More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3613 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_3613  monooxygenase, FAD-binding  100 
 
 		 390 aa  761    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.210857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3466  monooxygenase, FAD-binding  53.37 
 
 		 417 aa  335  7.999999999999999e-91  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.185468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2964  monooxygenase FAD-binding  41.43 
 
 		 422 aa  233  5e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000808449 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1535  monooxygenase, FAD-binding  35.56 
 
 		 422 aa  179  8e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.859227 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0427  monooxygenase FAD-binding  36.78 
 
 		 402 aa  153  5e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.12804  hitchhiker  0.0000412039 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0440  monooxygenase FAD-binding  35.73 
 
 		 386 aa  150  4e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0943043  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0545  oxidoreductase protein  37.1 
 
 		 398 aa  145  1e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.309598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01733  oxidoreductase  41.94 
 
 		 267 aa  145  1e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4393  monooxygenase FAD-binding  31.47 
 
 		 377 aa  91.3  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0712  hypothetical protein  29.65 
 
 		 371 aa  89.4  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1784  monooxygenase, FAD-binding  28.4 
 
 		 410 aa  89  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4891  monooxygenase, FAD-binding  29.7 
 
 		 402 aa  86.3  9e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.292821 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0813  monooxygenase, FAD-binding  27.82 
 
 		 377 aa  86.3  9e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0991  salicylate 1-monooxygenase  27.37 
 
 		 397 aa  84  0.000000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0622996  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1889  hypothetical protein  24.05 
 
 		 374 aa  83.2  0.000000000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2962  monooxygenase FAD-binding protein  26.86 
 
 		 397 aa  81.6  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0096  monooxygenase FAD-binding  30.45 
 
 		 388 aa  80.5  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0544698 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1885  putative salicylate hydroxylase  32.74 
 
 		 389 aa  80.1  0.00000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.122899  normal  0.226674 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4031  DNA mismatch endonuclease Vsr  28.03 
 
 		 404 aa  79  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0778  monooxygenase FAD-binding  32.15 
 
 		 393 aa  77  0.0000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0373747  decreased coverage  0.000456942 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2257  hypothetical protein  27.62 
 
 		 378 aa  74.7  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.472155 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1561  hypothetical protein  27.12 
 
 		 377 aa  74.3  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2656  putative salicylate hydroxylase (salicylate 1-monooxygenase)  30.97 
 
 		 391 aa  73.6  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1313  monooxygenase, FAD-binding  30.97 
 
 		 391 aa  73.6  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1193  monooxygenase, FAD-binding  29.83 
 
 		 390 aa  73.2  0.000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.155257  normal  0.524756 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0896  monooxygenase, FAD-binding  29.55 
 
 		 389 aa  72.8  0.000000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2005  hypothetical protein  21.47 
 
 		 377 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00436005  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1542  monooxygenase FAD-binding protein  24.35 
 
 		 374 aa  71.6  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0929471  normal  0.228138 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5278  monooxygenase, FAD-binding  26.18 
 
 		 395 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.630865 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0338  monooxygenase FAD-binding  26.58 
 
 		 372 aa  71.6  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2621  monooxygenase, FAD-binding  31.9 
 
 		 388 aa  70.9  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.684205  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2161  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  29.12 
 
 		 784 aa  70.5  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.172901  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4063  monooxygenase FAD-binding protein  29.29 
 
 		 402 aa  70.1  0.00000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.69418 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3284  monooxygenase FAD-binding protein  26.8 
 
 		 393 aa  68.6  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.289154 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2527  monooxygenase FAD-binding protein  30.56 
 
 		 388 aa  67.8  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.172814 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0696  putative monooxygenase  26.95 
 
 		 388 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0540721  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0770  putative monooxygenase  26.95 
 
 		 388 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.522816  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1734  putative monooxygenase  26.95 
 
 		 388 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5319  monooxygenase FAD-binding protein  27.32 
 
 		 390 aa  67.8  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3294  monooxygenase FAD-binding protein  26.39 
 
 		 388 aa  67.4  0.0000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0802651  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5557  monooxygenase FAD-binding protein  26.82 
 
 		 371 aa  67.4  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2421  putative monooxygenase  26.95 
 
 		 388 aa  67  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1144  putative monooxygenase  26.95 
 
 		 388 aa  67  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.670847  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1219  putative monooxygenase  26.95 
 
 		 388 aa  67  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00380078  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11286  hypothetical protein  29.45 
 
 		 372 aa  66.2  0.0000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2393  hypothetical protein  28.69 
 
 		 376 aa  65.9  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.142228  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0733  hypothetical protein  25.14 
 
 		 369 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1983  hypothetical protein  29.46 
 
 		 431 aa  64.7  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.564684 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1002  hypothetical protein  24.86 
 
 		 369 aa  63.5  0.000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.132346  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1576  putative monooxygenase  27.68 
 
 		 388 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.472277  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2526  salicylate 1-monooxygenase  26.79 
 
 		 396 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.066083 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5812  monooxygenase, FAD-binding protein  25.21 
 
 		 408 aa  63.2  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0698086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8535  monooxygenase FAD-binding  28.81 
 
 		 384 aa  63.2  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0157087  hitchhiker  0.0015439 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2710  monooxygenase FAD-binding  23.6 
 
 		 392 aa  62.8  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7773  monooxygenase FAD-binding  28.53 
 
 		 374 aa  62.8  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3566  monooxygenase, FAD-binding  30.7 
 
 		 389 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.411114  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21010  putative FAD-dependent monooxygenase  27.67 
 
 		 388 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.12929  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1987  hypothetical protein  21.67 
 
 		 377 aa  61.6  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000746962  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1969  hypothetical protein  22.71 
 
 		 377 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0438709  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5691  monooxygenase FAD-binding  24.86 
 
 		 376 aa  61.6  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5437  monooxygenase, FAD-binding  27.69 
 
 		 364 aa  62  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.863729 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1528  monooxygenase FAD-binding  27.2 
 
 		 362 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.392805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5348  monooxygenase, FAD-binding protein  27.69 
 
 		 360 aa  62  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.437085  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7785  FAD-dependent oxidoreductase  50.77 
 
 		 425 aa  61.6  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.786204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3438  monooxygenase, FAD-binding  26.57 
 
 		 399 aa  61.6  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2230  hypothetical protein  21.33 
 
 		 377 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000757274  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5423  monooxygenase FAD-binding  26.2 
 
 		 382 aa  61.2  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.224517  normal  0.231326 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3428  monooxygenase, FAD-binding  27.44 
 
 		 372 aa  61.2  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5727  monooxygenase, FAD-binding  27.69 
 
 		 364 aa  60.8  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0213  salicylate 1-monooxygenase (NahW)  28.4 
 
 		 403 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00584161  normal  0.918812 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1754  monooxygenase, FAD-binding  28.21 
 
 		 405 aa  60.5  0.00000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5104  hypothetical protein  24.88 
 
 		 415 aa  60.5  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3960  monooxygenase, FAD-binding  28.35 
 
 		 388 aa  60.5  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0442  hypothetical protein  28.21 
 
 		 425 aa  60.1  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3170  hypothetical protein  27.52 
 
 		 406 aa  60.1  0.00000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.161745 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3662  monooxygenase, FAD-binding  25 
 
 		 395 aa  60.1  0.00000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.555838  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1231  salicylate 1-monooxygenase  25.2 
 
 		 404 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.592071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5851  hypothetical protein  32.29 
 
 		 405 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.3306  hitchhiker  0.00183506 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5431  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  26.16 
 
 		 407 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.509963  normal  0.0291121 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2424  monooxygenase FAD-binding protein  30.21 
 
 		 393 aa  59.3  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.127723  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2242  hypothetical protein  26.67 
 
 		 379 aa  59.3  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0546  monooxygenase, FAD-binding  26.96 
 
 		 373 aa  58.9  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2329  hypothetical protein  21.25 
 
 		 374 aa  58.5  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5386  monooxygenase FAD-binding  27.55 
 
 		 392 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.336288 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2372  hypothetical protein  21.25 
 
 		 374 aa  58.5  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4033  monooxygenase FAD-binding  27.39 
 
 		 404 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.115519 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2326  monooxygenase FAD-binding protein  27.35 
 
 		 388 aa  58.2  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000156334  normal  0.582922 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3561  monooxygenase, FAD-binding protein  30.91 
 
 		 389 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.014092  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4498  salicylate 1-monooxygenase  27.89 
 
 		 422 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4040  salicylate 1-monooxygenase  27.59 
 
 		 404 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2480  monooxygenase FAD-binding  31.11 
 
 		 395 aa  58.9  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3634  monooxygenase, FAD-binding  30.91 
 
 		 389 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.231418  normal  0.598375 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01380  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  29.33 
 
 		 378 aa  58.2  0.0000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2496  putative oxidoreductase  27.3 
 
 		 374 aa  57.8  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.117419 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4355  hypothetical protein  26.41 
 
 		 421 aa  57.8  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0233973  normal  0.534906 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1655  hypothetical protein  25.27 
 
 		 419 aa  57.8  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.151005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2729  hypothetical protein  25.89 
 
 		 415 aa  58.2  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2908  salicylate hydroxylase  25.85 
 
 		 396 aa  57  0.0000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.511935 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0323  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  27.11 
 
 		 409 aa  56.6  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.97579 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0125  monooxygenase FAD-binding  23.84 
 
 		 374 aa  56.6  0.0000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>