More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_2174 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_2174  hypothetical protein  100 
 
 
405 aa  792    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.825478  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1366  hypothetical protein  57.86 
 
 
418 aa  451  1e-125  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.496364 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3170  hypothetical protein  57.71 
 
 
406 aa  445  1.0000000000000001e-124  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.161745 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1655  hypothetical protein  53.38 
 
 
419 aa  436  1e-121  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.151005  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2320  hypothetical protein  52.87 
 
 
421 aa  419  1e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0456  hypothetical protein  56.69 
 
 
400 aa  412  1e-114  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.558276  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3035  hypothetical protein  53.88 
 
 
399 aa  401  9.999999999999999e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2386  monooxygenase FAD-binding protein  54.55 
 
 
412 aa  389  1e-107  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.611075  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2410  monooxygenase FAD-binding protein  47.78 
 
 
408 aa  386  1e-106  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.262762  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1429  hypothetical protein  49.75 
 
 
405 aa  384  1e-105  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.834024  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2327  hypothetical protein  55.3 
 
 
414 aa  382  1e-105  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0143705  normal  0.574012 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6078  hypothetical protein  50.98 
 
 
421 aa  381  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.25348  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2049  hypothetical protein  48.25 
 
 
409 aa  376  1e-103  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.961619  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3289  monooxygenase FAD-binding protein  50.86 
 
 
405 aa  369  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158471  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2982  hypothetical protein  49.38 
 
 
419 aa  370  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.402878  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0437  hypothetical protein  50.25 
 
 
423 aa  370  1e-101  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00330  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  52.03 
 
 
405 aa  368  1e-101  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1983  hypothetical protein  53.88 
 
 
431 aa  368  1e-100  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.564684 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1898  monooxygenase FAD-binding protein  52.07 
 
 
391 aa  366  1e-100  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.305388 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1503  hypothetical protein  53.3 
 
 
405 aa  365  1e-99  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2901  hypothetical protein  47.42 
 
 
521 aa  361  2e-98  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0623331  normal  0.318501 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11769  hypothetical protein  49.62 
 
 
460 aa  359  4e-98  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.196079  hitchhiker  0.00000209473 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5898  monooxygenase FAD-binding protein  51.6 
 
 
408 aa  356  3.9999999999999996e-97  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.106816 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6010  monooxygenase FAD-binding  52.67 
 
 
410 aa  355  6.999999999999999e-97  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3882  monooxygenase FAD-binding protein  44.89 
 
 
410 aa  353  2e-96  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1606  monooxygenase FAD-binding protein  52.72 
 
 
413 aa  347  2e-94  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0134367  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0442  hypothetical protein  50.76 
 
 
425 aa  347  2e-94  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1232  monooxygenase FAD-binding protein  50.76 
 
 
417 aa  342  5.999999999999999e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0108745 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2848  monooxygenase FAD-binding  49.88 
 
 
404 aa  336  5e-91  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1565  hypothetical protein  50.91 
 
 
423 aa  333  4e-90  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.000000103303  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0304  hypothetical protein  49.23 
 
 
415 aa  331  1e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.605002  normal  0.180027 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2633  monooxygenase FAD-binding protein  48.74 
 
 
415 aa  330  4e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.835252  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0506  hypothetical protein  47.64 
 
 
420 aa  320  1.9999999999999998e-86  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09000  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  48.01 
 
 
416 aa  317  3e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3557  monooxygenase FAD-binding protein  48.54 
 
 
383 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3972  monooxygenase FAD-binding  36.73 
 
 
416 aa  206  5e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0762736  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0075  hypothetical protein  29.79 
 
 
404 aa  162  1e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1747  hypothetical protein  35.12 
 
 
419 aa  150  3e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0945012 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04210  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  29.01 
 
 
510 aa  84.7  0.000000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2807  monooxygenase FAD-binding  29.13 
 
 
417 aa  82.4  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.461648  normal  0.985986 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5384  monooxygenase FAD-binding  25.66 
 
 
506 aa  76.3  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.297257  normal  0.119449 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3055  monooxygenase FAD-binding  32.8 
 
 
408 aa  75.5  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3838  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  25.83 
 
 
395 aa  72.8  0.000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0090  hypothetical protein  28.34 
 
 
497 aa  72.4  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1484  hypothetical protein  26.22 
 
 
499 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.115631  normal  0.323666 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0585  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  26.59 
 
 
391 aa  72.4  0.00000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000156374  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0599  monooxygenase FAD-binding protein  27.22 
 
 
488 aa  72.4  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1216  hypothetical protein  25.84 
 
 
486 aa  71.6  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.795806  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1139  ubiquinone biosynthesis hydroxylase  23.53 
 
 
422 aa  71.6  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.254878  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00630  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  26.59 
 
 
391 aa  70.9  0.00000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000612482  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2964  Ubiquinone biosynthesis hydroxylase, UbiH/UbiF/VisC/COQ6 family  26.59 
 
 
391 aa  70.9  0.00000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000940784  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0709  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  26.59 
 
 
391 aa  70.9  0.00000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000850111  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2983  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  26.59 
 
 
391 aa  70.9  0.00000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000743082  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00621  hypothetical protein  26.59 
 
 
391 aa  70.9  0.00000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00122324  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3551  monooxygenase FAD-binding  27 
 
 
630 aa  70.9  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.412652  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0685  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  26.32 
 
 
391 aa  70.5  0.00000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00002921  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0692  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  26.32 
 
 
391 aa  70.1  0.00000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000811141  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3421  monooxygenase FAD-binding protein  25.88 
 
 
388 aa  70.1  0.00000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.875468  normal  0.0698914 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0756  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  26.32 
 
 
391 aa  70.1  0.00000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000354317  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04530  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  27.73 
 
 
457 aa  69.7  0.00000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.722855  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3045  monooxygenase, FAD-binding  24.46 
 
 
600 aa  69.3  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000523244  unclonable  0.000000929922 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3267  monooxygenase FAD-binding  28.22 
 
 
486 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3774  monooxygenase, FAD-binding  27.66 
 
 
397 aa  69.7  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.343223  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1860  hypothetical protein  29.34 
 
 
498 aa  69.3  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.267805  normal  0.600833 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0818  2-octaprenyl-6-methoxyphenyl hydroxylase  24.85 
 
 
414 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.15699 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1940  monooxygenase, FAD-binding  27.07 
 
 
489 aa  68.2  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0850  FAD-dependent oxidoreductase  24.15 
 
 
555 aa  68.6  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0192309  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0962  putative monooxygenase, FAD-binding  28.36 
 
 
574 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0576419  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4192  FAD-dependent oxidoreductase  24.7 
 
 
564 aa  66.2  0.0000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1172  monooxygenase, FAD-binding  27.71 
 
 
535 aa  65.9  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.570475 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2566  FAD-dependent oxidoreductase  23.9 
 
 
555 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0279  geranylgeranyl reductase  29.35 
 
 
424 aa  66.2  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3043  geranylgeranyl reductase  25.38 
 
 
376 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.483009 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6470  monooxygenase, FAD-binding  25.79 
 
 
586 aa  65.1  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.71496  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1505  2-octaprenyl-6-methoxyphenyl hydroxylase  24.17 
 
 
419 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0417  monooxygenase FAD-binding  29.67 
 
 
501 aa  65.1  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.969537  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3216  FAD-dependent oxidoreductase  25.81 
 
 
553 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3231  FAD-dependent oxidoreductase  25.81 
 
 
553 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0786  FAD-dependent oxidoreductase  23.9 
 
 
553 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1395  FAD-dependent oxidoreductase  25.53 
 
 
553 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3177  FAD-dependent oxidoreductase  25.81 
 
 
553 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1649  hypothetical protein  24.93 
 
 
497 aa  64.7  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.256973  normal  0.216495 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0777  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  27.68 
 
 
391 aa  64.7  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000759163  normal  0.821116 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4142  monooxygenase, FAD-binding  30.88 
 
 
546 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.372966  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1850  hypothetical protein  26.36 
 
 
497 aa  63.9  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.790198 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1532  2-octaprenyl-6-methoxyphenyl hydroxylase  24.17 
 
 
419 aa  63.9  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.367837 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0334  FAD-dependent oxidoreductase  24.84 
 
 
553 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7215  FAD-dependent oxidoreductase  23.25 
 
 
569 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0817  FAD-dependent oxidoreductase  24.84 
 
 
553 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0834776  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1656  hypothetical protein  28.92 
 
 
508 aa  63.9  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.652016  normal  0.325297 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9228  hypothetical protein  28.75 
 
 
504 aa  63.5  0.000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.187294  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3910  FAD-dependent oxidoreductase  24.45 
 
 
550 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0725  monooxygenase FAD-binding  26.92 
 
 
571 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.490959  normal  0.227588 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1564  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  27.56 
 
 
391 aa  63.2  0.000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0892208  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0730  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  25.77 
 
 
391 aa  63.2  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.11675  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1463  monooxygenase FAD-binding  24.04 
 
 
598 aa  62.8  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0716  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  27.4 
 
 
391 aa  62.4  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000335906  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3293  monooxygenase FAD-binding  27.3 
 
 
486 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247977  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2196  monooxygenase, FAD-binding  25.29 
 
 
503 aa  62.4  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3025  monooxygenase FAD-binding  26.9 
 
 
574 aa  62  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.114894  normal  0.0108713 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>