More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0545 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0545  oxidoreductase protein  100 
 
 		 398 aa  791    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.309598  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0440  monooxygenase FAD-binding  81.46 
 
 		 386 aa  574  1.0000000000000001e-163  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0943043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0427  monooxygenase FAD-binding  81.53 
 
 		 402 aa  570  1e-161  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.12804  hitchhiker  0.0000412039 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2964  monooxygenase FAD-binding  38.9 
 
 		 422 aa  188  1e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000808449 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1535  monooxygenase, FAD-binding  36.44 
 
 		 422 aa  160  3e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.859227 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3613  monooxygenase, FAD-binding  36.75 
 
 		 390 aa  159  6e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.210857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01733  oxidoreductase  37.67 
 
 		 267 aa  116  6.9999999999999995e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3466  monooxygenase, FAD-binding  30.72 
 
 		 417 aa  110  3e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.185468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1784  monooxygenase, FAD-binding  30.53 
 
 		 410 aa  106  9e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5557  FAD-dependent oxidoreductase  31.61 
 
 		 367 aa  97.4  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.633311 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2369  monooxygenase FAD-binding protein  32.25 
 
 		 371 aa  90.9  4e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2257  hypothetical protein  28.37 
 
 		 378 aa  85.9  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.472155 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3565  monooxygenase FAD-binding  28.31 
 
 		 384 aa  85.5  0.000000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5727  monooxygenase, FAD-binding  28.87 
 
 		 364 aa  84  0.000000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4393  monooxygenase FAD-binding  29.01 
 
 		 377 aa  84  0.000000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2848  monooxygenase FAD-binding  30.09 
 
 		 404 aa  84  0.000000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0712  hypothetical protein  25.91 
 
 		 371 aa  83.2  0.000000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5348  monooxygenase, FAD-binding protein  28.57 
 
 		 360 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.437085  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5437  monooxygenase, FAD-binding  28.57 
 
 		 364 aa  82.8  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.863729 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2393  hypothetical protein  27.68 
 
 		 376 aa  81.3  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.142228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0546  monooxygenase, FAD-binding  30.52 
 
 		 373 aa  81.3  0.00000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0859  hypothetical protein  24.63 
 
 		 376 aa  80.5  0.00000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3284  monooxygenase FAD-binding protein  27.99 
 
 		 393 aa  80.1  0.00000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.289154 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1987  hypothetical protein  23.24 
 
 		 377 aa  79  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000746962  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2656  putative salicylate hydroxylase (salicylate 1-monooxygenase)  28.81 
 
 		 391 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1193  monooxygenase, FAD-binding  28.81 
 
 		 390 aa  79  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.155257  normal  0.524756 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1313  monooxygenase, FAD-binding  28.81 
 
 		 391 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01380  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  28.96 
 
 		 378 aa  77.8  0.0000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2318  monooxygenase FAD-binding  26.6 
 
 		 385 aa  77.8  0.0000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.694664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0809  monooxygenase, FAD-binding  26.27 
 
 		 396 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.815643  normal  0.21546 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3170  hypothetical protein  29.18 
 
 		 406 aa  77.8  0.0000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.161745 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5278  monooxygenase, FAD-binding  26.63 
 
 		 395 aa  77.4  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.630865 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1969  hypothetical protein  23.31 
 
 		 377 aa  77  0.0000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0438709  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1655  hypothetical protein  27.62 
 
 		 419 aa  75.9  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.151005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1561  hypothetical protein  26.04 
 
 		 377 aa  75.9  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2174  hypothetical protein  29.5 
 
 		 405 aa  74.3  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.825478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2160  monooxygenase FAD-binding  28.93 
 
 		 395 aa  74.3  0.000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6010  monooxygenase FAD-binding  31.13 
 
 		 410 aa  73.9  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2005  hypothetical protein  21.3 
 
 		 377 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00436005  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2242  hypothetical protein  27.88 
 
 		 379 aa  73.6  0.000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00330  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  29.23 
 
 		 405 aa  73.2  0.000000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19150  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  30.73 
 
 		 351 aa  72  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0319604  normal  0.370849 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0813  monooxygenase, FAD-binding  26.91 
 
 		 377 aa  72  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0229  monooxygenase FAD-binding  28.42 
 
 		 409 aa  71.2  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.297351 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0213  salicylate 1-monooxygenase (NahW)  26.36 
 
 		 403 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00584161  normal  0.918812 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6537  monooxygenase, FAD-binding protein  27.14 
 
 		 392 aa  70.9  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0203356  normal  0.0154804 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1898  monooxygenase FAD-binding protein  28.24 
 
 		 391 aa  70.9  0.00000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.305388 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5812  monooxygenase, FAD-binding protein  26.79 
 
 		 408 aa  70.9  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0698086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1486  monooxygenase FAD-binding protein  27.32 
 
 		 408 aa  70.9  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.528879  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0456  hypothetical protein  30.99 
 
 		 400 aa  70.5  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.558276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0304  hypothetical protein  29.25 
 
 		 415 aa  70.5  0.00000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.605002  normal  0.180027 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2962  monooxygenase FAD-binding protein  26.19 
 
 		 397 aa  70.5  0.00000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21010  putative FAD-dependent monooxygenase  28.61 
 
 		 388 aa  70.1  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.12929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3960  monooxygenase, FAD-binding  29.94 
 
 		 388 aa  70.5  0.00000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1889  hypothetical protein  23.38 
 
 		 374 aa  69.7  0.0000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4581  monooxygenase FAD-binding protein  28.44 
 
 		 399 aa  69.3  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.626069 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1684  monooxygenase, FAD-binding  27.22 
 
 		 373 aa  69.3  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.750023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2320  hypothetical protein  25.65 
 
 		 421 aa  69.3  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4378  monooxygenase FAD-binding  28.23 
 
 		 420 aa  69.3  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.760367 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3289  monooxygenase FAD-binding protein  28.81 
 
 		 405 aa  68.9  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2386  monooxygenase FAD-binding protein  28.25 
 
 		 412 aa  68.6  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.611075  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3466  monooxygenase, FAD-binding  25.77 
 
 		 392 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5319  monooxygenase FAD-binding protein  26.19 
 
 		 390 aa  68.2  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5386  monooxygenase FAD-binding  25.77 
 
 		 392 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.336288 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4900  monooxygenase, FAD-binding  25.77 
 
 		 392 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.99121 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2514  monooxygenase FAD-binding protein  27.97 
 
 		 391 aa  68.6  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2230  hypothetical protein  21.58 
 
 		 377 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000757274  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11769  hypothetical protein  27.3 
 
 		 460 aa  68.2  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.196079  hitchhiker  0.00000209473 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0338  monooxygenase FAD-binding  26.76 
 
 		 372 aa  68.2  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2480  monooxygenase FAD-binding  29.34 
 
 		 395 aa  68.2  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4828  hypothetical protein  27.68 
 
 		 376 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.454319 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2526  salicylate 1-monooxygenase  26.25 
 
 		 396 aa  67  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.066083 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1885  putative salicylate hydroxylase  29.12 
 
 		 389 aa  67  0.0000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.122899  normal  0.226674 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0437  hypothetical protein  26.51 
 
 		 423 aa  67  0.0000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0506  hypothetical protein  25.75 
 
 		 420 aa  66.6  0.0000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5490  hypothetical protein  25.56 
 
 		 376 aa  67  0.0000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.263569  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1542  monooxygenase FAD-binding protein  23.96 
 
 		 374 aa  66.6  0.0000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0929471  normal  0.228138 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0307  FAD dependent oxidoreductase  29.65 
 
 		 378 aa  66.6  0.0000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000823237 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4971  monooxygenase FAD-binding  28.57 
 
 		 384 aa  65.9  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.415719  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2552  monooxygenase FAD-binding protein  25.61 
 
 		 376 aa  65.9  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4891  monooxygenase, FAD-binding  28.98 
 
 		 402 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.292821 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2901  hypothetical protein  28.72 
 
 		 521 aa  66.2  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0623331  normal  0.318501 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0442  hypothetical protein  30.43 
 
 		 425 aa  66.2  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1893  monooxygenase, FAD-binding  25 
 
 		 382 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3579  monooxygenase FAD-binding  25.36 
 
 		 382 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.817981 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0075  hypothetical protein  24.88 
 
 		 404 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0310  monooxygenase FAD-binding protein  25.17 
 
 		 309 aa  64.3  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0496808  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4129  monooxygenase FAD-binding protein  28.96 
 
 		 421 aa  64.3  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3882  monooxygenase FAD-binding protein  24.65 
 
 		 410 aa  64.3  0.000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5898  monooxygenase FAD-binding protein  26.79 
 
 		 408 aa  64.3  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.106816 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2527  monooxygenase FAD-binding protein  27.42 
 
 		 388 aa  63.9  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.172814 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0096  monooxygenase FAD-binding  26.51 
 
 		 388 aa  63.2  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0544698 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2049  hypothetical protein  26.97 
 
 		 409 aa  62.8  0.000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.961619  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3294  monooxygenase FAD-binding protein  26.37 
 
 		 388 aa  62.8  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0802651  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2203  monooxygenase FAD-binding  28.94 
 
 		 395 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2410  monooxygenase FAD-binding protein  26.3 
 
 		 408 aa  62.4  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.262762  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2710  monooxygenase FAD-binding  25.55 
 
 		 392 aa  62.4  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0896  monooxygenase, FAD-binding  28.61 
 
 		 389 aa  62.8  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2116  monooxygenase FAD-binding protein  23.41 
 
 		 384 aa  62.8  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.400145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2957  monooxygenase FAD-binding  24.57 
 
 		 372 aa  62.4  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575675  hitchhiker  0.00000079656 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>