More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3035 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_3035  hypothetical protein  100 
 
 
399 aa  791    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1983  hypothetical protein  59.7 
 
 
431 aa  423  1e-117  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.564684 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2174  hypothetical protein  53.88 
 
 
405 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.825478  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3170  hypothetical protein  51.26 
 
 
406 aa  391  1e-107  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.161745 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1366  hypothetical protein  50.37 
 
 
418 aa  379  1e-104  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.496364 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1898  monooxygenase FAD-binding protein  54.66 
 
 
391 aa  372  1e-102  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.305388 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3289  monooxygenase FAD-binding protein  53.75 
 
 
405 aa  374  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158471  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1655  hypothetical protein  49.75 
 
 
419 aa  370  1e-101  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.151005  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2320  hypothetical protein  49.62 
 
 
421 aa  369  1e-101  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00330  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  49.62 
 
 
405 aa  366  1e-100  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1606  monooxygenase FAD-binding protein  53.85 
 
 
413 aa  363  2e-99  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0134367  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2386  monooxygenase FAD-binding protein  52.75 
 
 
412 aa  362  9e-99  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.611075  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0442  hypothetical protein  52.13 
 
 
425 aa  354  2e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11769  hypothetical protein  49.87 
 
 
460 aa  353  4e-96  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.196079  hitchhiker  0.00000209473 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0456  hypothetical protein  48.29 
 
 
400 aa  340  2.9999999999999998e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.558276  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6010  monooxygenase FAD-binding  51.39 
 
 
410 aa  336  3.9999999999999995e-91  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0304  hypothetical protein  51.52 
 
 
415 aa  336  3.9999999999999995e-91  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.605002  normal  0.180027 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5898  monooxygenase FAD-binding protein  50.37 
 
 
408 aa  334  2e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.106816 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2848  monooxygenase FAD-binding  48 
 
 
404 aa  330  2e-89  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0437  hypothetical protein  45.98 
 
 
423 aa  330  2e-89  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2049  hypothetical protein  45.48 
 
 
409 aa  330  3e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.961619  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2410  monooxygenase FAD-binding protein  43.52 
 
 
408 aa  329  4e-89  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.262762  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1232  monooxygenase FAD-binding protein  50.75 
 
 
417 aa  326  5e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0108745 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09000  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  50.87 
 
 
416 aa  324  2e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2982  hypothetical protein  45.27 
 
 
419 aa  323  4e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.402878  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2327  hypothetical protein  48.11 
 
 
414 aa  319  5e-86  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0143705  normal  0.574012 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3882  monooxygenase FAD-binding protein  42.46 
 
 
410 aa  319  6e-86  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1503  hypothetical protein  45.67 
 
 
405 aa  318  1e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0506  hypothetical protein  47.56 
 
 
420 aa  315  8e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1565  hypothetical protein  50.37 
 
 
423 aa  313  2.9999999999999996e-84  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.000000103303  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1429  hypothetical protein  43.42 
 
 
405 aa  312  6.999999999999999e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.834024  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2633  monooxygenase FAD-binding protein  50.37 
 
 
415 aa  309  4e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.835252  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6078  hypothetical protein  44.39 
 
 
421 aa  306  3e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.25348  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2901  hypothetical protein  45.31 
 
 
521 aa  289  5.0000000000000004e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0623331  normal  0.318501 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3557  monooxygenase FAD-binding protein  48.18 
 
 
383 aa  240  4e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3972  monooxygenase FAD-binding  35.7 
 
 
416 aa  197  3e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0762736  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0075  hypothetical protein  29.75 
 
 
404 aa  162  7e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1747  hypothetical protein  30.84 
 
 
419 aa  137  5e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0945012 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3055  monooxygenase FAD-binding  34.24 
 
 
408 aa  89  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4799  monooxygenase FAD-binding  32.26 
 
 
477 aa  89  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5384  monooxygenase FAD-binding  29.79 
 
 
506 aa  82.4  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.297257  normal  0.119449 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3048  hypothetical protein  30.4 
 
 
506 aa  81.6  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04210  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  26.72 
 
 
510 aa  81.3  0.00000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1860  hypothetical protein  29.83 
 
 
498 aa  81.3  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.267805  normal  0.600833 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3421  monooxygenase FAD-binding protein  29.28 
 
 
388 aa  80.1  0.00000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.875468  normal  0.0698914 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3774  monooxygenase, FAD-binding  33.33 
 
 
397 aa  79.7  0.00000000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.343223  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0696  putative monooxygenase  26.21 
 
 
388 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0540721  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1734  putative monooxygenase  26.21 
 
 
388 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0770  putative monooxygenase  26.21 
 
 
388 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.522816  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1219  putative monooxygenase  25.93 
 
 
388 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00380078  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2421  putative monooxygenase  25.93 
 
 
388 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1144  putative monooxygenase  25.93 
 
 
388 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.670847  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0724  monooxygenase, FAD-binding  27.96 
 
 
461 aa  77.4  0.0000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.127725  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0161  monooxygenase FAD-binding protein  30.7 
 
 
493 aa  77  0.0000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0417  monooxygenase FAD-binding  28.21 
 
 
501 aa  76.3  0.0000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.969537  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1172  monooxygenase, FAD-binding  27.45 
 
 
535 aa  75.5  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.570475 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2454  regulatory proteins, IclR  25.71 
 
 
575 aa  73.6  0.000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.283629  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0090  hypothetical protein  27.72 
 
 
497 aa  73.2  0.000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1733  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-related FAD-dependent oxidoreductase  28.06 
 
 
490 aa  73.6  0.000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.932836 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2135  monooxygenase FAD-binding  26.06 
 
 
540 aa  72.8  0.000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.218617  normal  0.0232179 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2013  monooxygenase FAD-binding  28.05 
 
 
475 aa  72.4  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4431  monooxygenase FAD-binding protein  26.84 
 
 
474 aa  72.8  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.412484 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0592  UbiH/UbiF/VisC/COQ6 family ubiquinone biosynthesis hydroxylase  23.96 
 
 
434 aa  72.4  0.00000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10582  FAD binding monooxygenase, putative (JCVI)  24.77 
 
 
566 aa  71.6  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.832072  normal  0.150999 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1676  monooxygenase FAD-binding protein  28.69 
 
 
481 aa  72  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00000910554  normal  0.199479 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1576  putative monooxygenase  24.16 
 
 
388 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.472277  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0850  FAD-dependent oxidoreductase  25.51 
 
 
555 aa  72  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0192309  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3485  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase and related FAD-dependent oxidoreductases-like  25.96 
 
 
557 aa  72  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.108496 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0818  2-octaprenyl-6-methoxyphenyl hydroxylase  25.4 
 
 
414 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.15699 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2328  monooxygenase FAD-binding  29.52 
 
 
480 aa  72  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.238819  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0143  monooxygenase FAD-binding protein  29.91 
 
 
968 aa  71.2  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3793  monooxygenase, FAD-binding  27.57 
 
 
524 aa  70.9  0.00000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.791839  normal  0.0125936 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2389  hypothetical protein  27.7 
 
 
557 aa  70.9  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4215  hypothetical protein  28.87 
 
 
546 aa  70.9  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0566809  hitchhiker  0.000593788 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0599  monooxygenase FAD-binding protein  26.88 
 
 
488 aa  70.5  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1744  FAD-binding monooxygenase, PheA/TfdB family  24.5 
 
 
539 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.572505 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3293  monooxygenase FAD-binding  28 
 
 
486 aa  70.5  0.00000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247977  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2841  putative rifampin monooxygenase  28.75 
 
 
475 aa  70.5  0.00000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0327  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  25.56 
 
 
407 aa  70.5  0.00000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3068  monooxygenase FAD-binding  28.22 
 
 
493 aa  70.1  0.00000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.159708  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3838  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  27.22 
 
 
395 aa  69.7  0.00000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4133  pentachlorophenol monooxygenase  26.16 
 
 
479 aa  70.1  0.00000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.636421 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3217  monooxygenase FAD-binding protein  29.23 
 
 
488 aa  69.7  0.00000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0996184  hitchhiker  0.0000000987139 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0291  FAD-dependent oxidoreductase  27.09 
 
 
545 aa  69.7  0.00000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.339644  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3896  monooxygenase FAD-binding protein  28.12 
 
 
537 aa  69.7  0.00000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.228643 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0541  hypothetical protein  24.93 
 
 
512 aa  69.7  0.00000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1656  hypothetical protein  27.95 
 
 
508 aa  69.7  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.652016  normal  0.325297 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1484  hypothetical protein  27.79 
 
 
499 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.115631  normal  0.323666 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1544  monooxygenase, FAD-binding protein  28.44 
 
 
478 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.585572  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0585  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  23.69 
 
 
391 aa  69.3  0.0000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000156374  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1567  monooxygenase, FAD-binding  28.44 
 
 
478 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2748  monooxygenase FAD-binding protein  30.15 
 
 
489 aa  69.3  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0756  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  23.56 
 
 
391 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000354317  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3231  FAD-dependent oxidoreductase  28.57 
 
 
553 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5676  monooxygenase, FAD-binding  28.7 
 
 
515 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1649  hypothetical protein  28.02 
 
 
497 aa  68.2  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.256973  normal  0.216495 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3216  FAD-dependent oxidoreductase  28.57 
 
 
553 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5297  monooxygenase, FAD-binding protein  28.7 
 
 
515 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.85745  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5386  monooxygenase, FAD-binding  28.7 
 
 
515 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.416517 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3177  FAD-dependent oxidoreductase  28.57 
 
 
553 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>