More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2548 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_2548  salicylate hydroxylase  100 
 
 		 221 aa  451  1.0000000000000001e-126  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1565  monooxygenase FAD-binding  53.05 
 
 		 384 aa  238  6.999999999999999e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.156985 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1762  monooxygenase FAD-binding  52.11 
 
 		 384 aa  234  7e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.638414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1110  monooxygenase FAD-binding  52.11 
 
 		 389 aa  224  1e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.7504  normal  0.659993 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0871  salicylate hydroxylase  41.55 
 
 		 422 aa  165  5.9999999999999996e-40  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0457769  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1117  monooxygenase, FAD-binding  41.12 
 
 		 399 aa  155  7e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0746  salicylate hydroxylase  40.62 
 
 		 401 aa  153  2e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0740  salicylate hydroxylase  40.62 
 
 		 401 aa  153  2e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2546  salicylate hydroxylase  41.96 
 
 		 408 aa  151  7e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.766677  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2182  monooxygenase, FAD-binding  36.77 
 
 		 412 aa  122  3e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0991  salicylate 1-monooxygenase  34.96 
 
 		 397 aa  117  9.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0622996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3311  monooxygenase, FAD-binding  35.11 
 
 		 401 aa  114  7.999999999999999e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3149  salicylate 1-monooxygenase  35.32 
 
 		 398 aa  114  8.999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.136472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5237  putative salicylate 1-monooxygenase  35.59 
 
 		 399 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.192496 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1885  putative salicylate hydroxylase  37.1 
 
 		 389 aa  113  2.0000000000000002e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.122899  normal  0.226674 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2131  salicylate 1-monooxygenase  35.4 
 
 		 400 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3662  monooxygenase, FAD-binding  32.73 
 
 		 395 aa  111  7.000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.555838  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0982  monooxygenase FAD-binding  36.16 
 
 		 399 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0183396 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3231  monooxygenase FAD-binding  34.58 
 
 		 400 aa  108  8.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3292  salicylate 1-monooxygenase  34.38 
 
 		 404 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0110847 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2584  monooxygenase, FAD-binding  35.43 
 
 		 400 aa  107  2e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.613825  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3920  monooxygenase FAD-binding  34.82 
 
 		 397 aa  106  3e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0588  monooxygenase FAD-binding  33.33 
 
 		 397 aa  105  7e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.395887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3023  monooxygenase, FAD-binding  33.77 
 
 		 425 aa  104  1e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.367896  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2480  monooxygenase FAD-binding  33.33 
 
 		 395 aa  103  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1154  monooxygenase, FAD-binding  36.16 
 
 		 412 aa  103  2e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1067  monooxygenase FAD-binding  35.45 
 
 		 414 aa  100  2e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.265786  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0896  monooxygenase, FAD-binding  31.05 
 
 		 389 aa  99.8  3e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1146  monooxygenase, FAD-binding  34.09 
 
 		 414 aa  99.4  4e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.263204  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0355  salicylate hydroxylase  32.88 
 
 		 427 aa  99  5e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3591  salicylate 1-monooxygenase  33.63 
 
 		 398 aa  98.2  8e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.331421 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1022  salicylate 1-monooxygenase  33.18 
 
 		 391 aa  97.4  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1345  monooxygenase, FAD-binding  34.65 
 
 		 444 aa  95.1  7e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0367059 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2680  monooxygenase, FAD-binding  34.07 
 
 		 384 aa  95.1  7e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.156834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5419  salicylate 1-monooxygenase  33.03 
 
 		 395 aa  95.1  8e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00608306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0213  salicylate 1-monooxygenase (NahW)  31.51 
 
 		 403 aa  93.2  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00584161  normal  0.918812 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6758  monooxygenase FAD-binding  34.91 
 
 		 406 aa  92.8  4e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.242699  normal  0.115846 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2203  monooxygenase FAD-binding  33.81 
 
 		 395 aa  92.8  4e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2160  monooxygenase FAD-binding  33.33 
 
 		 395 aa  92.4  5e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4207  salicylate 1-monooxygenase  33.95 
 
 		 406 aa  92.4  5e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.880254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1633  monooxygenase FAD-binding  30.36 
 
 		 410 aa  92.4  5e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.719976  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2526  salicylate 1-monooxygenase  30.65 
 
 		 396 aa  92  7e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.066083 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0762  monooxygenase FAD-binding  31.9 
 
 		 421 aa  91.3  1e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00121092 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1445  monooxygenase FAD-binding  32.88 
 
 		 394 aa  91.3  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0546  monooxygenase, FAD-binding  34.25 
 
 		 373 aa  90.5  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2656  putative salicylate hydroxylase (salicylate 1-monooxygenase)  32.27 
 
 		 391 aa  89.7  3e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1313  monooxygenase, FAD-binding  32.27 
 
 		 391 aa  89.7  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2055  monooxygenase, FAD-binding  30.21 
 
 		 416 aa  89  5e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.6459  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3144  salicylate hydroxylase  28.57 
 
 		 400 aa  88.2  9e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.403778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56402  Salicylate hydroxylase (Salicylate 1-monooxygenase)  30.21 
 
 		 426 aa  88.2  9e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.476468  normal  0.198075 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1193  monooxygenase, FAD-binding  31.82 
 
 		 390 aa  88.2  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.155257  normal  0.524756 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0923  monooxygenase FAD-binding  32.24 
 
 		 412 aa  86.7  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.264093 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2159  monooxygenase FAD-binding  33.93 
 
 		 402 aa  86.7  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.429326  normal  0.511267 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7505  monooxygenase FAD-binding  32.08 
 
 		 407 aa  85.9  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.426443  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3669  salicylate hydroxylase  29.03 
 
 		 400 aa  85.9  5e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3703  salicylate hydroxylase  30.6 
 
 		 402 aa  83.2  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0229464  normal  0.0740994 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3267  salicylate hydroxylase  28.7 
 
 		 397 aa  83.2  0.000000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.128222 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01881  salicylate hydroxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04330)  33.98 
 
 		 341 aa  82.8  0.000000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.390445  normal  0.393025 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_31126  Salicylate hydroxylase (Salicylate 1-monooxygenase)  28.57 
 
 		 411 aa  82.4  0.000000000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4129  monooxygenase FAD-binding protein  33.84 
 
 		 421 aa  82.4  0.000000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2128  salicylate hydroxylase  31.94 
 
 		 397 aa  82.4  0.000000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.453627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2172  monooxygenase, FAD-binding  30.13 
 
 		 413 aa  81.6  0.000000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0853287 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6859  FAD dependent oxidoreductase  30.4 
 
 		 420 aa  81.6  0.000000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.87929 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07684  monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01680)  29.83 
 
 		 506 aa  80.9  0.00000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6277  monooxygenase FAD-binding  28.77 
 
 		 405 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.146167  normal  0.672282 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03569  salicylate hydroxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G10180)  27.66 
 
 		 711 aa  80.1  0.00000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.417638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2321  salicylate hydroxylase  28.25 
 
 		 397 aa  80.5  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2522  salicylate hydroxylase  28.25 
 
 		 397 aa  80.5  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2410  salicylate hydroxylase  28.25 
 
 		 397 aa  80.5  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.228446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2365  salicylate hydroxylase  28.25 
 
 		 397 aa  80.5  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.602992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2414  salicylate hydroxylase  28.25 
 
 		 397 aa  80.9  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.285012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1231  salicylate 1-monooxygenase  27.06 
 
 		 404 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.592071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2253  monooxygenase FAD-binding protein  30.18 
 
 		 401 aa  78.6  0.00000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3612  monooxygenase FAD-binding  31.96 
 
 		 430 aa  78.2  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0302868  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4498  salicylate 1-monooxygenase  29.09 
 
 		 422 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4040  salicylate 1-monooxygenase  27.85 
 
 		 404 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4033  monooxygenase FAD-binding  28.64 
 
 		 404 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.115519 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4439  salicylate hydroxylase  31.08 
 
 		 402 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0982291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5861  salicylate hydroxylase  28.77 
 
 		 404 aa  75.9  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.163921  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4218  salicylate hydroxylase  30.49 
 
 		 402 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.820412  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1886  salicylate hydroxylase  30.63 
 
 		 402 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.499924 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3586  salicylate 1-monooxygenase  29.23 
 
 		 427 aa  72.8  0.000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.942873 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4148  salicylate hydroxylase  30.49 
 
 		 402 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0202605  normal  0.0490833 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06742  salicylate hydroxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00590)  33.12 
 
 		 697 aa  72.4  0.000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.00748094 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3371  salicylate hydroxylase  29.15 
 
 		 402 aa  71.6  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0591709  normal  0.3753 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5805  salicylate hydroxylase  28.77 
 
 		 403 aa  71.6  0.000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6042  monooxygenase FAD-binding  31.34 
 
 		 378 aa  71.2  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0233658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2905  monooxygenase FAD-binding  30.9 
 
 		 381 aa  71.2  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00589473 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2515  salicylate 1-monooxygenase  30.34 
 
 		 386 aa  71.6  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.193433  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2514  monooxygenase FAD-binding protein  29.65 
 
 		 391 aa  70.9  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3601  salicylate 1-monooxygenase  30 
 
 		 402 aa  70.1  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.733205  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08199  MAK1-like monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G12060)  31.86 
 
 		 469 aa  69.7  0.00000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.167964 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1853  monooxygenase FAD-binding  32.58 
 
 		 385 aa  69.3  0.00000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3162  monooxygenase FAD-binding  30.43 
 
 		 387 aa  68.6  0.00000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0052  monooxygenase, FAD-binding  30.18 
 
 		 413 aa  68.6  0.00000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02114  salicylate hydroxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G05260)  27.47 
 
 		 448 aa  68.2  0.00000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07902  conserved hypothetical protein  27.84 
 
 		 462 aa  67.8  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.286901 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4031  DNA mismatch endonuclease Vsr  28.57 
 
 		 404 aa  67.8  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3927  salicylate 1-monooxygenase  30.17 
 
 		 385 aa  67  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.567277  normal  0.0279633 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0481  salicylate 1-monooxygenase  29.82 
 
 		 373 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>