More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_1655 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_1655  hypothetical protein  100 
 
 		 419 aa  857    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.151005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2320  hypothetical protein  87.29 
 
 		 421 aa  719    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3170  hypothetical protein  52.97 
 
 		 406 aa  438  9.999999999999999e-123  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.161745 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1366  hypothetical protein  53.01 
 
 		 418 aa  438  9.999999999999999e-123  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.496364 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2174  hypothetical protein  53.38 
 
 		 405 aa  414  1e-114  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.825478  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00330  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  49.62 
 
 		 405 aa  384  1e-105  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0442  hypothetical protein  49.5 
 
 		 425 aa  376  1e-103  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2410  monooxygenase FAD-binding protein  48.28 
 
 		 408 aa  373  1e-102  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.262762  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11769  hypothetical protein  47.85 
 
 		 460 aa  365  1e-100  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.196079  hitchhiker  0.00000209473 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3289  monooxygenase FAD-binding protein  51.01 
 
 		 405 aa  367  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2901  hypothetical protein  43.43 
 
 		 521 aa  364  1e-99  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0623331  normal  0.318501 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1898  monooxygenase FAD-binding protein  46.46 
 
 		 391 aa  358  9.999999999999999e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.305388 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0456  hypothetical protein  48.12 
 
 		 400 aa  356  5e-97  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.558276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2386  monooxygenase FAD-binding protein  48.24 
 
 		 412 aa  351  1e-95  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.611075  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1983  hypothetical protein  46.98 
 
 		 431 aa  348  8e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.564684 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1503  hypothetical protein  49 
 
 		 405 aa  348  1e-94  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2049  hypothetical protein  45.59 
 
 		 409 aa  345  7e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.961619  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0437  hypothetical protein  45.61 
 
 		 423 aa  344  2e-93  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6078  hypothetical protein  47.65 
 
 		 421 aa  343  4e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.25348  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3035  hypothetical protein  49.75 
 
 		 399 aa  343  4e-93  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1429  hypothetical protein  44.11 
 
 		 405 aa  339  7e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.834024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2982  hypothetical protein  47.03 
 
 		 419 aa  338  9.999999999999999e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.402878  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2327  hypothetical protein  47.16 
 
 		 414 aa  338  9.999999999999999e-92  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0143705  normal  0.574012 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0304  hypothetical protein  47.84 
 
 		 415 aa  337  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.605002  normal  0.180027 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2848  monooxygenase FAD-binding  48.37 
 
 		 404 aa  333  3e-90  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3882  monooxygenase FAD-binding protein  42.32 
 
 		 410 aa  332  9e-90  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1232  monooxygenase FAD-binding protein  46.53 
 
 		 417 aa  325  1e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0108745 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09000  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  46 
 
 		 416 aa  321  1.9999999999999998e-86  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2633  monooxygenase FAD-binding protein  47.24 
 
 		 415 aa  319  7e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.835252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1565  hypothetical protein  46.52 
 
 		 423 aa  317  3e-85  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.000000103303  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6010  monooxygenase FAD-binding  46.46 
 
 		 410 aa  316  4e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0506  hypothetical protein  46.29 
 
 		 420 aa  312  9e-84  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1606  monooxygenase FAD-binding protein  47.01 
 
 		 413 aa  311  1e-83  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0134367  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5898  monooxygenase FAD-binding protein  43.14 
 
 		 408 aa  290  5.0000000000000004e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.106816 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3557  monooxygenase FAD-binding protein  48.97 
 
 		 383 aa  256  4e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3972  monooxygenase FAD-binding  35.19 
 
 		 416 aa  209  7e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0762736  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0075  hypothetical protein  28.4 
 
 		 404 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1747  hypothetical protein  30.39 
 
 		 419 aa  158  1e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0945012 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5384  monooxygenase FAD-binding  27.38 
 
 		 506 aa  96.7  7e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.297257  normal  0.119449 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2841  putative rifampin monooxygenase  31.06 
 
 		 475 aa  89  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0090  hypothetical protein  27.03 
 
 		 497 aa  87.8  3e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3551  monooxygenase FAD-binding  26.28 
 
 		 630 aa  87  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.412652  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0623  monooxygenase FAD-binding  25.85 
 
 		 533 aa  85.5  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3774  monooxygenase, FAD-binding  26.51 
 
 		 397 aa  83.6  0.000000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.343223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1216  hypothetical protein  26.99 
 
 		 486 aa  81.3  0.00000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.795806  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1676  monooxygenase FAD-binding protein  26.97 
 
 		 481 aa  80.1  0.00000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00000910554  normal  0.199479 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3079  monooxygenase FAD-binding protein  28.9 
 
 		 503 aa  79.7  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.591797  normal  0.0830218 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1515  monooxygenase, FAD-binding  27.49 
 
 		 478 aa  79.3  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.497595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4358  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  26.79 
 
 		 391 aa  78.2  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.119328  normal  0.266581 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1649  hypothetical protein  27.97 
 
 		 497 aa  77  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.256973  normal  0.216495 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4133  pentachlorophenol monooxygenase  26.68 
 
 		 479 aa  77  0.0000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.636421 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5698  monooxygenase FAD-binding  25.47 
 
 		 531 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0767168 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2748  monooxygenase FAD-binding protein  27.63 
 
 		 489 aa  75.9  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1544  monooxygenase, FAD-binding protein  27.14 
 
 		 478 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.585572  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1567  monooxygenase, FAD-binding  27.14 
 
 		 478 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0725  monooxygenase FAD-binding protein  25.51 
 
 		 509 aa  74.3  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.812372  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3055  monooxygenase FAD-binding  28.49 
 
 		 408 aa  74.3  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4006  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  26.82 
 
 		 395 aa  73.9  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187739  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04210  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  26.42 
 
 		 510 aa  73.6  0.000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4320  monooxygenase FAD-binding  27.22 
 
 		 522 aa  73.6  0.000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1498  monooxygenase, FAD-binding  29.29 
 
 		 477 aa  73.6  0.000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.106253  normal  0.474209 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0641  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  28.22 
 
 		 389 aa  73.2  0.000000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4799  monooxygenase FAD-binding  26.46 
 
 		 477 aa  72.4  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0603  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  27.61 
 
 		 389 aa  72.4  0.00000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.862767  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4203  monooxygenase FAD-binding  25.51 
 
 		 487 aa  72.4  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2964  monooxygenase FAD-binding  26.57 
 
 		 422 aa  71.6  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000808449 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6603  monooxygenase FAD-binding protein  25.48 
 
 		 400 aa  71.6  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.145948  normal  0.349109 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2512  monooxygenase FAD-binding  23.98 
 
 		 544 aa  71.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1850  hypothetical protein  27.27 
 
 		 497 aa  71.2  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.790198 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3345  monooxygenase FAD-binding  27.78 
 
 		 505 aa  71.6  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.527889 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4043  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  24.87 
 
 		 396 aa  71.2  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3838  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  26.61 
 
 		 395 aa  70.5  0.00000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1484  hypothetical protein  27.73 
 
 		 499 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.115631  normal  0.323666 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2807  monooxygenase FAD-binding  27.19 
 
 		 417 aa  70.1  0.00000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.461648  normal  0.985986 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0850  FAD-dependent oxidoreductase  22.84 
 
 		 555 aa  70.1  0.00000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0192309  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2436  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  27.16 
 
 		 389 aa  68.9  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.873151  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3421  monooxygenase FAD-binding protein  26.11 
 
 		 388 aa  69.3  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.875468  normal  0.0698914 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3284  hypothetical protein  24.69 
 
 		 554 aa  68.9  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9228  hypothetical protein  25 
 
 		 504 aa  69.7  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.187294  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3896  monooxygenase FAD-binding protein  22.35 
 
 		 537 aa  68.9  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.228643 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3131  PheA/TfdB family FAD-binding monooxygenase  26.21 
 
 		 483 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1117  monooxygenase, FAD-binding  24.32 
 
 		 399 aa  68.2  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0291  FAD-dependent oxidoreductase  26.75 
 
 		 545 aa  67.8  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.339644  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10582  FAD binding monooxygenase, putative (JCVI)  22.08 
 
 		 566 aa  67.8  0.0000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.832072  normal  0.150999 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2814  monooxygenase FAD-binding protein  25.42 
 
 		 537 aa  67.4  0.0000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0957884  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3723  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  26.5 
 
 		 389 aa  67.4  0.0000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0599  monooxygenase FAD-binding protein  24.8 
 
 		 488 aa  67.4  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2573  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  24.54 
 
 		 389 aa  67.4  0.0000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6220  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  26.54 
 
 		 390 aa  67.4  0.0000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.315018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2198  monooxygenase, FAD-binding  27.45 
 
 		 479 aa  67.4  0.0000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.695646  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1940  monooxygenase, FAD-binding  24.69 
 
 		 489 aa  67  0.0000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0417  monooxygenase FAD-binding  26.33 
 
 		 501 aa  67  0.0000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.969537  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0724  monooxygenase, FAD-binding  28 
 
 		 461 aa  67  0.0000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.127725  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0725  monooxygenase FAD-binding  23.26 
 
 		 571 aa  67  0.0000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.490959  normal  0.227588 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2422  hypothetical protein  28.27 
 
 		 526 aa  67  0.0000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.230317  normal  0.0556109 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3068  monooxygenase FAD-binding  27.67 
 
 		 493 aa  66.2  0.0000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.159708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1172  monooxygenase, FAD-binding  23.46 
 
 		 535 aa  66.2  0.0000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.570475 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1650  hypothetical protein  24.21 
 
 		 502 aa  66.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1576  putative monooxygenase  25.87 
 
 		 388 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.472277  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3543  monooxygenase FAD-binding  24.51 
 
 		 489 aa  65.9  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>