More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3972 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3972  monooxygenase FAD-binding  100 
 
 		 416 aa  813    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0762736  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0437  hypothetical protein  45.69 
 
 		 423 aa  285  9e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2049  hypothetical protein  41.52 
 
 		 409 aa  260  3e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.961619  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3882  monooxygenase FAD-binding protein  39.59 
 
 		 410 aa  259  5.0000000000000005e-68  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5898  monooxygenase FAD-binding protein  41.98 
 
 		 408 aa  229  8e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.106816 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1898  monooxygenase FAD-binding protein  41.42 
 
 		 391 aa  229  9e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.305388 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1366  hypothetical protein  37.79 
 
 		 418 aa  228  1e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.496364 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1655  hypothetical protein  35.81 
 
 		 419 aa  224  2e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.151005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3170  hypothetical protein  37.73 
 
 		 406 aa  224  3e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.161745 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3289  monooxygenase FAD-binding protein  41.71 
 
 		 405 aa  223  4e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2386  monooxygenase FAD-binding protein  40.26 
 
 		 412 aa  218  2e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.611075  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2410  monooxygenase FAD-binding protein  34.99 
 
 		 408 aa  217  2.9999999999999998e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.262762  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00330  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  40.31 
 
 		 405 aa  215  9.999999999999999e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1503  hypothetical protein  37.07 
 
 		 405 aa  214  2.9999999999999995e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2320  hypothetical protein  35.35 
 
 		 421 aa  213  3.9999999999999995e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1429  hypothetical protein  35.17 
 
 		 405 aa  213  4.9999999999999996e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.834024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2174  hypothetical protein  36.73 
 
 		 405 aa  207  4e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.825478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3035  hypothetical protein  36.71 
 
 		 399 aa  194  3e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2327  hypothetical protein  37.19 
 
 		 414 aa  194  4e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0143705  normal  0.574012 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11769  hypothetical protein  36.89 
 
 		 460 aa  192  8e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.196079  hitchhiker  0.00000209473 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1232  monooxygenase FAD-binding protein  38.79 
 
 		 417 aa  190  5e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0108745 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1983  hypothetical protein  35.97 
 
 		 431 aa  190  5e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.564684 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2848  monooxygenase FAD-binding  36.09 
 
 		 404 aa  189  8e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2901  hypothetical protein  35.92 
 
 		 521 aa  187  2e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0623331  normal  0.318501 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0456  hypothetical protein  36.1 
 
 		 400 aa  186  8e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.558276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09000  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  38.86 
 
 		 416 aa  184  2.0000000000000003e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2633  monooxygenase FAD-binding protein  37.88 
 
 		 415 aa  183  6e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.835252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0506  hypothetical protein  36.84 
 
 		 420 aa  182  1e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6078  hypothetical protein  34.31 
 
 		 421 aa  181  2e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.25348  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0442  hypothetical protein  36.89 
 
 		 425 aa  179  1e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2982  hypothetical protein  33.76 
 
 		 419 aa  178  1e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.402878  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6010  monooxygenase FAD-binding  36 
 
 		 410 aa  174  3.9999999999999995e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1606  monooxygenase FAD-binding protein  36.28 
 
 		 413 aa  166  5e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0134367  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0304  hypothetical protein  34.13 
 
 		 415 aa  157  3e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.605002  normal  0.180027 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1565  hypothetical protein  37.42 
 
 		 423 aa  157  4e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.000000103303  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0075  hypothetical protein  30.53 
 
 		 404 aa  156  6e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1747  hypothetical protein  33.02 
 
 		 419 aa  136  7.000000000000001e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0945012 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3557  monooxygenase FAD-binding protein  33.57 
 
 		 383 aa  125  1e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3896  monooxygenase FAD-binding protein  29.13 
 
 		 537 aa  93.2  8e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.228643 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1150  monooxygenase FAD-binding protein  29.11 
 
 		 397 aa  79.3  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.862466  normal  0.995827 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5698  monooxygenase FAD-binding  28.02 
 
 		 531 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0767168 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1511  monooxygenase FAD-binding  29.72 
 
 		 576 aa  78.2  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0685394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3774  monooxygenase, FAD-binding  27.39 
 
 		 397 aa  77.4  0.0000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.343223  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0623  monooxygenase FAD-binding  24.61 
 
 		 533 aa  75.9  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3440  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  26.48 
 
 		 605 aa  75.9  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.845304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2119  tryptophan halogenase  30 
 
 		 507 aa  75.1  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0671126  normal  0.0332938 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3345  monooxygenase FAD-binding  27.88 
 
 		 505 aa  74.7  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.527889 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1515  monooxygenase, FAD-binding  29.2 
 
 		 478 aa  73.9  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.497595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3043  geranylgeranyl reductase  28.74 
 
 		 376 aa  73.9  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.483009 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3846  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  27.51 
 
 		 391 aa  73.6  0.000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.536675  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0417  monooxygenase FAD-binding  28.53 
 
 		 501 aa  73.6  0.000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.969537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3068  monooxygenase FAD-binding  27.25 
 
 		 493 aa  73.2  0.000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.159708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4066  geranylgeranyl reductase  29.91 
 
 		 423 aa  72.4  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.449431  normal  0.299227 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1544  monooxygenase, FAD-binding protein  28.54 
 
 		 478 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.585572  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1567  monooxygenase, FAD-binding  28.54 
 
 		 478 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1576  putative monooxygenase  23.85 
 
 		 388 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.472277  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04210  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  26.97 
 
 		 510 aa  71.2  0.00000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4215  hypothetical protein  30.03 
 
 		 546 aa  71.2  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0566809  hitchhiker  0.000593788 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0390  monooxygenase FAD-binding  30.77 
 
 		 425 aa  70.5  0.00000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0398453 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1937  monooxygenase FAD-binding  27.89 
 
 		 400 aa  70.1  0.00000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000536386 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04530  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  31.07 
 
 		 457 aa  70.1  0.00000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.722855  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0583  geranylgeranyl reductase  27.94 
 
 		 425 aa  70.1  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3281  pentachlorophenol-4-monooxygenase  27.86 
 
 		 414 aa  69.7  0.00000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4464  geranylgeranyl reductase  28.53 
 
 		 423 aa  68.9  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.152921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2465  tryptophan halogenase  27.81 
 
 		 495 aa  69.7  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.842716  normal  0.17253 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8053  geranylgeranyl reductase  29.8 
 
 		 423 aa  68.6  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.661392 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2031  tryptophan halogenase  29.41 
 
 		 413 aa  68.9  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0818162  normal  0.0655371 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2724  tryptophan halogenase  26.52 
 
 		 506 aa  68.9  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.656683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1308  geranylgeranyl reductase  24.51 
 
 		 406 aa  68.9  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3421  monooxygenase FAD-binding protein  26.1 
 
 		 388 aa  68.6  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.875468  normal  0.0698914 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5020  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  26.59 
 
 		 389 aa  67.4  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.355822  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3184  tryptophan halogenase  27.73 
 
 		 441 aa  67.4  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.153347  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4358  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  26.22 
 
 		 391 aa  67.4  0.0000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.119328  normal  0.266581 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10084  phenol 2-monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G11480)  23.41 
 
 		 590 aa  67  0.0000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.578884 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2377  hypothetical protein  26.38 
 
 		 553 aa  67  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.879652  normal  0.249541 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2807  monooxygenase FAD-binding  28.95 
 
 		 417 aa  67  0.0000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.461648  normal  0.985986 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3293  monooxygenase FAD-binding  27.59 
 
 		 486 aa  66.6  0.0000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0530  tryptophan halogenase  28 
 
 		 491 aa  66.6  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.680136  normal  0.208224 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2826  geranylgeranyl reductase  28.28 
 
 		 443 aa  66.2  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0858816 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4420  geranylgeranyl reductase  27.57 
 
 		 418 aa  66.2  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1273  geranylgeranyl reductase  27.57 
 
 		 457 aa  65.9  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0513601 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0561  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  25.94 
 
 		 389 aa  65.9  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.061935  normal  0.130471 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2326  monooxygenase FAD-binding protein  26.15 
 
 		 388 aa  66.2  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000156334  normal  0.582922 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4886  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  28.3 
 
 		 407 aa  65.1  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.879694  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7086  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  27.65 
 
 		 391 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.335822  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5592  monooxygenase FAD-binding protein  23.4 
 
 		 524 aa  65.1  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5386  monooxygenase, FAD-binding  27.63 
 
 		 515 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.416517 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5297  monooxygenase, FAD-binding protein  27.63 
 
 		 515 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.85745  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5676  monooxygenase, FAD-binding  27.63 
 
 		 515 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2944  monooxygenase, FAD-binding protein  28.76 
 
 		 436 aa  65.1  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4192  FAD-dependent oxidoreductase  25.5 
 
 		 564 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1983  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  27.1 
 
 		 390 aa  63.9  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.334759  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2763  ubiquinone biosynthesis hydroxylase, UbiH/UbiF/VisC/COQ6  25.86 
 
 		 406 aa  64.3  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4381  monooxygenase FAD-binding  26.06 
 
 		 417 aa  64.3  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2543  2-octaprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase / 2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  25.66 
 
 		 413 aa  63.9  0.000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.402909  normal  0.0280811 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0161  monooxygenase FAD-binding protein  30.96 
 
 		 493 aa  63.9  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3230  geranylgeranyl reductase  27.55 
 
 		 431 aa  63.9  0.000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716202 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4799  monooxygenase FAD-binding  28.53 
 
 		 477 aa  63.5  0.000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5585  putative FAD-binding monooxygenase  25.58 
 
 		 514 aa  63.2  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.396725  normal  0.187805 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2645  FAD-binding monooxygenase, PheA/TfdB family  25.71 
 
 		 529 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0393426  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>