More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2496 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_2496  putative oxidoreductase  100 
 
 
374 aa  755    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.117419 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2022  putative oxidoreductase  56.14 
 
 
407 aa  368  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.461121  normal  0.126773 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11286  hypothetical protein  52.02 
 
 
372 aa  365  1e-100  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5557  monooxygenase FAD-binding protein  49.32 
 
 
371 aa  348  1e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7487  putative oxidoreductase  52.05 
 
 
399 aa  343  4e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.455453  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0067  monooxygenase FAD-binding protein  50.43 
 
 
400 aa  311  1e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2424  monooxygenase FAD-binding protein  47.91 
 
 
393 aa  306  4.0000000000000004e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.127723  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4063  monooxygenase FAD-binding protein  46.11 
 
 
402 aa  281  1e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.69418 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1039  putative oxidoreductase  48.45 
 
 
387 aa  276  3e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0582367  normal  0.0597058 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8153  monooxygenase FAD-binding protein  46.97 
 
 
424 aa  271  1e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.976532 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5927  monooxygenase FAD-binding protein  46.49 
 
 
400 aa  268  1e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3006  monooxygenase FAD-binding protein  47.52 
 
 
404 aa  265  7e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00211074 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26790  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  44.57 
 
 
398 aa  263  3e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.15237  normal  0.462192 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2360  monooxygenase, FAD-binding protein  42.4 
 
 
400 aa  259  5.0000000000000005e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.175962  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2407  monooxygenase, FAD-binding  42.4 
 
 
400 aa  259  5.0000000000000005e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.254272 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2401  monooxygenase, FAD-binding  42.4 
 
 
400 aa  259  5.0000000000000005e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.236058 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0928  monooxygenase FAD-binding  43.27 
 
 
424 aa  255  1.0000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.607239  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0387  monooxygenase FAD-binding  41.55 
 
 
402 aa  251  1e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.491614 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1719  monooxygenase FAD-binding protein  43.15 
 
 
402 aa  242  6e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.861582  normal  0.177423 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3917  putative oxidoreductase  42.41 
 
 
397 aa  242  9e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.280043  normal  0.0698195 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2957  monooxygenase FAD-binding  36.46 
 
 
372 aa  239  6.999999999999999e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575675  hitchhiker  0.00000079656 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7249  monooxygenase FAD-binding  41.57 
 
 
377 aa  230  3e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4470  FAD dependent oxidoreductase  43.84 
 
 
371 aa  225  1e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4249  monooxygenase FAD-binding  39.48 
 
 
370 aa  222  9.999999999999999e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.850855  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0549  monooxygenase FAD-binding  38.03 
 
 
380 aa  220  1.9999999999999999e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.554692  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3990  monooxygenase FAD-binding  38.11 
 
 
415 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.842303  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2116  monooxygenase FAD-binding protein  36.86 
 
 
384 aa  219  3.9999999999999997e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.400145  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4005  monooxygenase FAD-binding  43.55 
 
 
396 aa  218  1e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.888605  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2591  hypothetical protein  39.94 
 
 
389 aa  216  4e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000360209  hitchhiker  0.000709187 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10960  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  39.2 
 
 
403 aa  212  7e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10585  hypothetical protein  40.61 
 
 
388 aa  206  7e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000190201  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1283  monooxygenase FAD-binding protein  37.46 
 
 
403 aa  205  1e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000514503 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0385  hypothetical protein  38.08 
 
 
391 aa  203  4e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3005  monooxygenase FAD-binding  41.93 
 
 
411 aa  198  1.0000000000000001e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6278  monooxygenase FAD-binding  38.86 
 
 
393 aa  196  5.000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.435986  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5899  monooxygenase FAD-binding  36.68 
 
 
398 aa  191  1e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00196665 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1462  monooxygenase FAD-binding  33.92 
 
 
390 aa  190  4e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000001589  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2729  hypothetical protein  34.88 
 
 
415 aa  189  5.999999999999999e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0093  flavoprotein monooxygenase  38.18 
 
 
467 aa  187  3e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0135  monooxygenase FAD-binding  38.46 
 
 
400 aa  180  2.9999999999999997e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5428  hypothetical protein  34.76 
 
 
394 aa  180  4e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00235903 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0724  monooxygenase FAD-binding  37.01 
 
 
408 aa  179  1e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.30015 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01821  FAD-binding monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G07040)  32.53 
 
 
423 aa  171  3e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00520599  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1494  monooxygenase, FAD-binding  37.64 
 
 
386 aa  169  1e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.379752  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3892  monooxygenase FAD-binding protein  36 
 
 
396 aa  167  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.116118  normal  0.359829 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2036  monooxygenase FAD-binding  35.96 
 
 
388 aa  158  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5341  monooxygenase FAD-binding protein  33.52 
 
 
418 aa  156  6e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4094  FAD dependent oxidoreductase  35.45 
 
 
413 aa  151  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.232539  normal  0.561641 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0299  monooxygenase  34.94 
 
 
351 aa  149  7e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4777  monooxygenase FAD-binding protein  32.66 
 
 
496 aa  141  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.712751  hitchhiker  0.00463722 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4615  monooxygenase FAD-binding  33.24 
 
 
392 aa  139  8.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.992897  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1253  monooxygenase, FAD-binding  30.64 
 
 
388 aa  139  1e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.420129  normal  0.229963 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4701  putative oxidoreductase transmembrane protein  35.09 
 
 
381 aa  136  5e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105263  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4339  monooxygenase FAD-binding  33.89 
 
 
434 aa  130  3e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5767  putative oxidoreductase transmembrane protein  30.47 
 
 
405 aa  128  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.117987  normal  0.249872 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1142  monooxygenase FAD-binding  29.48 
 
 
388 aa  128  2.0000000000000002e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000665044 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1265  monooxygenase FAD-binding protein  32.66 
 
 
396 aa  124  3e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.717662  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1977  monooxygenase FAD-binding protein  32.53 
 
 
393 aa  120  3.9999999999999996e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.0000420901  unclonable  0.000000044053 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1730  monooxygenase, FAD-binding  31.55 
 
 
395 aa  119  7.999999999999999e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.569431  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0960  monooxygenase, FAD-binding  27.51 
 
 
368 aa  110  3e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.234631  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0950  monooxygenase, FAD-binding  27.3 
 
 
368 aa  108  2e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2471  monooxygenase FAD-binding  28.98 
 
 
373 aa  103  4e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2657  monooxygenase, FAD-binding  29.81 
 
 
377 aa  100  3e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.751067  normal  0.222603 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1561  hypothetical protein  29.57 
 
 
377 aa  100  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28690  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  31.83 
 
 
387 aa  99.4  8e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1002  hypothetical protein  26.79 
 
 
369 aa  94.7  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.132346  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0733  hypothetical protein  27.25 
 
 
369 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2149  monooxygenase FAD-binding protein  22.78 
 
 
391 aa  90.5  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.438269  normal  0.289576 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3140  hypothetical protein  26.55 
 
 
376 aa  90.5  5e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1542  monooxygenase FAD-binding protein  28.17 
 
 
374 aa  89.4  9e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0929471  normal  0.228138 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2823  monooxygenase, FAD-binding  25.14 
 
 
371 aa  88.2  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.091542  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0712  hypothetical protein  27.71 
 
 
371 aa  88.2  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0503  monooxygenase FAD-binding  28.61 
 
 
376 aa  87  4e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3614  monooxygenase FAD-binding  28.4 
 
 
378 aa  87.4  4e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0392094  normal  0.0720055 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4891  monooxygenase, FAD-binding  30.17 
 
 
402 aa  86.3  8e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.292821 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2779  monooxygenase FAD-binding  28.94 
 
 
411 aa  85.5  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0421282 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0481  salicylate 1-monooxygenase  30.37 
 
 
373 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0859  hypothetical protein  27.89 
 
 
376 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2393  hypothetical protein  28.37 
 
 
376 aa  84.3  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.142228  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0568  monooxygenase FAD-binding  28.65 
 
 
376 aa  84  0.000000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5691  monooxygenase FAD-binding  24.24 
 
 
376 aa  83.2  0.000000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5335  FAD-dependent monooxygenase  27.87 
 
 
378 aa  82.4  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103313  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2140  monooxygenase FAD-binding  25.75 
 
 
382 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0383787 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5490  hypothetical protein  27.75 
 
 
376 aa  80.9  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.263569  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4581  monooxygenase FAD-binding protein  27.6 
 
 
399 aa  80.5  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.626069 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1486  monooxygenase FAD-binding protein  27.99 
 
 
408 aa  77.4  0.0000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.528879  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3944  salicylate hydroxylase  24.84 
 
 
382 aa  76.6  0.0000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0448295  normal  0.412797 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2253  monooxygenase FAD-binding protein  26.54 
 
 
401 aa  76.6  0.0000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0813  monooxygenase, FAD-binding  26.35 
 
 
377 aa  76.6  0.0000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5437  monooxygenase, FAD-binding  26.95 
 
 
364 aa  76.6  0.0000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.863729 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3144  salicylate hydroxylase  27.41 
 
 
400 aa  76.6  0.0000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.403778  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1893  monooxygenase, FAD-binding  24.84 
 
 
382 aa  76.3  0.0000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2515  salicylate 1-monooxygenase  24.84 
 
 
386 aa  76.3  0.0000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.193433  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0982  monooxygenase FAD-binding  28.11 
 
 
369 aa  76.3  0.0000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.240273  decreased coverage  0.000117397 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0125  monooxygenase FAD-binding  26.46 
 
 
374 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1576  putative monooxygenase  29 
 
 
388 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.472277  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2257  hypothetical protein  23.89 
 
 
378 aa  75.9  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.472155 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2705  monooxygenase, FAD-binding protein  31.87 
 
 
423 aa  75.1  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.891359  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4040  salicylate 1-monooxygenase  26.8 
 
 
404 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5727  monooxygenase, FAD-binding  26.65 
 
 
364 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>