More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_6078 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_6078  hypothetical protein  100 
 
 		 421 aa  857    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.25348  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2982  hypothetical protein  69.06 
 
 		 419 aa  560  1e-158  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.402878  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2327  hypothetical protein  71.82 
 
 		 414 aa  550  1e-155  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0143705  normal  0.574012 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1503  hypothetical protein  58.54 
 
 		 405 aa  449  1e-125  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1429  hypothetical protein  57.32 
 
 		 405 aa  447  1.0000000000000001e-124  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.834024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3170  hypothetical protein  54.32 
 
 		 406 aa  433  1e-120  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.161745 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1366  hypothetical protein  52.14 
 
 		 418 aa  427  1e-118  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.496364 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2174  hypothetical protein  50.98 
 
 		 405 aa  398  9.999999999999999e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.825478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1655  hypothetical protein  47.65 
 
 		 419 aa  389  1e-107  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.151005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2320  hypothetical protein  46.1 
 
 		 421 aa  363  3e-99  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00330  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  47.26 
 
 		 405 aa  356  2.9999999999999997e-97  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2901  hypothetical protein  40.71 
 
 		 521 aa  343  5e-93  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0623331  normal  0.318501 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0456  hypothetical protein  47.92 
 
 		 400 aa  337  1.9999999999999998e-91  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.558276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3289  monooxygenase FAD-binding protein  48 
 
 		 405 aa  337  1.9999999999999998e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158471  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2410  monooxygenase FAD-binding protein  45.12 
 
 		 408 aa  337  2.9999999999999997e-91  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.262762  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2386  monooxygenase FAD-binding protein  46.75 
 
 		 412 aa  335  9e-91  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.611075  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1983  hypothetical protein  46.8 
 
 		 431 aa  333  3e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.564684 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2848  monooxygenase FAD-binding  47.19 
 
 		 404 aa  329  6e-89  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1898  monooxygenase FAD-binding protein  46.02 
 
 		 391 aa  322  9.000000000000001e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.305388 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3035  hypothetical protein  44.56 
 
 		 399 aa  318  7.999999999999999e-86  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11769  hypothetical protein  43.39 
 
 		 460 aa  315  9.999999999999999e-85  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.196079  hitchhiker  0.00000209473 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0437  hypothetical protein  43.07 
 
 		 423 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6010  monooxygenase FAD-binding  45.48 
 
 		 410 aa  310  4e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0442  hypothetical protein  43.39 
 
 		 425 aa  306  3e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2049  hypothetical protein  40.98 
 
 		 409 aa  301  1e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.961619  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0506  hypothetical protein  44.83 
 
 		 420 aa  300  4e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3882  monooxygenase FAD-binding protein  40.33 
 
 		 410 aa  296  3e-79  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1232  monooxygenase FAD-binding protein  45.36 
 
 		 417 aa  295  1e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0108745 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5898  monooxygenase FAD-binding protein  45.21 
 
 		 408 aa  294  2e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.106816 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09000  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  45.21 
 
 		 416 aa  294  2e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0304  hypothetical protein  41.25 
 
 		 415 aa  280  3e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.605002  normal  0.180027 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1565  hypothetical protein  43.73 
 
 		 423 aa  278  1e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.000000103303  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1606  monooxygenase FAD-binding protein  41.44 
 
 		 413 aa  274  2.0000000000000002e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0134367  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2633  monooxygenase FAD-binding protein  41.46 
 
 		 415 aa  268  1e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.835252  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3557  monooxygenase FAD-binding protein  46.13 
 
 		 383 aa  222  9.999999999999999e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3972  monooxygenase FAD-binding  35.84 
 
 		 416 aa  205  1e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0762736  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0075  hypothetical protein  32.82 
 
 		 404 aa  176  7e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1747  hypothetical protein  34.52 
 
 		 419 aa  155  1e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0945012 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3774  monooxygenase, FAD-binding  30.52 
 
 		 397 aa  103  7e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.343223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3896  monooxygenase FAD-binding protein  29.01 
 
 		 537 aa  98.2  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.228643 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5384  monooxygenase FAD-binding  27.59 
 
 		 506 aa  92.4  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.297257  normal  0.119449 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1344  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  29.18 
 
 		 561 aa  92.8  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.430096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04210  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  27.45 
 
 		 510 aa  91.3  3e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3055  monooxygenase FAD-binding  34.03 
 
 		 408 aa  89  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3079  monooxygenase FAD-binding protein  29.81 
 
 		 503 aa  86.3  9e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.591797  normal  0.0830218 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0090  hypothetical protein  28.7 
 
 		 497 aa  81.3  0.00000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6603  monooxygenase FAD-binding protein  27.48 
 
 		 400 aa  80.1  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.145948  normal  0.349109 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2807  monooxygenase FAD-binding  27.96 
 
 		 417 aa  79.7  0.00000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.461648  normal  0.985986 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1216  hypothetical protein  29.86 
 
 		 486 aa  79.3  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.795806  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3345  monooxygenase FAD-binding  28.61 
 
 		 505 aa  79.3  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.527889 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1395  FAD-dependent oxidoreductase  27.48 
 
 		 553 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3790  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  26.4 
 
 		 568 aa  78.2  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.829218 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3786  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  26.4 
 
 		 573 aa  78.2  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1676  monooxygenase FAD-binding protein  27.71 
 
 		 481 aa  77.8  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00000910554  normal  0.199479 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3859  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  26.4 
 
 		 573 aa  78.2  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0750  monooxygenase FAD-binding protein  29.61 
 
 		 485 aa  77.8  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9228  hypothetical protein  28.12 
 
 		 504 aa  77.4  0.0000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.187294  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0698  FAD-dependent oxidoreductase  27.38 
 
 		 555 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3045  monooxygenase, FAD-binding  26.22 
 
 		 600 aa  77  0.0000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000523244  unclonable  0.000000929922 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3910  FAD-dependent oxidoreductase  26.01 
 
 		 550 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2055  monooxygenase, FAD-binding  29.13 
 
 		 486 aa  76.6  0.0000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3231  FAD-dependent oxidoreductase  27.89 
 
 		 553 aa  76.3  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3177  FAD-dependent oxidoreductase  27.89 
 
 		 553 aa  76.3  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3216  FAD-dependent oxidoreductase  27.89 
 
 		 553 aa  76.3  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1850  hypothetical protein  27.06 
 
 		 497 aa  76.3  0.0000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.790198 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04530  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  27.37 
 
 		 457 aa  75.9  0.000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.722855  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0715  FAD-dependent oxidoreductase  27.38 
 
 		 558 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.520934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4529  FAD-dependent oxidoreductase  29.38 
 
 		 559 aa  75.1  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.609398  normal  0.38599 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0270  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  25.14 
 
 		 618 aa  75.1  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.385681  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4535  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  26.16 
 
 		 615 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4661  FAD-dependent oxidoreductase  29.38 
 
 		 559 aa  75.1  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.135002 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0411  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  26.04 
 
 		 554 aa  74.7  0.000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0836277  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0371  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  26.04 
 
 		 554 aa  74.7  0.000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000897196  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3278  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  26.04 
 
 		 554 aa  74.7  0.000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0146118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2401  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  25.19 
 
 		 569 aa  74.7  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3259  monooxygenase FAD-binding protein  25.07 
 
 		 554 aa  74.3  0.000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.257115  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0378  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  25.76 
 
 		 554 aa  73.9  0.000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0214512  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00301  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  25.07 
 
 		 554 aa  73.9  0.000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00155662  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2566  FAD-dependent oxidoreductase  26.46 
 
 		 555 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00305  hypothetical protein  25.07 
 
 		 554 aa  73.9  0.000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00161031  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7215  FAD-dependent oxidoreductase  25.21 
 
 		 569 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2685  FAD-dependent oxidoreductase  27.61 
 
 		 553 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2059  FAD-dependent oxidoreductase  27.61 
 
 		 553 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0853  FAD-dependent oxidoreductase  27.61 
 
 		 553 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1924  FAD-dependent oxidoreductase  27.61 
 
 		 553 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.421754  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0786  FAD-dependent oxidoreductase  27.38 
 
 		 553 aa  73.2  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0623  monooxygenase FAD-binding  24.54 
 
 		 533 aa  72.8  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1484  hypothetical protein  26.36 
 
 		 499 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.115631  normal  0.323666 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0161  monooxygenase FAD-binding protein  30.5 
 
 		 493 aa  72.8  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0334  FAD-dependent oxidoreductase  27.09 
 
 		 553 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2163  2-octaprenyl-6-methoxyphenyl hydroxylase  26.46 
 
 		 402 aa  72.8  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.260088  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1940  monooxygenase, FAD-binding  28.12 
 
 		 489 aa  72.8  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0817  FAD-dependent oxidoreductase  27.09 
 
 		 553 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0834776  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0422  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  24.79 
 
 		 554 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1649  hypothetical protein  27.58 
 
 		 497 aa  72  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.256973  normal  0.216495 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1172  monooxygenase, FAD-binding  26.44 
 
 		 535 aa  72.4  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.570475 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1463  monooxygenase FAD-binding  25.28 
 
 		 598 aa  71.6  0.00000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0291  FAD-dependent oxidoreductase  26.65 
 
 		 545 aa  71.2  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.339644  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08756  phenol monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03030)  32.67 
 
 		 693 aa  71.2  0.00000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2645  FAD-binding monooxygenase, PheA/TfdB family  25.21 
 
 		 529 aa  70.9  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0393426  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>