More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3168 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_3168  monooxygenase, FAD-binding  100 
 
 
395 aa  754    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.138678 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3393  monooxygenase FAD-binding  91.18 
 
 
395 aa  643    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.529657  normal  0.469317 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2514  monooxygenase FAD-binding protein  42.5 
 
 
391 aa  276  4e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5319  monooxygenase FAD-binding protein  36.32 
 
 
390 aa  176  9e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0096  monooxygenase FAD-binding  34.64 
 
 
388 aa  164  4.0000000000000004e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0544698 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0778  monooxygenase FAD-binding  37.35 
 
 
393 aa  151  1e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0373747  decreased coverage  0.000456942 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1561  monooxygenase FAD-binding  36.36 
 
 
392 aa  140  4.999999999999999e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0688558  normal  0.0725424 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2527  monooxygenase FAD-binding protein  33.86 
 
 
388 aa  138  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.172814 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0229  monooxygenase FAD-binding  33.97 
 
 
409 aa  137  2e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.297351 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5557  FAD-dependent oxidoreductase  33.77 
 
 
367 aa  137  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.633311 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01380  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  35.54 
 
 
378 aa  135  9.999999999999999e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2621  monooxygenase, FAD-binding  33.43 
 
 
388 aa  134  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.684205  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3960  monooxygenase, FAD-binding  37.54 
 
 
388 aa  133  5e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2701  monooxygenase FAD-binding protein  38.42 
 
 
377 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0307  FAD dependent oxidoreductase  37.8 
 
 
378 aa  127  3e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000823237 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3328  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  35.01 
 
 
407 aa  125  1e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.150159  normal  0.347251 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2257  hypothetical protein  30.23 
 
 
378 aa  124  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.472155 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3561  monooxygenase, FAD-binding protein  36 
 
 
389 aa  124  3e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.014092  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3634  monooxygenase, FAD-binding  36 
 
 
389 aa  124  3e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.231418  normal  0.598375 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0392  monooxygenase FAD-binding protein  34.52 
 
 
383 aa  122  8e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.890611  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1093  monooxygenase FAD-binding  32.89 
 
 
408 aa  122  9e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0291534  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0019  monooxygenase FAD-binding protein  32.56 
 
 
384 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0991  salicylate 1-monooxygenase  29.07 
 
 
397 aa  120  6e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0622996  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2005  hypothetical protein  25.77 
 
 
377 aa  116  7.999999999999999e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00436005  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3566  monooxygenase, FAD-binding  34.46 
 
 
389 aa  116  7.999999999999999e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.411114  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2611  putative FAD-dependent monooxygenase  32.32 
 
 
382 aa  113  7.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.172271  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1889  hypothetical protein  23.19 
 
 
374 aa  111  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7785  FAD-dependent oxidoreductase  30.44 
 
 
425 aa  111  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.786204  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19150  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  32.26 
 
 
351 aa  110  3e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0319604  normal  0.370849 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2710  monooxygenase FAD-binding  25.59 
 
 
392 aa  110  4.0000000000000004e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2962  monooxygenase FAD-binding protein  30.6 
 
 
397 aa  110  6e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30630  putative FAD-dependent monooxygenase  31.68 
 
 
382 aa  110  6e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0241073 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0923  monooxygenase FAD-binding  30.43 
 
 
412 aa  108  2e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.264093 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2369  monooxygenase FAD-binding protein  34.74 
 
 
371 aa  107  3e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4211  monooxygenase, FAD-binding  33.14 
 
 
382 aa  107  5e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.815591  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4002  monooxygenase FAD-binding  26.6 
 
 
376 aa  106  7e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1784  monooxygenase, FAD-binding  28.88 
 
 
410 aa  106  7e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5237  putative salicylate 1-monooxygenase  32.94 
 
 
399 aa  105  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.192496 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3957  monooxygenase FAD-binding  26.6 
 
 
376 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1542  monooxygenase FAD-binding protein  29.48 
 
 
374 aa  104  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0929471  normal  0.228138 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2230  hypothetical protein  24.35 
 
 
377 aa  103  4e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000757274  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2526  salicylate 1-monooxygenase  32.24 
 
 
396 aa  103  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.066083 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3149  salicylate 1-monooxygenase  32.52 
 
 
398 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.136472  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3565  monooxygenase FAD-binding  28.57 
 
 
384 aa  101  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1987  hypothetical protein  24.14 
 
 
377 aa  100  6e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000746962  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2182  monooxygenase, FAD-binding  30.94 
 
 
412 aa  100  7e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0809  monooxygenase, FAD-binding  31.58 
 
 
396 aa  99.4  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.815643  normal  0.21546 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2131  salicylate 1-monooxygenase  32.55 
 
 
400 aa  99  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1969  hypothetical protein  23.08 
 
 
377 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0438709  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5335  FAD-dependent monooxygenase  33.62 
 
 
378 aa  98.6  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103313  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1633  monooxygenase FAD-binding  30.29 
 
 
410 aa  97.4  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.719976  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2318  monooxygenase FAD-binding  29.22 
 
 
385 aa  97.4  4e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.694664  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1885  putative salicylate hydroxylase  32.21 
 
 
389 aa  97.1  5e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.122899  normal  0.226674 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4602  monooxygenase FAD-binding  33.68 
 
 
382 aa  96.3  8e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.296431  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1762  monooxygenase FAD-binding  28.86 
 
 
384 aa  95.5  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.638414  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1528  monooxygenase FAD-binding  28.93 
 
 
362 aa  94.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.392805  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1313  monooxygenase, FAD-binding  32.16 
 
 
391 aa  94.4  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2656  putative salicylate hydroxylase (salicylate 1-monooxygenase)  32.16 
 
 
391 aa  94.4  3e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0813  monooxygenase, FAD-binding  28.91 
 
 
377 aa  94.4  3e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5386  monooxygenase FAD-binding  31.72 
 
 
392 aa  94.4  4e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.336288 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1193  monooxygenase, FAD-binding  31.89 
 
 
390 aa  93.6  6e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.155257  normal  0.524756 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2584  monooxygenase, FAD-binding  31.41 
 
 
400 aa  92.8  8e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.613825  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2455  putative monooxygenase (putative secreted protein)  31.35 
 
 
393 aa  92.8  9e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1117  monooxygenase, FAD-binding  30.65 
 
 
399 aa  92.4  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2372  hypothetical protein  22.34 
 
 
374 aa  91.7  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2329  hypothetical protein  22.34 
 
 
374 aa  91.7  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21010  putative FAD-dependent monooxygenase  29.75 
 
 
388 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.12929  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5278  monooxygenase, FAD-binding  29.4 
 
 
395 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.630865 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0338  monooxygenase FAD-binding  28.08 
 
 
372 aa  91.3  3e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2304  monooxygenase FAD-binding  30.08 
 
 
340 aa  90.9  4e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5490  hypothetical protein  28.84 
 
 
376 aa  90.9  4e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.263569  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3466  monooxygenase, FAD-binding  31.42 
 
 
392 aa  90.9  4e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4900  monooxygenase, FAD-binding  31.42 
 
 
392 aa  90.9  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.99121 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0052  monooxygenase, FAD-binding  28.39 
 
 
413 aa  90.5  5e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4355  hypothetical protein  30.59 
 
 
421 aa  90.1  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0233973  normal  0.534906 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4042  monooxygenase, FAD-binding  29.6 
 
 
343 aa  90.1  7e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2657  monooxygenase, FAD-binding  31.79 
 
 
377 aa  89.7  8e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.751067  normal  0.222603 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0982  monooxygenase FAD-binding  30.75 
 
 
399 aa  89.7  8e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0183396 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5387  hypothetical protein  29.14 
 
 
420 aa  89  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1022  salicylate 1-monooxygenase  29.35 
 
 
391 aa  89  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4207  salicylate 1-monooxygenase  32.34 
 
 
406 aa  88.2  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.880254  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5437  monooxygenase, FAD-binding  26.87 
 
 
364 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.863729 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4439  salicylate hydroxylase  28.41 
 
 
402 aa  87.8  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0982291  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2393  hypothetical protein  30.59 
 
 
376 aa  87.8  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.142228  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0881  hypothetical protein  30.21 
 
 
402 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.200049  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1886  salicylate hydroxylase  29.17 
 
 
402 aa  87.8  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.499924 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2480  monooxygenase FAD-binding  31.99 
 
 
395 aa  87.4  4e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1565  monooxygenase FAD-binding  28.72 
 
 
384 aa  87.4  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.156985 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3231  monooxygenase FAD-binding  33.42 
 
 
400 aa  87  5e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3371  salicylate hydroxylase  27.73 
 
 
402 aa  86.7  6e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0591709  normal  0.3753 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0859  hypothetical protein  25.75 
 
 
376 aa  86.7  7e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5727  monooxygenase, FAD-binding  26.59 
 
 
364 aa  86.3  8e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09400  hypothetical protein  30.21 
 
 
402 aa  86.3  9e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4033  monooxygenase FAD-binding  28.97 
 
 
404 aa  86.3  9e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.115519 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56402  Salicylate hydroxylase (Salicylate 1-monooxygenase)  26.78 
 
 
426 aa  85.1  0.000000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.476468  normal  0.198075 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5348  monooxygenase, FAD-binding protein  26.61 
 
 
360 aa  85.5  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.437085  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6277  monooxygenase FAD-binding  27.44 
 
 
405 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.146167  normal  0.672282 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3836  monooxygenase FAD-binding  30.77 
 
 
351 aa  84.7  0.000000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3579  monooxygenase FAD-binding  28.95 
 
 
382 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.817981 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0213  salicylate 1-monooxygenase (NahW)  28.38 
 
 
403 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00584161  normal  0.918812 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>