More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3438 on replicon NC_009427
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009427  Saro_3438  monooxygenase, FAD-binding  100 
 
 		 399 aa  813    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0859  hypothetical protein  39.3 
 
 		 376 aa  277  2e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2393  hypothetical protein  38.75 
 
 		 376 aa  266  5.999999999999999e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.142228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4828  hypothetical protein  42.55 
 
 		 376 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.454319 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5490  hypothetical protein  38.61 
 
 		 376 aa  244  1.9999999999999999e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.263569  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1936  hypothetical protein  38.24 
 
 		 376 aa  241  2e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0712  hypothetical protein  36.29 
 
 		 371 aa  240  2.9999999999999997e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1684  monooxygenase, FAD-binding  38.46 
 
 		 373 aa  238  2e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.750023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3140  hypothetical protein  37.4 
 
 		 376 aa  237  3e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2242  hypothetical protein  38.12 
 
 		 379 aa  228  1e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1542  monooxygenase FAD-binding protein  33.14 
 
 		 374 aa  215  9.999999999999999e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0929471  normal  0.228138 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3428  monooxygenase, FAD-binding  36.54 
 
 		 372 aa  213  2.9999999999999995e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3199  hypothetical protein  35 
 
 		 374 aa  208  1e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.3549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0304  hypothetical protein  37.92 
 
 		 361 aa  207  3e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.741519  normal  0.196732 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2552  monooxygenase FAD-binding protein  37.86 
 
 		 376 aa  204  2e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3417  monooxygenase, FAD-binding  35.59 
 
 		 379 aa  189  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0807578 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1561  hypothetical protein  33.16 
 
 		 377 aa  173  3.9999999999999995e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3547  hypothetical protein  35.71 
 
 		 374 aa  159  9e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1002  hypothetical protein  28.66 
 
 		 369 aa  133  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.132346  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0733  hypothetical protein  28.44 
 
 		 369 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1093  monooxygenase, FAD-binding  30.86 
 
 		 369 aa  129  7.000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.363504 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0982  monooxygenase FAD-binding  29.32 
 
 		 369 aa  119  9.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.240273  decreased coverage  0.000117397 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2005  hypothetical protein  27.65 
 
 		 377 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00436005  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30630  putative FAD-dependent monooxygenase  30 
 
 		 382 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0241073 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1462  monooxygenase FAD-binding  28.57 
 
 		 390 aa  107  4e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000001589  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4928  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase and related FAD-dependent oxidoreductase-like protein  45 
 
 		 123 aa  103  4e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.182085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0125  monooxygenase FAD-binding  27.04 
 
 		 374 aa  101  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1969  hypothetical protein  26.72 
 
 		 377 aa  101  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0438709  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2611  putative FAD-dependent monooxygenase  29.63 
 
 		 382 aa  101  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.172271  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1885  putative salicylate hydroxylase  29.75 
 
 		 389 aa  101  3e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.122899  normal  0.226674 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1987  hypothetical protein  26.8 
 
 		 377 aa  100  4e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000746962  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2657  monooxygenase, FAD-binding  29.08 
 
 		 377 aa  100  5e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.751067  normal  0.222603 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01380  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  28.89 
 
 		 378 aa  99.8  8e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2230  hypothetical protein  26.59 
 
 		 377 aa  99  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000757274  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2526  salicylate 1-monooxygenase  29.28 
 
 		 396 aa  96.7  7e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.066083 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1889  hypothetical protein  25.7 
 
 		 374 aa  94.7  2e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5812  monooxygenase, FAD-binding protein  28.25 
 
 		 408 aa  94.4  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0698086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2656  putative salicylate hydroxylase (salicylate 1-monooxygenase)  29.43 
 
 		 391 aa  94  5e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1313  monooxygenase, FAD-binding  29.43 
 
 		 391 aa  94  5e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2701  monooxygenase FAD-binding protein  29.35 
 
 		 377 aa  92.8  9e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4063  monooxygenase FAD-binding protein  27.22 
 
 		 402 aa  92  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.69418 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1193  monooxygenase, FAD-binding  29.58 
 
 		 390 aa  92.4  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.155257  normal  0.524756 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0881  hypothetical protein  28.29 
 
 		 402 aa  92  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.200049  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09400  hypothetical protein  28.57 
 
 		 402 aa  92  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10960  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  27.66 
 
 		 403 aa  89.7  9e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2329  hypothetical protein  25.43 
 
 		 374 aa  88.2  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_1611  zeaxanthin epoxidase (ABA1) (NPQ2)  26.18 
 
 		 429 aa  88.2  2e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.539309  normal  0.0529961 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3284  monooxygenase FAD-binding protein  25.57 
 
 		 393 aa  88.2  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.289154 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2372  hypothetical protein  25.43 
 
 		 374 aa  88.2  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1494  monooxygenase, FAD-binding  27.68 
 
 		 386 aa  87.4  4e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.379752  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08199  MAK1-like monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G12060)  27.03 
 
 		 469 aa  87  5e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.167964 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7487  putative oxidoreductase  29.11 
 
 		 399 aa  87  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.455453  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0096  monooxygenase FAD-binding  27.69 
 
 		 388 aa  87  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0544698 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0546  monooxygenase, FAD-binding  28.24 
 
 		 373 aa  86.3  8e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2621  monooxygenase, FAD-binding  26.77 
 
 		 388 aa  86.3  8e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.684205  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4602  monooxygenase FAD-binding  28.53 
 
 		 382 aa  86.3  9e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.296431  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2401  monooxygenase, FAD-binding  28.41 
 
 		 400 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.236058 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4031  DNA mismatch endonuclease Vsr  29.01 
 
 		 404 aa  85.9  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2360  monooxygenase, FAD-binding protein  28.41 
 
 		 400 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.175962  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2407  monooxygenase, FAD-binding  28.41 
 
 		 400 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.254272 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1142  monooxygenase FAD-binding  26.27 
 
 		 388 aa  84.3  0.000000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000665044 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6278  monooxygenase FAD-binding  33.82 
 
 		 393 aa  84.3  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.435986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0991  salicylate 1-monooxygenase  25.92 
 
 		 397 aa  84.7  0.000000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0622996  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5073  Salicylate 1-monooxygenase  28.53 
 
 		 386 aa  84.3  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.926874  normal  0.172716 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21010  putative FAD-dependent monooxygenase  28.49 
 
 		 388 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.12929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1253  monooxygenase, FAD-binding  26.41 
 
 		 388 aa  84  0.000000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.420129  normal  0.229963 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1093  monooxygenase FAD-binding  28.38 
 
 		 408 aa  83.6  0.000000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0291534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3960  monooxygenase, FAD-binding  28.53 
 
 		 388 aa  83.6  0.000000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00340  kynurenine 3-monooxygenase, putative  23.98 
 
 		 421 aa  82.8  0.000000000000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.303065  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4249  monooxygenase FAD-binding  26.76 
 
 		 370 aa  82.8  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.850855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4581  monooxygenase FAD-binding protein  24.66 
 
 		 399 aa  82.8  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.626069 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5927  monooxygenase FAD-binding protein  25.99 
 
 		 400 aa  81.6  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3565  monooxygenase FAD-binding  25.34 
 
 		 384 aa  82  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3662  monooxygenase, FAD-binding  24.42 
 
 		 395 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.555838  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3061  hypothetical protein  27.4 
 
 		 428 aa  81.3  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0232846 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5319  monooxygenase FAD-binding protein  26.85 
 
 		 390 aa  81.3  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4207  salicylate 1-monooxygenase  26.93 
 
 		 406 aa  80.1  0.00000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.880254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6537  monooxygenase, FAD-binding protein  24.72 
 
 		 392 aa  80.1  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0203356  normal  0.0154804 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2339  monooxygenase FAD-binding  25.35 
 
 		 388 aa  80.1  0.00000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000167175  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0950  monooxygenase, FAD-binding  23.15 
 
 		 368 aa  80.1  0.00000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1486  monooxygenase FAD-binding protein  26.76 
 
 		 408 aa  80.1  0.00000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.528879  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4393  monooxygenase FAD-binding  28.07 
 
 		 377 aa  79.7  0.00000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1633  monooxygenase FAD-binding  27.07 
 
 		 410 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.719976  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0019  monooxygenase FAD-binding protein  27.84 
 
 		 384 aa  79.3  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0067  monooxygenase FAD-binding protein  27.62 
 
 		 400 aa  79.3  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2257  hypothetical protein  26.2 
 
 		 378 aa  79  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.472155 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07684  monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01680)  25.18 
 
 		 506 aa  78.2  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4211  monooxygenase, FAD-binding  26.22 
 
 		 382 aa  78.2  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.815591  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0960  monooxygenase, FAD-binding  22.85 
 
 		 368 aa  78.6  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.234631  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA05260  conserved hypothetical protein  25.46 
 
 		 446 aa  78.6  0.0000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5023  monooxygenase FAD-binding protein  26.18 
 
 		 413 aa  77.8  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0896  monooxygenase, FAD-binding  29.38 
 
 		 389 aa  77.8  0.0000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2527  monooxygenase FAD-binding protein  25.22 
 
 		 388 aa  77.4  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.172814 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0387  monooxygenase FAD-binding  23.82 
 
 		 402 aa  77.4  0.0000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.491614 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_56492  zeaxanthin epoxidase  26.02 
 
 		 557 aa  76.6  0.0000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.688102  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1022  salicylate 1-monooxygenase  27.03 
 
 		 391 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11286  hypothetical protein  26.55 
 
 		 372 aa  76.6  0.0000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5387  hypothetical protein  24.4 
 
 		 420 aa  76.6  0.0000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5557  monooxygenase FAD-binding protein  27.74 
 
 		 371 aa  76.3  0.0000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56402  Salicylate hydroxylase (Salicylate 1-monooxygenase)  24.42 
 
 		 426 aa  76.3  0.0000000000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.476468  normal  0.198075 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>