More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2022 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_2022  putative oxidoreductase  100 
 
 
407 aa  835    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.461121  normal  0.126773 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7487  putative oxidoreductase  56.39 
 
 
399 aa  434  1e-120  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.455453  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1039  putative oxidoreductase  52.66 
 
 
387 aa  369  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0582367  normal  0.0597058 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2496  putative oxidoreductase  56.14 
 
 
374 aa  368  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.117419 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1719  monooxygenase FAD-binding protein  47.98 
 
 
402 aa  364  1e-99  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.861582  normal  0.177423 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0928  monooxygenase FAD-binding  49.87 
 
 
424 aa  357  9.999999999999999e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.607239  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4063  monooxygenase FAD-binding protein  46.48 
 
 
402 aa  338  9.999999999999999e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.69418 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3006  monooxygenase FAD-binding protein  48.23 
 
 
404 aa  333  4e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00211074 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0067  monooxygenase FAD-binding protein  49.86 
 
 
400 aa  333  4e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11286  hypothetical protein  49.72 
 
 
372 aa  323  4e-87  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2424  monooxygenase FAD-binding protein  51.18 
 
 
393 aa  321  9.999999999999999e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.127723  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8153  monooxygenase FAD-binding protein  46.52 
 
 
424 aa  316  5e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.976532 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26790  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  48.4 
 
 
398 aa  309  5e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.15237  normal  0.462192 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5557  monooxygenase FAD-binding protein  47.21 
 
 
371 aa  301  2e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5927  monooxygenase FAD-binding protein  44.67 
 
 
400 aa  295  8e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0387  monooxygenase FAD-binding  42.57 
 
 
402 aa  295  1e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.491614 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3917  putative oxidoreductase  43.14 
 
 
397 aa  280  3e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.280043  normal  0.0698195 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7249  monooxygenase FAD-binding  43.32 
 
 
377 aa  280  5e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2401  monooxygenase, FAD-binding  44.63 
 
 
400 aa  273  3e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.236058 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2360  monooxygenase, FAD-binding protein  44.63 
 
 
400 aa  270  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.175962  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2407  monooxygenase, FAD-binding  44.63 
 
 
400 aa  270  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.254272 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3990  monooxygenase FAD-binding  41.33 
 
 
415 aa  268  1e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.842303  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6278  monooxygenase FAD-binding  40.81 
 
 
393 aa  266  4e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.435986  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10585  hypothetical protein  42.39 
 
 
388 aa  258  2e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000190201  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10960  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  40.25 
 
 
403 aa  253  3e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1283  monooxygenase FAD-binding protein  42.7 
 
 
403 aa  248  2e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000514503 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3005  monooxygenase FAD-binding  41.08 
 
 
411 aa  237  3e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2591  hypothetical protein  41.53 
 
 
389 aa  236  6e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000360209  hitchhiker  0.000709187 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4249  monooxygenase FAD-binding  38.72 
 
 
370 aa  236  8e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.850855  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4470  FAD dependent oxidoreductase  43.86 
 
 
371 aa  235  8e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4005  monooxygenase FAD-binding  43.15 
 
 
396 aa  230  3e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.888605  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5899  monooxygenase FAD-binding  40.9 
 
 
398 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00196665 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0093  flavoprotein monooxygenase  38.73 
 
 
467 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5428  hypothetical protein  39 
 
 
394 aa  226  6e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00235903 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0549  monooxygenase FAD-binding  39.02 
 
 
380 aa  225  1e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.554692  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2116  monooxygenase FAD-binding protein  36.54 
 
 
384 aa  224  2e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.400145  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0385  hypothetical protein  39.06 
 
 
391 aa  223  4e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2957  monooxygenase FAD-binding  34.76 
 
 
372 aa  215  9.999999999999999e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575675  hitchhiker  0.00000079656 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2729  hypothetical protein  37.22 
 
 
415 aa  211  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0724  monooxygenase FAD-binding  37.28 
 
 
408 aa  208  1e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.30015 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0135  monooxygenase FAD-binding  38.98 
 
 
400 aa  204  3e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01821  FAD-binding monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G07040)  36.01 
 
 
423 aa  201  1.9999999999999998e-50  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00520599  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1462  monooxygenase FAD-binding  33.51 
 
 
390 aa  196  8.000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000001589  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2036  monooxygenase FAD-binding  33.83 
 
 
388 aa  186  5e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3892  monooxygenase FAD-binding protein  33.89 
 
 
396 aa  185  1.0000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.116118  normal  0.359829 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0299  monooxygenase  35.39 
 
 
351 aa  176  8e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4094  FAD dependent oxidoreductase  34.19 
 
 
413 aa  170  3e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.232539  normal  0.561641 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4777  monooxygenase FAD-binding protein  31.87 
 
 
496 aa  168  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.712751  hitchhiker  0.00463722 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5341  monooxygenase FAD-binding protein  29.95 
 
 
418 aa  159  6e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4701  putative oxidoreductase transmembrane protein  36.13 
 
 
381 aa  158  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105263  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1253  monooxygenase, FAD-binding  30.59 
 
 
388 aa  154  2e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.420129  normal  0.229963 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1494  monooxygenase, FAD-binding  32.51 
 
 
386 aa  151  3e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.379752  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4339  monooxygenase FAD-binding  33.97 
 
 
434 aa  147  4.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1977  monooxygenase FAD-binding protein  33.73 
 
 
393 aa  146  5e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.0000420901  unclonable  0.000000044053 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1142  monooxygenase FAD-binding  30.25 
 
 
388 aa  144  3e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000665044 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1265  monooxygenase FAD-binding protein  31.97 
 
 
396 aa  138  2e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.717662  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5767  putative oxidoreductase transmembrane protein  29.68 
 
 
405 aa  129  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.117987  normal  0.249872 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1730  monooxygenase, FAD-binding  31.23 
 
 
395 aa  125  1e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.569431  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4615  monooxygenase FAD-binding  31.53 
 
 
392 aa  125  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.992897  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2657  monooxygenase, FAD-binding  29.97 
 
 
377 aa  99.4  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.751067  normal  0.222603 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28690  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  30.52 
 
 
387 aa  97.8  3e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2779  monooxygenase FAD-binding  27.66 
 
 
411 aa  95.5  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0421282 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4581  monooxygenase FAD-binding protein  30.29 
 
 
399 aa  91.7  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.626069 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2471  monooxygenase FAD-binding  26.72 
 
 
373 aa  90.9  3e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1561  hypothetical protein  29.75 
 
 
377 aa  90.5  5e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0960  monooxygenase, FAD-binding  25.3 
 
 
368 aa  89.7  7e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.234631  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0950  monooxygenase, FAD-binding  25 
 
 
368 aa  87.8  3e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2393  hypothetical protein  29.06 
 
 
376 aa  86.7  8e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.142228  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2786  monooxygenase FAD-binding protein  27.45 
 
 
408 aa  85.5  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00390244  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5490  hypothetical protein  28.78 
 
 
376 aa  85.5  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.263569  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5335  FAD-dependent monooxygenase  28.16 
 
 
378 aa  82.8  0.000000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103313  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1486  monooxygenase FAD-binding protein  27.68 
 
 
408 aa  82.4  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.528879  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0859  hypothetical protein  27.14 
 
 
376 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2526  salicylate 1-monooxygenase  27.68 
 
 
396 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.066083 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0304  hypothetical protein  28.35 
 
 
361 aa  79.7  0.00000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.741519  normal  0.196732 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4891  monooxygenase, FAD-binding  26.98 
 
 
402 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.292821 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3199  hypothetical protein  28.42 
 
 
374 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.3549  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1542  monooxygenase FAD-binding protein  25.69 
 
 
374 aa  78.6  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0929471  normal  0.228138 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0503  monooxygenase FAD-binding  28.21 
 
 
376 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3944  salicylate hydroxylase  26.57 
 
 
382 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0448295  normal  0.412797 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6042  monooxygenase FAD-binding  26.01 
 
 
378 aa  77  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0233658  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1214  hypothetical protein  28.73 
 
 
414 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0712  hypothetical protein  26.35 
 
 
371 aa  76.6  0.0000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3061  hypothetical protein  28.06 
 
 
428 aa  76.6  0.0000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0232846 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1893  monooxygenase, FAD-binding  26.88 
 
 
382 aa  76.3  0.0000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2149  monooxygenase FAD-binding protein  20.35 
 
 
391 aa  76.3  0.0000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.438269  normal  0.289576 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2849  hypothetical protein  28.45 
 
 
414 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2974  hypothetical protein  28.73 
 
 
414 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.556187  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5073  Salicylate 1-monooxygenase  24.86 
 
 
386 aa  75.5  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.926874  normal  0.172716 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2242  hypothetical protein  30.91 
 
 
379 aa  75.1  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3579  monooxygenase FAD-binding  26.79 
 
 
382 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.817981 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3140  hypothetical protein  26.1 
 
 
376 aa  74.7  0.000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0391  hypothetical protein  28.1 
 
 
440 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0439  hypothetical protein  28.1 
 
 
440 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0568  monooxygenase FAD-binding  28.13 
 
 
376 aa  74.3  0.000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0514  hypothetical protein  27.41 
 
 
421 aa  74.3  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.472933  normal  0.467939 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1585  hypothetical protein  28.1 
 
 
440 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.825888  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1770  hypothetical protein  28.1 
 
 
440 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0982  monooxygenase FAD-binding  30.68 
 
 
369 aa  73.9  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.240273  decreased coverage  0.000117397 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2140  monooxygenase FAD-binding  26.57 
 
 
382 aa  73.9  0.000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0383787 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>