More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2455 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_2455  putative monooxygenase (putative secreted protein)  100 
 
 
393 aa  765    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0096  monooxygenase FAD-binding  41.45 
 
 
388 aa  278  2e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0544698 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2701  monooxygenase FAD-binding protein  48.04 
 
 
377 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7785  FAD-dependent oxidoreductase  39.91 
 
 
425 aa  271  2e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.786204  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2527  monooxygenase FAD-binding protein  42.67 
 
 
388 aa  263  3e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.172814 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0019  monooxygenase FAD-binding protein  42.2 
 
 
384 aa  236  7e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5557  FAD-dependent oxidoreductase  42.98 
 
 
367 aa  221  9.999999999999999e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.633311 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0229  monooxygenase FAD-binding  40.84 
 
 
409 aa  215  9.999999999999999e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.297351 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5319  monooxygenase FAD-binding protein  35.18 
 
 
390 aa  202  6e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0307  FAD dependent oxidoreductase  38.19 
 
 
378 aa  177  4e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000823237 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2257  hypothetical protein  29.67 
 
 
378 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.472155 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0778  monooxygenase FAD-binding  34.33 
 
 
393 aa  162  1e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0373747  decreased coverage  0.000456942 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19150  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  39.51 
 
 
351 aa  159  1e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0319604  normal  0.370849 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01380  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  36.03 
 
 
378 aa  155  2e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4211  monooxygenase, FAD-binding  34.55 
 
 
382 aa  154  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.815591  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2005  hypothetical protein  25.75 
 
 
377 aa  149  9e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00436005  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1561  monooxygenase FAD-binding  34.44 
 
 
392 aa  147  3e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0688558  normal  0.0725424 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2230  hypothetical protein  26.84 
 
 
377 aa  143  6e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000757274  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1969  hypothetical protein  25.85 
 
 
377 aa  143  6e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0438709  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1987  hypothetical protein  25.42 
 
 
377 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000746962  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2621  monooxygenase, FAD-binding  32.9 
 
 
388 aa  138  2e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.684205  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2369  monooxygenase FAD-binding protein  38.85 
 
 
371 aa  137  2e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3960  monooxygenase, FAD-binding  36.47 
 
 
388 aa  136  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1889  hypothetical protein  26.91 
 
 
374 aa  134  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0991  salicylate 1-monooxygenase  29.8 
 
 
397 aa  133  5e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0622996  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2514  monooxygenase FAD-binding protein  33.57 
 
 
391 aa  133  6e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3566  monooxygenase, FAD-binding  36.31 
 
 
389 aa  131  3e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.411114  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0392  monooxygenase FAD-binding protein  32.77 
 
 
383 aa  130  5.0000000000000004e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.890611  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1093  monooxygenase FAD-binding  32.08 
 
 
408 aa  128  1.0000000000000001e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0291534  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2393  hypothetical protein  32.58 
 
 
376 aa  129  1.0000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.142228  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3561  monooxygenase, FAD-binding protein  36.01 
 
 
389 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.014092  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3634  monooxygenase, FAD-binding  36.01 
 
 
389 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.231418  normal  0.598375 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2526  salicylate 1-monooxygenase  32.31 
 
 
396 aa  125  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.066083 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4002  monooxygenase FAD-binding  28.73 
 
 
376 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3565  monooxygenase FAD-binding  29.05 
 
 
384 aa  124  3e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3957  monooxygenase FAD-binding  28.45 
 
 
376 aa  124  4e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0712  hypothetical protein  30.35 
 
 
371 aa  123  5e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5727  monooxygenase, FAD-binding  28.61 
 
 
364 aa  123  5e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5437  monooxygenase, FAD-binding  28.61 
 
 
364 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.863729 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0982  monooxygenase FAD-binding  33.07 
 
 
399 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0183396 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1784  monooxygenase, FAD-binding  30.52 
 
 
410 aa  119  7.999999999999999e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5490  hypothetical protein  30.4 
 
 
376 aa  119  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.263569  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5348  monooxygenase, FAD-binding protein  28.29 
 
 
360 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.437085  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2710  monooxygenase FAD-binding  27.12 
 
 
392 aa  115  1.0000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2962  monooxygenase FAD-binding protein  29.01 
 
 
397 aa  115  1.0000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0809  monooxygenase, FAD-binding  30.9 
 
 
396 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.815643  normal  0.21546 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2318  monooxygenase FAD-binding  28.65 
 
 
385 aa  114  3e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.694664  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0213  salicylate 1-monooxygenase (NahW)  29.79 
 
 
403 aa  113  6e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00584161  normal  0.918812 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4828  hypothetical protein  29.44 
 
 
376 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.454319 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4602  monooxygenase FAD-binding  30.68 
 
 
382 aa  111  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.296431  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3328  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  33.72 
 
 
407 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.150159  normal  0.347251 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0813  monooxygenase, FAD-binding  29.75 
 
 
377 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0859  hypothetical protein  27.37 
 
 
376 aa  110  5e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0923  monooxygenase FAD-binding  32.24 
 
 
412 aa  110  6e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.264093 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2552  monooxygenase FAD-binding protein  31.09 
 
 
376 aa  109  8.000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2372  hypothetical protein  25.14 
 
 
374 aa  108  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3466  monooxygenase, FAD-binding  31.86 
 
 
392 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2329  hypothetical protein  25.14 
 
 
374 aa  108  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4900  monooxygenase, FAD-binding  31.86 
 
 
392 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.99121 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3162  monooxygenase FAD-binding  32.46 
 
 
387 aa  107  4e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2339  monooxygenase FAD-binding  29.59 
 
 
388 aa  107  5e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000167175  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5386  monooxygenase FAD-binding  32.04 
 
 
392 aa  107  5e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.336288 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4378  monooxygenase FAD-binding  29.35 
 
 
420 aa  106  7e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.760367 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5278  monooxygenase, FAD-binding  26.61 
 
 
395 aa  105  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.630865 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1561  hypothetical protein  30.9 
 
 
377 aa  105  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1542  monooxygenase FAD-binding protein  26.97 
 
 
374 aa  104  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0929471  normal  0.228138 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2304  monooxygenase FAD-binding  33.33 
 
 
340 aa  103  4e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4581  monooxygenase FAD-binding protein  28.95 
 
 
399 aa  103  4e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.626069 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6537  monooxygenase, FAD-binding protein  31.09 
 
 
392 aa  103  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0203356  normal  0.0154804 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4042  monooxygenase, FAD-binding  30.14 
 
 
343 aa  103  5e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0546  monooxygenase, FAD-binding  31.9 
 
 
373 aa  103  5e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3601  salicylate 1-monooxygenase  30.7 
 
 
402 aa  102  8e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.733205  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2311  monooxygenase FAD-binding  28.94 
 
 
383 aa  102  9e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3140  hypothetical protein  25.93 
 
 
376 aa  102  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1022  salicylate 1-monooxygenase  31.67 
 
 
391 aa  101  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2657  monooxygenase, FAD-binding  32.06 
 
 
377 aa  100  3e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.751067  normal  0.222603 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2656  putative salicylate hydroxylase (salicylate 1-monooxygenase)  30.87 
 
 
391 aa  101  3e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1313  monooxygenase, FAD-binding  30.87 
 
 
391 aa  101  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0125  monooxygenase FAD-binding  27.27 
 
 
374 aa  100  6e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0503  monooxygenase FAD-binding  32.8 
 
 
376 aa  99.4  9e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1193  monooxygenase, FAD-binding  31.48 
 
 
390 aa  99.4  9e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.155257  normal  0.524756 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4971  monooxygenase FAD-binding  31.66 
 
 
384 aa  99  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.415719  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5335  FAD-dependent monooxygenase  30.74 
 
 
378 aa  99.4  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103313  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1936  hypothetical protein  29.71 
 
 
376 aa  98.6  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3294  monooxygenase FAD-binding protein  29.75 
 
 
388 aa  98.2  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0802651  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3927  salicylate 1-monooxygenase  27.79 
 
 
385 aa  98.2  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.567277  normal  0.0279633 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1565  monooxygenase FAD-binding  30.6 
 
 
384 aa  97.1  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.156985 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3428  monooxygenase, FAD-binding  28.78 
 
 
372 aa  97.1  5e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1853  monooxygenase FAD-binding  28.32 
 
 
385 aa  97.1  5e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1110  monooxygenase FAD-binding  30.52 
 
 
389 aa  96.7  6e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.7504  normal  0.659993 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3547  hypothetical protein  31.63 
 
 
374 aa  96.7  6e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4129  monooxygenase FAD-binding protein  31.32 
 
 
421 aa  96.7  6e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3199  hypothetical protein  29.62 
 
 
374 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.3549  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2160  monooxygenase FAD-binding  34.96 
 
 
395 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21010  putative FAD-dependent monooxygenase  30.66 
 
 
388 aa  94  4e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.12929  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3168  monooxygenase, FAD-binding  33.33 
 
 
395 aa  94  4e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.138678 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2705  monooxygenase, FAD-binding protein  33.13 
 
 
423 aa  93.6  5e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.891359  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4040  salicylate 1-monooxygenase  29.77 
 
 
404 aa  92.8  9e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0481  salicylate 1-monooxygenase  30.28 
 
 
373 aa  92.8  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3393  monooxygenase FAD-binding  32.33 
 
 
395 aa  92.4  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.529657  normal  0.469317 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>