD-dependent monooxygenase  27.05 
 
 		 378 aa  63.2  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2591  hypothetical protein  26.51 
 
 		 389 aa  63.2  0.000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000360209  hitchhiker  0.000709187 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0495  kynurenine 3-monooxygenase  22.22 
 
 		 446 aa  63.2  0.000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.167172  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2552  monooxygenase FAD-binding protein  25.35 
 
 		 376 aa  63.2  0.000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5898  monooxygenase FAD-binding protein  25.58 
 
 		 408 aa  62.8  0.000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.106816 
 
 
-
 
NC_004310  BR0746  salicylate hydroxylase  33.53 
 
 		 401 aa  62.4  0.00000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1885  putative salicylate hydroxylase  27.67 
 
 		 389 aa  62.4  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.122899  normal  0.226674 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3294  monooxygenase FAD-binding protein  26.54 
 
 		 388 aa  62.4  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0802651  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0740  salicylate hydroxylase  33.53 
 
 		 401 aa  62  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0385  hypothetical protein  24.47 
 
 		 391 aa  61.6  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19150  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  29.48 
 
 		 351 aa  61.2  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0319604  normal  0.370849 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4828  hypothetical protein  26.19 
 
 		 376 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.454319 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2160  monooxygenase FAD-binding  27.84 
 
 		 395 aa  60.8  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4013  monooxygenase FAD-binding  26.2 
 
 		 362 aa  61.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0834664  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>