118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_4472 on replicon NC_010678
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010678  Rpic_4472  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  100 
 
 		 407 aa  827    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.110729 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4606  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  100 
 
 		 407 aa  827    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.892585  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5366  FAD dependent oxidoreductase  59.79 
 
 		 387 aa  441  1e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1285  FAD dependent oxidoreductase  38.96 
 
 		 371 aa  208  2e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2990  FAD dependent oxidoreductase  40.66 
 
 		 377 aa  196  7e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6219  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  36.39 
 
 		 372 aa  192  7e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.885627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6735  FAD dependent oxidoreductase  36.59 
 
 		 387 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.164401  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2100  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  37.08 
 
 		 367 aa  189  5e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.246903  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0101  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  31.73 
 
 		 426 aa  181  2.9999999999999997e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4839  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  33.53 
 
 		 380 aa  166  1.0000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0215652  hitchhiker  0.000104965 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3094  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  33.23 
 
 		 381 aa  156  5.0000000000000005e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.224046  normal  0.972092 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3401  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  27.88 
 
 		 383 aa  136  7.000000000000001e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.067104 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0054  FAD dependent oxidoreductase  32.02 
 
 		 371 aa  122  9e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.327919 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1302  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  33.69 
 
 		 380 aa  122  9.999999999999999e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.490757  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1318  FAD dependent oxidoreductase  32.9 
 
 		 371 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.580199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5636  FAD dependent oxidoreductase  31.22 
 
 		 370 aa  99  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0161199 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3818  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  31.58 
 
 		 373 aa  97.1  5e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0193828  hitchhiker  0.0039585 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2008  FAD dependent oxidoreductase  30.95 
 
 		 372 aa  80.9  0.00000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.281649  normal  0.0887503 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2633  FAD dependent oxidoreductase  29.84 
 
 		 372 aa  79  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0082  FAD dependent oxidoreductase  31.71 
 
 		 393 aa  59.7  0.00000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0765  putative FAD dependent oxidoreductase  26.36 
 
 		 442 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.144956 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5919  FAD dependent oxidoreductase  37.5 
 
 		 398 aa  57  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000776638  normal  0.0692698 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4955  FAD dependent oxidoreductase  30 
 
 		 442 aa  55.5  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.916041  normal  0.433563 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3290  FAD dependent oxidoreductase  26.98 
 
 		 451 aa  54.7  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.298058 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3636  FAD dependent oxidoreductase  29.27 
 
 		 394 aa  54.3  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.295113  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2996  FAD dependent oxidoreductase  29.06 
 
 		 433 aa  54.7  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3930  FAD dependent oxidoreductase  29.64 
 
 		 461 aa  54.3  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.130124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0236  AgaE protein  32.33 
 
 		 447 aa  53.1  0.000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1879  FAD dependent oxidoreductase  31.58 
 
 		 447 aa  51.6  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.846969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0860  FAD dependent oxidoreductase  46.67 
 
 		 471 aa  52  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.300011 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2911  FAD dependent oxidoreductase  29.34 
 
 		 433 aa  50.8  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4733  FAD dependent oxidoreductase  32.29 
 
 		 383 aa  50.1  0.00008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.233714  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5571  FAD dependent oxidoreductase  26.88 
 
 		 415 aa  50.1  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000397488  normal  0.22054 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3630  FAD dependent oxidoreductase  32.29 
 
 		 383 aa  50.1  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.508922 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2694  hypothetical protein  45.76 
 
 		 427 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.177617  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3536  FAD dependent oxidoreductase  35.51 
 
 		 382 aa  49.7  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.13999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1909  FAD dependent oxidoreductase  48 
 
 		 427 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.275266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7847  oxidoreductase, FAD-binding protein  27.63 
 
 		 472 aa  48.5  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2708  D-amino-acid dehydrogenase  30.23 
 
 		 440 aa  48.9  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5371  FAD dependent oxidoreductase  35.34 
 
 		 382 aa  48.1  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.395195 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3761  FAD dependent oxidoreductase  38.46 
 
 		 431 aa  47.8  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5517  FAD dependent oxidoreductase  26.88 
 
 		 441 aa  48.1  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.176807  normal  0.255694 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2427  FAD dependent oxidoreductase  44.07 
 
 		 427 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.214399 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4426  FAD dependent oxidoreductase  33.06 
 
 		 375 aa  47.4  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.767277 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4225  FAD dependent oxidoreductase  33.02 
 
 		 375 aa  47.4  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0211166  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3002  FAD dependent oxidoreductase  28.19 
 
 		 433 aa  47.4  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4141  FAD dependent oxidoreductase  33.02 
 
 		 375 aa  47.4  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.659228  normal  0.0539213 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3021  FAD dependent oxidoreductase  28.19 
 
 		 433 aa  47.4  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6351  FAD dependent oxidoreductase  28.94 
 
 		 433 aa  47  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3942  FAD dependent oxidoreductase  29.03 
 
 		 385 aa  47  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.741631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0708  FAD dependent oxidoreductase  22.71 
 
 		 362 aa  47  0.0006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.440314  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3049  FAD dependent oxidoreductase  28.51 
 
 		 433 aa  47  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0721  FAD dependent oxidoreductase  28.4 
 
 		 983 aa  47  0.0006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4114  FAD dependent oxidoreductase  27.94 
 
 		 427 aa  47  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.776855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0537  FAD dependent oxidoreductase  43.28 
 
 		 419 aa  47  0.0007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1388  FAD dependent oxidoreductase  41.49 
 
 		 492 aa  46.6  0.0007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.569106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3316  FAD dependent oxidoreductase  48.08 
 
 		 433 aa  46.6  0.0008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2366  FAD dependent oxidoreductase  29.39 
 
 		 431 aa  46.6  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1556  FAD dependent oxidoreductase  26.19 
 
 		 604 aa  46.6  0.0008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1893  FAD dependent oxidoreductase  26.52 
 
 		 375 aa  45.8  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.534087 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1839  FAD dependent oxidoreductase  25.78 
 
 		 376 aa  46.2  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.672748  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1237  FAD dependent oxidoreductase  27.45 
 
 		 965 aa  45.8  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.18893  normal  0.393596 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4107  FAD dependent oxidoreductase  43.08 
 
 		 393 aa  45.4  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0968917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4607  FAD dependent oxidoreductase  40.79 
 
 		 364 aa  45.8  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28180  hypothetical protein  44 
 
 		 427 aa  45.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0347636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1975  FAD dependent oxidoreductase  40.68 
 
 		 427 aa  45.4  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.185752  normal  0.0484481 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6497  oxidoreductase  30.88 
 
 		 380 aa  45.1  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1282  FAD dependent oxidoreductase  30.29 
 
 		 415 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.783246  normal  0.547311 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2415  FAD dependent oxidoreductase  29.03 
 
 		 436 aa  45.1  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0342096  normal  0.0777393 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1255  FAD dependent oxidoreductase  30.29 
 
 		 415 aa  44.7  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.621856  normal  0.317392 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4676  oxidoreductase, FAD-dependent  44 
 
 		 427 aa  44.7  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1120  FAD dependent oxidoreductase  46 
 
 		 421 aa  45.1  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1533  D-amino-acid dehydrogenase  42.55 
 
 		 428 aa  44.7  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000097225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4365  FAD dependent oxidoreductase  42.19 
 
 		 437 aa  44.7  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3245  FAD dependent oxidoreductase  40.35 
 
 		 427 aa  44.7  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.363775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0577  glycine oxidase ThiO  38 
 
 		 405 aa  44.7  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0408  glycine oxidase ThiO  32.11 
 
 		 335 aa  44.7  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0882665  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1379  FAD dependent oxidoreductase  39.39 
 
 		 500 aa  45.1  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.258536  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1475  FAD dependent oxidoreductase  39.39 
 
 		 500 aa  45.1  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7399  oxidoreductase  31.71 
 
 		 376 aa  44.7  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2448  FAD dependent oxidoreductase  38.6 
 
 		 427 aa  44.3  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1537  FAD dependent oxidoreductase  42.19 
 
 		 429 aa  44.3  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000289011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2360  D-amino-acid dehydrogenase  38.57 
 
 		 446 aa  44.3  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0223413  normal  0.51106 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2456  hypothetical protein  42 
 
 		 427 aa  44.3  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0482132  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3524  FAD dependent oxidoreductase  38.6 
 
 		 427 aa  44.3  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193766 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1949  FAD dependent oxidoreductase  38.6 
 
 		 427 aa  44.3  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.764265  decreased coverage  0.00013363 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3378  FAD dependent oxidoreductase  33.94 
 
 		 375 aa  44.3  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.344294  normal  0.353692 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6619  FAD dependent oxidoreductase  40.62 
 
 		 410 aa  44.3  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.664029 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2383  FAD dependent oxidoreductase  37.66 
 
 		 435 aa  43.9  0.005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.155247  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0977  FAD dependent oxidoreductase  42 
 
 		 428 aa  43.9  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1341  FAD dependent oxidoreductase  42.42 
 
 		 435 aa  43.9  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.268345  normal  0.168111 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4055  FAD dependent oxidoreductase  42.42 
 
 		 435 aa  43.9  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.80988  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4032  FAD dependent oxidoreductase  32.55 
 
 		 375 aa  43.9  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.120783 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20380  FAD-dependent oxidoreductase  44 
 
 		 427 aa  43.9  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5605  FAD dependent oxidoreductase  27.87 
 
 		 984 aa  43.9  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0778  FAD dependent oxidoreductase  25.71 
 
 		 429 aa  43.9  0.006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0594018  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3551  FAD dependent oxidoreductase  33.02 
 
 		 375 aa  43.5  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4136  FAD dependent oxidoreductase  47.92 
 
 		 415 aa  43.5  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3843  FAD dependent oxidoreductase  47.27 
 
 		 435 aa  43.9  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2742  FAD dependent oxidoreductase  45.31 
 
 		 432 aa  43.5  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>