More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1253 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1253  monooxygenase, FAD-binding  100 
 
 		 388 aa  781    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.420129  normal  0.229963 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1142  monooxygenase FAD-binding  92.53 
 
 		 388 aa  723    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000665044 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3892  monooxygenase FAD-binding protein  53.71 
 
 		 396 aa  408  1e-113  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.116118  normal  0.359829 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1977  monooxygenase FAD-binding protein  50.9 
 
 		 393 aa  325  8.000000000000001e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.0000420901  unclonable  0.000000044053 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1730  monooxygenase, FAD-binding  44.22 
 
 		 395 aa  289  5.0000000000000004e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.569431  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28690  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  39.73 
 
 		 387 aa  221  1.9999999999999999e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1462  monooxygenase FAD-binding  35.03 
 
 		 390 aa  194  2e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000001589  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1494  monooxygenase, FAD-binding  35.26 
 
 		 386 aa  190  4e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.379752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5341  monooxygenase FAD-binding protein  34.73 
 
 		 418 aa  189  5e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1265  monooxygenase FAD-binding protein  36.03 
 
 		 396 aa  183  4.0000000000000006e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.717662  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0067  monooxygenase FAD-binding protein  35.77 
 
 		 400 aa  181  2e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4094  FAD dependent oxidoreductase  37.27 
 
 		 413 aa  181  2e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.232539  normal  0.561641 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5428  hypothetical protein  32.73 
 
 		 394 aa  179  8e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235903 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4777  monooxygenase FAD-binding protein  35.39 
 
 		 496 aa  176  4e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.712751  hitchhiker  0.00463722 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4701  putative oxidoreductase transmembrane protein  35.38 
 
 		 381 aa  172  6.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3006  monooxygenase FAD-binding protein  32.73 
 
 		 404 aa  162  7e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00211074 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0385  hypothetical protein  32.13 
 
 		 391 aa  162  9e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4063  monooxygenase FAD-binding protein  31.23 
 
 		 402 aa  162  1e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.69418 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7487  putative oxidoreductase  31.94 
 
 		 399 aa  161  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.455453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10585  hypothetical protein  31.23 
 
 		 388 aa  160  4e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000190201  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2424  monooxygenase FAD-binding protein  34.86 
 
 		 393 aa  157  4e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.127723  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2022  putative oxidoreductase  30.59 
 
 		 407 aa  154  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.461121  normal  0.126773 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2591  hypothetical protein  32.81 
 
 		 389 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000360209  hitchhiker  0.000709187 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0387  monooxygenase FAD-binding  29.54 
 
 		 402 aa  150  4e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.491614 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5557  monooxygenase FAD-binding protein  30.5 
 
 		 371 aa  148  2.0000000000000003e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5927  monooxygenase FAD-binding protein  30.71 
 
 		 400 aa  147  4.0000000000000006e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5767  putative oxidoreductase transmembrane protein  32.58 
 
 		 405 aa  145  8.000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.117987  normal  0.249872 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4615  monooxygenase FAD-binding  34.75 
 
 		 392 aa  141  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.992897  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4339  monooxygenase FAD-binding  33.14 
 
 		 434 aa  139  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2496  putative oxidoreductase  30.64 
 
 		 374 aa  139  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.117419 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11286  hypothetical protein  29.97 
 
 		 372 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3917  putative oxidoreductase  31.16 
 
 		 397 aa  137  4e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.280043  normal  0.0698195 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7249  monooxygenase FAD-binding  30.03 
 
 		 377 aa  137  5e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4005  monooxygenase FAD-binding  33.53 
 
 		 396 aa  134  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.888605  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26790  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  30.95 
 
 		 398 aa  133  6e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.15237  normal  0.462192 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2360  monooxygenase, FAD-binding protein  30.72 
 
 		 400 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.175962  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2407  monooxygenase, FAD-binding  30.72 
 
 		 400 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.254272 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10960  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  33.04 
 
 		 403 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2116  monooxygenase FAD-binding protein  29.94 
 
 		 384 aa  131  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.400145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4249  monooxygenase FAD-binding  30.28 
 
 		 370 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.850855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2401  monooxygenase, FAD-binding  30.23 
 
 		 400 aa  130  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.236058 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1719  monooxygenase FAD-binding protein  30.2 
 
 		 402 aa  126  6e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.861582  normal  0.177423 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2729  hypothetical protein  28.3 
 
 		 415 aa  125  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2957  monooxygenase FAD-binding  26.58 
 
 		 372 aa  124  3e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575675  hitchhiker  0.00000079656 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6278  monooxygenase FAD-binding  32.43 
 
 		 393 aa  124  4e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.435986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0135  monooxygenase FAD-binding  29.53 
 
 		 400 aa  123  6e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2036  monooxygenase FAD-binding  31.67 
 
 		 388 aa  123  6e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0928  monooxygenase FAD-binding  28.92 
 
 		 424 aa  120  4.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.607239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8153  monooxygenase FAD-binding protein  30.31 
 
 		 424 aa  119  6e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.976532 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2657  monooxygenase, FAD-binding  33.04 
 
 		 377 aa  119  7e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.751067  normal  0.222603 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01821  FAD-binding monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G07040)  28.85 
 
 		 423 aa  119  9e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00520599  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4470  FAD dependent oxidoreductase  30.53 
 
 		 371 aa  119  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5899  monooxygenase FAD-binding  31.2 
 
 		 398 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00196665 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1039  putative oxidoreductase  30.93 
 
 		 387 aa  116  6e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0582367  normal  0.0597058 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0093  flavoprotein monooxygenase  28.29 
 
 		 467 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5437  monooxygenase, FAD-binding  29.71 
 
 		 364 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.863729 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0549  monooxygenase FAD-binding  27.95 
 
 		 380 aa  110  3e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.554692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5727  monooxygenase, FAD-binding  29.41 
 
 		 364 aa  109  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5348  monooxygenase, FAD-binding protein  29.5 
 
 		 360 aa  109  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.437085  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1283  monooxygenase FAD-binding protein  28.36 
 
 		 403 aa  109  7.000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000514503 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3990  monooxygenase FAD-binding  28.41 
 
 		 415 aa  108  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.842303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2393  hypothetical protein  29.38 
 
 		 376 aa  105  9e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.142228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21010  putative FAD-dependent monooxygenase  29.41 
 
 		 388 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.12929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0950  monooxygenase, FAD-binding  26.61 
 
 		 368 aa  101  2e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3005  monooxygenase FAD-binding  30.45 
 
 		 411 aa  100  4e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0960  monooxygenase, FAD-binding  27.19 
 
 		 368 aa  100  5e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.234631  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5490  hypothetical protein  28.98 
 
 		 376 aa  99  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.263569  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5335  FAD-dependent monooxygenase  29.34 
 
 		 378 aa  98.6  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103313  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0503  monooxygenase FAD-binding  29.8 
 
 		 376 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2242  hypothetical protein  29.1 
 
 		 379 aa  98.2  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2149  monooxygenase FAD-binding protein  23.78 
 
 		 391 aa  96.3  7e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.438269  normal  0.289576 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3140  hypothetical protein  27.12 
 
 		 376 aa  95.1  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2005  hypothetical protein  24.28 
 
 		 377 aa  94  4e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00436005  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0299  monooxygenase  27.6 
 
 		 351 aa  93.6  5e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0724  monooxygenase FAD-binding  28.78 
 
 		 408 aa  93.2  7e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.30015 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2230  hypothetical protein  25.45 
 
 		 377 aa  92.8  8e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000757274  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0568  monooxygenase FAD-binding  29.23 
 
 		 376 aa  91.3  3e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0712  hypothetical protein  28.32 
 
 		 371 aa  90.9  4e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30630  putative FAD-dependent monooxygenase  29.91 
 
 		 382 aa  90.1  5e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0241073 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0859  hypothetical protein  24.58 
 
 		 376 aa  89  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0125  monooxygenase FAD-binding  26.52 
 
 		 374 aa  88.2  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2621  monooxygenase, FAD-binding  29.49 
 
 		 388 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.684205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2611  putative FAD-dependent monooxygenase  31.25 
 
 		 382 aa  86.7  6e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.172271  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3565  monooxygenase FAD-binding  25.71 
 
 		 384 aa  86.7  7e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4129  monooxygenase FAD-binding protein  28.39 
 
 		 421 aa  84.7  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4393  monooxygenase FAD-binding  29.57 
 
 		 377 aa  85.1  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1987  hypothetical protein  22.96 
 
 		 377 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000746962  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1093  monooxygenase, FAD-binding  29.2 
 
 		 369 aa  84.3  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.363504 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3438  monooxygenase, FAD-binding  26.41 
 
 		 399 aa  84  0.000000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19150  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  29.25 
 
 		 351 aa  84  0.000000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0319604  normal  0.370849 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01380  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  29.89 
 
 		 378 aa  84  0.000000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1969  hypothetical protein  22.66 
 
 		 377 aa  83.2  0.000000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0438709  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3284  monooxygenase FAD-binding protein  29.83 
 
 		 393 aa  83.2  0.000000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.289154 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2339  monooxygenase FAD-binding  28.05 
 
 		 388 aa  82.8  0.000000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000167175  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4602  monooxygenase FAD-binding  28.52 
 
 		 382 aa  82.4  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.296431  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1561  hypothetical protein  29.09 
 
 		 377 aa  82  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3968  monooxygenase FAD-binding  27.3 
 
 		 362 aa  82  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3614  monooxygenase FAD-binding  29.52 
 
 		 378 aa  81.3  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0392094  normal  0.0720055 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1936  hypothetical protein  26.54 
 
 		 376 aa  80.9  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4031  DNA mismatch endonuclease Vsr  27.27 
 
 		 404 aa  80.9  0.00000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>