More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2424 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2424  monooxygenase FAD-binding protein  100 
 
 		 393 aa  783    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.127723  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4063  monooxygenase FAD-binding protein  46.91 
 
 		 402 aa  326  4.0000000000000003e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.69418 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7487  putative oxidoreductase  49.01 
 
 		 399 aa  322  5e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.455453  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2022  putative oxidoreductase  51.18 
 
 		 407 aa  321  9.999999999999999e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.461121  normal  0.126773 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5557  monooxygenase FAD-binding protein  47.31 
 
 		 371 aa  309  5.9999999999999995e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2496  putative oxidoreductase  47.91 
 
 		 374 aa  306  4.0000000000000004e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.117419 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11286  hypothetical protein  44.88 
 
 		 372 aa  300  3e-80  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0067  monooxygenase FAD-binding protein  48.83 
 
 		 400 aa  286  4e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3006  monooxygenase FAD-binding protein  48.21 
 
 		 404 aa  284  1.0000000000000001e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00211074 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2401  monooxygenase, FAD-binding  45.3 
 
 		 400 aa  283  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.236058 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2360  monooxygenase, FAD-binding protein  45.01 
 
 		 400 aa  279  5e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.175962  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2407  monooxygenase, FAD-binding  45.01 
 
 		 400 aa  279  5e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.254272 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0928  monooxygenase FAD-binding  45.66 
 
 		 424 aa  273  4.0000000000000004e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.607239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5899  monooxygenase FAD-binding  47.25 
 
 		 398 aa  272  1e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00196665 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0387  monooxygenase FAD-binding  44.06 
 
 		 402 aa  271  2e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.491614 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3917  putative oxidoreductase  44.57 
 
 		 397 aa  267  2.9999999999999995e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.280043  normal  0.0698195 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5927  monooxygenase FAD-binding protein  45.13 
 
 		 400 aa  261  1e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0093  flavoprotein monooxygenase  45.14 
 
 		 467 aa  257  3e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8153  monooxygenase FAD-binding protein  44.38 
 
 		 424 aa  255  1.0000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.976532 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10960  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  43.33 
 
 		 403 aa  254  3e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26790  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  44.93 
 
 		 398 aa  253  5.000000000000001e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.15237  normal  0.462192 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0724  monooxygenase FAD-binding  46.84 
 
 		 408 aa  253  6e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.30015 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1719  monooxygenase FAD-binding protein  39.2 
 
 		 402 aa  248  1e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.861582  normal  0.177423 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0135  monooxygenase FAD-binding  45.61 
 
 		 400 aa  248  1e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1283  monooxygenase FAD-binding protein  42.9 
 
 		 403 aa  246  4e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000514503 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1039  putative oxidoreductase  44.54 
 
 		 387 aa  243  5e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0582367  normal  0.0597058 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6278  monooxygenase FAD-binding  42.4 
 
 		 393 aa  221  1.9999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.435986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7249  monooxygenase FAD-binding  40.86 
 
 		 377 aa  220  3.9999999999999997e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4005  monooxygenase FAD-binding  40.98 
 
 		 396 aa  219  5e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.888605  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2036  monooxygenase FAD-binding  42.24 
 
 		 388 aa  216  4e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0299  monooxygenase  41.94 
 
 		 351 aa  204  2e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2729  hypothetical protein  38.1 
 
 		 415 aa  204  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4249  monooxygenase FAD-binding  38.08 
 
 		 370 aa  202  9e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.850855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10585  hypothetical protein  41.09 
 
 		 388 aa  198  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000190201  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5428  hypothetical protein  34.09 
 
 		 394 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235903 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3005  monooxygenase FAD-binding  39.77 
 
 		 411 aa  194  2e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0385  hypothetical protein  36.6 
 
 		 391 aa  190  2.9999999999999997e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3990  monooxygenase FAD-binding  34.9 
 
 		 415 aa  190  2.9999999999999997e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.842303  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01821  FAD-binding monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G07040)  36.94 
 
 		 423 aa  190  4e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00520599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0549  monooxygenase FAD-binding  36.66 
 
 		 380 aa  189  8e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.554692  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4470  FAD dependent oxidoreductase  38.29 
 
 		 371 aa  187  4e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1462  monooxygenase FAD-binding  34.58 
 
 		 390 aa  183  4.0000000000000006e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000001589  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2957  monooxygenase FAD-binding  31.08 
 
 		 372 aa  183  4.0000000000000006e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575675  hitchhiker  0.00000079656 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2591  hypothetical protein  39.24 
 
 		 389 aa  183  6e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000360209  hitchhiker  0.000709187 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2116  monooxygenase FAD-binding protein  33.52 
 
 		 384 aa  170  3e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.400145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3892  monooxygenase FAD-binding protein  34.28 
 
 		 396 aa  161  2e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.116118  normal  0.359829 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1253  monooxygenase, FAD-binding  34.86 
 
 		 388 aa  157  4e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.420129  normal  0.229963 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4701  putative oxidoreductase transmembrane protein  36.34 
 
 		 381 aa  151  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1142  monooxygenase FAD-binding  34.48 
 
 		 388 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000665044 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5341  monooxygenase FAD-binding protein  33.33 
 
 		 418 aa  149  1.0000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4777  monooxygenase FAD-binding protein  33.33 
 
 		 496 aa  148  2.0000000000000003e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.712751  hitchhiker  0.00463722 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1494  monooxygenase, FAD-binding  34.71 
 
 		 386 aa  142  9.999999999999999e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.379752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4339  monooxygenase FAD-binding  34.16 
 
 		 434 aa  141  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1977  monooxygenase FAD-binding protein  34.81 
 
 		 393 aa  138  2e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.0000420901  unclonable  0.000000044053 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4094  FAD dependent oxidoreductase  34.64 
 
 		 413 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.232539  normal  0.561641 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1265  monooxygenase FAD-binding protein  35.17 
 
 		 396 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.717662  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5767  putative oxidoreductase transmembrane protein  30.48 
 
 		 405 aa  120  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.117987  normal  0.249872 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1730  monooxygenase, FAD-binding  30.94 
 
 		 395 aa  115  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.569431  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1561  hypothetical protein  30.7 
 
 		 377 aa  109  9.000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4615  monooxygenase FAD-binding  30.68 
 
 		 392 aa  108  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.992897  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0712  hypothetical protein  31.16 
 
 		 371 aa  107  4e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3199  hypothetical protein  32.56 
 
 		 374 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.3549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2471  monooxygenase FAD-binding  30.27 
 
 		 373 aa  103  7e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2657  monooxygenase, FAD-binding  30.99 
 
 		 377 aa  102  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.751067  normal  0.222603 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1542  monooxygenase FAD-binding protein  30.29 
 
 		 374 aa  101  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0929471  normal  0.228138 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2242  hypothetical protein  31.35 
 
 		 379 aa  100  4e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3140  hypothetical protein  27.33 
 
 		 376 aa  97.8  3e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5490  hypothetical protein  29.17 
 
 		 376 aa  97.8  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.263569  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0960  monooxygenase, FAD-binding  27.46 
 
 		 368 aa  97.4  4e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.234631  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0950  monooxygenase, FAD-binding  27.16 
 
 		 368 aa  94.4  3e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1936  hypothetical protein  29.85 
 
 		 376 aa  94  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2393  hypothetical protein  30.21 
 
 		 376 aa  93.6  5e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.142228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28690  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  34.36 
 
 		 387 aa  92  2e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5335  FAD-dependent monooxygenase  30.74 
 
 		 378 aa  89  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4891  monooxygenase, FAD-binding  30.61 
 
 		 402 aa  89  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.292821 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3428  monooxygenase, FAD-binding  30.16 
 
 		 372 aa  89.4  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0304  hypothetical protein  30.32 
 
 		 361 aa  89  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.741519  normal  0.196732 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1784  monooxygenase, FAD-binding  30.49 
 
 		 410 aa  84  0.000000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0859  hypothetical protein  25.55 
 
 		 376 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0813  monooxygenase, FAD-binding  27.82 
 
 		 377 aa  81.3  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5387  hypothetical protein  29.71 
 
 		 420 aa  80.9  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2779  monooxygenase FAD-binding  30.43 
 
 		 411 aa  81.3  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0421282 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4581  monooxygenase FAD-binding protein  29.71 
 
 		 399 aa  81.3  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.626069 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2526  salicylate 1-monooxygenase  28.62 
 
 		 396 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.066083 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0982  monooxygenase FAD-binding  29.26 
 
 		 369 aa  79.3  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.240273  decreased coverage  0.000117397 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1684  monooxygenase, FAD-binding  28.86 
 
 		 373 aa  79  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.750023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3614  monooxygenase FAD-binding  29.94 
 
 		 378 aa  79.3  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0392094  normal  0.0720055 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3547  hypothetical protein  29.1 
 
 		 374 aa  79  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1486  monooxygenase FAD-binding protein  29.33 
 
 		 408 aa  78.6  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.528879  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2656  putative salicylate hydroxylase (salicylate 1-monooxygenase)  28.37 
 
 		 391 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2962  monooxygenase FAD-binding protein  27.91 
 
 		 397 aa  78.2  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3417  monooxygenase, FAD-binding  28.08 
 
 		 379 aa  78.2  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0807578 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1313  monooxygenase, FAD-binding  28.37 
 
 		 391 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0568  monooxygenase FAD-binding  29.68 
 
 		 376 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3284  monooxygenase FAD-binding protein  29.23 
 
 		 393 aa  78.2  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.289154 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1193  monooxygenase, FAD-binding  28.1 
 
 		 390 aa  77.8  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.155257  normal  0.524756 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2257  hypothetical protein  29.23 
 
 		 378 aa  77.4  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.472155 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4828  hypothetical protein  30.53 
 
 		 376 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.454319 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0503  monooxygenase FAD-binding  29.1 
 
 		 376 aa  76.6  0.0000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4355  hypothetical protein  29.49 
 
 		 421 aa  75.9  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0233973  normal  0.534906 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>