223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2891 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007964  Nham_2891  glycine oxidase ThiO  100 
 
 
338 aa  683    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.894969  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2464  FAD dependent oxidoreductase  87.87 
 
 
338 aa  603  1.0000000000000001e-171  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.750874  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2166  glycine oxidase ThiO  67.83 
 
 
346 aa  498  1e-140  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.402403 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3428  glycine oxidase ThiO  71.25 
 
 
369 aa  496  1e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4092  FAD dependent oxidoreductase  69.72 
 
 
368 aa  491  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0346042  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1958  glycine oxidase ThiO  71.87 
 
 
338 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0655991  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6222  thiamine biosynthesis oxidoreductase thiO  68.55 
 
 
338 aa  489  1e-137  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.787474  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2166  glycine oxidase ThiO  50.91 
 
 
337 aa  313  1.9999999999999998e-84  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.232699  normal  0.765835 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1414  glycine oxidase ThiO  52.29 
 
 
339 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0208  glycine oxidase ThiO  51.23 
 
 
334 aa  308  1.0000000000000001e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.642429  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0217  D-amino acid oxidase family protein  51.23 
 
 
334 aa  307  1.0000000000000001e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0284  glycine oxidase ThiO  49.68 
 
 
334 aa  298  6e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0009  glycine oxidase ThiO  48.4 
 
 
338 aa  289  4e-77  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.363265 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0914  glycine oxidase ThiO  50.48 
 
 
325 aa  285  7e-76  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.173839  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3650  glycine oxidase ThiO  51.8 
 
 
324 aa  283  4.0000000000000003e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2562  glycine oxidase ThiO  46.48 
 
 
331 aa  280  2e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.185136  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4173  glycine oxidase ThiO  48.17 
 
 
334 aa  272  5.000000000000001e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.269428 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0041  FAD dependent oxidoreductase  44.62 
 
 
325 aa  270  2.9999999999999997e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.161257  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0445  thiamine biosynthesis oxidoreductase  44.81 
 
 
316 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5918  glycine oxidase ThiO  46.3 
 
 
330 aa  267  2e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.669561  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6396  glycine oxidase ThiO  46.58 
 
 
316 aa  262  4.999999999999999e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3575  FAD dependent oxidoreductase  42.47 
 
 
376 aa  227  2e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.747856  hitchhiker  0.00000218413 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1748  glycine oxidase  37.28 
 
 
340 aa  224  1e-57  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0438  glycine oxidase ThiO  37.28 
 
 
340 aa  224  1e-57  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.017801  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2697  FAD dependent oxidoreductase  43.93 
 
 
378 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0410  FAD dependent oxidoreductase  43.93 
 
 
378 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.533271  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2774  FAD dependent oxidoreductase  43.83 
 
 
386 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.300759  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1786  FAD dependent oxidoreductase  39.53 
 
 
374 aa  221  1.9999999999999999e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0563944  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3008  oxidoreductase, FAD-binding  43.6 
 
 
377 aa  220  3e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1936  FAD dependent oxidoreductase  39.53 
 
 
374 aa  219  3.9999999999999997e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.969419  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0383  putative D-amino acid oxidase flavoprotein  42.47 
 
 
376 aa  219  7e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0570  FAD dependent oxidoreductase  37.72 
 
 
353 aa  218  7.999999999999999e-56  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0389  FAD dependent oxidoreductase  43.03 
 
 
378 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0337  FAD dependent oxidoreductase  44.24 
 
 
378 aa  216  5e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.832252  normal  0.324335 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3508  FAD dependent oxidoreductase  43.57 
 
 
378 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.544782  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0163  FAD dependent oxidoreductase  40.34 
 
 
410 aa  214  9.999999999999999e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.550604  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0452  FAD-dependent oxidoreductase  36.42 
 
 
354 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2780  glycine oxidase ThiO  42.81 
 
 
377 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3710  oxidoreductase, FAD-binding  42.81 
 
 
377 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3224  glycine oxidase ThiO  42.81 
 
 
377 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1773  glycine oxidase ThiO  42.81 
 
 
377 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2730  oxidoreductase, FAD-binding  42.2 
 
 
377 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1460  hypothetical protein  36.81 
 
 
356 aa  213  4.9999999999999996e-54  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0328  FAD dependent oxidoreductase  43.93 
 
 
378 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3681  glycine oxidase ThiO  43.03 
 
 
377 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0313  FAD dependent oxidoreductase  43.61 
 
 
378 aa  212  7e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.235316  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3739  glycine oxidase ThiO  43.03 
 
 
377 aa  212  7e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1932  FAD dependent oxidoreductase  35.81 
 
 
410 aa  211  1e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0147  FAD dependent oxidoreductase  38.94 
 
 
350 aa  210  2e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1523  hypothetical protein  37.05 
 
 
356 aa  207  2e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3068  FAD dependent oxidoreductase  38.66 
 
 
372 aa  206  5e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0186757  normal  0.325054 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4314  FAD dependent oxidoreductase  39.36 
 
 
378 aa  206  5e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.274376  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3293  FAD dependent oxidoreductase  40.14 
 
 
398 aa  206  6e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.204133 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3643  FAD dependent oxidoreductase  40.3 
 
 
381 aa  205  8e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3319  FAD dependent oxidoreductase  40 
 
 
381 aa  204  2e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0112  putative D-amino acid oxidase flavoprotein oxidoreductase  39.7 
 
 
379 aa  204  2e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.333695  normal  0.56231 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0206  FAD dependent oxidoreductase  39.14 
 
 
402 aa  204  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.573991  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1456  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.57 
 
 
394 aa  204  2e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.712312  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0895  FAD dependent oxidoreductase  36.18 
 
 
365 aa  204  2e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00321446  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0947  FAD dependent oxidoreductase  36.31 
 
 
374 aa  202  9e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2398  FAD dependent oxidoreductase  40.06 
 
 
363 aa  196  3e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0038  FAD dependent oxidoreductase  37.39 
 
 
353 aa  196  5.000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0020  glycine oxidase ThiO  36.28 
 
 
355 aa  194  2e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.504997 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2464  FAD dependent oxidoreductase  36.76 
 
 
358 aa  189  4e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.112989  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0251  oxidoreductase, FAD-dependent  32.69 
 
 
393 aa  188  1e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1609  thiamine biosynthesis oxidoreductase ThiO, putative  37.01 
 
 
360 aa  175  9e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.575711  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2431  FAD dependent oxidoreductase  38.44 
 
 
367 aa  174  9.999999999999999e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.779457 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3748  glycine oxidase ThiO  34.25 
 
 
342 aa  111  2.0000000000000002e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0708  glycine oxidase ThiO  34.35 
 
 
338 aa  108  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.740866  normal  0.0447216 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10420  thiamine biosynthesis oxidoreductase thiO  33.13 
 
 
340 aa  107  2e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.219353  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2099  glycine oxidase ThiO  29.54 
 
 
374 aa  106  5e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.119028  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1340  glycine oxidase ThiO  31.36 
 
 
375 aa  102  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  hitchhiker  0.0035061 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1286  glycine oxidase ThiO  32.25 
 
 
356 aa  102  1e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0535  glycine oxidase ThiO  32.52 
 
 
338 aa  97.1  4e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0545  glycine oxidase ThiO  32.52 
 
 
338 aa  97.1  4e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0557  glycine oxidase ThiO  32.52 
 
 
338 aa  97.1  4e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.959703  normal  0.488282 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3033  glycine oxidase ThiO  27.32 
 
 
382 aa  95.1  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000572882  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3888  glycine oxidase ThiO  30.64 
 
 
385 aa  94.4  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0773  glycine oxidase ThiO  31.94 
 
 
392 aa  93.2  5e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0408  glycine oxidase ThiO  31.19 
 
 
335 aa  90.5  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0882665  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34650  glycine oxidase  28.24 
 
 
375 aa  90.5  4e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.048332  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0577  glycine oxidase ThiO  30.49 
 
 
405 aa  89.4  9e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0989  glycine oxidase ThiO  27.47 
 
 
404 aa  89.4  9e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.136129  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1152  glycine oxidase ThiO  30.81 
 
 
360 aa  86.7  5e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3405  glycine oxidase ThiO  27.81 
 
 
371 aa  85.9  9e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.289575  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4390  glycine oxidase ThiO  28.02 
 
 
361 aa  84.3  0.000000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0197  glycine oxidase ThiO  31.71 
 
 
342 aa  83.6  0.000000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01740  glycine oxidase ThiO  29.46 
 
 
388 aa  81.6  0.00000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3116  glycine oxidase ThiO  28.57 
 
 
393 aa  81.6  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.248059  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2783  glycine oxidase ThiO  28.46 
 
 
372 aa  80.9  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256999  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0912  glycine oxidase ThiO  27.85 
 
 
349 aa  80.1  0.00000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.970325  normal  0.149805 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1044  thiamine biosynthesis oxidoreductase ThiO  28.69 
 
 
391 aa  78.2  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4279  glycine oxidase ThiO  32.7 
 
 
398 aa  77.4  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.196313  hitchhiker  0.00513964 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0964  glycine oxidase ThiO  28.13 
 
 
373 aa  75.1  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2406  FAD dependent oxidoreductase  28.24 
 
 
379 aa  73.9  0.000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.000101651  normal  0.0131925 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0143  glycine oxidase ThiO  29.26 
 
 
375 aa  72.8  0.000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.23525 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1866  putative D-amino acid oxidase  28.12 
 
 
368 aa  72.4  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4544  glycine oxidase ThiO  25.34 
 
 
369 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.569361 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0640  glycine oxidase  25.14 
 
 
369 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0807  glycine oxidase ThiO  25.14 
 
 
369 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.35515e-47 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>